单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 15061 - 15080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15061 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing in cancer research
2016, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1586/14737159.2016.1115345
PMID:26594792
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用及其对癌症治疗和诊断的潜在影响 | 单细胞测序技术能够揭示肿瘤内细胞的遗传、表观遗传和转录交互的复杂变异性，有助于设计更精确的抗癌治疗方案 | 临床应用前仍需克服技术、生物学和计算方面的难题 | 增强对肿瘤生物学表型的理解，并改进癌症治疗和诊断方法 | 肿瘤内的单个细胞及其遗传和表观遗传特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA和RNA | NA |
| 15062 | 2024-08-07 |
A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor
2016, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.9501.2
PMID:27909575
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研究论文 | 本文描述了一种基于开源Bioconductor项目的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据低级分析的计算工作流程 | 该工作流程专门针对scRNA-seq数据的分析，能够利用细胞分辨率并考虑技术噪声 | NA | 提供一种适用于scRNA-seq数据低级分析的计算工作流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因水平计数数据 | 涉及造血干细胞、脑源性细胞、T辅助细胞和小鼠胚胎干细胞的多个公开数据集 |
| 15063 | 2024-08-07 |
BASiCS: Bayesian Analysis of Single-Cell Sequencing Data
2015-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1004333
PMID:26107944
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研究论文 | BASiCS是一个综合的贝叶斯分层模型，用于分析单细胞测序数据，能够估计细胞特异性归一化常数，量化技术变异性，并分解表达计数的总变异性为技术和生物成分 | BASiCS模型通过引入人工合成的spike-in基因来量化技术变异性，并提供了一个直观的检测标准来识别高度或低度变异的基因 | NA | 开发和验证一个用于分析单细胞mRNA测序数据的新方法，以识别细胞间基因表达的真实异质性 | 单细胞mRNA测序数据中的基因表达变异性 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯分层模型 | 基因表达数据 | 使用了来自小鼠胚胎干细胞的基因表达测量数据 |
| 15064 | 2024-08-07 |
Dynamics of genomic clones in breast cancer patient xenografts at single-cell resolution
2015-Feb-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13952
PMID:25470049
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研究论文 | 本文通过深度基因组和单细胞测序方法，研究了免疫缺陷小鼠中人类乳腺癌原发和转移性肿瘤的克隆动力学 | 首次系统地检查了移植和传播对肿瘤基因组克隆结构的影响，并展示了单细胞测序在理解克隆复杂性和快速进化案例中的应用 | 研究仅限于15个案例，可能需要更多的样本以验证结果的普遍性 | 探讨人类乳腺癌在免疫缺陷小鼠中的克隆动力学及其对肿瘤进化的影响 | 人类乳腺癌的原发和转移性肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 15例人类乳腺癌样本 |
| 15065 | 2024-08-07 |
An Analysis Regarding the Association Between DAZ Interacting Zinc Finger Protein 1 (DZIP1) and Colorectal Cancer (CRC)
2024-Feb-09, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01065-1
PMID:38334905
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研究论文 | 本研究探讨了DAZ相互作用锌指蛋白1（DZIP1）与结直肠癌（CRC）之间的关联 | 首次揭示了DZIP1在CRC中的作用，包括其在纤维母细胞恶性转化中的上调以及对上皮-间质转化（EMT）的促进作用 | 研究主要基于细胞和动物模型，需要在人体临床试验中进一步验证 | 揭示DZIP1在结直肠癌中的作用机制，为治疗提供新途径 | DZIP1在结直肠癌中的表达及其对纤维母细胞和肿瘤细胞的影响 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scrna-seq | NA | 临床样本数据 | 涉及细胞和异种移植裸鼠模型 |
| 15066 | 2024-08-05 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize the molecular and cellular architecture of the ischemic mouse brain
2024-Feb-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg1323
PMID:38324639
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学研究小鼠缺血半球的分子和细胞结构 | 本研究首次揭示了缺血大脑中非神经元细胞的分子和空间特征，以及细胞类型间的相互作用 | 对缺血大脑中其他细胞类型的研究较为有限 | 研究缺血后小鼠大脑的分子和细胞架构 | 小鼠缺血半球及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 缺血性脑卒中 | 空间转录组学 | NA | 转录组 | 19777个点 |
| 15067 | 2024-08-05 |
The unfolded protein response pathway as a possible link in the pathogenesis of COVID-19 and sepsis
2024-Jan-08, Archives of virology
IF:2.5Q3
DOI:10.1007/s00705-023-05948-7
PMID:38191819
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研究论文 | 本研究揭示了在单细胞水平上COVID-19和脓毒症的发病机制中未折叠蛋白反应（UPR）通路的重要性 | 提供了COVID-19与脓毒症之间的共同发病机制的新分子视角 | 未在研究中提及具体的生物标志物或临床数据的长时间追踪 | 探讨COVID-19与脓毒症之间的潜在联系及其共同的发病机制 | COVID-19和脓毒症病例的单细胞RNA-seq数据及转录组数据 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 15068 | 2024-08-05 |
Single-Cell Suspension Preparation from Nile Tilapia Intestine for Single-Cell Sequencing
2023-02-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/64688
PMID:36847395
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研究论文 | 本研究展示了一种优化的鲤鱼肠道单细胞悬浮液制备协议 | 提出并优化了针对尼罗河罗非鱼肠道的单细胞悬浮液制备方法 | 该方法主要针对特定鱼类的肠道，其他组织或鱼种可能需要进一步优化 | 开发高质量单细胞悬浮液制备方案以支持单细胞层级研究 | 尼罗河罗非鱼的肠道细胞 | 数字病理学 | NA | 胶原酶/解聚酶 | NA | 细胞悬浮液 | NA |
| 15069 | 2024-08-07 |
Characterizing allele- and haplotype-specific copy numbers in single cells with CHISEL
2021-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0661-6
PMID:32879467
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research paper | 本文介绍了一种名为CHISEL的方法，用于在单细胞和细胞亚群中推断等位基因和单体型特异性的拷贝数 | CHISEL方法通过聚合数百或数千个单个细胞的稀疏信号，能够推断出等位基因和单体型特异性的拷贝数，这在低序列覆盖率的情况下尤为重要 | NA | 研究目的是开发一种方法来推断单细胞中的等位基因和单体型特异性拷贝数，特别是在低序列覆盖率的情况下 | 研究对象是乳腺癌患者的单细胞序列数据 | digital pathology | breast cancer | single-cell sequencing | NA | genome | 约2,000个细胞，来自两名乳腺癌患者 |
| 15070 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals intratumoral heterogeneity in lung adenocarcinoma
2024-Mar, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24048
PMID:38133212
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了肺腺癌中的肿瘤内异质性，并开发了一个有效的预后指数。 | 本文首次在单细胞水平上分析了肺腺癌的肿瘤内异质性，并开发了一个跨多个队列的有效预后指数。 | NA | 探索肺腺癌的肿瘤内异质性，并开发个性化治疗策略。 | 肺腺癌的肿瘤内异质性及其对预后的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了1458个样本，包括TCGA-LUAD（503个），GSE68465（442个），GSE72094（398个）和GSE26939（115个）。 |
| 15071 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of mechanical loading on knee tibial cartilage in osteoarthritis
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111496
PMID:38224628
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了机械负荷对膝骨关节炎患者膝关节胫骨软骨中软骨细胞亚群的影响 | 首次识别出一种新的软骨细胞亚群HTC-C，并分析了其在不同机械负荷条件下的功能和细胞间相互作用 | 研究仅限于KOA患者的膝关节胫骨软骨，且样本量未具体说明 | 探究机械负荷对膝骨关节炎发展中软骨细胞亚群的影响及其分子机制 | 膝骨关节炎患者的膝关节胫骨软骨 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本量未提及 |
| 15072 | 2024-08-07 |
Elevated enteric putrescine suppresses differentiation of intestinal germinal center B cells
2024-Feb-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.111544
PMID:38266445
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研究论文 | 本研究探讨了外源性腐胺对肠道微环境中B细胞分化的影响 | 发现腐胺通过影响B细胞受体信号通路和脂肪酸氧化相关基因，抑制肠道B细胞分化，并揭示了腐胺在不同癌症中的免疫调节作用 | NA | 研究腐胺与B细胞成熟和代谢失调之间的因果关系及其机制 | 肠道微环境中的B细胞分化 | 免疫学 | NA | bulk RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 15073 | 2024-08-07 |
Understanding the cell fate and behavior of progenitors at the origin of the mouse cardiac mitral valve
2024-Feb-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.12.006
PMID:38198889
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和回顾性多色克隆分析，探讨了小鼠心脏二尖瓣起源的前体细胞的命运和行为 | 首次详细描述了二尖瓣前体细胞的代谢过程和其在阀叶形成中的特定贡献 | NA | 揭示小鼠心脏二尖瓣前体细胞的身份、命运决策及其在阀叶中的行为和分布 | 小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞 | 数字病理学 | 先天性心脏畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 涉及小鼠胚胎和新生儿的二尖瓣前体细胞样本 |
| 15074 | 2024-08-07 |
Autoreactive T cells target peripheral nerves in Guillain-Barré syndrome
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06916-6
PMID:38233524
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研究论文 | 本文通过结合体外T细胞筛选、单细胞RNA测序和T细胞受体（TCR）测序，研究了Guillain-Barré综合征（GBS）中自身反应性T细胞的作用 | 首次鉴定出具有细胞毒性T辅助1（T1）样表型的自身反应性记忆CD4细胞和针对周围神经髓鞘抗原的稀有CD8 T细胞，并揭示了多克隆TCR谱系、短CDR3β长度、偏好HLA-DR限制和识别免疫优势表位 | NA | 揭示Guillain-Barré综合征中自身反应性T细胞的免疫机制 | Guillain-Barré综合征患者中的自身反应性T细胞 | NA | Guillain-Barré综合征 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | RNA | 超过1,000个自身反应性单T细胞克隆 |
| 15075 | 2024-08-07 |
The Gut Microbiome Controls Liver Tumors via the Vagus Nerve
2024-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.23.576951
PMID:38328040
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研究论文 | 本文探讨了肠道微生物群通过迷走神经影响肝脏肿瘤的机制 | 首次揭示肠道微生物群通过迷走神经调节肝脏肿瘤的机制，并发现迷走神经通过乙酰胆碱影响CD8+ T细胞活性 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人体中验证 | 研究肠道微生物群与迷走神经在肝脏肿瘤发展中的相互作用 | 肝脏肿瘤、肠道微生物群、迷走神经、CD8+ T细胞 | NA | 肝脏肿瘤 | scRNA-seq | NA | 微生物群数据 | 涉及Rag1KO小鼠和无肿瘤小鼠 |
| 15076 | 2024-08-05 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576260
PMID:38328172
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞。 | 创新之处在于应用DEGAS工具，将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据上，以识别为2型糖尿病病理提供关键的β细胞亚群。 | 本研究没有涉及与其他潜在影响因素的交互作用。 | 本研究旨在优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好理解2型糖尿病的发病机制。 | 研究对象为与2型糖尿病和肥胖相关的不同β细胞亚群。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习模型 | 基因表达数据 | 涉及来自健康和2型糖尿病供体的人类胰腺切片 |
| 15077 | 2024-08-05 |
Cancer stem cells: Recent insights and therapies
2023-03, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2023.115441
PMID:36720355
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综述 | 本篇综述讨论了癌症干细胞的最新特征、标记和机制研究进展。 | 探讨了单细胞测序和空间转录组分析在癌症干细胞研究中的应用，提出新的治疗策略。 | NA | 深入了解癌症干细胞在癌症生物学中的基本角色。 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序、空间转录组分析 | NA | NA | NA |
| 15078 | 2024-08-05 |
Molecular functional characterization of the setdb1 and its potential target gene sox5 illuminate the histone modification-mediated orchestration of gonadal development in Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis)
2024-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148199
PMID:38253299
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研究论文 | 该研究揭示了setdb1在中国舌鳎性别分化和生殖细胞发育中的作用 | 首次在中国舌鳎中详细描述了setdb1及其潜在靶基因sox5在性别发育调控中的分子机制 | 缺乏对setdb1在其他发育阶段的功能研究 | 探讨setdb1如何通过调控sox5的转录影响性别分化和生殖细胞发育 | 中国舌鳎的setdb1基因及其靶基因sox5 | 数字病理学 | NA | qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列, RNA数据 | NA |
| 15079 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics and the anatomical pathologist: Molecular meets morphology
2024-Mar, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.15093
PMID:37991396
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小型综述 | 本文概述了空间转录组学方法及其在解剖病理学实践中的应用 | 本研究强调了与福尔马林固定石蜡包埋组织（FFPE）兼容的空间转录组学技术的进展 | 目前这些技术仍主要在研究实验室中使用，对于在常规解剖病理学实践中的整合还需进一步发展 | 探讨空间转录组学在解剖病理学中的应用与潜力 | 空间转录组学技术及其与解剖病理学实践的关系 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 15080 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the role of antigen presentation in liver metastatic breast cancer
2024-Feb-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.108896
PMID:38318373
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研究论文 | 这篇文章深入分析了11例晚期乳腺癌患者的肝转移转录组特征 | 揭示了肝转移相关的抗原呈递功能障碍与肿瘤浸润T细胞的关系 | 样本量较小，仅为11例，可能影响结果的普遍性 | 研究肝转移乳腺癌中抗原呈递的作用 | 11例患有继发性肝癌的乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 11例 |