单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1481	2025-05-24	A phase 2 randomized trial with autologous polyclonal expanded regulatory T cells in children with new-onset type 1 diabetes 2024-05-08, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adn2404 PMID:38718135	研究论文	该研究探讨了自体多克隆扩增调节性T细胞（expT）在新发1型糖尿病儿童中的安全性和有效性	首次在儿童和青少年中进行自体多克隆扩增调节性T细胞的随机二期临床试验，并评估其安全性和对β细胞功能的影响	单次剂量的expT未能显著阻止β细胞功能的下降，且治疗效果与T细胞的质量相关	评估自体多克隆扩增调节性T细胞在1型糖尿病治疗中的安全性和有效性	新发1型糖尿病的儿童和青少年	临床医学	1型糖尿病	流式细胞术、批量RNA测序、单细胞RNA测序	NA	临床数据、RNA测序数据	110名儿童和青少年患者
1482	2025-05-24	Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence 2024-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.04.29.591541 PMID:38746119	research paper	该研究通过单细胞测序技术，探索了不同细胞内信号域（ICD）结构如何影响CAR-T细胞的功能，特别是在分子水平上	首次系统性地研究了不同ICD结构如何通过信号传导影响CAR-T细胞的转录输出和功能，并发现了一种与持久性相关的独特信号特征	研究发现这种持久性信号特征仅适用于液体肿瘤，对实体瘤无效	解码CAR信号传导的设计原则，为下一代优化ICD结构的合理设计提供依据	表达嵌合抗原受体（CARs）的工程化T细胞	免疫治疗	肿瘤	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	NA
1483	2025-05-24	Targeting of epigenetic co-dependencies enhances anti-AML efficacy of Menin inhibitor in AML with MLL1-r or mutant NPM1 2023-04-13, Blood cancer journal IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41408-023-00826-6 PMID:37055414	研究论文	本研究探讨了Menin抑制剂（MI）在携带MLL1-r或mtNPM1的AML患者中的抗白血病效果，并通过联合靶向表观遗传共依赖性增强其疗效	发现MI与BET、MOZ、LSD1或CBP/p300抑制剂联合使用可协同降低AML细胞的存活率，并在体内模型中显示出显著优越的疗效	研究主要基于临床前模型，尚未在临床试验中验证其效果	增强Menin抑制剂在AML治疗中的疗效，防止AML干细胞/祖细胞逃逸	携带MLL1-r或mtNPM1的AML细胞	肿瘤学	急性髓系白血病（AML）	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、染色质免疫沉淀测序（ChiP-Seq）、ATAC-Seq、RNA测序（RNA-Seq）、反向蛋白质阵列（RPPA）、质谱流式细胞术（CyTOF）	CRISPR-Cas9筛选	基因组数据、转录组数据、蛋白质数据	临床前研究中的AML细胞系和异种移植模型
1484	2025-05-24	Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy 2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy DOI:10.2147/DMSO.S413569 PMID:37312900	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，结合多种机器学习方法，识别了糖尿病肾病中的新型免疫特征	首次从免疫学角度揭示了糖尿病肾病进展的关键免疫相关基因和潜在药物靶点	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证	探索糖尿病肾病中免疫调节的潜在治疗靶点和分子机制	糖尿病肾病患者的基因表达数据和免疫相关基因	生物信息学	糖尿病肾病	单细胞RNA测序, 大块RNA测序, WGCNA, CIBERSORT算法	随机森林(RF), 支持向量机(SVM), AdaBoost, KNN	基因表达数据	来自GEO数据库的多个数据集，包括GSE142025等
1485	2025-05-24	Lysyl oxidase promotes anaplastic thyroid carcinoma cell proliferation and metastasis mediated via BMP1 2022-Jan, Gland surgery IF:1.5Q3 DOI:10.21037/gs-21-908 PMID:35242686	研究论文	本文研究了赖氨酰氧化酶（LOX）和骨形态发生蛋白-1（BMP1）在促进未分化甲状腺癌（ATC）细胞增殖和转移中的作用	揭示了LOX/BMP1轴在ATC恶性进展中的关键作用，为基于该轴的靶向治疗提供了新思路	研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏体内实验验证	探索ATC的新型治疗靶点	未分化甲状腺癌细胞	癌症研究	甲状腺癌	单细胞RNA测序、微阵列分析、定量实时PCR、Western blot、siRNA敲低、CCK-8实验、克隆形成实验、伤口愈合实验、Transwell实验	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	ATC组织和细胞系
1486	2025-05-23	Mendelian randomization combined with single-cell sequencing data analysis of chemokines and chemokine receptors and key genes and molecular mechanisms associated with epilepsy 2025-Jun-04, Neuroreport IF:1.6Q4 DOI:10.1097/WNR.0000000000002168 PMID:40298633	研究论文	结合孟德尔随机化和单细胞测序数据分析趋化因子及其受体在癫痫中的作用及分子机制	首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别出与癫痫相关的关键基因和免疫细胞	研究结果需要进一步的实验验证，样本来源和数量未明确说明	探索趋化因子及其受体相关基因在癫痫中的功能和潜在调控机制	趋化因子及其受体相关基因、癫痫	生物信息学	癫痫	孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	NA
1487	2025-05-23	Functional diversity of cardiac macrophages in health and disease 2025-Jun, Nature reviews. Cardiology DOI:10.1038/s41569-024-01109-8 PMID:39743564	review	本文综述了心脏巨噬细胞在健康和疾病中的功能多样性，探讨了它们的发育起源、转录特征以及在心脏稳态和疾病中的不同作用	利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了心脏巨噬细胞的新细胞状态和疾病相关细胞邻域	NA	探讨心脏巨噬细胞在心脏疾病发病机制中的作用，为新的治疗靶点和诊断工具的研发提供基础	心脏巨噬细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
1488	2025-05-23	The molecular mechanism by which CTSB degrades FPN to disrupt macrophage iron homeostasis and promote the progression of atherosclerosis 2025-Jun, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05228-9 PMID:39960586	研究论文	本文研究了CTSB通过降解FPN破坏巨噬细胞铁稳态并促进动脉粥样硬化进展的分子机制	首次揭示了CTSB通过降解FPN调控巨噬细胞铁死亡进而影响动脉粥样硬化进展的分子机制	研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限	阐明CTSB在动脉粥样硬化进展中的作用机制	巨噬细胞铁稳态和动脉粥样硬化斑块	分子病理学	心血管疾病	单细胞转录组分析、基因敲除、药理学抑制	ApoE敲除小鼠和高脂饮食SD大鼠模型	基因表达数据、蛋白质水平数据	两种动物模型（数量未明确）和人类AS组织单细胞数据
1489	2025-05-23	Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals that CD177+ Tregs enhance immunosuppression through apoptosis and resistance to immunotherapy in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03330-2 PMID:40055567	research paper	该研究通过单细胞和空间转录组分析，发现CD177+ Tregs通过凋亡和免疫治疗抵抗增强肝细胞癌的免疫抑制	首次鉴定CD177作为肿瘤浸润Treg细胞的生物标志物，并揭示其在肝细胞癌免疫抑制中的关键作用	研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床转化效果需进一步验证	探索肝细胞癌中Treg细胞的免疫抑制机制并寻找新的治疗靶点	CD177+ Treg细胞	癌症免疫学	肝细胞癌	单细胞转录组测序	CD177 Treg条件性敲除小鼠模型	转录组数据	NA
1490	2025-05-23	Ifosfamide alleviates autoimmune toxicity and enhances antitumor efficacy in melanoma immunotherapy 2025-06, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2025.116851 PMID:40081767	研究论文	研究探讨了异环磷酰胺（IFO）在减轻自身免疫毒性及增强黑色素瘤免疫治疗效果中的作用	首次揭示了IFO在自身免疫条件下的广泛抑制作用，并展示了其增强CD8 T细胞活化的特异性免疫调节效应	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证IFO的效果	开发管理免疫相关不良事件（irAEs）的新策略，并增强免疫检查点抑制剂（ICI）的抗肿瘤效果	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型和荷瘤小鼠	免疫治疗	黑色素瘤	单细胞RNA测序	EAU小鼠模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
1491	2025-05-23	Swimming induces bone loss via regulating mechanical sensing pathways in bone marrow 2025-Jun, Mechanobiology in medicine DOI:10.1016/j.mbm.2025.100125 PMID:40395774	研究论文	该研究通过建立长期游泳训练模型，探讨了低负荷运动对骨稳态的影响机制	揭示了游泳通过调节骨髓中的机械感应通路（如Integrins和ERK1/2信号通路）诱导骨丢失的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究低负荷运动（如游泳）对骨稳态的影响机制	小鼠的骨组织和骨髓细胞	骨生物学	骨丢失	单细胞测序、microCT扫描、组织学染色	小鼠长期游泳训练模型	基因表达谱数据、影像数据	未明确说明小鼠数量
1492	2025-05-23	Dual cytokine-engineered macrophages rejuvenate the tumor microenvironment and enhance anti-PD-1 therapy in renal cell carcinoma 2025-05-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114725 PMID:40294469	研究论文	研究开发了一种双细胞因子工程化的巨噬细胞，用于重编程肾细胞癌的肿瘤微环境并增强抗PD-1疗法的效果	开发了同时递送IL-12和CXCL-9的双细胞因子工程化巨噬细胞，能够重塑肿瘤微环境并显著增强抗PD-1疗法的效果	NA	克服肾细胞癌对抗PD-1疗法的耐药性	肾细胞癌的肿瘤微环境	肿瘤免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
1493	2025-05-23	Bisecting GlcNAc expression by bone marrow stromal cells modulates TGF-β1-driven macrophage polarization in myeloid leukemias 2025-May-22, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.287091 PMID:40400458	研究论文	研究骨髓基质细胞中双分N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）表达如何通过TGF-β1调控髓系白血病中的巨噬细胞极化	揭示了骨髓基质细胞中特定糖链（减少的双分GlcNAc）通过TGFβ1分泌促进M2极化巨噬细胞亚型的机制，并发现这一过程提高了PD-L1表达，从而损害CD8+ T细胞功能	NA	探讨骨髓基质细胞中糖链修饰对髓系白血病肿瘤微环境中巨噬细胞极化的影响	骨髓基质细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	髓系白血病（AML和MDS）	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学数据	NA
1494	2025-05-23	A conserved epilepsy-associated gene co-expression module identifies increased metabolic rate as a shared pathomechanism 2025-May-22, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052307 PMID:40401642	研究论文	通过果蝇全脑单细胞RNA测序，研究癫痫相关基因共表达网络，揭示代谢率增加作为癫痫的共同病理机制	利用果蝇单细胞表达数据和行为验证人类基因共表达网络，首次将代谢率增加与癫痫易感性联系起来	研究结果主要基于果蝇模型，需要在人类样本中进一步验证	揭示癫痫的分子机制，特别是代谢与癫痫易感性的关系	果蝇和人类癫痫相关基因	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	果蝇基因敲低模型	RNA测序数据	26个基因的果蝇全脑单细胞RNA测序数据
1495	2025-05-23	Single-cell sequencing on PBMCs from HA & HB patients with inhibitors reveals different immune responses to FVIII & FIX 2025-May-22, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799 PMID:40402102	研究论文	通过单细胞测序技术研究血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫反应	首次在单细胞水平上比较了HA和HB患者对FVIII和FIX的免疫反应差异，揭示了淋巴细胞亚群组成和功能状态的差异	样本量较小（5例HA和5例HB患者），可能影响结果的普遍性	探索HA和HB患者对FVIII和FIX的不同免疫反应机制	血友病A和血友病B患者的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞测序	血友病	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	5例HA患者和5例HB患者的PBMCs，共75,051个细胞
1496	2025-05-23	Myeloid Cells in Abdominal Aortic Aneurysm 2025-May-22, Current atherosclerosis reports IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s11883-025-01302-1 PMID:40402405	review	综述了髓系细胞在腹主动脉瘤(AAA)发病机制中的关键作用及其治疗潜力	单细胞RNA测序揭示了AAA中髓系细胞的多样性，并阐明了不同髓系细胞亚群在疾病中的作用机制	临床转化面临微环境串扰和潜在脱靶效应的挑战	探讨髓系细胞在腹主动脉瘤发病机制中的作用及治疗靶向潜力	腹主动脉瘤中的髓系细胞	血管生物学	腹主动脉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
1497	2025-05-23	Mechanism of Initial Favorable Response to Decitabine in TP53-Mutated MDS/AML and Potential Mechanisms of Subsequent Relapse 2025-May-21, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3192 PMID:40397797	研究论文	该研究探讨了TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨初始治疗反应及后续复发的潜在机制	整合了靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序和单细胞转录组学分析，揭示了白血病与免疫细胞群之间的动态变化	样本量有限，且为单中心研究	阐明TP53突变型MDS/AML患者对地西他滨治疗反应及复发的分子机制	骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓系白血病(AML)患者	血液肿瘤学	骨髓增生异常综合征/急性髓系白血病	靶向骨髓组测序、纳米孔DNA甲基化测序、单细胞转录组学	NA	基因组数据、转录组数据	II期临床试验中的系列患者样本
1498	2025-05-23	Exploring the untapped potential of single-cell and spatial omics in plant biology 2025-May-21, The New phytologist DOI:10.1111/nph.70220 PMID:40398874	综述	本文探讨了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的未开发潜力及其当前应用	强调了单细胞和空间组学技术在植物生物学中的创新应用，包括多组学、谱系追踪、分子记录和高通量遗传与化学扰动表型分析等新兴技术	植物特有的技术挑战和资源限制，如细胞壁复杂性和抗体资源有限，以及需要更完整的参考图谱和计算工具	探索单细胞和空间组学技术在植物生物学中的应用潜力，推动植物科学的发展	植物细胞和组织	植物生物学	NA	单细胞转录组分析、染色质可及性分析、空间转录组学、多组学、谱系追踪、分子记录、高通量遗传与化学扰动表型分析	NA	分子和细胞数据	多个模型植物物种的综合细胞图谱
1499	2025-05-23	Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke 2025-May-21, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-025-01523-6 PMID:40399534	研究论文	研究发现PPM1D基因的功能获得性突变可以减轻缺血性脑损伤，并验证了其药物稳定剂T2755作为缺血性中风的有前景疗法	首次发现PPM1D基因的功能获得性突变与缺血性中风患者的临床表型改善相关，并揭示了PPM1D通过PPARα途径保护内皮细胞功能的机制	研究中仅发现8例携带PPM1D突变的患者，样本量较小	探索缺血性中风的遗传基础及潜在治疗靶点	10,241名缺血性中风患者和Ppm1d缺陷小鼠	遗传学	缺血性中风	全基因组测序、空间转录组学、蛋白质组学分析	Ppm1d缺陷小鼠模型	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	10,241名缺血性中风患者（其中8例携带PPM1D突变）和Ppm1d缺陷小鼠
1500	2025-05-23	Multigenerational cell tracking of DNA replication and heritable DNA damage 2025-May-21, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08986-0 PMID:40399682	research paper	该研究通过多代单细胞追踪技术，结合内源性标记蛋白和定制计算工具，探讨了致癌扰动如何诱导姐妹细胞不对称和表型异质性	使用双CRISPR基因组编辑同时追踪DNA复制模式和可遗传的内源性DNA损伤，结合单细胞转录组学揭示了致癌事件如何触发多倍体化的多种途径	研究仅追踪了最多四代的细胞谱系树，可能无法完全反映长期细胞异质性的发展过程	解析细胞异质性的来源及其在多代细胞中的传递机制	异步生长的细胞及其多代谱系	基因组学	癌症	双CRISPR基因组编辑、单细胞转录组学、迭代染色	NA	基因组数据、转录组数据	异步生长的细胞谱系树（最多四代）