单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1481 - 1500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2025-10-05 |
Deciphering the combinatorial expression pattern and genetic regulatory mechanisms of Beats and Sides in the olfactory circuits of Drosophila
2025-Aug-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.31.657193
PMID:40502011
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转基因驱动线分析果蝇嗅觉回路中Beat和Side基因家族的表达模式及其调控机制 | 首次系统揭示了果蝇嗅觉神经元中Beat和Side基因的类别特异性组合表达模式，并发现其在昆虫进化中的保守性 | 干扰Beat-IIa-Side-IV相互作用未在检测的两个肾小球中产生显著错误靶向，功能验证有限 | 解析果蝇嗅觉回路中Beat和Side基因家族的组合表达模式及其遗传调控机制 | 果蝇的嗅觉受体神经元(ORNs)和投射神经元(PNs) | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 基因陷阱转基因驱动线技术 | NA | 基因表达数据, 转基因品系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1482 | 2025-10-05 |
Immunomodulatory effects of a short-term gluten-free diet on pediatric celiac disease: Findings from a single-cell transcriptomics study
2025-Aug-11, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110063
PMID:40803542
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析探讨短期无麸质饮食对儿童乳糜泻患者免疫细胞的调节作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析短期无麸质饮食对儿童乳糜泻患者外周血单个核细胞的免疫调节机制 | 样本量较小（仅5名患者），结果需要更大规模队列研究进一步验证 | 研究短期无麸质饮食对儿童乳糜泻患者免疫细胞转录组的影响 | 儿童乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名儿童乳糜泻患者（干预前后配对样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴式单细胞RNA测序 |
| 1483 | 2025-10-05 |
Plasma Proteomics Reveals Dysregulated Pathways Across the Spectrum LMNA Cardiomyopathy
2025-Aug, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.124.004924
PMID:40509996
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研究论文 | 通过血浆蛋白质组学分析揭示LMNA心肌病发展过程中的失调通路 | 首次在LMNA心肌病中鉴定出EDA2R、MYL4等新型蛋白标志物，并发现26个蛋白在心肌细胞中呈现一致性差异表达 | 样本量相对有限（LMNA组41例，肌小节组18例），需要更大规模研究验证 | 探索LMNA基因致病变异相关的蛋白质和生物学通路 | 遗传性扩张型心肌病患者（LMNA和肌小节变异）及表型阴性家族成员 | 蛋白质组学 | 心血管疾病 | 血浆蛋白质组学分析，单细胞测序 | 主成分分析 | 蛋白质表达数据，基因表达数据 | 114例（41例LMNA DCM，18例肌小节DCM，55例表型阴性个体） | OLINK | 血浆蛋白质组学 | OLINK平台 | 测量约3000种血浆蛋白质 |
| 1484 | 2025-10-05 |
Autophagy-related biomarkers in non-obstructive azoospermia: insights from transcriptomics and single-cell sequencing
2025-Aug, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03559-6
PMID:40587077
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序技术筛选非梗阻性无精子症中的自噬相关生物标志物 | 首次结合差异表达分析、WGCNA和机器学习算法筛选NOA的自噬相关生物标志物，并在单细胞水平验证其表达模式 | 研究主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 探索自噬相关基因在非梗阻性无精子症中的作用并筛选诊断生物标志物 | 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | 生物信息学 | 男性不育症 | 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个公共数据集（包括GSE9210和GSE145467） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 1485 | 2025-09-14 |
Comparative spatial transcriptomics of pancreatic cancer with ductal and acinar origins in mouse models
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70416
PMID:40717219
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1486 | 2025-10-05 |
Barcoded monoclonal embryoids are a potential solution to confounding bottlenecks in mosaic organoid screens
2025-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655669
PMID:40475436
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研究论文 | 本研究开发了条形码单克隆胚胎体技术，解决了嵌合体类器官筛选中因细胞瓶颈导致的统计效力不足和结果混淆问题 | 开发了可扩展的单克隆胚胎体协议，通过遗传条形码技术解决了嵌合体类器官筛选中细胞瓶颈导致的统计效力限制 | 研究仍处于概念验证阶段，需要在更广泛的遗传扰动和表型分析中进一步验证 | 解决嵌合体类器官遗传筛选中因细胞瓶颈导致的统计效力不足和结果不可重复性问题 | 小鼠胚胎干细胞和胚胎体 | 发育生物学 | NA | CRISPR筛选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1487 | 2025-10-05 |
Resident memory T cell development is gradual and shows AP-1 gene expression in mature cells
2025-Jun-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187381
PMID:40548376
