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当前共找到 39013 篇文献，本页显示第 1481 - 1500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1481 | 2026-04-18 |
Differential role of glucocorticoid receptor based on its cell type specific expression on tumor cells and infiltrating lymphocytes
2024-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.101957
PMID:38643748
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研究论文 | 本研究探讨了糖皮质激素受体在乳腺癌中基于细胞类型特异性表达的差异作用，并开发了一个独立于雌激素受体状态的GR特征 | 开发了一个独立于ER状态的GR特征，并揭示了GR在肿瘤细胞和浸润淋巴细胞中的细胞类型特异性作用，特别是在三阴性乳腺癌中的预后意义 | NA | 解决关于GR在乳腺癌中预后作用的矛盾报告，并探索其治疗潜力 | 乳腺癌细胞系、公共数据集中的肿瘤样本、独立乳腺癌队列中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1482 | 2026-04-18 |
The impact of package selection and versioning on single-cell RNA-seq analysis
2024-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588111
PMID:38617255
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研究论文 | 本文详细比较了Seurat和Scanpy这两个广泛使用的单细胞RNA测序分析软件包在算法和输出结果上的差异 | 揭示了Seurat和Scanpy在单细胞RNA-seq分析中存在的显著差异，其影响相当于减少5%的测序reads或20%的细胞数量，并强调了软件版本更新对结果的影响 | 研究主要聚焦于Seurat和Scanpy，可能未涵盖所有单细胞分析工具，且差异的生物学意义需进一步验证 | 评估单细胞RNA测序分析中软件包选择和版本控制对结果的影响 | 单细胞RNA测序数据分析软件包（Seurat和Scanpy）及其算法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1483 | 2026-04-18 |
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
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研究论文 | 本研究提出了一种整合空间转录组学与组织病理学图像数据的新型深度学习方法，以更好地捕捉癌症组织中的生物学模式 | 首次将ResNet深度学习模型提取的形态学特征与空间基因表达数据相结合进行聚类分析，实现了图像感知的特征发现 | 方法主要针对胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌等侵袭性癌症类型，在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 通过整合多模态数据提升空间转录组学分析的生物学洞察力 | 胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤, 三阴性乳腺癌 | 空间转录组学, 组织病理学成像 | ResNet-50, Louvain聚类 | 空间基因表达数据, 高分辨率全切片组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1484 | 2026-04-18 |
Hypercapnia alters stroma-derived Wnt production to limit β-catenin signaling and proliferation in AT2 cells
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159331
PMID:36626234
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研究论文 | 本研究探讨高碳酸血症如何通过改变基质细胞Wnt产生，限制AT2细胞的β-catenin信号传导和增殖，从而影响肺损伤修复 | 首次揭示高碳酸血症通过改变PDGFRα+成纤维细胞的Wnt表达，从促进转向拮抗β-catenin信号，进而限制AT2祖细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养，人类临床数据有限，且高碳酸血症的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究高碳酸血症对肺损伤后修复过程的影响，特别是对肺泡II型细胞增殖和信号通路的调控 | 小鼠模型、肺泡II型细胞、PDGFRα+成纤维细胞、3D类器官培养 | 数字病理学 | 肺疾病 | 空间转录组学、细胞谱系追踪、3D培养 | 小鼠模型 | 转录组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1485 | 2026-04-18 |
Metagenomic and single-cell RNA-Seq survey of the Helicobacter pylori-infected stomach in asymptomatic individuals
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.161042
PMID:36810249
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研究论文 | 本研究通过宏基因组测序、单细胞RNA测序等技术，深入调查了无症状幽门螺杆菌感染者胃部的宿主-微生物群环境 | 首次结合宏基因组和单细胞RNA测序全面描绘无症状幽门螺杆菌感染者胃黏膜的微生物组和免疫细胞图谱，揭示了人类胃黏膜中ILC3s的主导地位及其与特定微生物类群的相关性 | 研究主要关注无症状个体，可能无法完全反映有症状感染者的病理变化；样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 深入表征幽门螺杆菌感染者胃部的宿主-微生物群环境，比较无症状感染者与未感染者的差异 | 人类胃组织样本，包括幽门螺杆菌感染和无症状个体 | 数字病理学 | 幽门螺杆菌感染 | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 荧光显微镜 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人类胃组织样本 | NA | 宏基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1486 | 2026-04-18 |
SECANT: a biology-guided semi-supervised method for clustering, classification, and annotation of single-cell multi-omics
2022-Sep, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac165
PMID:36157595
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SECANT的生物学引导的半监督方法，用于单细胞多组学数据的聚类、分类和注释 | SECANT的创新点包括：1) 利用表面蛋白数据中识别出的可靠细胞类型标签指导细胞聚类；2) 为每个细胞簇提供可靠的细胞类型通用注释；3) 利用具有不确定或缺失细胞类型标签的细胞来提高性能；4) 能够准确预测scRNA-seq数据中的可靠细胞类型 | NA | 开发一种新的单细胞多组学数据分析方法 | 单细胞多组学数据（特别是CITE-seq数据） | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 半监督模型 | 单细胞多组学数据 | 公共和内部数据集（来自多个组织） | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |
| 1487 | 2026-04-18 |
RAGE Inhibitors as Alternatives to Dexamethasone for Managing Cerebral Edema Following Brain Tumor Surgery
2022-03, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1007/s13311-022-01207-w
PMID:35226341
|
研究论文 | 本文研究了RAGE抑制剂作为地塞米松替代方案，用于管理脑肿瘤手术后脑水肿的效果 | 首次证实RAGE抑制剂在减轻神经炎症方面与地塞米松效果相当，且不影响抗PD-1免疫疗法的疗效 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，临床转化需进一步验证 | 探索替代地塞米松的新方法，以最小化神经外科手术引起的脑水肿 | 小鼠和人类脑肿瘤组织及手术腔液 | 神经科学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, ELISA, Nanostring, 流式细胞术, qPCR, 免疫印迹 | RAGE基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞数据 | 野生型和RAGE敲除小鼠脑组织, 人类肿瘤组织和手术腔液 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1488 | 2026-04-18 |
Elevated Calprotectin and Abnormal Myeloid Cell Subsets Discriminate Severe from Mild COVID-19
2020-09-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.002
PMID:32810439
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研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序，揭示了严重COVID-19患者中非经典单核细胞消失、经典单核细胞积累及钙卫蛋白大量释放等先天免疫异常特征 | 首次结合高维流式细胞术和单细胞RNA测序，系统揭示了COVID-19严重程度与先天免疫细胞亚群及钙卫蛋白水平的关联，并提出了具有潜在预测价值的生物标志物组合 | 研究为观察性分析，需前瞻性研究验证预测价值；样本来源和规模可能限制结论的普适性 | 探究COVID-19严重程度与先天免疫反应差异的关系，并寻找可区分高风险患者的生物标志物 | COVID-19患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | COVID-19患者外周血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1489 | 2026-04-18 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
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研究论文 | 本文描述了一位由JAK1基因镶嵌性功能获得性突变引起的早发性多器官免疫失调患者，通过单细胞RNA测序揭示突变转录型与基因型的差异，并探索JAK1激酶的功能机制 | 引入突变'转录型'概念，揭示JAK1 S703I突变不仅增强细胞因子信号传导，还赋予非经典信号传导能力，为个性化医疗提供新平台 | 研究基于单个患者案例，样本量有限，可能无法完全代表所有JAK1相关疾病 | 探究JAK1激酶在自身炎症性疾病中的转录和生化功能机制 | 携带JAK1 S703I镶嵌突变的自体炎症性疾病患者 | 自然语言处理 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1位患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制单细胞RNA测序 |
| 1490 | 2026-04-18 |
Purification of Human CD34+CD90+ HSCs Reduces Target Cell Population and Improves Lentiviral Transduction for Gene Therapy
2020-Sep-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2020.07.010
PMID:32802914
|
研究论文 | 本研究探讨了通过纯化人类CD34+CD90+造血干细胞来优化慢病毒介导的基因治疗策略 | 首次在临床适用性GMP级流式分选协议中直接比较CD90+细胞选择与CD133+或CD38- CD34+细胞选择，证明CD90+富集能显著减少靶细胞数量并提高慢病毒转导效率 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未在人类临床试验中全面验证其安全性和长期疗效 | 优化造血干细胞基因治疗的靶细胞纯化策略以提高治疗效率和安全性 | 人类造血干细胞（HSC），特别是CD34+CD90+细胞亚群 | 基因治疗 | 遗传性疾病、恶性肿瘤、感染性疾病 | 流式细胞分选、单细胞RNA测序、慢病毒转导 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人类血液制品中的细胞分选比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1491 | 2026-04-18 |
Microglia Require CD4 T Cells to Complete the Fetal-to-Adult Transition
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.026
PMID:32702313
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研究论文 | 本研究通过成像、单细胞和手术方法，识别了小鼠和人类大脑中的CD69+ CD4 T细胞群体，并探讨了其在脑发育中的作用 | 首次揭示了大脑中CD69+ CD4 T细胞的存在及其通过原位分化形成的过程，并发现这些细胞对微胶质细胞成熟和神经发育至关重要 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证可能有限；具体分子机制和临床相关性需进一步探索 | 探究健康大脑中CD4 T细胞的存在、来源及其在脑发育和免疫-神经系统互作中的功能 | 小鼠和人类大脑中的CD4 T细胞及微胶质细胞 | 神经科学 | NA | 成像技术、单细胞测序、手术方法 | NA | 图像数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1492 | 2026-04-18 |
Single-cell RNA sequencing in breast cancer: Understanding tumor heterogeneity and paving roads to individualized therapy
2020-08, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12078
PMID:32654419
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用，包括理解肿瘤异质性和推动个体化治疗 | 综述了scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的最新应用，强调了其在解析肿瘤异质性和识别治疗靶点方面的创新潜力 | 当前scRNA-seq技术在治疗选择方面的研究有限，且存在技术挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的应用，以促进个体化治疗 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1493 | 2026-04-18 |
BREM-SC: a bayesian random effects mixture model for joint clustering single cell multi-omics data
2020-06-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa314
PMID:32379315
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研究论文 | 本研究开发了一种名为BREM-SC的贝叶斯随机效应混合模型，用于联合聚类单细胞转录组和蛋白质组数据 | 提出了一种新的统计方法，能够同时利用转录组和蛋白质组数据进行细胞聚类，并量化每个单细胞的聚类不确定性 | NA | 开发用于分析多模态CITE-Seq数据的统计方法和计算工具 | 单细胞转录组和蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），CITE-seq | 贝叶斯随机效应混合模型 | 转录组和蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium系统 |
| 1494 | 2026-04-17 |
Dietary conjugated linoleic acid enhances resistance to Salmonella infection by promoting PPARγ-mediated metabolic reprogramming and effector function in CD8⁺ T cells
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2657625
PMID:41964110
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研究论文 | 本研究揭示了膳食共轭亚油酸通过激活PPARγ信号通路，促进肠道CD8⁺ T细胞的代谢重编程和效应功能，从而增强宿主对鼠伤寒沙门氏菌感染的黏膜抵抗力 | 首次阐明膳食共轭亚油酸通过PPARγ介导的代谢重编程增强CD8⁺ T细胞效应功能，从而抵抗肠道感染的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人体中的适用性尚需验证；且未详细探讨不同CLA异构体的特异性作用 | 探究膳食共轭亚油酸增强宿主对沙门氏菌感染抵抗力的免疫学机制 | 小鼠肠道CD8⁺ T细胞、肠道微生物群、鼠伤寒沙门氏菌感染模型 | 免疫代谢学 | 肠道感染 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、粪便微生物移植、药理学抑制 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 1495 | 2026-04-17 |
Evaluation of the impact of glycolysis-related gene signatures on prognosis and therapeutic targeting in lung adenocarcinoma
2026-Jun, Cytotechnology
IF:2.0Q4
DOI:10.1007/s10616-026-00953-5
PMID:41987806
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法，评估了糖酵解相关基因特征对肺腺癌预后及治疗靶向的影响 | 结合多组学数据（TCGA、GEO数据库的bulk RNA-seq和scRNA-seq），利用机器学习框架筛选糖酵解相关预后标志物，并构建了具有强预测能力的预后特征，同时分析了其与肿瘤微环境免疫浸润、细胞间通讯及药物敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证；生物信息学分析结果需要进一步的体外或体内实验验证 | 探究糖酵解基因与肺腺癌进展的关联，并构建基于糖酵解相关预后标志物的风险特征以评估预后和指导治疗 | 肺腺癌患者（来自TCGA和GEO数据库的基因表达数据及单细胞RNA测序数据） | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，基因表达谱分析，机器学习 | 机器学习计算框架（包含多种算法组合），Cox回归模型 | 基因表达数据（bulk RNA-seq和scRNA-seq） | 一个来自TCGA的训练集和四个来自GEO的验证集（具体样本数未明确说明），以及来自GEO的scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1496 | 2026-04-17 |
Role of Stress-Responsive NR4A2 in Aldosterone-Producing Cell Cluster Formation
2026-May, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析，探讨了应激响应转录因子NR4A2在醛固酮产生细胞簇形成中的作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了NR4A2作为应激诱导APCC形成的关键分子介质 | 研究样本量较小，仅基于3名患者的组织样本，且结论可能仅适用于部分病例 | 探究醛固酮产生细胞簇形成的分子机制 | APCC细胞、醛固酮产生腺瘤细胞和同一肾上腺中的球状带细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名原发性醛固酮增多症患者的肾上腺组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1497 | 2026-04-17 |
Patient-derived pediatric brain tumor orthotopic xenografts and tumor organoids faithfully recapitulate primary tumors
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea4966
PMID:41984959
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研究论文 | 本研究建立了源自患者的小儿脑肿瘤类器官和类器官异种移植模型，并证明其能高度模拟原发肿瘤的分子特征和异质性 | 首次从髓母细胞瘤、多层菊形团胚胎性肿瘤和非典型畸胎样横纹肌样瘤的PDOX模型中成功建立了TO和TOX模型，并系统验证了其在表观遗传、转录组、基因组和细胞异质性层面对原发肿瘤的忠实复现能力 | 研究未明确说明建立的TO和TOX模型在长期培养中的稳定性，也未涉及模型对肿瘤微环境（如免疫细胞、血管等）的模拟程度 | 开发能够准确模拟小儿胚胎性脑肿瘤生物学特性的体外模型，以促进功能研究和药物筛选 | 髓母细胞瘤、多层菊形团胚胎性肿瘤、非典型畸胎样横纹肌样瘤的患者来源异种移植模型及其衍生的肿瘤类器官 | 数字病理学 | 小儿脑肿瘤 | DNA甲基化测序、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、全基因组测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1498 | 2026-04-17 |
Deep learning inference of cell type-specific gene expression from breast tumor histopathology
2026-Apr-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01419-9
PMID:41986599
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为SLIDE-EX的深度学习框架，能够直接从乳腺癌组织病理学全切片图像预测细胞类型特异性基因表达和丰度 | 首次提出直接从常规组织病理学图像预测多种细胞类型的特异性基因表达，绕过了单细胞或批量RNA测序的成本和时间限制，为肿瘤微环境表征提供了一种快速、经济的新方法 | 模型在癌症相关成纤维细胞和癌细胞上表现最佳，对其他细胞类型的预测性能可能有限；目前仅在乳腺癌中验证，泛化到其他癌症类型需要进一步测试 | 开发一种从组织病理学图像低成本、快速推断细胞类型特异性基因表达的方法，以促进乳腺癌精准肿瘤学 | 乳腺癌组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 深度学习框架 | 图像，基因表达数据 | TCGA乳腺癌队列及一个包含160例的独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 1499 | 2026-04-17 |
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199035
PMID:41734034
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序等技术，揭示了肿瘤细胞来源的IFN通过诱导巨噬细胞表达SPP1，从而形成免疫抑制微环境并导致PARP抑制剂耐药的机制 | 首次在空间层面揭示了IFN-SPP1轴在PARP抑制剂耐药中的作用，并证实SPP1可作为治疗靶点和预后生物标志物 | 研究主要基于卵巢癌样本和HRD小鼠模型，在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究PARP抑制剂耐药的机制并寻找克服耐药的治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本和HRD小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | PhenoCycler-Fusion空间分析，单细胞RNA测序，多重免疫组化 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，免疫组化图像 | 来自前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗试验的患者样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | PhenoCycler-Fusion | PhenoCycler-Fusion空间分析系统 |
| 1500 | 2026-04-17 |
GSDME-IL-18 pyroptotic axis prevents myosteatosis by expanding tissue-resident macrophages to promote muscle regeneration
2026-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198076
PMID:41701674
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研究论文 | 本研究揭示了GSDME依赖性细胞焦亡信号通过IL-18-TRM轴，促进组织驻留巨噬细胞扩增以维持脂质稳态，从而支持肌肉再生并防止肌脂肪变性 | 首次发现GSDME依赖性细胞焦亡信号在肌肉损伤修复中具有保护作用，并阐明其通过IL-18激活TRMs的KLF4/JUN信号通路来维持脂质清除能力的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；未详细探讨衰老肌肉中该轴受损的具体上游原因 | 探究GSDME依赖性细胞焦亡信号在肌肉损伤修复和防止肌脂肪变性中的作用机制 | 肌肉损伤模型小鼠、术后人类肌肉损伤样本、纤维脂肪祖细胞、组织驻留巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肌肉损伤/肌脂肪变性 | 单细胞RNA测序、脂质组学、多重流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、脂质组数据、流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和人类术后肌肉样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |