单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 15161 - 15180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15161 | 2024-08-07 |
Single-cell technologies in reproductive immunology
2019-09, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13157
PMID:31206899
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综述 | 本文综述了单细胞技术在生殖免疫学中的应用，特别是如何通过这些技术来理解母胎界面的复杂免疫环境 | 介绍了单细胞RNA测序与微流控技术结合，以及多色流式细胞术在识别新型细胞类型中的应用 | 生成的数据集具有极高的维度和大小，需要应用新的计算方法进行无偏分析 | 为生殖免疫学界提供关于复杂流式细胞术和RNA测序数据获取及分析的计算工具的概述和简要入门 | 母胎界面的免疫环境及其中的细胞类型 | 生殖免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，多色流式细胞术 | tSNE，SPADE，SPICE | 细胞分辨率的数据 | NA |
| 15162 | 2024-08-07 |
Dissecting Cellular Heterogeneity Using Single-Cell RNA Sequencing
2019-Mar-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2019.2446
PMID:30764602
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析细胞异质性中的应用 | 介绍了scRNA-seq技术如何通过提供来自数万个单个细胞的全基因组分子轮廓来定量和无偏地表征细胞异质性 | NA | 探讨如何利用scRNA-seq数据解释观察到的细胞间变异性 | 细胞异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数万个单个细胞 |
| 15163 | 2024-08-05 |
Effect of aging on the human myometrium at single-cell resolution
2024-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45143-z
PMID:38296945
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research paper | 本研究构建了来自186,120个细胞的人类子宫肌层老化细胞图谱 | 首次使用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示年龄对人类子宫肌层的影响 | 研究仅限于20名围绝经期和绝经后女性的样本 | 研究衰老对人类子宫肌层功能的影响及其对妊娠和分娩的潜在影响 | 针对围绝经期和绝经后女性的人类子宫肌层细胞进行分析 | NA | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 细胞 | 20名围绝经期和绝经后女性的186,120个细胞 |
| 15164 | 2024-08-07 |
A cell atlas of the larval Aedes aegypti ventral nerve cord
2024-Jan-31, Neural development
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s13064-023-00178-8
PMID:38297398
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，全面展示了埃及伊蚊幼虫腹神经索（VNC）的细胞组成 | 首次详细描述了埃及伊蚊幼虫VNC中的35种以上细胞类型，并探讨了单胺能和肽能神经元的多样性 | NA | 深入理解影响蚊子宿主寻找行为和病原体传播的发育事件 | 埃及伊蚊幼虫的腹神经索（VNC） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 超过35种VNC细胞类型 |
| 15165 | 2024-08-07 |
NADase CD38 is a key determinant of ovarian aging
2024-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00532-9
PMID:38129670
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研究论文 | 本文通过分析年轻和中老年小鼠不同器官的转录组景观，揭示了卵巢早衰的机制，特别是NADase CD38表达增加和NAD水平下降对卵巢衰老的影响。 | 首次揭示了CD38在卵巢早衰中的关键作用，并提供了通过抑制CD38来改善中老年雌性小鼠生育能力的潜在治疗方法。 | NA | 探讨卵巢早衰的机制并寻找潜在的治疗方法。 | 小鼠的卵巢和其他器官。 | NA | 卵巢早衰 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和中老年小鼠的多个器官 |
| 15166 | 2024-08-05 |
RENGE infers gene regulatory networks using time-series single-cell RNA-seq data with CRISPR perturbations
2023-12-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05594-4
PMID:38155269
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research paper | 本研究提出了RENG，利用时间序列单细胞CRISPR数据推断基因调控网络 | RENG能够区分直接和间接调控，超越当前方法在基因调控网络推断的准确性 | 该方法的局限性在于依赖于时间序列单细胞数据 | 研究目的是推断基因调控网络 | 研究对象为人诱导多能干细胞的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理 | NA | CRISPR扰动 | NA | 单细胞RNA-seq | 来自人诱导多能干细胞的数据集 |
| 15167 | 2024-08-05 |
scPML: pathway-based multi-view learning for cell type annotation from single-cell RNA-seq data
2023-12-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05634-z
PMID:38097699
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研究论文 | 本文提出了scPML模型，该模型通过不同的基因信号通路数据来进行细胞类型注释 | scPML模型利用基因信号通路数据来分割细胞的遗传特征，改善了细胞注释的泛化能力和鲁棒性 | 现有方法在细胞注释任务中缺乏良好的泛化性和鲁棒性，尤其在技术差异和基因异质性方面存在挑战 | 本文旨在提升单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 | 研究对象为不同物种、平台和组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因信号通路数据 | 涉及多个物种和组织的细胞样本 |
| 15168 | 2024-08-07 |
Single-cell map of dynamic cellular microenvironment of radiation-induced intestinal injury
2023-12-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05645-w
PMID:38071238
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，描绘了辐射诱导肠道损伤（RIII）及其再生过程中肠道微环境的动态变化图谱 | 揭示了肠道不同细胞类型的异质性辐射敏感性，以及肠道干细胞（ISCs）的动态变化模式和细胞间的复杂转换模式 | NA | 探究辐射诱导肠道损伤及其再生过程中肠道微环境的动态变化 | 肠道微环境中的细胞类型及其在辐射损伤后的动态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 15169 | 2024-08-05 |
Iron inhibits glioblastoma cell migration and polarization
2023-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202202157RR
PMID:37983646
|
研究论文 | 这篇文章探讨了铁如何影响胶质母细胞瘤细胞的迁移能力和极性。 | 本研究首次系统性地调查了细胞内铁含量对胶质母细胞瘤细胞迁移能力的影响。 | 该研究未能全面探讨铁对胶质母细胞瘤细胞其他生物学特性的影响。 | 研究细胞内铁含量对胶质母细胞瘤细胞迁移及极性建立的影响。 | 人类胶质母细胞瘤细胞及其在肿瘤微环境中的行为。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 使用了人类胶质母细胞瘤样本的单细胞RNA-seq数据集 |
| 15170 | 2024-08-05 |
Integrative Proteomics and N-Glycoproteomics Analyses of Rheumatoid Arthritis Synovium Reveal Immune-Associated Glycopeptides
2023-05, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2023.100540
PMID:37019382
|
研究论文 | 本研究首次呈现了类风湿关节炎滑膜的N-糖蛋白组，描述了与免疫相关的糖基化 | 通过完整N-糖肽的定量策略，识别了RA滑膜中的1260个完整N-糖肽，揭示了糖基化与免疫反应之间的关联 | 对滑膜组织的深入糖蛋白组学分析仍然不足 | 研究N-糖蛋白组在类风湿关节炎中的作用及其与免疫反应的关联 | 类风湿关节炎滑膜中的N-糖蛋白和免疫细胞类型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 蛋白质组学，N-糖蛋白组学 | NA | 蛋白质数据 | 334个糖蛋白中的481个N-糖位点 |
| 15171 | 2024-08-07 |
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.87977
PMID:37928259
|
研究论文 | 本研究探讨了长非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | 发现了lncR-APDC沉默后牙周炎模型中独特的上皮细胞亚群和显著升高的表达水平，为牙周炎的表观遗传调控提供了新视角 | NA | 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 | lncR-APDC基因敲除小鼠和诱导的实验性牙周炎模型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | lncR-APDC基因敲除小鼠和牙周炎牙龈组织 |
| 15172 | 2024-08-07 |
Comparative analysis of sequencing technologies for single-cell transcriptomics
2019-04-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1676-5
PMID:30961669
|
研究论文 | 本文首次比较了BGISEQ-500平台与Illumina HiSeq平台在单细胞RNA测序技术中的应用 | 提供了468个单细胞和1297个匹配的单cDNA样本的资源，用于基准测试新的单细胞RNA测序库准备协议和测序平台 | NA | 比较不同测序技术在单细胞转录组学中的性能 | 单细胞RNA测序技术 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 468个单细胞和1297个匹配的单cDNA样本 |
| 15173 | 2024-08-07 |
In situ 10-cell RNA sequencing in tissue and tumor biopsy samples
2019-03-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-41235-9
PMID:30894605
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研究论文 | 本文介绍了一种在组织和肿瘤活检样本中进行原位10细胞RNA测序的方法 | 结合激光捕获技术和改进的预放大程序，实现了对10个微切割细胞的RNA测序，提高了单细胞RNA测序的技术可靠性和灵敏度 | NA | 开发一种新的方法来量化细胞在其原始组织环境中的个体调控状态 | 组织和肿瘤活检样本中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 10个微切割细胞 |
| 15174 | 2024-08-05 |
Hyperhomocysteinemia may aggravate abdominal aortic aneurysm formation by up-regulating RASSF2
2024-Mar-10, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.148036
PMID:38036076
|
研究论文 | 本研究探讨了高同型半胱氨酸血症通过上调RASSF2可能加重腹主动脉瘤形成的机制 | 揭示了RASSF2和IL-1β作为HHcy介导的腹主动脉瘤形成的潜在靶基因 | 研究主要集中在分子机制的探索，缺乏临床干预的研究 | 阐明高同型半胱氨酸血症加重腹主动脉瘤形成的潜在分子机制 | 腹主动脉瘤及其相关的内皮细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序 | 单细胞RNA测序 | 基因表达数据 | 分析了多组腹主动脉瘤和对照组织样本数据 |
| 15175 | 2024-08-07 |
Network Activity Evaluation Reveals Significant Gene Regulatory Architectures during SARS-CoV-2 Viral Infection from Dynamic scRNA-seq Data
2024-Jan-31, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3360529
PMID:38294926
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研究论文 | 本文提出了一种名为scNAE的单细胞网络活性评估框架，用于评估基因调控网络（GRN）与基因表达谱的一致性，特别是在SARS-CoV-2病毒感染期间的动态scRNA-seq数据 | scNAE框架通过构建带有正则化惩罚项的损失函数和快速收敛的交替方向乘子法，有效解决了GRN推断问题，并能通过排列统计测试程序得出经验P值 | NA | 揭示SARS-CoV-2病毒感染期间的基因活动，特别是在分子水平上的基因调控网络活性 | SARS-CoV-2病毒感染期间的单细胞基因表达数据 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | ODE模型 | 基因表达数据 | NA |
| 15176 | 2024-08-07 |
Multi-omics analysis reveals NNMT as a master metabolic regulator of metastasis in esophageal squamous cell carcinoma
2024-Jan-30, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-024-00509-w
PMID:38291241
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）淋巴结转移中代谢重编程的关键调控因子NNMT | 首次发现NNMT在ESCC淋巴结转移中的重要作用，并揭示了其通过影响表观遗传修饰调控细胞代谢的机制 | NA | 探索食管鳞状细胞癌淋巴结转移中的代谢变化及其调控机制 | 食管鳞状细胞癌及其淋巴结转移 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、代谢组学 | NA | RNA、代谢物 | ESCC肿瘤组织和淋巴结样本 |
| 15177 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of epithelial, immune, and stromal signatures and interactions in human ovarian cancer
2024-01-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-05826-1
PMID:38278958
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研究论文 | 本文通过分析来自84名卵巢癌患者的超过50万个单细胞转录组数据，研究了卵巢癌中的上皮细胞、免疫细胞和基质细胞及其相互作用 | 发现了具有功能变异的上皮细胞临床亚型特征，以及在IC2阶段显著增加的特定T细胞亚型和具有肿瘤进展相关功能的癌症相关成纤维细胞 | NA | 深入理解卵巢癌进展，并为更好的诊断和治疗开发提供依据 | 卵巢癌中的上皮细胞、免疫细胞和基质细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 84名卵巢癌患者 |
| 15178 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of conventional central chondrosarcoma reveals the role of endoplasmic reticulum stress in malignant transformation
2024-01-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-05790-w
PMID:38267611
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了11个原发性软骨肿瘤及对照组，构建了传统中央型软骨肉瘤的单细胞图谱，揭示了内质网应激在恶性转化中的作用 | 首次通过单细胞图谱揭示了内质网应激在传统中央型软骨肉瘤恶性转化中的作用，并发现NF-κB通路减轻了内质网应激诱导的凋亡 | 研究样本量较小，且仅限于传统中央型软骨肉瘤，可能限制了结果的普遍性 | 探讨软骨肉瘤恶性转化的机制，寻找潜在的诊断标志物和治疗策略 | 传统中央型软骨肉瘤及其恶性转化过程 | 数字病理学 | 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 11个原发性软骨肿瘤及对照组 |
| 15179 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of the microenvironment in human bone metastatic renal cell carcinoma
2024-01-12, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-05772-y
PMID:38216635
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了人类骨转移性肾细胞癌的微环境，包括6个原发性肾细胞癌和9个骨转移性肾细胞癌的细胞转录组，以及早期和晚期肾细胞癌、正常肾脏和健康骨髓样本的数据，以探索骨转移性肾细胞癌的治疗靶点。 | 本研究首次系统地描述了骨转移性肾细胞癌微环境中主要细胞系的分子特性和动态变化，揭示了免疫抑制T细胞的主导作用及其在治疗后的部分恢复，以及骨转移性肿瘤中免疫抑制CD47 T细胞的浸润现象。 | NA | 探索骨转移性肾细胞癌的治疗靶点和微环境特性。 | 骨转移性肾细胞癌的微环境和细胞转录组。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个原发性肾细胞癌和9个骨转移性肾细胞癌样本，以及早期和晚期肾细胞癌、正常肾脏和健康骨髓样本 |
| 15180 | 2024-08-05 |
C/EBPβ-induced lymphoid-to-myeloid transdifferentiation emulates granulocyte-monocyte progenitor biology
2024-01-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.11.011
PMID:38157851
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研究论文 | C/EBPβ诱导小鼠B细胞转分化为粒单核细胞前体样细胞 | 提出了一种新型的粒单核细胞前体培养系统，用于研究GMP生物学和谱系承诺 | 研究中对IRF8和C/EBPβ的缺失效果分析可能受到特定条件的限制 | 探索C/EBPβ在调控B细胞转分化过程中的作用 | 主要研究转分化的鼠源B细胞及其生成的前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞样本 | 使用了初级v-Abl不朽化小鼠B细胞 |