单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 15161 - 15180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15161 | 2024-08-04 |
Comprehensive benchmark of differential transcript usage analysis for static and dynamic conditions
2024-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.14.575548
PMID:38313260
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研究论文 | 本文对差异转录使用分析中的多种工具进行全面基准测试 | 通过考虑不同实验条件和数据类型，提供了工具选择的系统比较和推荐 | 主要集中于现有工具的比较，对新工具的开发和优化没有深入探讨 | 帮助用户选择最适合其实验任务的转录组分析工具 | 模拟和实际的转录组数据集，包括时间序列数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 使用了模拟的和实际的转录组数据集，包括时间序列数据 |
| 15162 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in donor and end-stage heart failure patients identifies NLRP3 as a therapeutic target for arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy
2024-01-08, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-03232-8
PMID:38185631
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了供体和终末期心力衰竭患者的血液及双心室心肌细胞，识别出NLRP3作为治疗心律失常右室心肌病的潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术在心律失常右室心肌病患者中发现NLRP3的表达与右室扩张和功能障碍相关，并验证了其作为治疗靶点的有效性 | 研究样本量较小，仅包括8名研究参与者，且仅使用了Dsg2mut/mut小鼠模型进行验证 | 探索心律失常右室心肌病的新治疗靶点 | 心律失常右室心肌病患者的血液及双心室心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 8名研究参与者，包括6名终末期心力衰竭的心律失常右室心肌病患者和2名正常对照 |
| 15163 | 2024-08-04 |
LCP1 knockdown in monocyte-derived macrophages: mitigating ischemic brain injury and shaping immune cell signaling and metabolism
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.88678
PMID:38164159
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研究论文 | 本研究探讨了LCP1在单核细胞来源的巨噬细胞中对缺血性脑损伤的影响 | 研究首次揭示了LCP1在缺血性脑损伤中的作用，并阐明了其对免疫细胞信号和代谢的调节机制 | 尚不清楚LCP1在缺血性中风中作用的完整机制以及临床应用的可行性 | 旨在深入理解LCP1在缺血性脑伤害和免疫反应中的功能 | 研究对象为单核细胞来源的巨噬细胞及其对缺血性脑损伤的影响 | 数字病理学 | 缺血性中风 | CyTOF 技术 | 小鼠模型 | 单细胞测序数据 | 小鼠样本数量未知 |
| 15164 | 2024-08-04 |
Palmitoylation of PKCδ by ZDHHC5 in hypothalamic microglia presents as a therapeutic target for fatty liver disease
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.89602
PMID:38250049
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研究论文 | 本研究发现PKCδ的棕榈酰化在下丘脑小胶质细胞中作为脂肪肝疾病的治疗靶点 | 首次揭示了抗疟药物阿莫西林通过抑制小胶质细胞的活化，改善脂质代谢，并确定了PKCδ作为直接靶 alvo | 该研究主要在小鼠模型中进行，临床应用的有效性和安全性尚需进一步验证 | 探讨下丘脑小胶质细胞中PKCδ的棕榈酰化在脂肪肝疾病中的作用 | 高脂饮食诱导的小鼠及人类脑组织样本 | 数字病理学 | 脂肪肝疾病 | 生物素标记化学探针 | NA | 组织样本 | 高脂饮食诱导的小鼠和人类脑组织样本 |
| 15165 | 2024-08-07 |
Reciprocal interactions between malignant cells and macrophages enhance cancer stemness and M2 polarization in HBV-associated hepatocellular carcinoma
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.87962
PMID:38169544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV相关肝细胞癌患者的肿瘤微环境，揭示了恶性细胞与巨噬细胞之间的相互作用如何增强癌症干细胞特性和M2极化 | 首次详细描述了HBV相关肝细胞癌中恶性细胞与巨噬细胞之间的相互作用，以及这种作用如何影响癌症干细胞特性和M2极化 | 研究仅基于九名患者的样本，可能存在样本量较小的问题 | 探讨肿瘤微环境中恶性细胞与巨噬细胞的相互作用对癌症干细胞特性和M2极化的影响 | HBV相关肝细胞癌患者的恶性细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 九名HBV相关肝细胞癌患者 |
| 15166 | 2024-08-07 |
Exosomes derived from CD271+CD56+ bone marrow mesenchymal stem cell subpopoulation identified by single-cell RNA sequencing promote axon regeneration after spinal cord injury
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.89008
PMID:38169566
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现了一种特殊的骨髓间充质干细胞亚群，该亚群能够促进脊髓损伤后的轴突再生，并探讨了其治疗效果及机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术发现了一种能够促进脊髓损伤后轴突再生的骨髓间充质干细胞亚群，并开发了一种持续释放系统的治疗方法 | NA | 探索能够增强脊髓损伤后轴突再生的途径 | 骨髓间充质干细胞亚群及其衍生的外泌体在脊髓损伤后的治疗效果 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15167 | 2024-08-07 |
Comprehensive characterization of early-programmed tumor microenvironment by tumor-associated macrophages reveals galectin-1 as an immune modulatory target in breast cancer
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.88917
PMID:38169569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在早期肿瘤发展中对肿瘤微环境（TME）的调控作用，并发现Galectin-1作为免疫调节靶点 | 首次揭示了TAMs在早期肿瘤发展中对TME的全面调控作用，并确定了Galectin-1作为关键分子因子 | NA | 研究TAMs在早期肿瘤发展中对TME的调控作用及关键分子因子 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、肿瘤微环境（TME）、Galectin-1 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15168 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomics develops a robust neuroendocrine cell-intrinsic signature to predict prostate cancer progression
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.92336
PMID:38250042
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组学数据，开发了一种稳健的神经内分泌细胞内在特征，用于预测前列腺癌的进展 | 开发了一种集成分析流程，识别了762个高质量的神经内分泌标记物，并创建了一个名为NEPAL的R包，用于预测神经内分泌前列腺癌的风险评分 | NA | 精确识别神经内分泌前列腺癌细胞，为研究和临床应用提供重要意义 | 神经内分泌前列腺癌细胞及其在前列腺癌进展中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共包含210,879个单细胞，包括66个肿瘤样本 |
| 15169 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals S100a9hi macrophages promote the transition from acute inflammation to fibrotic remodeling after myocardial ischemia‒reperfusion
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.91180
PMID:38323308
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术探讨了心肌缺血再灌注后巨噬细胞亚型及其在炎症和纤维化过程中的作用 | 首次鉴定出一种独特的S100a9巨噬细胞亚型，该亚型参与急性炎症和纤维化过程，并揭示了其在心肌缺血再灌注后的作用机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类中验证这些发现 | 探讨心肌缺血再灌注后巨噬细胞的异质性和转化机制 | 心肌缺血再灌注后的巨噬细胞及其在炎症和纤维化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用S100a9小鼠建立心肌缺血再灌注模型，并进行了骨髓来源的巨噬细胞再灌注实验 |
| 15170 | 2024-08-07 |
Tumor cell senescence-induced macrophage CD73 expression is a critical metabolic immune checkpoint in the aging tumor microenvironment
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.91119
PMID:38323313
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研究论文 | 本研究探讨了衰老细胞在肿瘤微环境中的代谢重塑作用，特别是肿瘤细胞诱导的肿瘤相关巨噬细胞CD73上调对腺苷积累的影响 | 首次揭示了衰老肿瘤微环境的代谢景观，特别是肿瘤细胞诱导的肿瘤相关巨噬细胞CD73上调对腺苷积累的影响 | NA | 探索从代谢角度增强衰老细胞诱导的抗肿瘤免疫的精确靶点 | 衰老细胞在肿瘤微环境中的代谢重塑作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术, 免疫荧光染色, 单细胞转录组测序 | NA | 肿瘤间质液, 临床样本 | 使用8 Gy×3放射治疗或顺铂化疗诱导的衰老模型, 以及10 Gy照射或顺铂处理的模型 |
| 15171 | 2024-08-04 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Dec-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
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研究论文 | 本研究分析了小鼠中与大肝脓肿形成相关的遗传和免疫决定因素 | 首次揭示了小鼠肝脓肿的形成过程及其与免疫细胞聚集的关系 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法直接类推到其他生物 | 确定宿主对肝脓肿形成的易感性决定因素 | C57BL品系小鼠，特别是C57BL/6N雌性小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 15172 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of Anopheles gambiae spermatogenesis defines the onset of meiotic silencing and premeiotic overexpression of the X chromosome
2023-08-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05224-z
PMID:37582841
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对Anopheles gambiae的精子发生过程进行了详细分析，定义了减数分裂沉默的开始及X染色体在减数分裂前细胞中的过度表达 | 揭示了X染色体在减数分裂前细胞中的过度表达，并记录了减数分裂沉默在精子发生后期细胞亚群中的开始 | 仅分析了少数生殖细胞特异性调控元件，且多数显示出泄漏表达，这可能影响当前遗传控制策略的效率 | 理解Anopheles gambiae生殖细胞的发育和遗传调控，以开发针对这一疟疾蚊媒的有效遗传控制策略 | Anopheles gambiae的精子发生过程及其遗传调控 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 八个不同的细胞集群及其相关生殖细胞类型 |
| 15173 | 2024-08-07 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.08.539879
PMID:37215034
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研究论文 | 本文通过使用稳态、新生和单细胞RNA测序策略，全面分析了雄性生殖细胞群体中的基因表达，揭示了RNA聚合酶II（Pol II）在精子分化早期暂停的必要性及其在调控基因活性和完成减数分裂中的作用。 | 发现RNA聚合酶II在精子分化早期暂停对于建立发育过程中的基因活性景观至关重要，并揭示了Pol II暂停在减数分裂调控中的新角色。 | NA | 旨在解析雄性生殖细胞发育过程中基因调控的机制，并为治疗相关不孕症提供新见解。 | 雄性生殖细胞及其在精子发生过程中的基因表达调控。 | NA | 不孕症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个雄性生殖细胞群体 |
| 15174 | 2024-08-07 |
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2023-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.01.538975
PMID:37205545
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研究论文 | 介绍了一种名为scDisInFact的深度学习框架，用于处理和预测多批次、多条件的单细胞RNA测序数据，该框架能够分离批次效应和条件效应 | scDisInFact能够同时执行批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测，这在现有方法中是独特的 | NA | 开发一种能够同时处理批次效应和条件效应的深度学习框架，以提高单细胞RNA测序数据整合和预测的准确性 | 多批次、多条件的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 15175 | 2024-08-07 |
An artificial neural network model to diagnose non-obstructive azoospermia based on RNA-binding protein-related genes
2023-04-24, Aging
DOI:10.18632/aging.204674
PMID:37116198
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研究论文 | 本文构建了一种基于RNA结合蛋白相关基因的人工神经网络模型，用于诊断非阻塞性无精症 | 首次开发了一种基于RNA结合蛋白DDX20和NCBP2的人工神经网络诊断模型，并在多个数据集上进行了验证 | NA | 研究RNA结合蛋白在非阻塞性无精症中的功能和诊断价值 | 非阻塞性无精症及其相关RNA结合蛋白 | 机器学习 | 男性不育症 | RNA测序 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 训练集包含58个睾丸样本，验证集包含多个公共数据集和44个临床样本，总计约500个样本 |
| 15176 | 2024-08-07 |
Assessing the effects of aging on the liver endothelial cell landscape using single-cell RNA sequencing
2023-02-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000021
PMID:36724124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝脏内皮细胞在老化过程中的转录组变化 | 首次详细描述了老化对肝脏内皮细胞分子调控机制的影响，并发现了两种特异性表达于老年小鼠内皮细胞的亚型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探究老化对肝脏内皮细胞分子机制的影响 | 肝脏内皮细胞及其在老化过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的肝脏内皮细胞 |
| 15177 | 2024-08-07 |
Exosomal proteomics identifies RAB13 as a potential regulator of metastasis for HCC
2023-01-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000006
PMID:36633475
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法和体内外实验，首次鉴定了RAB13作为肝细胞癌（HCC）来源外泌体中调控转移的关键蛋白 | 首次发现RAB13在HCC转移中的调控作用，并通过体内外实验验证了其功能 | NA | 探索癌症细胞来源的外泌体蛋白在肿瘤转移中的生物学功能和分子机制 | 肝细胞癌（HCC）的转移机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 批量基因表达分析、单细胞RNA测序数据分析、基因集富集分析 | NA | RNA测序数据 | 包括体外HCC细胞系和体内移植瘤小鼠模型 |
| 15178 | 2024-08-07 |
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.005
PMID:33207244
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研究论文 | 研究分析了正常器官捐赠者和COVID-19患者胰腺中SARS-CoV-2进入因子ACE2的表达情况 | 首次详细分析了COVID-19患者胰腺中ACE2的表达及其与糖尿病的可能关联 | 研究主要基于公共数据集和有限的样本，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨SARS-CoV-2感染与糖尿病之间的关系 | 胰腺中ACE2的表达及COVID-19患者的胰腺病理变化 | NA | COVID-19 | scRNA-seq, 荧光原位杂交, 蛋白质印迹, 免疫定位 | NA | RNA, 蛋白质 | 五个公共scRNA-seq胰腺数据集及来自正常人和COVID-19患者的胰腺组织 |
| 15179 | 2024-08-04 |
Integrating leiomyoma genetics, epigenomics, and single-cell transcriptomics reveals causal genetic variants, genes, and cell types
2024-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45382-0
PMID:38326302
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研究论文 | 本研究整合了基因组学、表观基因组学和单细胞转录组学，以揭示与子宫纤维瘤相关的遗传变异、基因和细胞类型 | 首次将多组学数据与特定位点的表观遗传编辑方法相结合，识别与疾病相关的基因和细胞类型 | 具体的遗传变异和基因靶点之间的因果关系仍然理解不足 | 探讨与子宫纤维瘤相关的遗传因素及其生物机制 | 与子宫纤维瘤相关的遗传变异和基因 | 数字病理学 | NA | CRISPR | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞基因表达数据 | 24个与子宫纤维瘤相关的风险位点，394个基因 |
| 15180 | 2024-08-07 |
The HSP90-MYC-CDK9 network drives therapeutic resistance in mantle cell lymphoma
2024-Feb-07, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00484-9
PMID:38326887
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研究论文 | 研究探讨了在套细胞淋巴瘤中，HSP90-MYC-CDK9网络如何驱动对Bruton酪氨酸激酶抑制剂和CAR-T疗法的抗药性 | 揭示了HSP90-MYC-CDK9网络是治疗抗性的主要驱动力，并提出了药物联合靶向HSP90和CDK9以减少MYC活性的策略 | NA | 解析套细胞淋巴瘤中对Bruton酪氨酸激酶抑制剂和CAR-T疗法的连续抗药性的潜在机制 | 套细胞淋巴瘤患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 66个样本来自25名患者 |