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了组织驻留记忆T细胞发育的渐进过程及成熟细胞中AP-1转录因子家族的关键作用 | 首次定义了跨越皮肤和小肠上皮淋巴细胞的时序性TRM特征，发现AP-1转录因子家族在成熟TRM中的特异性表达 | 研究主要关注CD8+ TRM细胞，其他T细胞亚型的研究相对有限 | 阐明组织驻留记忆T细胞分化机制及其回忆效应功能的启动原理 | CD8+ 组织驻留记忆T细胞（皮肤和小肠上皮淋巴细胞） | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 循环免疫荧光成像 | 线性模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据, 组织成像数据 | 10个发育时间点的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 空间成像 | NA | NA |
| 1488 | 2025-10-05 |
Maintenance of chronic neuroinflammation in multiple sclerosis via interferon signaling and CD8 T cell-mediated cytotoxicity
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.09.658729
PMID:40568143
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了多发性硬化中慢性神经炎症的机制，发现干扰素信号和CD8 T细胞介导的细胞毒性是主要驱动因素 | 首次将放射学特征（PRL）与单细胞水平的免疫反应机制相关联，揭示了B细胞耗竭治疗后仍持续的CD8 T细胞介导的神经炎症机制 | 样本量相对有限（34名MS患者和5名健康对照），且未能完全阐明所有提名治疗靶点的具体作用机制 | 探究多发性硬化中慢性神经炎症的分子机制和潜在治疗靶点 | 多发性硬化患者和健康对照者的脑脊液和血液免疫细胞 | 单细胞生物学 | 多发性硬化 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 蛋白质组数据 | 34名多发性硬化成年患者（17名未治疗，6名B细胞耗竭治疗）和5名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1489 | 2025-10-05 |
High-throughput differentiation of human blood vessel organoids reveals overlapping and distinct functions of the cerebral cavernous malformation proteins
2025-Jun-06, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-09985-5
PMID:40478324
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研究论文 | 本研究通过高通量分化人血管类器官揭示脑 cavernous 畸形蛋白的重叠和独特功能 | 结合高通量血管类器官分化、单细胞RNA测序和高内涵成像技术系统比较CCM1/2/3基因敲除的功能差异 | 研究主要基于体外类器官模型，需要进一步体内验证 | 探究CCM3突变为何比CCM1/2突变导致更严重表型的分子机制 | 人诱导多能干细胞分化的血管类器官 | 单细胞生物学 | 脑血管畸形 | 单细胞RNA测序, 高内涵成像, 基因敲除 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 96孔板高通量格式的血管类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1490 | 2025-10-05 |
A novel frameshift mutation in Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 1 (PIK3R1) causes immunodeficiency and Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655625
PMID:40568112
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研究论文 | 本研究通过鉴定PIK3R1基因的新型移码突变，揭示了其在免疫缺陷和肌萎缩侧索硬化症发病机制中的作用 | 首次报道PIK3R1基因c.1710dup移码突变导致单倍体不足，并通过iPSC模型证明其对神经元功能和存活的影响 | 研究基于单例患者样本，需要更大样本量验证 | 探究PIK3R1基因突变在免疫缺陷和神经系统疾病中的致病机制 | 携带PIK3R1 c.1710dup突变的常见变异型免疫缺陷患者及其iPSC衍生细胞模型 | 遗传学与神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序，iPSC技术，脑类器官培养 | iPSC衍生运动神经元和脑类器官模型 | 基因测序数据，单细胞转录组数据，细胞功能数据 | 1例患者及其iPSC衍生细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1491 | 2025-10-05 |
Alternatively activated monocyte-derived myeloid cells promote extracellular pathogen persistence within pulmonary fungal granulomas
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655817
PMID:40568097
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研究论文 | 本研究揭示了CD4 T辅助2细胞通过替代性激活单核来源髓系细胞抑制肺部真菌清除的新机制 | 发现替代性激活的髓系细胞并非真菌内在复制场所，且真菌主要存在于细胞外环境，提出了T辅助2细胞-髓系细胞环路驱动细胞外真菌持续存在的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究潜伏性真菌感染中无法产生灭菌免疫的机制 | 隐球菌肉芽肿的免疫动态和细胞结构 | 空间转录组学 | 真菌感染 | 空间转录组学, 流式细胞术, 命运图谱, 小鼠遗传工具 | NA | 空间转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1492 | 2025-10-05 |
Trajectories of macrophage ontogeny and reprogramming in cancer
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112498
PMID:40475851
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤相关巨噬细胞的发育轨迹及其在癌症免疫治疗中的重编程机制 | 首次通过伪时间分析揭示了巨噬细胞从免疫刺激状态向免疫抑制状态的发育轨迹，并发现特定基因失活可阻断这一过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索肿瘤相关巨噬细胞的发育轨迹及其在免疫治疗中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠癌症模型和癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1493 | 2025-10-05 |
An improved nuclei isolation protocol from leaf tissue for single-cell transcriptomics
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302118
PMID:40929130
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研究论文 | 本研究开发了一种从玉米叶片组织中分离细胞核的改进方案，用于单细胞转录组学研究 | 利用叶绿体自发荧光特性在FACS步骤中有效去除叶绿体污染，提高了测序reads与基因组和转录组的比对效率 | 该方法主要针对高叶绿体含量的植物叶片组织，在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 | 开发适用于高叶绿体含量植物组织的单细胞核RNA测序样品制备方法 | 玉米叶片组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞核RNA测序，荧光激活细胞分选 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1494 | 2025-10-05 |
CD8+ T-cell differentiation and dysfunction inform treatment response in acute myeloid leukemia
2024-09-12, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023021680
PMID:38776511
|
研究论文 | 本研究通过多模态方法揭示了CD8+ T细胞分化状态与急性髓系白血病治疗反应的关系 | 发现早期记忆CD8+ T细胞分化为两个不同的终末状态，并揭示CD8+衰老细胞偏向分化是治疗抵抗的标志 | NA | 探究CD8+ T细胞分化状态、功能障碍与AML治疗反应的关联机制 | 急性髓系白血病患者的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 高维流式细胞术, 单细胞转录组学 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1495 | 2025-10-05 |
From womb to wellness: early environmental exposures, cord blood DNA methylation and disease origins
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2390823
PMID:39263926
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综述 | 探讨胎儿环境暴露通过脐带血DNA甲基化影响疾病起源的机制与研究方向 | 系统阐述脐带血DNA甲基化作为胎儿表观遗传窗口的重要性，并提出单细胞测序等新技术应用前景 | 存在组织特异性问题、现有甲基化芯片覆盖度有限、细胞组成变异等混杂因素 | 阐明早期环境暴露与表观基因组相互作用机制，开发预防策略 | 脐带血DNA甲基化与胎儿环境暴露 | 表观遗传学 | 发育源性疾病 | DNA甲基化分析，单细胞测序 | NA | 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1496 | 2025-10-05 |
Identification of a novel cuproptosis-related gene signature for rheumatoid arthritis-A prospective study
2023-11, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3535
PMID:37338187
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，鉴定出与类风湿关节炎相关的铜死亡关键基因DLAT | 首次在类风湿关节炎中系统研究铜死亡相关基因，发现DLAT作为关键生物标志物与滤泡辅助性T细胞密切相关 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索铜死亡相关基因在类风湿关节炎发病机制中的作用 | 类风湿关节炎患者样本和永生化人软骨细胞 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 生物信息学分析，qRT-PCR，单细胞测序，细胞实验 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1497 | 2025-10-05 |
Exploration of s new biomarker in osteosarcoma and association with clinical outcomes: TOP2A+ cancer associated fibroblasts
2023-11, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3528
PMID:37246449
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析识别骨肉瘤中致癌性癌症相关成纤维细胞亚群TOP2A+ CAFs，并构建预后预测模型 | 首次系统研究骨肉瘤中CAFs的作用，识别出TOP2A+ CAFs这一致癌亚群，并基于其差异表达基因构建高精度预后预测模型 | 样本量较小（仅6例单细胞数据），需要更大规模研究验证 | 探索骨肉瘤中癌症相关成纤维细胞的作用并开发预后预测工具 | 骨肉瘤患者样本和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析，LASSO回归，ROC分析 | LASSO回归，列线图模型 | 单细胞RNA测序数据，批量转录组数据 | 6例单细胞RNA测序样本，88例预后分析样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 1498 | 2025-10-06 |
The multifaceted role of SQSTM1/p62 in disc degeneration: A master regulator of cellular stress responses
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102222
PMID:40933658
|
综述 | 本文综述了SQSTM1/p62蛋白在椎间盘退变中的多面性作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 系统总结了SQSTM1在椎间盘退变中通过调控自噬、氧化应激、炎症和程序性细胞死亡等多重途径的核心作用 | 精确调控SQSTM1活性及将研究发现转化为临床疗法仍面临挑战 | 探讨SQSTM1/p62在椎间盘退变发病机制中的多面性功能 | SQSTM1/p62蛋白及其在椎间盘退变中的作用机制 | 分子病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、类器官模型 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1499 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous response of interlamellar cell mass to hypoxic stress in crucian carp (Carassius auratus) gills
2025-Nov, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110584
PMID:40701446
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示鲫鱼鳃中间片细胞团对缺氧应激的异质性响应机制 | 首次在单细胞水平揭示鲫鱼鳃中间片细胞团对缺氧应激的异质性响应，发现内质网应激是细胞凋亡主要通路 | 研究仅针对鲫鱼特定细胞类型，未验证其他鱼类或组织的普适性 | 探究鱼类鳃组织对缺氧应激的细胞分子响应机制 | 鲫鱼（Carassius auratus）鳃组织中的间片细胞团 | 单细胞生物学 | 缺氧应激 | 单细胞RNA测序，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，组织切片图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1500 | 2025-10-05 |
Hemocyte diversity in crustaceans
2025-Nov, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110612
PMID:40750028
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综述 | 本文综述了甲壳动物血细胞多样性的研究进展，包括传统分类方法和新兴单细胞RNA测序技术带来的新发现 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了新的血细胞分子标记，挑战了基于形态学的传统血细胞分类方法 | NA | 探讨甲壳动物血细胞的多样性、分类和功能 | 甲壳动物（特别是小龙虾和虾类）的循环血细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |