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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1481 | 2025-10-05 |
Complete Response to BET Inhibitor in Primary Pulmonary NUT Carcinoma With Single-Cell Sequencing-Based Analysis: A Case Report
2025-Oct, JTO clinical and research reports
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jtocrr.2025.100885
PMID:40926997
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病例报告 | 报道一例原发性肺NUT癌患者通过BET抑制剂NHWD-870单药治疗获得完全缓解的病例 | 首次报道BET抑制剂单药治疗NUT癌获得完全缓解,并通过单细胞测序揭示其通过直接抑制肿瘤和调节免疫微环境双重机制发挥作用 | 单病例报告,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探讨BET抑制剂在NUT癌治疗中的疗效和机制 | 36岁IIIB期原发性肺NUT癌患者 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1482 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal Proliferative Heterogeneity of Intraorgan Endothelial Cells
2025-Sep-12, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326748
PMID:40814781
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研究论文 | 本研究揭示了心脏、肝脏和肺脏中内皮细胞增殖的时空异质性及其调控机制 | 首次开发内皮细胞特异性增殖追踪系统,发现同一器官内不同区域内皮细胞存在显著增殖异质性 | 研究主要聚焦于三种器官,其他器官的内皮细胞增殖异质性仍需进一步探索 | 探究同一器官内内皮细胞增殖的时空异质性及其分子机制 | 小鼠心脏、肝脏和肺脏的内皮细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | RNA测序,空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | 多个器官的内皮细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
1483 | 2025-10-05 |
Customized Design and Preparation of Bionic Drug Delivery System Leveraging Single-Cell RNA Sequencing for Precisely Targeted Therapy
2025-Sep-12, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501497
PMID:40936355
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术开发了一种针对急性肾损伤关键细胞亚型的仿生药物递送系统 | 首次结合单细胞RNA测序技术识别急性肾损伤的关键细胞亚型,并基于此定制设计仿生药物递送系统 | 研究仅针对急性肾损伤模型,在其他疾病中的应用效果尚待验证 | 开发精准靶向治疗的仿生药物递送系统 | 急性肾损伤的关键细胞亚型(PTIs) | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1484 | 2025-10-05 |
Retinoic Acid Inhibition Alters Intestinal Composition in Zebrafish: A Non-genetic Model to Study Hirschsprung Disease?
2025-Sep-12, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.70155
PMID:40937495
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研究论文 | 本研究通过抑制斑马鱼体内视黄酸合成,探究其对肠道细胞组成的广泛影响及其作为先天性巨结肠疾病模型的潜力 | 首次在斑马鱼模型中系统揭示视黄酸抑制对神经元和非神经元肠道细胞组成的全面影响,并比较其与遗传性HSCR模型的差异 | 两种模型(DEAB处理和ret突变)在非神经元细胞变化方面存在显著差异,提示模型间的生物学机制不完全一致 | 研究视黄酸在肠道发育中的作用及其与先天性巨结肠疾病的关联 | 斑马鱼幼虫 | 发育生物学 | 先天性巨结肠疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | DEAB处理组、野生型和ret突变HSCR模型斑马鱼 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1485 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals developmental trajectories and environmental regulation of callus formation in Arabidopsis
2025-Sep-12, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00255-4
PMID:40938467
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥愈伤组织形成的发育轨迹和环境调控机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了愈伤组织发育过程中的转录组动态和转录因子调控网络 | 研究仅聚焦于拟南芥模型,未在其他植物物种中验证 | 探索植物愈伤组织发育的调控网络和细胞命运决定机制 | 拟南芥愈伤组织细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | UMAP聚类,伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 拟南芥愈伤组织在起始、增殖和绿化三个关键阶段的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1486 | 2025-10-05 |
Novel Genetic Loci for Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease and Potential Protective Effect of Body Mass Index
2025-Sep-12, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202406-1253OC
PMID:40938630
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研究论文 | 通过全基因组关联研究鉴定非结核分枝杆菌肺病的遗传位点并探索BMI的保护作用 | 发现两个新的NTM-PD遗传位点并验证一个已知位点,首次通过孟德尔随机化揭示BMI与NTM-PD的潜在因果关系 | 研究人群主要基于东亚和欧洲人群,样本量在部分队列中相对有限 | 识别NTM-PD的遗传结构并评估九个风险因素与疾病的关联 | 非结核分枝杆菌肺病患者和健康对照人群 | 基因组学 | 肺部疾病 | 全基因组关联研究, 数量性状位点分析, 单细胞转录组分析, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 韩国队列:1,949例患者和2,955例对照;日本队列:1,137例患者和1,546例对照;欧洲队列:243例患者和570例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1487 | 2025-10-05 |
Insulin signalling-associated cell fate promotes neoplastic invasiveness in non-functioning pituitary gonadotroph adenoma via cis-regulatory elements activation
2025-Sep-11, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03122-1
PMID:40935899
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据揭示了胰岛素信号通路通过顺式调控元件激活促进无功能垂体促性腺激素腺瘤侵袭性的分子机制 | 首次发现胰岛素信号相关细胞命运驱动NFGA侵袭性,并鉴定出SREBF1和IGF2BP2相关的顺式调控元件在肿瘤侵袭中的关键作用 | 样本量有限(仅3例患者进行单细胞测序),需要更大规模研究验证发现 | 探究无功能垂体促性腺激素腺瘤侵袭性的分子机制 | 无功能垂体促性腺激素腺瘤患者肿瘤组织和原代细胞系 | 单细胞多组学 | 垂体腺瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 体外功能验证 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 3例NFGA患者(单细胞测序)+ 210例患者队列验证 + 3个原代细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
1488 | 2025-10-05 |
AP2X-1 is a negative regulator of Toxoplasma gondii sexual commitment
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00052-25
PMID:40823841
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研究论文 | 本研究鉴定AP2X-1作为弓形虫有性发育的关键负调控因子 | 首次发现AP2X-1通过调控HDAC3/MORC复合物功能抑制缓殖子和有性阶段特异性基因表达 | 未明确AP2X-1与HDAC3/MORC复合物相互作用的分子机制细节 | 探究弓形虫生活周期转换的调控机制 | 弓形虫AP2X-1转录因子及其调控网络 | 分子生物学 | 寄生虫感染 | 单细胞测序,CUT&Tag,ATAC-seq | 基因敲除模型 | 基因组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,染色质可及性分析 | NA | NA |
1489 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment in osteoarthritis: from heterogeneity to therapeutic targets
2025-Sep-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115521
PMID:40934543
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综述 | 系统总结单细胞RNA测序技术在解析骨关节炎免疫微环境中的关键进展 | 从传统机械磨损理论转向免疫炎症驱动新范式,首次系统绘制免疫细胞动态轨迹和细胞间配体-受体网络 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进行理论总结 | 解析骨关节炎免疫微环境特征并寻找治疗靶点 | 骨关节炎患者关节组织中的免疫细胞和关节常驻细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1490 | 2025-10-05 |
Endothelin B receptor inhibition rescues aging-dependent neuronal regenerative decline
2025-Sep-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100217
PMID:40924015
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研究论文 | 本研究揭示通过抑制内皮素B受体可改善衰老导致的神经元再生能力下降 | 首次发现卫星胶质细胞表达内皮素B受体,并证明其抑制可逆转衰老相关的轴突再生能力下降 | 机制研究尚未完全阐明,临床转化需要进一步验证 | 探索衰老导致神经元再生能力下降的机制及治疗策略 | 背根神经节中的感觉神经元和卫星胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,电子显微镜 | NA | 基因表达数据,显微图像 | 成年和老年小鼠的背根神经节 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
1491 | 2025-10-05 |
Computational pathology annotation enhances the resolution and interpretation of breast cancer spatial transcriptomics data
2025-Sep-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01104-3
PMID:40925915
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研究论文 | 本研究开发了一种计算病理学图像分析流程,用于增强乳腺癌空间转录组数据的解析和解释 | 提出计算组织注释(CTA)流程,利用机器学习算法在Visium平台数据中精确映射肿瘤、基质和免疫区室,提高数据分析分辨率 | 研究样本量较小(仅4名患者的23个肿瘤切片),且空间转录组技术尚未达到单细胞分辨率 | 开发计算病理学方法以增强乳腺癌空间转录组数据的解析能力 | 乳腺癌肿瘤组织切片 | 计算病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,机器学习 | 机器学习算法 | 图像,空间转录组数据 | 4名患者的23个乳腺癌肿瘤切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组平台 |
1492 | 2025-10-05 |
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-Sep-08, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106050
PMID:40930164
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综述 | 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统其他细胞类型的动态相互作用及其功能多样性 | 突破传统仅关注髓鞘形成功能的认知,通过单细胞测序和活体成像技术揭示OPCs在神经发育、稳态维持和病理重塑中的多模态功能 | NA | 整合OPCs非髓鞘形成功能的现有证据,探讨神经再生医学的治疗靶点 | 少突胶质前体细胞与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、血管内皮细胞的相互作用 | 神经科学 | 多发性硬化症, 脑缺血 | 单细胞测序, 活体成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1493 | 2025-10-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify dihydrolipoic acid succinyltransferase as a promoter of tumor invasion via vascular pathways in cutaneous melanoma
2025-Sep-07, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147504
PMID:40925436
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了二氢硫辛酸琥珀酰转移酶通过血管途径促进皮肤黑色素瘤侵袭的新机制 | 首次发现DLST通过调控组蛋白去甲基化酶KDM4C活性,影响H3K9和H3K27去甲基化,从而促进黑色素瘤进展 | DLST与KDM4C相互作用的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究DLST在黑色素瘤进展中的作用机制及其临床意义 | 皮肤黑色素瘤患者样本和黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,生物信息学分析,siRNA沉默,免疫共沉淀,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
1494 | 2025-10-05 |
DNA methylation subtypes dictate metastatic heterogeneity of osteosarcoma via distinct tumor-stromal interactions: Multi-omics profiling and decitabine validation
2025-Sep-05, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147473
PMID:40915448
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研究论文 | 通过整合DNA甲基化分析和单细胞RNA测序,揭示骨肉瘤转移异质性的表观遗传机制 | 首次发现DNA甲基化亚型通过不同的肿瘤-基质相互作用决定骨肉瘤转移异质性,并验证了地西他滨的治疗潜力 | NA | 阐明骨肉瘤转移异质性的表观遗传驱动机制 | 骨肉瘤细胞和肿瘤微环境中的基质细胞 | 表观遗传学 | 骨肉瘤 | DNA甲基化分析, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 假时间轨迹分析 | NA | 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量DNA甲基化分析 | NA | NA |
1495 | 2025-10-05 |
FmH2ST: foundation model-based spatial transcriptomics generation from histological images
2025-Sep-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf865
PMID:40923764
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研究论文 | 提出基于基础模型的FmH2ST方法,从组织学图像预测空间基因表达 | 采用预训练基础模型和双分支框架,结合多级特征提取和双图策略解决切片间异质性和切片内复杂性 | NA | 从组织学图像预测空间转录组数据 | 组织学图像和空间转录组数据 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 基础模型, Transformer, 图神经网络, 多尺度卷积 | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1496 | 2025-10-05 |
Persistent and progressive acute lung allograft dysfunction is linked to cell compositional and transcriptional changes in small airways
2025-Sep, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2025.03.010
PMID:40293382
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析急性肺移植物功能障碍患者小气道的细胞组成和转录变化 | 首次将急性肺移植物功能障碍的临床进展与单细胞水平的细胞组成和转录变化相关联 | 样本量较小(总样本20例),属于初步研究 | 识别急性肺移植物功能障碍进展为慢性肺移植物功能障碍的分子标志物 | 肺移植受者的小气道细胞 | 单细胞测序分析 | 肺移植相关并发症 | 单细胞RNA测序 | PERMANOVA统计模型 | 单细胞转录组数据 | 20例肺移植受者(8例对照组,4例恢复组,5例持续组,3例进展组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1497 | 2025-10-05 |
Global transcriptome characterization of peripheral blood mononuclear cells in individuals with chronic HIV infection
2025-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111082
PMID:40639496
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析HIV感染者外周血单个核细胞的免疫代谢特征 | 首次在HIV感染不同临床进展群体中系统比较PBMCs的代谢谱差异,发现免疫无应答者存在显著的代谢紊乱 | 样本量较小(仅18例),且为横断面研究无法确定因果关系 | 探究不同HIV感染群体外周血单个核细胞的免疫代谢差异 | HIV感染者的外周血单个核细胞,包括免疫应答者、免疫无应答者、典型进展者和精英控制者 | 单细胞组学 | HIV感染/艾滋病 | RNA-seq,单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例HIV感染者(4例IRs,5例INRs,5例TPs,4例ECs) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1498 | 2025-10-05 |
Pericytes change function depending on glioblastoma vicinity: emphasis on immune regulation
2025-Sep, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70095
PMID:40674254
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胶质母细胞瘤微环境中壁细胞的空间异质性及其免疫调节功能 | 首次发现壁细胞在肿瘤内部和边界区域具有不同的转录组特征和免疫调节功能 | 研究样本量有限,需要进一步验证功能机制 | 探究胶质母细胞瘤微环境中壁细胞的空间异质性及其免疫调节作用 | 小鼠和人类胶质母细胞瘤样本中的壁细胞(包括周细胞和平滑肌细胞) | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1499 | 2025-10-05 |
Exploring the mechanism of action of trastuzumab-induced cardiomyocyte atrophy based on the FN1/PI3K/AKT-mediated mTOR-independent signaling pathway
2025-Sep, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111087
PMID:40683573
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和生物信息学方法探索了曲妥珠单抗通过FN1/PI3K/AKT介导的mTOR非依赖性信号通路诱导心肌细胞萎缩的机制 | 首次发现免疫细胞来源的FN1通过细胞外基质机制激活PI3K/AKT介导的mTOR非依赖性信号通路在曲妥珠单抗诱导的心肌毒性中的作用 | NA | 研究曲妥珠单抗诱导心肌毒性的潜在靶点和信号通路 | 心肌细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌相关心肌病 | 单细胞转录组测序,生物信息学分析,Western blot,RT-PCR,免疫荧光,透射电镜 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1500 | 2025-10-05 |
Oxidative Stress Links Thyroid Autoimmunity to Cancer: Peroxiredoxin 2 Protection via Genomic and Single-Cell Insights
2025-Sep, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251360744
PMID:40735789
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的共享遗传因素,发现PRDX2是关键保护因子 | 首次结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和机器学习分类模型,系统揭示PRDX2在甲状腺自身免疫和癌症中的保护作用机制 | 样本来源相对有限,主要基于FinnGen数据库和单细胞测序数据,需要更多独立队列验证 | 探索桥本甲状腺炎与甲状腺癌之间的遗传联系和分子机制 | 甲状腺细胞和甲状腺疾病患者 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 机器学习 | 机器学习分类模型 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 76,243个甲状腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |