单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
15041 2024-08-07
Multi-omics analysis reveals the chemoresistance mechanism of proliferating tissue-resident macrophages in PDAC via metabolic adaptation
2023-06-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过多组学分析揭示了胰腺导管腺癌(PDAC)中增殖性组织驻留巨噬细胞通过代谢适应产生化疗耐药性的机制 首次识别出PDAC中与不良临床结果密切相关的增殖性组织驻留巨噬细胞(proliferating rMφs),并阐明了其通过代谢适应产生化疗耐药性的具体机制 NA 探究胰腺导管腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)促进化疗耐药性的具体机制 胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其在化疗耐药性中的作用 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、多色免疫组化(mIHC)、流式细胞术、代谢组学 NA 转录组数据、免疫组化图像、流式细胞数据、代谢组数据 人类和鼠类的化疗治疗样本
15042 2024-08-05
Complex subsets but redundant clonality after B cells egress from spontaneous germinal centers
2023-06-21, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究使用小鼠模型分析自发性生发中心后B细胞的特征 提出了B细胞在自发性生发中心后的复杂亚群体以及冗余克隆性的概念 研究仅限于小鼠模型,可能不完全适用于人类疾病的理解 分析自发性生发中心后B细胞的组成及其在自身免疫中的作用 分析B细胞亚群体及其在自发性生发中心后的发育状态 数字病理学 自身免疫疾病 单细胞转录组学, 抗体库分析 NA 转录组数据 使用小鼠模型进行多个B细胞亚群的分析
15043 2024-08-07
Leveraging single-cell RNA sequencing to unravel the impact of aging on stroke recovery mechanisms in mice
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了衰老对小鼠中风恢复机制的影响 首次揭示了衰老小鼠中风后早期修复转录重编程的缺失,并发现年轻小鼠的微胶质细胞和巨噬细胞移植可以部分恢复老年小鼠的血管生成和少突胶质细胞生成 研究仅限于小鼠模型,未来需要进一步在人类中验证这些发现 探究衰老如何影响中风后脑组织修复的机制 年轻和老年小鼠中风后急性期和慢性期的脑组织 数字病理学 中风 单细胞RNA测序 NA 转录组 年轻和老年小鼠的中风脑组织样本
15044 2024-08-05
Tissue-resident CXCR4+ macrophage as a poor prognosis signature promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression
2023-06-01, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了CXCR4+巨噬细胞在胰腺导管腺癌进展中的预后价值及其免疫特征和功能 发现CXCR4+巨噬细胞的浸润与胰腺导管腺癌的差预后相关,为靶向这些细胞的免疫治疗提供了新方向 研究仅限于手术后样本,未涉及胰腺癌早期患者的相关数据 评估CXCR4+巨噬细胞在胰腺导管腺癌进展中的作用及其预后意义 102名术后胰腺癌患者的组织样本 数字病理学 胰腺癌 流式细胞术, 免疫荧光, RNA-seq 小鼠同种异体PDAC模型 组织样本 102个手术后胰腺癌患者样本
15045 2024-08-07
EPAS1 prevents telomeric damage-induced senescence by enhancing transcription of TRF1, TRF2, and RAD50
2023-May-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过跨物种比较,发现EPAS1基因在蝙蝠纤维母细胞中高表达,增强TRF1、TRF2和RAD50的转录,从而赋予蝙蝠纤维母细胞抵抗衰老的能力 首次揭示了EPAS1在蝙蝠和人类中保护端粒的机制,并发现EPAS1激动剂M1001对博来霉素诱导的肺部端粒损伤和衰老具有保护作用 NA 探索调节人类肺部疾病中端粒稳定性的潜在机制 蝙蝠纤维母细胞和人类肺部内皮细胞 分子生物学 肺部疾病 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 NA
15046 2024-08-07
ARL13B promotes angiogenesis and glioma growth by activating VEGFA-VEGFR2 signaling
2023-05-04, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本文研究了ARL13B通过激活VEGFA-VEGFR2信号通路促进血管生成和胶质瘤生长的机制。 发现ARL13B通过与VEGFR2相互作用,调控VEGFR2的膜和纤毛定位,从而激活其下游信号,促进血管生成和肿瘤生长。 NA 旨在识别参与肿瘤血管生成的潜在信号通路。 研究了ARL13B在视网膜和脑部血管发育中的作用,以及在胶质瘤和黑色素瘤模型中对肿瘤生长和血管生成的影响。 数字病理学 胶质瘤 免疫组织化学, scRNA-seq, GST融合蛋白-蛋白相互作用, 共免疫沉淀 NA 组织, 细胞 使用转基因小鼠模型和人类胶质瘤组织样本进行研究。
15047 2024-08-05
Single-cell RNA-seq analysis reveals BHLHE40-driven pro-tumour neutrophils with hyperactivated glycolysis in pancreatic tumour microenvironment
2023-05, Gut IF:23.0Q1
研究论文 这项研究探讨了胰腺导管腺癌中的肿瘤相关中性粒细胞的异质性和促肿瘤机制。 发现BHLHE40在中性粒细胞极化为促肿瘤表型中的关键调节作用,并提供了多组学分析验证的支持。 研究样本仅限于5名胰腺导管腺癌患者,样本数量较小,可能影响结果的广泛适用性。 研究旨在探讨胰腺导管腺癌中非T细胞丰富的肿瘤中性粒细胞的作用。 研究对象为来自五名胰腺导管腺癌患者的外周血多形核白细胞及肿瘤浸润免疫细胞。 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组, 蛋白组和代谢组数据 来自五名胰腺导管腺癌患者的样本
15048 2024-08-07
Role of Up-Regulated Transmembrane Channel-Like Protein 5 in Pancreatic Adenocarcinoma
2023-05, Digestive diseases and sciences IF:2.5Q2
研究论文 研究上调的跨膜通道样蛋白5(TMC5)在胰腺腺癌(PAAD)中的作用 首次全面验证TMC5在PAAD中的高表达,并探讨其在细胞群体和细胞间通讯中的表达及潜在机制 研究结果需要进一步的实验验证 探讨TMC5在PAAD中的表达及其临床价值和潜在机制 胰腺腺癌(PAAD)中的TMC5表达 数字病理学 胰腺癌 免疫组织化学(IHC)、微阵列、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 组织样本数据 148个PAAD样本和19个非PAAD样本,以及1166个PAAD样本和704个非PAAD样本的微阵列和RNA测序数据
15049 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing of intestinal immune cells in neonatal necrotizing enterocolitis
2023-Apr-11, Pediatric surgery international IF:1.5Q3
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)患者的肠道免疫细胞基因表达谱 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了NEC患者肠道免疫细胞中MTOR、TNF-α和MYC信号通路的富集,表明炎症和细胞增殖相关的免疫反应上调 样本量较小,仅包括四名新生儿,且未涉及更多NEC和非NEC病例的比较 分析NEC患者的肠道免疫反应,以增进对NEC发病机制的理解 NEC患者的肠道免疫细胞 数字病理学 新生儿疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 四名新生儿(两名为NEC患者,两名为非NEC患者)
15050 2024-08-07
A novel immune checkpoint score system for prognostic evaluation in pancreatic adenocarcinoma
2023-Apr-06, BMC gastroenterology IF:2.5Q2
研究论文 本文研究了胰腺腺癌(PAAD)中免疫检查点评分系统的预测能力,并验证了OX40作为独立预后相关基因的作用。 首次建立了基于三个免疫检查点(OX40、TNFSF14和KIR3DL1)的风险评分系统,并验证了其在PAAD患者中的独立预后因子作用。 NA 探索胰腺腺癌的新型预后生物标志物 胰腺腺癌患者的免疫检查点和预后 数字病理学 胰腺癌 scRNA-seq, RT-PCR, IHC LASSO和Cox回归分析 基因表达数据 84个PAAD临床样本
15051 2024-08-05
MANGEM: a web app for Multimodal Analysis of Neuronal Gene expression, Electrophysiology and Morphology
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一个名为MANGEM的云端web应用,用于分析神经元的多模态数据 该应用提供了一种易于使用的界面,使生物学家和神经科学家能够进行多模态数据的机器学习对齐,而无需计算专业知识 使用此方法需要适当的计算基础设施,并且对生物学家和神经科学家的计算能力要求较高 旨在为神经元的多模态数据提供可访问的分析工具 研究对象是小鼠视觉皮层中的神经元细胞 机器学习 NA Patch-seq NA 多模态数据 小鼠视觉皮层中的神经元细胞
15052 2024-08-05
Single-cell profiling to explore pancreatic cancer heterogeneity, plasticity and response to therapy
2023-04, Nature cancer IF:23.5Q1
评论 这篇文章概述了单细胞分析在胰腺癌中的应用及其对疾病理解的影响 文章介绍了高分辨率单细胞测序和空间转录组技术在研究胰腺癌异质性和可塑性方面的最新进展 该文章可能缺乏实际的实验数据支持其观点 探讨胰腺导管腺癌的异质性、可塑性及其对治疗的反应 胰腺癌的恶性细胞和宿主细胞类型 数字病理学 胰腺癌 单细胞测序, 空间转录组 NA 细胞类型 NA
15053 2024-08-05
Integrated single-nucleus and spatial transcriptomics captures transitional states in soybean nodule maturation
2023-04, Nature plants IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过整合单核和空间转录组技术,建立了大豆结节和根部的细胞图谱 首次揭示了未感染细胞在结节发育过程中专门化为功能上不同的亚群体,并发现了富含结节相关基因的感染细胞过渡亚型 NA 研究根瘤菌与豆科植物的共生关系 大豆结节和根部细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组和空间转录组 NA 细胞 NA
15054 2024-08-05
AIRE illuminates the feature of medullary thymic epithelial cells in thymic carcinoma
2023-04, Cancer medicine IF:2.9Q2
研究论文 该文章探讨了胸腺癌中髓样胸腺上皮细胞的特征,并强调了AIRE的重要性 首次将AIRE与胸腺癌的起源联系起来,并指出胸腺癌可能来源于mTECs 未能完全确定胸腺癌的所有分子特征及其来源 阐明胸腺癌及相关胸腺上皮肿瘤的细胞起源 胸腺癌样本及其与mTECs的关系 数字病理学 NA RNA测序 NA 组织样本 使用了TCGA-THYM数据库和最新的人类单细胞RNA-seq数据
15055 2024-08-07
Myosin light-chain 4 gene-transfer attenuates atrial fibrosis while correcting autophagic flux dysregulation
2023-04, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 研究MYL4基因调控溶酶体功能及其在纤维化心房心肌病中的紊乱作用 首次揭示了MYL4蛋白通过调控溶酶体移动性影响心房心肌细胞自噬流,并提出MYL4过表达作为一种潜在的生物治疗策略 NA 探讨MYL4调控溶酶体功能及其在纤维化心房心肌病中的作用 MYL4基因、溶酶体功能、纤维化心房心肌病 NA 心血管疾病 免疫荧光、电子显微镜、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 NA 蛋白质、RNA 涉及MYL4p.E11K突变的小鼠模型
15056 2024-08-07
Immune profiling and prognostic model of pancreatic cancer using quantitative pathology and single-cell RNA sequencing
2023-03-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用定量病理学和单细胞RNA测序技术,对胰腺癌的免疫特征和预后模型进行了深入分析 首次结合定量病理学和单细胞RNA测序技术,揭示了胰腺癌的免疫微环境特征,并建立了基于免疫特征的风险评分预后模型 NA 旨在描绘胰腺导管腺癌的免疫景观,并确定免疫特征在肿瘤免疫微环境中的临床价值 胰腺导管腺癌及其免疫微环境 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多重免疫组化(mIHC) Cox回归分析 免疫特征数据 具体样本数量未在摘要中提及
15057 2024-08-07
Integrated transcriptional analysis reveals macrophage heterogeneity and macrophage-tumor cell interactions in the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Mar-02, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过综合转录组分析揭示了胰腺导管腺癌进展中巨噬细胞的异质性和巨噬细胞-肿瘤细胞相互作用 开发了一种结合批量和单细胞转录组测序的计算方法,用于描绘巨噬细胞异质性,并应用CellPhoneDB算法推断巨噬细胞-肿瘤相互作用网络 NA 识别肿瘤-巨噬细胞相互作用的分子机制,从而设计新的治疗策略 胰腺导管腺癌中的巨噬细胞及其与肿瘤细胞的相互作用 数字病理学 胰腺癌 单细胞转录组测序 CellPhoneDB算法 转录组数据 多个巨噬细胞亚群和胰腺癌细胞系
15058 2024-08-05
Molecular features and evolutionary trajectory of ASCL1+ and NEUROD1+ SCLC cells
2023-03, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本文探讨了ASCL1+和NEUROD1+小细胞肺癌细胞的分子特征和演化轨迹 发现ASCL1+和NEUROD1+ SCLC细胞在同一肿瘤组织中共存,并揭示了它们的不同生物学特征和代谢能力 未提及具体的样本量和研究范围的限制 研究小细胞肺癌(SCLC)亚型的生物学功能和演变过程 人类原发性小细胞肺癌组织中的ASCL1+和NEUROD1+细胞 数字病理 肺癌 单细胞RNA测序 NA 组织样本 NA
15059 2024-08-07
Single-cell profiling of the microenvironment in decidual tissue from women with missed abortions
2023-03, Fertility and sterility IF:6.6Q1
研究论文 本研究旨在定义正常染色体和非整倍体流产及选择性终止妊娠中的蜕膜微环境 首次通过单细胞RNA测序揭示了非整倍体流产蜕膜组织微环境的改变,并发现衰老的基质细胞比例与胚胎染色体异常的相关性 研究样本量较小,且仅限于特定时间段内的患者 探索流产中蜕膜组织的微环境变化及其与胚胎染色体异常的关系 34名经历流产的女性,包括6名选择性终止妊娠和28名非整倍体流产患者 数字病理学 妊娠并发症 单细胞RNA测序,逆转录定量聚合酶链反应 NA 转录组数据 16名女性的蜕膜组织进行单细胞RNA测序,18名女性的蜕膜组织进行逆转录定量聚合酶链反应
15060 2024-08-07
Pancreatic stellate cells exploit Wnt/β-catenin/TCF7-mediated glutamine metabolism to promote pancreatic cancer cells growth
2023-Feb-28, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 研究揭示了胰腺星状细胞通过Wnt/β-catenin/TCF7介导的谷氨酰胺代谢促进胰腺癌细胞生长的机制 首次详细阐明了胰腺星状细胞在谷氨酰胺代谢和肿瘤-基质代谢相互作用中的具体机制 NA 探讨胰腺星状细胞在胰腺导管腺癌中的代谢作用及其机制 胰腺星状细胞和胰腺癌细胞的谷氨酰胺代谢 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及人类组织和细胞样本
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