单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 15121 - 15140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15121 | 2024-08-05 |
Tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) deletion in myeloid cells augments cholestatic liver injury
2024-01-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52710-3
PMID:38273071
|
研究论文 | 本文探讨了肿瘤坏死因子相关的凋亡诱导配体(TRAIL)在骨髓细胞中的缺失如何加重胆汁淤积性肝损伤。 | 研究发现TRAIL源自招募的巨噬细胞，并抑制DR细胞扩展，从而限制胆汁淤积性肝损伤。 | 本文并未涉及湿剂量的不同或不同动物模型的比较，可能限制了其结果的广泛适用性。 | 研究TRAIL在骨髓细胞中的作用及其在胆汁淤积性肝损伤中的影响。 | 涉及Wild type (WT)、Trail和骨髓特异性Trail缺失的小鼠模型。 | 数字病理学 | 肝病 | 高维量子显微技术，空间转录组分析 | 小鼠模型 | 生物样本 | 包括Wild type、Trail和Trail缺失小鼠的多组小鼠 |
| 15122 | 2024-08-05 |
scCAN: Clustering With Adaptive Neighbor-Based Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data
2024 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3337231
PMID:38285569
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研究论文 | 提出了一种新的适应性邻域聚类基础的缺失值插补方法scCAN，用于单细胞RNA测序数据 | 本研究创新性地设计了一个方法，通过不断更新细胞相似性信息来改善缺失值的插补 | 未提及具体的局限性 | 研究单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 使用模拟和真实单细胞RNA测序数据进行研究 | 计算机视觉 | NA | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 四个模拟和八个真实的单细胞RNA-seq数据 |
| 15123 | 2024-08-05 |
Presence of onco-fetal neighborhoods in hepatocellular carcinoma is associated with relapse and response to immunotherapy
2024-Jan, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00672-2
PMID:38168935
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研究论文 | 本文研究了肝细胞癌中的肿瘤生态系统的癌胎编程及其与免疫治疗反应和复发的关系 | 首次提出POSTN外源性基质癌相关成纤维细胞作为关键的癌胎相互作用中心，并探讨其在肝细胞癌复发和免疫治疗反应中的影响 | 未明确阐述样本量与研究设计的具体限制 | 研究肝细胞癌中的癌胎邻域与复发及免疫治疗反应的关系 | 研究特定细胞亚群，包括POSTN CAFs、FOLR2巨噬细胞和PLVAP内皮细胞在肝细胞癌复发和免疫治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、整体RNA测序 | NA | NA | NA |
| 15124 | 2024-08-05 |
An emerging biomarker for the diagnosis and treatment of esophageal squamous cell carcinoma - Aurora A
2024-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107759
PMID:38043467
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研究论文 | 研究表明Aurora A在食管鳞状细胞癌中是一种潜在的预后和治疗生物标志物 | 本研究首次揭示了Aurora A在食管鳞状细胞癌中的作用及其对细胞增殖和药物敏感性的影响 | 本研究仅基于公共数据库的数据，可能存在数据集的局限性 | 探讨Aurora A在食管鳞状细胞癌中的分子机制及其作为生物标志物的潜力 | 研究对象为食管鳞状细胞癌患者的RNA-seq数据 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA-seq | NA | 文本 | 来自公共数据库的RNA-seq数据集，具体样本量未明确提供 |
| 15125 | 2024-08-07 |
Genetic variants in BCL-2 family genes influence the risk of non-syndromic cleft lip with or without cleft palate
2024-Jan, Birth defects research
IF:1.6Q4
DOI:10.1002/bdr2.2288
PMID:38108593
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研究论文 | 本研究探讨了BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险之间的关联 | 发现了位于增强子区域的rs3943258与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂的风险相关，并表现出BCL2的eQTL效应 | NA | 研究BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险之间的关联 | BCL-2家族基因中的遗传变异与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂风险 | 遗传学 | 口腔疾病 | 多标记基因组注释的多标记分析（Multi-marker Analysis of GenoMic Annotation）、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因组数据、RNA测序数据 | 第一阶段队列包括565例病例和1269例对照，候选SNPs通过额外的dbGaP病例-父母三联体进行复制 |
| 15126 | 2024-08-07 |
Gclc as a Marker for Injured Distal Nephron in Ischemia-Reperfusion Induced Acute Kidney Injury
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S451402
PMID:38313210
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转录组学分析，探讨了缺血-再灌注诱导的急性肾损伤中远端肾小管的作用，并验证了Gclc作为损伤远端肾小管的潜在标志物。 | 首次识别了LOH-Inj和DCT-Inj亚型，并发现Gclc在多种急性肾损伤模型中的高表达，特别是在损伤的远端肾小管中。 | NA | 理解远端肾小管在急性肾损伤中的作用，并识别损伤远端肾小管的标志物，以揭示肾脏损伤机制并寻找新的治疗靶点。 | 远端肾小管在急性肾损伤中的作用及损伤标志物Gclc。 | NA | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了缺血-再灌注、单侧输尿管阻塞、顺铂、草酸钠和脂多糖诱导的AKI小鼠模型及肾脏转录组样本。 |
| 15127 | 2024-08-05 |
Identification and targeting of cancer-associated fibroblast signature genes for prognosis and therapy in Cutaneous melanoma
2023-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107597
PMID:37875042
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研究论文 | 本研究探讨了与皮肤黑素瘤相关的癌症相关成纤维细胞（CAF）标志基因，并提出潜在的治疗靶点 | 首次识别了FBLN1和COL5A1作为皮肤黑素瘤的CAF特异性生物标志物，提供了新的治疗方向 | 尚需更多临床数据验证所识别的CAF标志基因与预后的相关性 | 探索皮肤黑素瘤中CAF标志基因的潜力并提出治疗靶点 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 皮肤黑素瘤 | 加权基因共表达网络分析、单细胞测序分析、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15128 | 2024-08-07 |
BHLHE40 drives protective polyfunctional CD4 T cell differentiation in the female reproductive tract against Chlamydia
2023-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.02.565369
PMID:37961221
|
研究论文 | 研究探讨了BHLHE40蛋白在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 首次揭示了BHLHE40在调节CD4 T细胞多功能性分化中的关键作用 | NA | 研究BHLHE40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | BHLHE40蛋白在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序结合TCR分析 | NA | RNA | 使用BHLHE40缺陷小鼠进行实验 |
| 15129 | 2024-08-05 |
Exercise Training Reduces the Inflammatory Response and Promotes Intestinal Mucosa-Associated Immunity in Lynch Syndrome
2023-11-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-23-0088
PMID:37724990
|
研究论文 | 本研究评估了一项为期12个月的有氧运动干预对林奇综合症患者免疫系统的影响 | 首次明确了运动对高癌症风险群体免疫系统的生物学影响 | 研究为非随机和序贯干预分配，样本量较小 | 探讨运动干预在林奇综合症患者中的潜在益处 | 21名患有林奇综合症的患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 代谢组学、mRNA测序、空间转录组学 | NA | 生物标志物数据 | 21名患者 |
| 15130 | 2024-08-07 |
Multi-dimensional single-cell characterization revealed suppressive immune microenvironment in AFP-positive hepatocellular carcinoma
2023-Jun-19, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00563-x
PMID:37336873
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了AFP阴性和阳性肝细胞癌及其邻近正常组织的特征，揭示了AFP阳性肝细胞癌中抑制性免疫微环境的机制 | 本研究首次揭示了AFP阳性肝细胞癌中TAM-SPP1的富集及其在调节免疫微环境中的作用，并提出SPP1-CD44轴作为治疗靶点 | NA | 旨在识别AFP阴性和阳性肝细胞癌的特征及其潜在治疗靶点 | AFP阴性肝细胞癌（ANHC）、AFP阳性肝细胞癌（APHC）及其邻近正常组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6个ANHC样本、6个APHC样本和4个邻近正常组织样本，以及30个HCC样本和59个HCC样本用于进一步验证 |
| 15131 | 2024-08-07 |
EPISCORE: cell type deconvolution of bulk tissue DNA methylomes from single-cell RNA-Seq data
2020-09-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02126-9
PMID:32883324
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研究论文 | 本文介绍了一种名为EPISCORE的计算算法，用于从单细胞RNA测序数据中对大量组织DNA甲基化数据进行细胞类型反卷积 | EPISCORE算法通过应用概率性的表观遗传模型，利用单细胞RNA测序组织图谱生成组织特异性的DNA甲基化参考矩阵，从而实现对大量组织数据的细胞类型比例和细胞类型特异性差异甲基化信号的量化 | NA | 开发一种算法，用于解决细胞类型异质性对表观基因组数据解释的挑战 | 大量组织DNA甲基化数据和单细胞RNA测序数据 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率性表观遗传模型 | DNA甲基化数据 | 多个表观基因组研究和组织类型 |
| 15132 | 2024-08-07 |
MYC Drives Temporal Evolution of Small Cell Lung Cancer Subtypes by Reprogramming Neuroendocrine Fate
2020-07-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.05.001
PMID:32473656
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞转录组分析，揭示了MYC在小细胞肺癌亚型动态演化中的驱动作用 | 首次揭示了MYC通过激活Notch信号通路，促使小细胞肺癌从ASCL1到NEUROD1再到YAP1状态的时间性转变 | NA | 探讨MYC在小细胞肺癌亚型演化中的作用机制 | 小细胞肺癌的分子亚型及其动态演化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠和人类模型进行研究 |
| 15133 | 2024-08-07 |
Nuclear MYH9-induced CTNNB1 transcription, targeted by staurosporin, promotes gastric cancer cell anoikis resistance and metastasis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.46001
PMID:32685004
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研究论文 | 本文通过多种技术手段研究了MYH9在胃癌细胞中的表达及其对细胞凋亡抵抗和转移的影响，并探讨了staurosporin对其的抑制作用。 | 首次揭示了核定位的MYH9通过促进CTNNB1转录来增强胃癌细胞的凋亡抵抗和转移能力，并发现staurosporin可以作为潜在的治疗药物。 | NA | 探讨MYH9在胃癌转移中的作用及其潜在的治疗策略。 | 胃癌细胞及胃癌患者的转移组织。 | 数字病理学 | 胃癌 | 2-DIGE, MALDI-TOF/TOF MS, 单细胞转录组, 免疫荧光, 免疫透射电子显微镜, 染色质分离, 共免疫沉淀, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告, 琼脂糖-寡核苷酸拉下, 流式细胞术, 细胞凋亡检测 | NA | 蛋白质, 转录组 | 包括正常胃黏膜、原发性胃癌及腹膜转移组织，以及胃癌细胞系和裸鼠模型。 |
| 15134 | 2024-08-07 |
Bulk RNA-sequencing, single-cell RNA-sequencing analysis, and experimental validation reveal iron metabolism-related genes CISD2 and CYP17A1 are potential diagnostic markers for recurrent pregnancy loss
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148168
PMID:38244949
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，结合实验验证，发现铁代谢相关基因CISD2和CYP17A1可能是复发性流产的潜在诊断标志物 | 首次揭示CISD2和CYP17A1基因在复发性流产中的作用，并验证了它们作为诊断和治疗标志物的潜力 | NA | 探索复发性流产的潜在诊断和治疗标志物 | 复发性流产患者的铁代谢相关基因 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及520个铁代谢相关基因，具体样本数量未详细说明 |
| 15135 | 2024-08-05 |
Can uric acid affect the immune microenvironment in bladder cancer? A single-center multi-omics study
2024-Mar, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23664
PMID:38018692
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研究论文 | 本研究探讨尿酸在膀胱癌免疫微环境中的作用 | 建立了与尿酸相关的11基因特征，并开发了用于预测膀胱癌患者生存率的命名图 | 仅在单中心进行研究，样本量有限 | 探索尿酸在膀胱癌代谢和免疫治疗中的影响 | 39名接受PD-1治疗的膀胱癌患者和169名接受根治性膀胱切除术的患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，流式细胞术 | 小鼠模型 | 基因组数据，免疫细胞数据 | 39名膀胱癌患者和169名接受根治性膀胱切除术的患者 |
| 15136 | 2024-08-07 |
Revealing PPP1R12B and COL1A1 as piRNA pathway genes contributing to abdominal aortic aneurysm through integrated analysis and experimental validation
2024-Mar-01, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2023.148068
PMID:38070790
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学方法发现并验证了piRNA通路基因PPP1R12B和COL1A1作为腹主动脉瘤的生物标志物，并探讨了其可能的分子机制 | 首次揭示了piRNA通路基因在腹主动脉瘤中的作用，并验证了PPP1R12B和COL1A1作为诊断标志物的潜力 | 需要进一步的临床试验来验证这些基因作为诊断标志物的有效性 | 探索piRNA通路基因在腹主动脉瘤中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 腹主动脉瘤及其相关piRNA通路基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 蛋白质印迹, scRNA-seq | 多因素逻辑回归, 极端梯度提升, 人工神经网络 | 基因表达数据 | 涉及腹主动脉瘤和正常血管组织的样本，以及小鼠腹主动脉瘤模型 |
| 15137 | 2024-08-07 |
T-cell infiltration and its regulatory mechanisms in cancers: insights at single-cell resolution
2024-Feb-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02960-w
PMID:38303018
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术研究肿瘤浸润T细胞及其调控机制的最新进展 | 采用单细胞RNA测序技术进行高分辨率分析，揭示了不同表型免疫细胞及其微环境因素的精确组成 | NA | 探讨影响T细胞浸润的因素，以理解肿瘤免疫并提高癌症免疫治疗的效果 | 肿瘤浸润T细胞及其调控机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 15138 | 2024-08-07 |
A single cell RNAseq benchmark experiment embedding "controlled" cancer heterogeneity
2024-Feb-02, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03002-y
PMID:38307867
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研究论文 | 本文介绍了一个基于10X Genomics平台的单细胞RNA测序实验，通过使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系，创建了一个受控的癌症异质性环境 | 本研究提供了一个全面的框架，用于开发和验证通过单细胞RNA测序分析癌症异质性的方法 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战，特别是细胞注释和肿瘤亚群识别 | 肺癌细胞系，表达七种不同驱动基因（EGFR, ALK, MET, ERBB2, KRAS, BRAF, ROS1） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用表达七种不同驱动基因的肺癌细胞系 |
| 15139 | 2024-08-05 |
Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03850-x
PMID:38087072
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研究论文 | 本文使用空间转录组学技术研究了养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色局部肌肉变化的细胞异质性 | 研究揭示了红色和黑色肌肉变色中的相似分子机制，并展示了不同样本类型中基因的独特表达模式 | 本研究未提及具体样本量和实验条件的限制 | 研究养殖大西洋鲑鱼肌肉的病理条件和细胞异质性 | 养殖大西洋鲑鱼的红色和黑色肌肉局部变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 15140 | 2024-08-07 |
Correction to: Cellular heterogeneity in red and melanized focal muscle changes in farmed Atlantic salmon (Salmo salar) visualized by spatial transcriptomics
2024-Feb, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-023-03856-5
PMID:38158442
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |