单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
15081 2024-08-07
Compartmentalization and synergy of osteoblasts drive bone formation in the regenerating fin
2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向成骨细胞消融和电子显微镜技术,探讨了斑马鱼再生鳍中表皮、成骨细胞和非成骨细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 研究揭示了再生鳍中成骨细胞的来源及其在再生过程中的分工和协同作用,以及再生受损时的检测和补偿机制 NA 探讨斑马鱼再生鳍中细胞的谱系关系及其在再生过程中的作用 斑马鱼再生鳍中的表皮细胞、成骨细胞和非成骨细胞 NA NA 单细胞RNA测序、谱系追踪、靶向消融、电子显微镜 NA RNA NA
15082 2024-08-07
Comparative transcriptomic analysis of bovine mesenchymal stromal cells reveals tissue-source and species-specific differences
2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞的转录组特征,并探讨了其与马和人类间充质干细胞的异同 首次系统比较了不同来源的牛间充质干细胞的转录组特征,并揭示了其与人类间充质干细胞的相似性,为牛作为非传统动物模型用于间充质干细胞研究提供了依据 NA 探讨牛间充质干细胞的转录组特征及其与人类和马间充质干细胞的异同 牛间充质干细胞及其与人类和马间充质干细胞的转录组特征 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 来自脂肪组织、骨髓和外周血的牛间充质干细胞,以及来自相同组织的马间充质干细胞和人类及小鼠的骨髓间充质干细胞
15083 2024-08-07
Delivery of Interferon β-Encoding Plasmid via Lipid Nanoparticle Restores Interferon β Expression to Enhance Antitumor Immunity in Colon Cancer
2024-Feb-06, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本文研究通过脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒,以恢复干扰素β表达并增强结直肠癌的抗肿瘤免疫 利用脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒,增强肿瘤免疫原性和T细胞效应功能,抑制结直肠癌生长 NA 测试通过阳离子脂质纳米颗粒递送干扰素β编码质粒至肿瘤,恢复干扰素β表达以抑制肿瘤免疫逃逸的效果 结直肠癌细胞及肿瘤微环境中的免疫细胞 数字病理学 结直肠癌 RNA-Seq, scRNA-Seq NA RNA 涉及人类结直肠肿瘤组织和细胞,以及小鼠模型
15084 2024-08-05
Gut microbiota-derived LCA mediates the protective effect of PEDV infection in piglets
2024-Feb-05, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究探讨了肠道微生物群与仔猪对PEDV感染的抵抗力之间的关系 发现LCA在炎症中发挥保护作用,并通过影响肠道T细胞群体来增强抗病毒效果 实验主要集中在猪的模型上,缺乏对其他动物或人类的广泛适用性研究 调查肠道微生物群在猪仔对PEDV感染抵抗力中的作用 猪仔的肠道微生物群及其对猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染的反应 数字病理学 NA 单细胞转录组学,16S扩增子测序,宏基因组学,非靶向代谢组学 NA NA NA
15085 2024-08-07
Cellular Senescence Contributes to the Progression of Hyperoxic Bronchopulmonary Dysplasia
2024-Feb, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本文研究了细胞衰老在超氧环境下支气管肺发育不良(BPD)进展中的作用 首次提出细胞衰老在BPD进展中的重要作用,并探讨了减少髓过氧化物酶毒性氧化物产生、内质网应激和减轻细胞衰老作为潜在治疗策略的可能性 NA 探讨细胞衰老在超氧环境下支气管肺发育不良进展中的作用及其潜在治疗策略 人类肺部解剖样本和Sprague-Dawley大鼠幼崽 NA 支气管肺发育不良 NA NA 组织学、转录组学和免疫印迹数据 人类肺部解剖样本和大鼠幼崽
15086 2024-08-05
Timing and precision of rattlesnake spinal motoneurons are determined by the KV72/3 potassium channel
2024-01-22, Current biology : CB IF:8.1Q1
研究论文 该文章探讨了响尾蛇运动神经元的生理特性及其对新型行为的影响 研究表明,响尾蛇体部和尾部的运动神经元具有根本不同的生理特性,这对于超快速肌肉的高时间精度控制是至关重要的 单细胞RNA测序未能揭示KV7通道表达的差异,可能限制了对其在生理学影响中的理解 探讨响尾蛇运动模式发生改变的生物机制 响尾蛇的运动神经元及其在体部和尾部的不同特性 数字病理学 NA 补丁钳记录电生理学 NA NA NA
15087 2024-08-07
Single-cell profiling of the pig cecum at various developmental stages
2024-Jan-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,对不同发育阶段的猪盲肠细胞进行了全面的转录组分析 首次揭示了猪盲肠在不同发育阶段的单细胞基因表达图谱,并发现了多种细胞类型及其特异性基因和转录因子 NA 探究猪盲肠在不同发育阶段的细胞异质性和功能 猪盲肠在不同发育阶段的细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 45,572个细胞,来自7个不同发育阶段的猪盲肠样本
15088 2024-08-05
Construction and validation of a mitochondria-associated genes prognostic signature and immune microenvironment characteristic of sepsis
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本文研究了与脓毒症相关的线粒体基因预后模型及其免疫微环境特征 建立了脓毒症的线粒体预后模型,并探讨了其与免疫微环境的关系 尚未明确线粒体与脓毒症免疫微环境之间的所有交互机制 旨在构建线粒体相关基因的预后模型来预测脓毒症患者的预后 研究对象为脓毒症患者的临床血样和线粒体相关基因 数字病理学 脓毒症 单细胞测序 NA 临床血样 5个与脓毒症相关的线粒体基因
15089 2024-08-05
Identifying the critical oncogenic mechanism of LDHA based on a prognostic model of T-cell synthetic drivers
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了与T细胞合成驱动因子相关的预后模型在肺腺癌中的重要性 首次展示了LDHA在肺腺癌恶性进展中的关键作用,并开发了一个相关的预后模型 缺乏对其他类型肿瘤的综合分析,可能对广泛应用有所限制 改善肺腺癌的免疫疗法效果 关注肺腺癌患者的T细胞合成驱动因子 数字病理学 肺癌 单细胞测序 Lasso Cox回归模型 临床数据 NA
15090 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing indicates cordycepin remodels the tumor immune microenvironment to enhance TIGIT blockade's anti-tumor effect in colon cancer
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果及其对肿瘤免疫微环境的重组作用 发现虫草素治疗能显著增强Cd226基因的表达,从而提高TIGIT阻断疗法的效果,并通过单细胞RNA测序证实了这一联合疗法在肿瘤免疫微环境中对NK细胞和CD8 T细胞的积极影响 NA 研究虫草素与TIGIT阻断疗法联合使用在结肠癌中的抗肿瘤效果 结肠癌肿瘤模型中的免疫细胞 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了MC38肿瘤模型中的免疫细胞进行分析
15091 2024-08-07
Transcriptomic and genomic profiling of multiple primary colorectal cancers reveals intratumor heterogeneity and a distinct immune microenvironment
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究报告了单一患者多发性原发性结直肠癌(MPCC)不同肿瘤病变的肿瘤内基因组和免疫学异质性 首次通过全外显子测序和单细胞RNA测序揭示了MPCC中肿瘤病变的分子和微环境特征,特别是发现了横结肠肿瘤病变中黏膜相关不变T细胞(MAIT)的富集 研究样本量较小,仅基于单一患者的数据,可能限制了结果的普遍性 探索MPCC患者不同原发部位肿瘤病变的分子和微环境特征 来自同一72岁男性MPCC患者的三个肿瘤病变,分别位于横结肠肝曲、乙状结肠和直肠 数字病理学 结直肠癌 全外显子测序(WES)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据、转录组数据 三个肿瘤样本
15092 2024-08-07
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing in double-hit lymphoma: IMPDH2 induces the progression of lymphoma by activating the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway" [Int. Immunopharmacol. 125(Part A) (2023) 111125]
2024-Jan-05, International immunopharmacology IF:4.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
15093 2024-08-07
Inferring Gene Regulatory Networks and Predicting the Effect of Gene Perturbations via IQCELL
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 IQCELL平台从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络,并模拟正常和扰动条件下的网络行为 开发了IQCELL平台,能够从单细胞RNA测序数据中推断布尔基因调控网络,并模拟其在正常和扰动条件下的行为 NA 提供使用IQCELL平台从原始数据集推断基因调控网络的详细指南 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 布尔网络 RNA测序数据 NA
15094 2024-08-07
Single-Cell mRNA-sncRNA Co-sequencing of Preimplantation Embryos
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了一种方法,通过在同一胚胎细胞上同时进行单细胞RNA测序(Smart-Seq2)和单细胞小非编码RNA测序(Small-Seq),来阐明胚胎的细胞动力学 本文创新地结合了单细胞RNA测序和小非编码RNA测序技术,以更全面地研究胚胎细胞的多样性和异质性 NA 研究胚胎细胞的分子机制和细胞动力学 胚胎细胞 基因组学 NA 单细胞RNA测序(Smart-Seq2)和小非编码RNA测序(Small-Seq) NA RNA NA
15095 2024-08-07
Evaluation of Stem-Cell Embryo Models by Integration with a Human Embryo Single-Cell Transcriptome Atlas
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文通过整合人类胚胎单细胞转录组图谱,评估了干细胞胚胎模型的转录组景观 利用单细胞RNA测序技术,实现了对早期胚胎分子过程的深入理解,并提供了评估早期胚胎细胞组成的手段 不同实验室和不同技术获取的单细胞数据集之间的比较存在挑战 通过比较分析胚胎的转录组景观,以更好地理解和改进基于干细胞的胚胎模型 人类囊胚模型(blastoids)与人类胚胎数据集及二维体外早期发育模型系统的整合分析 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 具体样本数量未提及
15096 2024-08-07
Deep scRNA sequencing reveals a broadly applicable Regeneration Classifier and implicates antioxidant response in corticospinal axon regeneration
2023-Dec-20, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过深度单细胞RNA测序分析了再生皮质脊髓束神经元的异质性,并开发了一个广泛适用的再生分类器,揭示了抗氧化应答在皮质脊髓轴突再生中的作用 本研究首次通过深度单细胞RNA测序揭示了再生皮质脊髓束神经元的转录组特征,并开发了一个可预测不同神经元类型再生潜力的再生分类器 研究仅限于PTEN和SOCS3删除后的再生皮质脊髓束神经元,未来研究需要扩展到其他条件和神经元类型 探索促进脊髓损伤后皮质脊髓束再生的生物学机制 再生皮质脊髓束神经元及其再生潜力 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 数百个表型确定的神经元
15097 2024-08-05
Integrative multi-omic profiling of adult mouse brain endothelial cells and potential implications in Alzheimer's disease
2023-11-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文生成了成年小鼠脑内皮细胞的综合分子图谱,探讨其在阿尔茨海默病中的潜在影响 研究首次整合了多组学数据,以揭示脑内皮细胞的功能异质性及其分子基础 该研究主要基于小鼠模型,可能限制了结果在人的适用性 研究血脑屏障的分子基础及其在神经疾病中的作用 成年小鼠脑内皮细胞及其在阿尔茨海默病中的变化 数字病理学 阿尔茨海默病 RNA测序和蛋白质组学 单细胞RNA测序 分子数据 涉及成年小鼠和人脑组织
15098 2024-08-05
Spatial Mapping of Genes Implicated in SARS-CoV-2 Neuroinvasion to Dorsolateral Prefrontal Cortex Gray Matter
2023-Jan, COVID
研究论文 本研究利用空间转录组学方法分析与SARS-CoV-2神经侵犯相关的基因异质性 首次对与SARS-CoV-2脑内渗透相关的基因在背外侧前额皮质的空间分布进行表征 目前对SARS-CoV-2神经侵犯的基因水平生物学理解仍然很有限 探究 SARS-CoV-2 对人类背外侧前额皮质的影响及相关基因的空间分布 人类背外侧前额皮质组织样本 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 组织样本 4
15099 2024-08-07
Integration of Multiple, Diverse Methods to Identify Biologically Significant Marker Genes
2022-10-15, Journal of molecular biology IF:4.7Q1
研究论文 本文探讨了通过整合多种不同方法来识别生物学上重要的标记基因 本文提出了一种集成多种差异表达分析方法的技术,以更稳健地识别标记细胞的基因 目前尚未有单一的最佳方法出现,且验证这些分析结果的成本较高 利用单细胞RNA测序更好地理解生物学特性 识别可靠标记不同细胞类型的基因 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 未具体说明样本数量
15100 2024-08-07
Erythroblastic islands foster granulopoiesis in parallel to terminal erythropoiesis
2022-10-06, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本文通过多光谱成像流式细胞术、体外岛重建和单细胞RNA测序等方法,研究了成年小鼠骨髓中的红细胞岛(EBI)成分细胞,发现EBI中的CD11b+细胞是与骨髓EBI巨噬细胞特异性相关的嗜中性粒细胞前体,表明红细胞(髓细胞)岛是终末粒细胞生成和红细胞生成的场所。 首次揭示了红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的双重作用,并展示了巨噬细胞在优化红细胞或嗜中性粒细胞生产中的适应性。 NA 研究红细胞岛在终末粒细胞生成和红细胞生成中的作用及其在不同生理病理状态下的调节机制。 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞及其在粒细胞生成和红细胞生成中的作用。 NA NA 多光谱成像流式细胞术、体外岛重建、单细胞RNA测序 NA 细胞 成年小鼠骨髓中的红细胞岛成分细胞
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