单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31938 篇文献，本页显示第 15081 - 15100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15081 | 2024-09-13 |
Transcriptome Analysis Reveals a Two-Gene Signature Links to Motor Progression and Alterations of Immune Cells in Parkinson's Disease
2023, Journal of Parkinson's disease
DOI:10.3233/JPD-223454
PMID:36591658
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了与帕金森病运动进展和免疫细胞变化相关的双基因标志物 | 本研究首次通过转录组分析识别出与帕金森病运动进展相关的双基因标志物，并探讨了其与免疫细胞变化的关系 | 本研究仅基于两个队列的血液转录组数据，样本量有限，且未涉及其他组织或细胞类型的分析 | 揭示转录组在帕金森病患者运动障碍进展中的潜在作用 | 帕金森病患者的运动进展和免疫细胞变化 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 两个队列的帕金森病患者和健康对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 15082 | 2024-09-13 |
Epididymis cell atlas in a patient with a sex development disorder and a novel NR5A1 gene mutation
2023 Jan-Feb, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202226
PMID:35546286
|
研究论文 | 研究描述了一名患有性发育障碍（DSD）的46,XY患者中，由于NR5A1基因的新型杂合突变导致的附睾细胞图谱变化 | 首次报道了NR5A1基因突变导致的附睾细胞图谱变化，并揭示了上皮-间质转化（EMT）过程与附睾上皮细胞丢失和成纤维细胞增多的关联 | 研究仅基于单一病例，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在描述一名46,XY DSD患者中由于NR5A1基因突变导致的附睾细胞图谱变化 | 附睾细胞图谱、NR5A1基因突变、上皮-间质转化（EMT）过程 | 基因组学 | 性发育障碍 | 下一代测序（NGS）、微流控单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1名46,XY DSD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 15083 | 2024-09-13 |
CCPLS reveals cell-type-specific spatial dependence of transcriptomes in single cells
2022-10-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac599
PMID:36063454
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CCPLS的统计框架，用于基于空间转录组数据识别细胞间通信对高变异基因表达变异性的影响 | CCPLS通过偏最小二乘回归模型量化了多个相邻细胞类型对高变异基因表达变异性的影响，并提供了生物学可解释的见解 | 现有的计算方法在量化和解释性方面存在局限，未关注高变异基因或考虑多个相邻细胞类型的影响 | 揭示细胞间通信对单细胞转录组空间依赖性的影响 | 高变异基因的细胞间表达变异性 | 生物信息学 | NA | 空间转录组 | 偏最小二乘回归 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15084 | 2024-09-13 |
ZIP1+ fibroblasts protect lung cancer against chemotherapy via connexin-43 mediated intercellular Zn2+ transfer
2022-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33521-4
PMID:36207295
|
研究论文 | 研究揭示了ZIP1阳性成纤维细胞通过连接蛋白-43介导的细胞间Zn2+转移，保护肺癌细胞免受化疗的影响 | 首次发现ZIP1阳性成纤维细胞在化疗后富集，并通过连接蛋白-43增强间隙连接形成，导致肺癌细胞的化疗耐药性 | NA | 探讨肿瘤基质细胞相互作用对癌症进展和治疗反应的影响 | ZIP1阳性肿瘤相关成纤维细胞与肺癌细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15085 | 2024-09-13 |
Functional inference of gene regulation using single-cell multi-omics
2022-Sep-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100166
PMID:36204155
|
研究论文 | 本文通过应用scATAC-seq和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，研究了静息和刺激状态下的人类血液细胞的基因调控功能 | 开发了功能性基因调控推断框架（FigR），用于整合多组学数据，推断基因调控网络（GRN）并识别候选转录因子（TF）调控因子 | NA | 研究细胞在环境刺激下基因表达的协调控制 | 静息和刺激状态下的人类血液细胞 | 基因组学 | NA | scATAC-seq, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 功能性基因调控推断框架（FigR） | 单细胞多组学数据 | 约91,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 15086 | 2024-09-13 |
Single-cell analysis of endometriosis reveals a coordinated transcriptional programme driving immunotolerance and angiogenesis across eutopic and ectopic tissues
2022-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-022-00961-5
PMID:35864314
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研究论文 | 研究分析了子宫内膜异位症中单细胞转录组，揭示了驱动免疫耐受和血管生成的协调转录程序 | 首次在单细胞转录组水平上全面分析了子宫内膜异位症的微环境，识别了新的细胞亚群和功能 | 研究样本仅限于接受激素治疗的个体，可能限制了结果的普适性 | 揭示子宫内膜异位症的病理生理机制，为早期诊断和治疗提供新线索 | 子宫内膜异位症的腹膜和卵巢病变及其与正常子宫内膜的比较 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14名个体，共122,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 15087 | 2024-09-13 |
The eternal quest for self-improvement of somatic cells
2022-Feb-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2022.100094
PMID:36778659
|
研究论文 | 本文研究了体细胞突变驱动癌细胞转化的进化过程 | 结合类器官技术、前瞻性条形码标记和单细胞测序来研究体细胞克隆的进化 | 体细胞突变驱动癌细胞转化的序列事件理解不足 | 研究体细胞突变驱动癌细胞转化的进化过程 | 体细胞克隆的进化 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15088 | 2024-09-11 |
SLC2A1 boosts the resistance of non-small cell lung cancer to taxanes by stimulating the formation of EPCAM+ cancer stem-like cells via glycolysis
2024-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102082
PMID:39126936
|
研究论文 | 研究SLC2A1通过激活糖酵解促进EPCAM+癌症干细胞样细胞的形成，从而增强非小细胞肺癌对紫杉烷类药物的耐药性 | 揭示了SLC2A1在非小细胞肺癌中通过激活糖酵解促进癌症干细胞样细胞形成的新机制 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 探讨SLC2A1在非小细胞肺癌对紫杉烷类药物耐药性中的作用机制 | 非小细胞肺癌细胞、SLC2A1表达、癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 流式细胞术、代谢组学、单细胞测序、细胞通讯分析 | NA | 细胞 | 涉及多个数据集和内部收集的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 15089 | 2024-09-11 |
GTF2H5 Identified as a crucial synthetic lethal target to counteract chemoresistance in colorectal cancer
2024-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102097
PMID:39173480
|
研究论文 | 本文研究了合成致死基因GTF2H5在结直肠癌化疗耐药中的作用，并探讨了其在克服化疗耐药中的潜在治疗靶点 | 首次识别GTF2H5为结直肠癌化疗耐药的关键合成致死靶点 | 实验验证仅初步，需进一步深入研究GTF2H5在化疗耐药中的具体机制 | 探讨合成致死基因在结直肠癌化疗耐药中的作用，寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌患者及其化疗耐药相关基因 | 癌症研究 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自UCSC和GEO数据库的结直肠癌患者数据，以及来自Tumor Immunology Single Cell Center数据库的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 15090 | 2024-09-11 |
6-Phosphogluconate dehydrogenase promotes glycolysis and fatty acid synthesis by inhibiting the AMPK pathway in lung adenocarcinoma cells
2024-Oct-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217177
PMID:39179096
|
研究论文 | 研究探讨了6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶（PGD）在肺腺癌（LUAD）细胞中的作用及其机制 | 首次揭示了IQGAP1是PGD的新型相互作用蛋白，并阐明了PGD通过竞争性结合IQGAP1的IQ域来降低p-AMPK水平，从而促进糖酵解和脂肪酸合成的机制 | NA | 探讨PGD在肺腺癌中的功能及其分子机制 | 肺腺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序、免疫沉淀-质谱（IP-MS） | NA | 组织微阵列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15091 | 2024-09-11 |
XgCPred: Cell type classification using XGBoost-CNN integration and exploiting gene expression imaging in single-cell RNAseq data
2024-Oct, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2024.109066
PMID:39180857
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为XgCPred的新方法，结合XGBoost和卷积神经网络（CNN）进行单细胞RNA测序数据的细胞类型分类 | XgCPred通过结合XGBoost和CNN，利用基因表达图像的层次结构，提高了细胞类型分类的准确性 | NA | 开发一种高效且准确的细胞类型分类方法，以应对单细胞RNA测序数据中的复杂性和多样性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | XGBoost和CNN | 基因表达图像 | 多个单细胞RNA测序数据集，每个数据集具有不同的细胞数量、基因表达多样性和细胞异质性 | NA | NA | NA | NA |
| 15092 | 2024-09-11 |
Up-regulated DSG2 promotes tumor growth and reduces immune infiltration in cervical cancer
2024-Oct, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2024.155554
PMID:39226803
|
研究论文 | 本文探讨了DSG2在宫颈癌中的功能机制及其对肿瘤生长和免疫浸润的影响 | 首次全面探索DSG2在宫颈癌中的功能机制，发现其上调与不良预后和免疫细胞浸润减少相关 | 实验主要在体外进行，缺乏体内实验验证 | 探究DSG2在宫颈癌中的功能机制及其对肿瘤生长和免疫浸润的影响 | DSG2在宫颈癌中的表达、预后、基因突变及潜在信号通路 | NA | 宫颈癌 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 收集的宫颈癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 15093 | 2024-09-11 |
Human RP105 monoclonal antibody enhances antigen-specific antibody production in unique culture conditions
2024-Sep-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.110649
PMID:39246445
|
研究论文 | 研究了在特定培养条件下，人RP105单克隆抗体增强抗原特异性抗体产生的能力 | 建立了新的培养条件，使得人B细胞在ɑhRP105的作用下被强烈激活，并成功检测到针对血型碳水化合物、ɑGal和SARS-CoV-2的特异性抗体产生 | 研究主要集中在体外培养条件下，尚未在临床环境中验证其效果 | 探讨人RP105单克隆抗体在特定条件下激活B细胞并促进抗体产生的能力 | 人B细胞、RP105单克隆抗体、CpGDNA | NA | 移植排斥、自身免疫疾病 | 液相色谱-电喷雾电离串联质谱、单细胞RNA测序、定量实时PCR | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15094 | 2024-09-11 |
DeepKINET: a deep generative model for estimating single-cell RNA splicing and degradation rates
2024-Sep-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03367-8
PMID:39237934
|
研究论文 | 提出了一种名为DeepKINET的深度生成模型，用于估计单细胞RNA剪接和降解速率 | DeepKINET能够在单细胞分辨率下估计剪接和降解速率，并优于现有的方法 | NA | 研究RNA剪接和降解速率在单细胞水平上的变化及其对基因表达调控的影响 | 单细胞RNA剪接和降解速率 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度生成模型 | RNA-seq数据 | 包括前脑和乳腺癌数据，以及红系细胞中的剪接因子突变数据 | NA | NA | NA | NA |
| 15095 | 2024-09-11 |
Single-cell RNA sequencing explored potential therapeutic targets by revealing the tumor microenvironment of neuroblastoma and its expression in cell death
2024-Sep-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01286-5
PMID:39235657
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示神经母细胞瘤的肿瘤微环境及其在细胞死亡中的表达，探索潜在的治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面研究神经母细胞瘤，并分析了新的细胞死亡途径cuproptosis，以寻找新的临床治疗靶点 | NA | 通过单细胞RNA测序和cuproptosis分析，揭示神经母细胞瘤的肿瘤微环境，寻找新的治疗靶点 | 神经母细胞瘤及其肿瘤微环境中的神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自神经母细胞瘤患者的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 15096 | 2024-09-11 |
A Bayesian framework for inferring dynamic intercellular interactions from time-series single-cell data
2024-Sep-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279126.124
PMID:39237300
|
研究论文 | 本文介绍了一种贝叶斯框架DIISCO，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中推断动态细胞间相互作用 | DIISCO框架利用结构化高斯过程回归来揭示不同细胞类型之间的时序相互作用，并结合受体-配体复合物的先验知识 | NA | 研究细胞间通信及其随时间的变化，以理解正常发育、疾病进展和治疗反应等生物过程的协调 | 细胞间相互作用及其时间动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯框架 | 时间序列数据 | 包括来自T细胞与淋巴瘤细胞共培养的新数据 | NA | NA | NA | NA |
| 15097 | 2024-09-11 |
Inference of single-cell network using mutual information for scRNA-seq data analysis
2024-Sep-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05895-3
PMID:39237886
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于互信息的单细胞网络构建方法SINUM，用于分析scRNA-seq数据 | SINUM通过估计基因间的互信息来确定基因在特定细胞中的依赖性或独立性，相比现有方法在细胞类型识别上表现更优 | NA | 构建单细胞网络以揭示生物系统的动态变化和细胞间的异质性 | scRNA-seq数据中的基因表达网络 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 互信息 | 基因表达数据 | 涉及不同细胞数量的多个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 15098 | 2024-09-11 |
Enhanced osteogenic differentiation in 3D hydrogel scaffold via macrophage mitochondrial transfer
2024-Sep-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-02757-1
PMID:39237942
|
研究论文 | 评估一种新型3D生物仿生水凝胶支架在促进骨折愈合中的效果 | 通过巨噬细胞线粒体转移增强3D水凝胶支架的成骨分化能力 | NA | 评估新型3D生物仿生水凝胶支架在促进骨折愈合中的效果 | 3D生物仿生水凝胶支架、巨噬细胞、骨髓间充质干细胞、骨折愈合 | 生物医学工程 | 骨折 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 体外实验使用骨髓间充质干细胞，体内实验使用骨折小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 15099 | 2024-09-11 |
Loss of Annexin A1 in macrophages restrains efferocytosis and remodels immune microenvironment in pancreatic cancer by activating the cGAS/STING pathway
2024-Sep-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-009318
PMID:39237260
|
研究论文 | 研究了 Annexin A1 在胰腺癌中的作用，发现其在巨噬细胞中的缺失通过激活 cGAS/STING 通路抑制了吞噬作用并重塑了免疫微环境 | 揭示了巨噬细胞中 Annexin A1 在胰腺癌中的新作用，通过调节肿瘤相关巨噬细胞的吞噬作用促进抗肿瘤免疫反应 | NA | 研究 Annexin A1 在胰腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 胰腺癌患者样本和 myeloid-specific ANXA1-knockout 小鼠 | NA | 胰腺癌 | 免疫组织化学、免疫荧光、单细胞 RNA 测序、流式细胞术 | NA | 组织样本、细胞 | 151 例胰腺癌患者样本和 myeloid-specific ANXA1-knockout 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 15100 | 2024-09-11 |
Dissecting viral infections, one cell at a time, by single-cell technologies
2024 Sep-Oct, Microbes and infection
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.micinf.2023.105268
PMID:38008398
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综述 | 本文综述了单细胞基因组技术，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）在病毒感染研究中的应用 | 探讨了单细胞技术在病毒学中的创新应用，特别是在COVID-19大流行期间的研究 | 技术限制、挑战及其解决方案 | 详细介绍单细胞水平研究病毒感染的优势，以及如何利用scRNA-seq技术实现这一目标 | 病毒与宿主的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |