单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28534 篇文献，本页显示第 15041 - 15060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 15041 | 2024-08-07 |
Identification of Transcriptomic Signatures of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma-Derived Exosomes That Promote Macrophage M2 Polarization and Predict Prognosis: S100A9 Reveals Tumor Progression
2024, Clinical Medicine Insights. Oncology
DOI:10.1177/11795549241239042
PMID:38510315
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研究论文 | 本研究通过分析胰腺导管腺癌（PDAC）细胞衍生的外泌体中的关键基因，揭示了其促进巨噬细胞M2极化并预测预后的机制，特别是S100A9在肿瘤进展中的作用 | 本研究首次建立了PDAC衍生外泌体和M2巨噬细胞的风险评分模型，并揭示了S100A9在巨噬细胞M2极化中的重要作用 | NA | 探讨胰腺导管腺癌细胞衍生的外泌体如何促进巨噬细胞M2极化及其在预后预测中的作用 | 胰腺导管腺癌细胞衍生的外泌体、巨噬细胞M2极化、S100A9基因 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 差异表达基因分析（DEGs）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、多变量Cox回归分析、定量聚合酶链反应（qPCR）、蛋白质印迹（western blot）、流式细胞术、细胞转染、Transwell实验、CCK-8实验 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 使用来自exoRbase 2.0、TCGA和ICGC数据库的数据，以及BxPC-3细胞系的外泌体进行体外实验 |
| 15042 | 2024-08-07 |
Matrisome gene-based subclassification of patients with liver fibrosis identifies clinical and molecular heterogeneities
2023-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000423
PMID:37098756
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研究论文 | 本文通过分析肝纤维化患者的转录组数据，识别并验证了与肝纤维化相关的基质基因（LFMGs），并探讨了这些基因在临床和生物学上的相关性 | 本文首次识别了与病因无关的肝纤维化特异性基质基因（LFMGs），并揭示了这些基因在肝纤维化进展和逆转中的表达模式和细胞景观 | NA | 旨在揭示与病因无关的基质基因，这些基因在临床上与肝纤维化相关 | 肝纤维化患者的转录组数据和临床特征 | 数字病理学 | 肝纤维化 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 35个肝纤维化特异性基质基因（LFMGs） |
| 15043 | 2024-08-07 |
An immune cell atlas reveals the dynamics of human macrophage specification during prenatal development
2023-09-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.08.019
PMID:37703875
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，绘制了人类胚胎发育期间（4-26周）巨噬细胞分化动态的图谱 | 首次在多个组织中识别出15种巨噬细胞亚型，包括类似小胶质细胞和促血管生成巨噬细胞，并揭示了它们在胚胎发育中的分布和功能 | NA | 揭示人类胚胎发育期间巨噬细胞的多样性和发育动态 | 人类胚胎发育期间的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及19个组织的巨噬细胞 |
| 15044 | 2024-08-07 |
Mapping the two distinct proliferative bursts early in T-cell development
2023-09, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12670
PMID:37465975
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合轨迹推断方法，精确确定了T细胞发育过程中胸腺细胞进入细胞周期的时机 | 首次精确界定了T细胞发育早期两个增殖爆发的时间点，即在双阴性(DN) 2a阶段和DN3b阶段 | NA | 研究T细胞发育过程中早期的两个增殖爆发 | T细胞发育过程中的胸腺细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 15045 | 2024-08-07 |
RNA sequencing of single allergen-specific memory B cells after grass pollen immunotherapy: Two unique cell fates and CD29 as a biomarker for treatment effect
2023-03, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15529
PMID:36153670
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞的变化，并探讨了CD29作为治疗效果生物标志物的可能性 | 首次揭示了草花粉免疫治疗后特异性记忆B细胞存在两种独特的转录特征，并发现CD29可作为治疗效果的早期生物标志物 | 研究样本量较小，仅涉及四名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨草花粉免疫治疗对特异性记忆B细胞的影响及其作为治疗效果生物标志物的潜力 | 特异性记忆B细胞及其表面蛋白表达变化 | NA | 过敏性鼻炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 27名对黑麦草花粉敏感且患有季节性鼻炎的患者 |
| 15046 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq analyses inform necroptosis-associated myeloid lineages influence the immune landscape of pancreas cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1263633
PMID:38149248
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研究论文 | 研究揭示了胰腺癌中与坏死性凋亡相关的髓系细胞谱系对免疫环境的影响 | 首次识别出与坏死性凋亡相关的10个基因以及三种髓系细胞亚群体 | 未提及研究的局限性 | 探讨胰腺导管腺癌中肿瘤浸润髓系细胞的特性和影响 | 16名胰腺导管腺癌患者的肿瘤和正常组织细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 12个原发肿瘤组织和4个转移肿瘤组织，3个正常胰腺组织，以及PBMC样本 |
| 15047 | 2024-08-07 |
Myeloid PFKFB3-mediated glycolysis promotes kidney fibrosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259434
PMID:38035106
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研究论文 | 本研究探讨了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化发展中的作用 | 首次揭示了髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用，并提出靶向髓系糖酵解是一种新的抑制肾脏纤维化的方法 | 研究主要基于小鼠模型，未来需在人类样本中验证其有效性和安全性 | 研究髓系细胞中糖酵解途径在肾脏纤维化中的作用 | 髓系细胞中的糖酵解途径及其在肾脏纤维化中的作用 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的髓系细胞 |
| 15048 | 2024-08-07 |
Chemical immune conization of precancerous cervical lesions awakens immune cells and restores normal HPV negative and abnormal proliferation
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1259723
PMID:38235142
|
研究论文 | 研究使用半抗原增强的肿瘤内化疗（HEIC）治疗宫颈癌前病变和HPV感染的效果 | 提出了一种新的治疗策略，即通过半抗原增强的肿瘤内化疗来激活免疫细胞，防止宫颈癌前细胞的异常增殖 | 研究仅基于单一患者的细胞样本，可能需要进一步的临床试验来验证其普遍性和有效性 | 探讨半抗原增强的肿瘤内化疗对宫颈癌前病变和HPV感染的治疗效果 | 宫颈癌前病变组织和HPV感染 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 40,239个细胞 |
| 15049 | 2024-08-07 |
Novel tumor-associated macrophage populations and subpopulations by single cell RNA sequencing
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1264774
PMID:38347955
|
综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了四种新型肿瘤相关巨噬细胞亚群在不同实体瘤中的核心基因特征及其功能 | 利用单细胞RNA测序技术识别与特定功能相关的肿瘤相关巨噬细胞亚群 | 单细胞RNA测序识别的细胞类型和亚群与其实际功能之间可能存在潜在的脱节 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞在不同实体瘤中的亚群及其功能 | 肿瘤相关巨噬细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同实体瘤组织中的多个样本 |
| 15050 | 2024-08-07 |
Switch of innate to adaptative immune responses in the brain of patients with Alzheimer's disease correlates with tauopathy progression
2024-Mar-18, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-024-00145-5
PMID:38499592
|
研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病（AD）患者大脑中的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，揭示了在tauopathy进展过程中，从先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | 首次通过单细胞RNA测序数据证实了阿尔茨海默病患者大脑中先天免疫反应向适应性免疫反应的转变 | NA | 探讨阿尔茨海默病中神经炎症的关键特征及其与tauopathy进展的关系 | 阿尔茨海默病患者大脑中的免疫反应变化 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 15051 | 2024-08-07 |
Antidepressant fluoxetine alleviates colitis by reshaping intestinal microenvironment
2024-03-12, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-01538-5
PMID:38475799
|
research paper | 本文研究了抗抑郁药氟西汀通过重塑肠道微环境缓解结肠炎的作用及其分子机制 | 首次揭示了氟西汀通过影响不同细胞群的分布、细胞间通讯和KEGG通路富集来减轻结肠炎症的作用 | NA | 探讨抗抑郁药氟西汀缓解结肠炎的生物效应和分子机制 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 | NA | Inflammatory bowel diseases (IBD) | RT-qPCR, western blot, 单细胞RNA测序, H&E染色, 免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C56BL/6小鼠的IBD模型及其对照组 |
| 15052 | 2024-08-07 |
An organism-wide atlas of hormonal signaling based on the mouse lemur single-cell transcriptome
2024-Mar-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46070-9
PMID:38467625
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研究论文 | 本研究利用鼠狐猴（Microcebus murinus）的全器官单细胞转录组图谱，系统地绘制了84类激素的源细胞和目标细胞 | 该研究揭示了先前未被表征的激素调控位点，并展示了激素信号网络密集连接、分散且富含反馈回路的特性 | NA | 旨在系统地研究激素信号在全器官水平上的作用 | 鼠狐猴的激素信号网络及其与人类的比较 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 涉及84类激素的源细胞和目标细胞 |
| 15053 | 2024-08-04 |
Deep learning in spatial transcriptomics: Learning from the next next-generation sequencing
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0091135
PMID:38505815
|
综述 | 本文综述了用于空间转录组学分析的深度学习方法 | 提出了利用深度学习模型解决空间转录组学特定挑战的新方法 | 目前深度学习模型尚处于初期阶段，需要进一步探索 | 研究深度学习在空间转录组学中的应用及其潜力 | 空间转录组学的数据分析方法 | 机器学习 | NA | 转录组学 | 深度学习模型 | 多模态数据，包括组织学图像和计数矩阵 | NA |
| 15054 | 2024-08-07 |
Single-cell sequencing of diverse microorganisms
2024-Apr, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-024-00708-y
PMID:38366032
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15055 | 2024-08-04 |
Recent advances in differential expression analysis for single-cell RNA-seq and spatially resolved transcriptomic studies
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad011
PMID:37022699
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综述 | 本文讨论了单细胞RNA测序和空间解析转录组数据的差异表达分析的最新进展 | 本文填补了有关多条件、多样本实验设计的单细胞RNA测序和空间解析转录组数据差异表达基因检测的综述空白 | 缺乏对现有DE工具的系统评估 | 研究单细胞RNA-seq和空间解析转录组的差异表达分析 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间解析转录组(SRT)数据的差异表达基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA |
| 15056 | 2024-08-04 |
An improved hierarchical variational autoencoder for cell-cell communication estimation using single-cell RNA-seq data
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac056
PMID:36752035
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研究论文 | 该文章提出了一种改进的层次变分自编码器模型，用于利用单细胞RNA-seq数据自动估算细胞间通信 | 提出了一种改进的HiVAE模型，通过学习细胞在已知配体-受体基因和所有基因上的潜在表示，提升了细胞间通信的估计准确性 | 使用的先前信息不足，仅涉及一部分细胞通信，可能导致假阳性或假阴性结果 | 旨在利用单细胞RNA-seq数据深入分析肿瘤微环境中的细胞间通信 | 研究对象为单细胞RNA-seq数据，特别是人类皮肤疾病数据集和黑色素瘤数据集 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 层次变分自编码器（HiVAE） | RNA-seq数据 | 涉及人类皮肤疾病数据集和黑色素瘤数据集的单细胞样本 |
| 15057 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq data clustering by deep information fusion
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad017
PMID:37208992
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度信息融合的单细胞数据聚类方法scDeepFC | scDeepFC通过深度自编码器和深度图卷积网络有效融合基因属性信息和细胞拓扑信息，以提升聚类效果 | 目前仍未提及具体的计算复杂度或模型训练时间等限制 | 旨在通过深度学习技术提升单细胞转录组数据的聚类和数据插补能力 | 研究对象为单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 深度自编码器，深度图卷积网络 | 深度自编码器，图卷积网络 | 单细胞转录组数据 | 在真实单细胞数据集上进行了广泛实验 |
| 15058 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell RNA sequencing data to genome-wide association analysis data identifies significant cell types in influenza A virus infection and COVID-19
2024-Mar-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad025
PMID:37340787
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据与全基因组关联分析数据，揭示了流感病毒感染和COVID-19中与疾病相关的细胞类型 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究相结合，以高分辨率解析流感疾病中的细胞多样性 | 研究结果需要在未来的研究中得到更多的关注和验证 | 揭示流感疾病和COVID-19的发病机制中与疾病相关的细胞类型 | 流感病毒感染和COVID-19的细胞类型关联 | 基因组学 | 流感 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | 约70,000个细胞，涉及欧洲和东亚人群 |
| 15059 | 2024-08-07 |
Spatially Resolved Tumor Microenvironment Predicts Treatment Outcomes in Relapsed/Refractory Hodgkin Lymphoma
2024-Mar-20, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
IF:42.1Q1
DOI:10.1200/JCO.23.01115
PMID:38113419
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研究论文 | 研究通过空间解析的肿瘤微环境（TME）生态系统，为复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤（r/r CHL）的治疗失败建立新型生物标志物 | 开发了一种新的预后模型RHL4S，利用TME生物学特性，适用于r/r CHL活检，为空间生物标志物的发展开辟了新途径 | NA | 描述空间解析的肿瘤微环境生态系统，建立与r/r CHL治疗失败相关的生物标志物 | 复发/难治性经典霍奇金淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 成像质谱流式细胞术（IMC） | NA | 图像 | 71对原发诊断和复发活检样本 |
| 15060 | 2024-08-04 |
ISR inhibition reverses pancreatic β-cell failure in Wolfram syndrome models
2024-03, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01258-w
PMID:38321214
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研究论文 | 本研究探讨了Wolfram综合征中胰腺β细胞功能失衡的机制以及ISR抑制剂的治疗潜力 | 首次在Wolfram综合征模型中揭示ISR作为β细胞失功能的关键机制，并验证了ISR抑制剂的治疗效果 | 在研究中可能忽略了其他潜在的治疗路径或机制 | 研究Wolfram综合征模型中胰腺β细胞失功能的病因及潜在治疗方法 | WFS1缺乏的胰腺β细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠Wfs1特异性敲除模型 | 细胞数据 | 人体多能干细胞衍生的胰岛细胞(NA)和小鼠模型 |