单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 15141 - 15160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15141 | 2024-08-07 |
Vitamin D3 reverses immune tolerance and enhances the cytotoxicity of effector T cells in coal pneumoconiosis
2024-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.115972
PMID:38218105
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研究论文 | 本研究探讨了维生素D3在煤工尘肺病中调节淋巴细胞功能的作用机制 | 首次揭示了维生素D3通过调节CD4+ T细胞分化和减少调节性T细胞数量，增强CD8+效应T细胞的细胞毒性，从而减轻肺纤维化和症状 | NA | 阐明维生素D3在煤工尘肺病中调节免疫状态的机制 | 煤工尘肺病中的淋巴细胞 | NA | 职业病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 15142 | 2024-08-05 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
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研究论文 | 本研究探讨了果蝇中全新基因的起源、进化和蛋白质结构的变化 | 结合高品质的全基因组比对和计算结构建模方法，识别出555个果蝇特有的全新基因候选者 | 对果蝇中特定族群的研究可能不适用于其他物种 | 研究果蝇中全新基因的起源和结构演变 | 果蝇D. melanogaster的全新基因候选者 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组序列 | 555个全新基因候选者 |
| 15143 | 2024-08-07 |
Integrative genomic analyses reveal putative cell type-specific targets of the Drosophila ets transcription factor Pointed
2024-Jan-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10017-7
PMID:38262913
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组单细胞和批量数据，识别了果蝇Ets转录因子Pointed的细胞类型特异性潜在靶点 | 首次通过结合染色质免疫沉淀与高通量测序（ChIP-seq）和单细胞基因组学数据（scRNA-seq和snATAC-seq），揭示了157个潜在的细胞类型特异性Pointed靶点及其功能增强子 | NA | 识别果蝇Ets转录因子Pointed的细胞类型特异性潜在靶点，以深入理解由表皮生长因子受体（Egfr）信号调控的复杂发育过程 | 果蝇Ets转录因子Pointed及其在眼盘发育中的作用 | 基因组学 | NA | ChIP-seq, scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因组数据 | 6,941个基因 |
| 15144 | 2024-08-05 |
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568157
PMID:38045273
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research paper | 该文章研究了肾单位祖细胞在肾脏分支形态发生过程中的自我更新和分化之间的节律性交替 | 创新点在于揭示了肾单位祖细胞的分化与更新之间的节律性模式以及与分支生长的同步关系 | 局限性在于研究主要基于小鼠模型，可能与人类有差异 | 研究肾单位祖细胞在肾脏发育中的动态变化与分支形态发生的关系 | 肾单位祖细胞及其在肾脏发育过程中的角色 | 数字病理 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠和人类干细胞来源的肾单位祖细胞类器官进行实验 |
| 15145 | 2024-08-07 |
FGL2 promotes tumour growth and attenuates infiltration of activated immune cells in melanoma and ovarian cancer models
2024-01-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-51217-1
PMID:38191799
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研究论文 | 本文研究了FGL2蛋白在黑色素瘤和卵巢癌模型中的作用，发现FGL2抑制免疫细胞的浸润并促进肿瘤生长 | 首次证明了FGL2缺失能增强肿瘤微环境中自然杀伤细胞的活性，并延长生存期 | 研究仅限于两种小鼠癌症模型，未来需在更多癌症类型中验证FGL2的作用 | 探讨FGL2在肿瘤微环境中的作用及其作为癌症治疗靶点的潜力 | FGL2蛋白在黑色素瘤和卵巢癌中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq | NA | RNA | 使用了Fgl2敲除小鼠进行实验 |
| 15146 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of head and neck carcinoma: Transcriptional landscape and prognostic model based on malignant epithelial cell features
2024-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301287RR
PMID:38085162
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析头颈部鳞状细胞癌的转录组特征及预后模型 | 首次揭示头颈部鳞状细胞癌中恶性上皮细胞特征与肿瘤微环境的相互作用，并开发了一种基于六个基因的预后模型 | 研究样本量较小，仅涉及七名患者及其相邻正常组织，可能影响结果的普适性 | 深入理解头颈部鳞状细胞癌肿瘤细胞及其微环境，以改善预后预测 | 七名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及一份相邻正常组织 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 七名头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及一份相邻正常组织 |
| 15147 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of epithelial cell and fibroblast cells from non- to metastatic lymph node OTSCC
2024-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202301724R
PMID:38169064
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了从非转移性到转移性淋巴结的口腔舌鳞状细胞癌（OTSCC）中的上皮细胞和成纤维细胞的异质性 | 发现了四种不同亚型的癌症相关成纤维细胞（CAFs），并确认了GAS和PTN通路在肿瘤转移进展中的作用 | NA | 旨在全面分析癌症相关成纤维细胞和上皮肿瘤细胞亚群在淋巴结转移性OTSCC中的作用 | 口腔舌鳞状细胞癌（OTSCC）中的上皮细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15148 | 2024-08-07 |
Thymic Carcinoma: Unraveling Neuroendocrine Differentiation and Epithelial Cell Identity Loss
2023-12-25, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16010115
PMID:38201543
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研究论文 | 本文探讨了胸腺癌的神经内分泌分化及上皮细胞身份丧失的基因表达特征 | 发现胸腺癌表现出偏向于簇细胞和离子细胞的神经内分泌表型，并鉴定了HDAC9和NFATC1作为神经内分泌组在成人胸腺上皮细胞和胸腺癌中的特征性表达 | 需要进一步研究HDAC9和NFATC1在胸腺上皮中的作用及其作为胸腺上皮肿瘤治疗靶点的潜力 | 探索胸腺癌的神经内分泌分化及上皮细胞身份丧失的机制 | 胸腺癌的基因表达特征及其与簇细胞、离子细胞和神经内分泌细胞的关系 | 数字病理学 | 胸腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自正常人胸腺的单细胞RNA测序数据集，并分析了公开的胸腺上皮细胞和肺癌的mRNA表达及甲基化状态数据 |
| 15149 | 2024-08-05 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532420
PMID:37425675
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研究论文 | 这篇文章研究了果蝇中新基因的起源和结构演化 | 该研究结合高质量全基因组比对、生物信息学分析和计算结构建模，提供了对特定谱系基因的系统性概述 | 对基因结构和功能起源的理解仍然有限，缺乏系统的研究 | 研究果蝇中新基因的起源、演化和蛋白质结构 | 研究特定谱系基因的蛋白质候选者 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Alphafold2, ESMFold, 分子动力学 | NA | 基因组数据 | 分析了555个基因候选者 |
| 15150 | 2024-08-07 |
Single-nuclei RNA-seq on human retinal tissue provides improved transcriptome profiling
2019-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12917-9
PMID:31848347
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序（snRNA-seq）技术对人类视网膜组织进行了转录组分析 | 本研究展示了单核RNA测序在人类冷冻组织中获取单细胞转录组的能力，相较于人类批量RNA测序或动物模型，提供了更深入的见解 | NA | 通过单核RNA测序技术解析复杂组织中的异质性 | 人类视网膜组织及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本，来自3名健康捐赠者，共5873个单核 |
| 15151 | 2024-08-07 |
Identification of Cell Type-Specific Effects of DNMT3A Mutations on Relapse in Acute Myeloid Leukemia
2023-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0093
PMID:37853686
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性髓系白血病（AML）不同阶段（诊断、完全缓解和复发）的骨髓单个核细胞，以探索DNMT3A突变在细胞类型特异性效应及其对AML复发的影响 | 本研究通过改进R882突变的靶向单细胞RNA测序检测，发现了从完全缓解到复发期间主要残留的突变细胞类型，并揭示了这些细胞与AML和白血病细胞相关的基因特征 | NA | 探索DNMT3A突变在急性髓系白血病中的细胞类型特异性效应及其对复发的影响 | 急性髓系白血病患者的骨髓单个核细胞 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自同一患者在不同AML阶段的骨髓单个核细胞 |
| 15152 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA-Seq Datasets: A Review of Computational Methods
2023-Feb-28, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2023.0009
PMID:36859475
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序数据集整合方法的概念和优缺点 | 提供了对不同整合方法的全面综述，强调了去除批次效应的方法学进展 | 未能深入探讨所有可能的整合方法和实际应用中的挑战 | 审视和总结单细胞RNA测序数据集整合的计算方法 | 针对公共库中单细胞RNA测序数据集的整合分析方法 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 15153 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics shows dose-dependent disruption of hepatic zonation by TCDD in mice
2023-01-31, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfac109
PMID:36222588
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研究论文 | 这篇文章使用单细胞转录组学研究TCDD对小鼠肝区分的剂量依赖性破坏。 | 文章通过单细胞核RNA测序和空间转录组学首次揭示了TCDD引起的剂量依赖性基因表达变化和肝区分的破坏。 | 本研究受限于使用小鼠模型，可能无法完全代表人类的生理和病理状态。 | 研究TCDD对小鼠肝脏细胞特异性和空间分布的影响。 | 研究对象为给药后接受TCDD处理的小鼠肝脏细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞核RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 131,613个细胞核 |
| 15154 | 2024-08-07 |
The Peripheral Immune Landscape in a Patient with Myocarditis after the Administration of BNT162b2 mRNA Vaccine
2022-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0031
PMID:35904026
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析，首次描述了接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎患者的周围免疫景观变化 | 首次使用单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序分析来描述接种BNT162b2 mRNA疫苗后心肌炎患者的周围免疫景观变化 | 研究样本仅为单一患者，可能影响结果的普遍性 | 探究BNT162b2 mRNA疫苗接种后心肌炎的发病机制 | 接种BNT162b2 mRNA疫苗后发生心肌炎患者的周围免疫景观 | NA | 心肌炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 单一患者 |
| 15155 | 2024-08-07 |
Transcriptional Heterogeneity of Cellular Senescence in Cancer
2022-Sep-30, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.0036
PMID:35983702
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析癌症细胞衰老相关基因表达异质性中的应用 | 利用scRNA-seq技术揭示了癌症细胞中衰老相关基因表达的多样性及其在肿瘤恶性转化中的作用 | NA | 探讨衰老细胞在肿瘤恶性转化中的作用及衰老相关基因在肿瘤微环境中的功能 | 癌症细胞及肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15156 | 2024-08-07 |
IL-13-programmed airway tuft cells produce PGE2, which promotes CFTR-dependent mucociliary function
2022-07-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159832
PMID:35608904
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研究论文 | 本文研究了IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响，发现IL-13能扩展和编程气道簇细胞向前列腺素E2代谢，进而促进囊性纤维化跨膜传导调节因子依赖的纤毛功能。 | 首次揭示了气道簇细胞在过敏性气道中调节上皮纤毛功能的作用。 | NA | 探讨IL-13在慢性2型炎症呼吸道疾病中对气道簇细胞的影响及其对纤毛功能的作用。 | 气道簇细胞及其在2型炎症中的作用。 | NA | 呼吸道疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用大量和单细胞RNA测序分析气道上皮和鼠模型。 |
| 15157 | 2024-08-07 |
Trophoblast Cell Subtypes and Dysfunction in the Placenta of Individuals with Preeclampsia Revealed by Single‑Cell RNA Sequencing
2022-May-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2021.0211
PMID:35289305
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了先兆子痫患者胎盘中滋养层细胞亚型及其功能异常的转录组变化 | 首次在单细胞水平上比较了健康对照组和先兆子痫组胎盘中滋养层细胞的转录组差异，并分析了相关的转录因子调控网络 | 研究主要集中在转录组水平，未涉及蛋白质水平或其他层面的功能验证 | 探究先兆子痫患者胎盘中滋养层细胞亚型的特异性转录组变化及其功能 | 胎盘组织中的滋养层细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 妊娠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 29,006个细胞，包括11种细胞类型 |
| 15158 | 2024-08-07 |
Gene Expression Profiling of the Habenula in Rats Exposed to Chronic Restraint Stress
2022-May-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2022.2257
PMID:35534192
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研究论文 | 本研究通过基因组范围的基因表达分析，研究了暴露于慢性束缚应激下的大鼠缰核的转录组变化 | 本研究首次识别了379个受慢性应激影响的差异表达基因（DEGs），并分析了这些基因在神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、昼夜节律同步和突触信号传导中的富集情况 | NA | 探讨慢性应激对大鼠缰核基因表达的影响及其在抑郁症发病机制中的作用 | 大鼠缰核的基因表达 | 神经科学 | 抑郁症 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 14天慢性束缚应激暴露的大鼠缰核样本 |
| 15159 | 2024-08-07 |
RAGE Inhibitors as Alternatives to Dexamethasone for Managing Cerebral Edema Following Brain Tumor Surgery
2022-03, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1007/s13311-022-01207-w
PMID:35226341
|
研究论文 | 研究了RAGE抑制剂在减少脑肿瘤手术后脑水肿中的作用，并比较了其与地塞米松的效果 | 发现RAGE抑制剂在减少神经炎症和血脑屏障破坏方面与地塞米松同样有效，且不会影响抗PD-1免疫疗法的效果 | 研究主要在动物模型和有限的临床样本中进行，需要进一步的人体临床试验验证 | 探索脑肿瘤手术后脑水肿管理的新方法 | RAGE受体及其配体在神经外科损伤后的炎症反应中的作用 | NA | 脑肿瘤 | Nanostring, 流式细胞术, qPCR, 免疫印迹, 单细胞RNA测序, ELISA | NA | 组织, 体液 | 小鼠模型和人类肿瘤组织及体液样本 |
| 15160 | 2024-08-07 |
Single-Cell Toolkits Opening a New Era for Cell Engineering
2021-Mar-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2021.0002
PMID:33795531
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）工具包的发展及其在细胞工程中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术的发展，使得研究人员能够以单细胞分辨率比较转录组，从而更深入地理解细胞功能 | 高吞吐量的单细胞'omics'工具的快速发展需要有效的假设验证策略 | 探讨细胞工程工具包的当前状态及其对单细胞和全基因组数据收集与分析的贡献 | 单细胞RNA测序工具包及其在细胞工程中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |