本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2026-04-09 |
Inflammatory risk contributes to post-COVID endothelial dysfunction through anti-ACKR1 autoantibody
2024-07, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402598
PMID:38740432
|
研究论文 | 本研究探讨了COVID-19康复者体内抗ACKR1自身抗体与血管功能障碍的关联及其机制 | 首次揭示了COVID-19后抗ACKR1自身抗体与内皮功能障碍的关联,并发现其通过抗体依赖性细胞毒性机制而非直接细胞毒性作用,同时识别了ACKR1的N端胞外域关键表位 | 研究主要基于观察性队列和体外实验,需要进一步在体实验验证;样本来源和规模可能限制普遍性结论 | 探究COVID-19后持续炎症状态下自身抗体导致血管功能障碍的机制 | COVID-19康复者、小鼠组织内皮细胞、人静脉内皮细胞、患者外周血单个核细胞 | NA | COVID-19后遗症、血管疾病 | 单细胞转录组测序、抗体纯化、细胞毒性实验、蛋白质重组技术 | NA | 转录组数据、临床数据、体外实验数据 | 健康COVID-19康复者队列(具体数量未明确)、独立随访队列(中位随访6.7年)、小鼠多种组织内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1482 | 2026-04-09 |
Frataxin deficiency shifts metabolism to promote reactive microglia via glucose catabolism
2024-07, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402609
PMID:38631900
|
研究论文 | 本研究探讨了弗里德赖希共济失调(FRDA)中frataxin(FXN)缺乏如何通过葡萄糖分解代谢促进反应性小胶质细胞,并揭示了丁酸盐通过调节免疫代谢途径改善神经功能的潜力 | 首次在单细胞水平上揭示了FXN缺乏导致小胶质细胞稳态丧失并转向糖酵解和衣康酸生成,并发现丁酸盐通过衣康酸-Nrf2-GSH通路和Hcar2介导恢复小胶质细胞稳态 | 研究基于小鼠模型,结果在人类FRDA患者中的适用性需进一步验证 | 探究FRDA中FXN缺乏对小胶质细胞免疫代谢的影响及丁酸盐的治疗潜力 | FRDA小鼠模型的小脑组织和小胶质细胞 | 免疫代谢学 | 弗里德赖希共济失调 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,代谢组学数据 | FRDA小鼠模型的小脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1483 | 2026-04-09 |
Unfolding the mysteries of heterogeneity from a high-resolution perspective: integration analysis of single-cell multi-omics and spatial omics revealed functionally heterogeneous cancer cells in ccRCC
2024-06-26, Aging
DOI:10.18632/aging.205974
PMID:38944814
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞多组学和空间组学数据,揭示了透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中功能异质性癌细胞的分类、空间分布及其临床意义 | 首次结合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组测序,从多组学和空间维度系统解析ccRCC的肿瘤内异质性,并识别出调控功能异质性癌细胞的关键转录因子 | 未明确说明样本数量及具体测序平台细节,可能限制了结果的普适性和技术可重复性 | 阐明透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤内异质性的分子机制及其在癌症转移、复发和治疗抵抗中的作用 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤组织 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq),空间转录组测序(stRNA-seq),批量RNA测序(RNA-seq) | 一致性非负矩阵分解(cNMF)算法 | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1484 | 2026-04-09 |
A human neural crest model reveals the developmental impact of neuroblastoma-associated chromosomal aberrations
2024-May-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-47945-7
PMID:38702304
|
研究论文 | 本研究利用人类胚胎干细胞分化模型,结合单细胞转录组和表观组分析,探索了神经母细胞瘤中染色体17q/1q增益对神经嵴细胞发育的影响 | 首次建立了人类神经嵴模型,系统评估了神经母细胞瘤相关染色体畸变在发育过程中的作用,揭示了拷贝数变异与MYCN过表达协同促进肿瘤发生的机制 | 模型基于体外分化系统,可能无法完全模拟体内肿瘤发生的复杂微环境 | 探究胚胎肿瘤中拷贝数变异如何影响发育过程并驱动肿瘤发生 | 人类胚胎干细胞分化的神经嵴细胞及其交感肾上腺衍生物 | 发育生物学与肿瘤学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序,单细胞表观组分析 | 人类胚胎干细胞分化模型 | 单细胞转录组数据,表观组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞表观组学 | NA | NA |
| 1485 | 2026-04-09 |
Single-cell multi-ome regression models identify functional and disease-associated enhancers and enable chromatin potential analysis
2024-Apr, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01689-8
PMID:38514783
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SCARlink的单细胞多组学回归模型,用于预测基因表达并识别功能性和疾病相关的增强子 | 开发了基于正则化泊松回归的基因级调控模型,避免了传统基因-峰相关性分析的局限性,并支持染色质潜力分析 | 未明确提及具体样本量或实验验证的局限性 | 构建单细胞多组学回归模型以识别增强子与靶基因的关联并分析染色质潜力 | 单细胞多组学测序数据(scRNA-seq和scATAC-seq) | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 正则化泊松回归模型 | 单细胞多组学测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1486 | 2026-04-09 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data identifies the characteristics of ferroptosis in lumbar disc herniation
2023-Sep-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01216-8
PMID:37653201
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别了腰椎间盘突出症中铁死亡的特征,并发现MYB基因可能是一个潜在的治疗靶点 | 首次将单细胞RNA测序与bulk RNA测序数据整合分析,用于研究腰椎间盘突出症中的铁死亡特征,并揭示了MYB基因在疾病中的关键作用及与免疫细胞的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅通过RT-qPCR确认了标志基因的功能,缺乏更深入的体内外功能实验验证 | 阐明铁死亡在腰椎间盘突出症发病机制中的具体作用,并寻找潜在的治疗靶点 | 腰椎间盘突出症患者的转录组数据集和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 腰椎间盘突出症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, 生物信息学分析 | LASSO, SVM-RFE, CIBERSORT, AUCell | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1487 | 2026-04-09 |
Multiomic analyses implicate a neurodevelopmental program in the pathogenesis of cerebral arachnoid cysts
2023-03, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02238-2
PMID:36879130
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了脑蛛网膜囊肿的发病机制,揭示了其与神经发育程序的关联 | 首次整合患者-父母外显子组、单细胞RNA测序转录组和医疗记录自然语言处理数据,系统性分析脑蛛网膜囊肿的遗传基础和临床亚型 | 研究样本量相对有限,且主要基于外显子组数据,可能遗漏非编码区域的变异 | 阐明脑蛛网膜囊肿的发病机制及其与神经发育障碍的关联 | 脑蛛网膜囊肿患者及其父母、人类和小鼠的脑及脑膜单细胞转录组数据 | 自然语言处理 | 脑蛛网膜囊肿 | 外显子组测序、单细胞RNA测序、自然语言处理 | NA | 基因组数据、转录组数据、文本数据 | 617个患者-父母三重外显子组、152,898个人类和小鼠脑及脑膜单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1488 | 2026-04-09 |
Cerebrospinal fluid immune dysregulation during healthy brain aging and cognitive impairment
2022-12-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.019
PMID:36516855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康衰老和认知障碍期间脑脊液免疫系统的变化 | 首次在单细胞水平上揭示了脑脊液免疫系统随年龄和认知障碍的动态变化,并发现了CXCL16-CXCR6信号通路在T细胞进入大脑中的潜在作用 | 样本量相对较小(共59例),且为横断面研究,无法确定因果关系 | 探究健康大脑衰老和认知障碍期间脑脊液免疫系统的变化 | 人类脑脊液样本 | 单细胞组学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 59例受试者(45例认知正常,14例认知障碍) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1489 | 2026-04-09 |
Metastatic Transition of Pancreatic Ductal Cell Adenocarcinoma Is Accompanied by the Emergence of Pro-Invasive Cancer-Associated Fibroblasts
2022-Apr-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14092197
PMID:35565326
|
研究论文 | 本研究通过分析胰腺导管腺癌(PDAC)从原发灶到淋巴结转移过程中的单细胞RNA测序数据,揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)在转移过程中的动态变化及其对基质侵袭性的调控作用 | 提出了“进化侵袭性水平(ELI)”框架来解释基质侵袭性的演变,并发现PDAC转移初期伴随促抵抗基因的下调和促侵袭性成纤维细胞亚群的出现 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据,实验验证部分可能有限;样本阶段覆盖可能不够全面 | 探究胰腺导管腺癌转移过程中癌症相关成纤维细胞的动态变化及其在调控基质侵袭性和促进转移中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)组织样本、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、星状细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq) | NA | 基因表达数据(RNA-seq) | 基于Peng等人已发表单细胞RNA测序数据及TCGA批量RNAseq队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1490 | 2026-04-09 |
A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-06-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02320-w
PMID:34193958
|
研究论文 | 本文介绍了一种针对酵母优化的单细胞转录组学平台yeastDrop-Seq,用于量化单个酵母细胞中不同的mRNA分子数量,并研究了霉酚酸和鸟嘌呤对全局mRNA水平的影响 | 开发了yeastDrop-Seq平台,这是对Drop-Seq技术的优化,使其适用于酵母这种细胞大小和形态特征不同的生物体,从而实现了酵母单细胞转录组的量化分析 | 平台可能仅适用于酵母细胞,对于其他生物体的应用可能仍具挑战性,且未提及样本量或技术验证的详细限制 | 研究霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞全局mRNA水平的转录组影响,并优化单细胞转录组学技术以应用于酵母 | 单个酵母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | yeastDrop-Seq | 针对酵母优化的Drop-Seq平台,用于量化单个酵母细胞中不同的mRNA分子数量 |
| 1491 | 2026-04-09 |
Cannabinoid Receptor Activation on Haematopoietic Cells and Enterocytes Protects against Colitis
2021-Jun-22, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaa253
PMID:33331878
|
研究论文 | 本研究探讨了大麻素受体激活在造血细胞和肠上皮细胞中对结肠炎的保护作用 | 揭示了THC通过作用于免疫细胞和肠上皮细胞来预防结肠炎,并明确了其独立于微生物组的抗炎机制 | 研究仅使用雌性C57BL/6小鼠,且CBD在测试剂量下效果有限,可能不适用于所有情况 | 确定大麻素在结肠炎中的抗炎作用机制,包括微生物组、代谢组以及造血和非造血细胞的贡献 | 雌性C57BL/6小鼠在化学诱导结肠炎模型中的反应 | NA | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 流式细胞术, 结肠镜检查, 组织学分析 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据, 临床参数 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1492 | 2026-04-09 |
Urinary EGF and MCP-1 and risk of CKD after cardiac surgery
2021-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.147464
PMID:33974569
|
研究论文 | 本研究评估了尿液中EGF和MCP-1作为心脏手术后慢性肾病风险的预测标志物 | 首次将反映细胞完整性的EGF和炎症标志物MCP-1联合用于预测心脏手术后的长期肾脏结局,并利用单细胞RNA测序在组织层面验证了相关基因表达变化 | 研究人群主要来自加拿大和美国的两家中心,可能存在选择偏倚,且为观察性研究,无法确定因果关系 | 评估新型尿液生物标志物对心脏手术后慢性肾病风险的预测价值 | 865名接受心脏手术的成年患者 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 尿液生物标志物数据、单细胞转录组数据 | 865名心脏手术患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1493 | 2026-04-09 |
The Rhesus Macaque Serves As a Model for Human Lateral Branch Nephrogenesis
2021-05-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020101459
PMID:33789950
|
研究论文 | 本研究利用恒河猴作为模型,探索人类晚期妊娠肾脏侧支肾单位发生的分子机制 | 首次将恒河猴确立为真实侧支肾单位发生的模型,支持了衰老肾单位祖细胞具有独特分子特征的假说 | 研究样本量有限,仅基于四个胎儿恒河猴肾脏,且依赖于人类存档组织进行验证 | 理解晚期妊娠人类胎儿肾脏发育的分子机制,特别是侧支肾单位发生 | 恒河猴胎儿肾脏及人类存档组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 免疫染色、3D渲染、单细胞RNA测序、单核RNA测序、RNAScope验证 | NA | 图像、RNA测序数据 | 四个妊娠129-131天的胎儿恒河猴肾脏皮质富集样本,以及人类存档组织 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1494 | 2026-04-09 |
Holistic characterization of single-hepatocyte transcriptome responses to high-fat diet
2021-02-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00391.2020
PMID:33103450
|
研究论文 | 本研究利用基于液滴的单细胞RNA测序技术,全面分析了高脂饮食诱导的非酒精性脂肪肝病中单个肝细胞的转录组响应特征 | 首次在单细胞水平系统表征了肝细胞对高脂饮食的异质性转录组变化,揭示了分区依赖和独立的响应模式,并发现了脂质代谢相关基因的空间共表达模式 | 研究主要关注转录组层面,未涉及蛋白质组或代谢组等多组学验证;样本来源为小鼠模型,人类临床样本的适用性有待进一步验证 | 探究高脂饮食诱导的非酒精性脂肪肝病中肝细胞的单细胞转录组响应机制 | 高脂饮食喂养小鼠的肝细胞 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但基于单细胞测序技术分析多个肝细胞 | 未明确指定 | 单细胞RNA-seq | Drop-seq | 基于液滴的单细胞RNA测序平台 |
| 1495 | 2026-04-09 |
Visual Genomics Analysis Studio as a Tool to Analyze Multiomic Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.642012
PMID:34220932
|
综述 | 本文介绍了Visual Genomics Analysis Studio (VGAS)这一集成应用,用于分析和可视化多组学单细胞数据,旨在帮助研究者无需高级生物信息学技能即可进行数据分析 | VGAS是一个用户友好的Windows图形界面应用,无需用户编程或高性能计算机,整合了性能优化的隐藏代码,提供快速直观的数据分析工具和高分辨率图形输出 | 本文作为综述,主要介绍VGAS的功能和应用,未涉及具体实验验证或性能对比数据 | 开发并推广一个集成工具,以降低多组学单细胞数据分析的技术门槛,促进免疫介导药物不良反应的研究 | 多组学单细胞数据,特别是单细胞TCR-RNA-CITE-seq数据,用于分析免疫细胞群 | 生物信息学 | 药物不良反应 | 单细胞TCR测序, 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 多组学单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1496 | 2026-04-08 |
A multidimensional analysis reveals distinct immune phenotypes and the composition of immune aggregates in pediatric acute myeloid leukemia
2024-Jul-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.03.03.23286485
PMID:37961528
|
研究论文 | 本研究通过多维分析揭示了儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的组成、表型和空间结构,特别是免疫浸润特征和T/B细胞聚集体的细胞构成 | 首次在儿童AML中发现约三分之一病例存在免疫浸润的骨髓微环境,并识别出大型T细胞网络及富含T/B细胞的免疫聚集热点 | 研究样本量有限,且主要基于观察性分析,未深入验证免疫聚集体的功能机制 | 解析儿童急性髓系白血病骨髓免疫微环境的组成与空间结构,为免疫治疗提供新见解 | 儿童急性髓系白血病患者及非白血病对照的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、免疫表型数据 | 儿童AML病例及非白血病对照(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1497 | 2026-04-08 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2024-01-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44210-1
PMID:38191471
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了前列腺癌进展中肿瘤微环境内间充质细胞的分子变化及其关键作用 | 首次通过跨物种(小鼠模型与人类肿瘤)单细胞分析,系统鉴定了八个保守的间充质细胞亚群,并发现骨转移相关基质特征,提出了超越Gleason评分的新型预后基因标志物 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类样本验证相对有限;未深入探讨间充质细胞与其他肿瘤微环境成分的动态互作机制 | 解析前列腺癌进展过程中肿瘤基质细胞的分子特征与功能作用 | 前列腺癌肿瘤微环境中的间充质细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四种基因工程小鼠模型及对应人类肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1498 | 2026-04-08 |
An Integrated Map of Cell Type-Specific Gene Expression in Pancreatic Islets
2023-11-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0130
PMID:37582230
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序构建了一个胰腺胰岛细胞类型特异性基因表达的综合图谱,涵盖多种疾病状态 | 首次整合了来自65名供体的192,203个细胞的单细胞RNA测序数据,创建了一个易于查询和用于生物信息学流程的胰岛细胞类型特异性基因表达参考图谱 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未涵盖其他组学层面(如蛋白质组学或表观遗传学)的信息,且样本来源和数量可能限制某些罕见细胞类型的全面表征 | 构建一个全面的胰岛细胞类型特异性基因表达参考图谱,以促进胰岛生物学研究和糖尿病相关疾病的理解 | 来自无糖尿病、1型糖尿病自身抗体阳性、1型糖尿病和2型糖尿病供体的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 192,203个细胞,来自65名供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1499 | 2026-04-08 |
The 'omics of obesity in B-cell acute lymphoblastic leukemia
2023-05-04, Journal of the National Cancer Institute. Monographs
DOI:10.1093/jncimonographs/lgad014
PMID:37139973
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨肥胖如何影响B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)的细胞功能和化疗耐药性 | 首次结合单细胞和批量转录组学、代谢组学及蛋白质组学分析,揭示脂肪细胞分泌组对B-ALL细胞的代谢、氧化应激保护、生存和化疗耐药性的调控作用,并发现肥胖相关的B细胞特异性转录特征与患者生存结局相关 | 研究主要基于体外和动物模型,人类样本分析可能受限于样本数量和异质性,且未详细探讨肥胖与B-ALL之间的因果关系机制 | 探究肥胖如何通过脂肪细胞影响B-ALL细胞的生物学功能及化疗耐药性,以识别潜在的治疗靶点 | 正常和恶性B细胞、小鼠模型、健康捐赠者和B-ALL患者的血清和血浆样本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA测序(单细胞和批量转录组学)、质谱分析(代谢组学和蛋白质组学) | NA | 转录组数据、代谢组数据、蛋白质组数据 | 涉及小鼠模型、健康捐赠者和B-ALL患者的样本,具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 代谢组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1500 | 2026-04-08 |
Single-cell RNA-seq integrated with multi-omics reveals SERPINE2 as a target for metastasis in advanced renal cell carcinoma
2023-01-16, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05566-w
PMID:36646679
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与多组学数据,揭示了SERPINE2作为晚期肾细胞癌转移的潜在治疗靶点 | 首次在晚期肾细胞癌中整合单细胞转录组、Hi-C、ATAC-seq和RNA-seq多组学数据,系统解析了恶性细胞与肿瘤微环境的相互作用,并鉴定出SERPINE2作为关键转移驱动因子 | 样本量相对有限(8例患者组织样本),主要基于细胞系验证,需要在更大规模临床队列中进一步验证 | 揭示晚期肾细胞癌进展中基因组、转录组和表观遗传改变的机制,并寻找转移治疗靶点 | 肾细胞癌患者组织样本、Caki-1肾癌细胞系、HK-2人肾小管上皮细胞系 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, Hi-C, ATAC-seq, RNA测序, 微阵列, 组织芯片 | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据, 三维基因组数据, 批量转录组数据 | 8例RCC患者组织样本(含2对原发-转移匹配样本), 407例RCC患者微阵列数据, 两个组织芯片队列(TMA-30和TMA-2020) | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RNA-seq | NA | NA |