单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 14961 - 14980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14961 | 2024-08-04 |
The promising application of cell-cell interaction analysis in cancer from single-cell and spatial transcriptomics
2023-10, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2023.07.001
PMID:37454878
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综述 | 文章讨论了细胞间相互作用分析在癌症研究中的应用，特别是单细胞转录组学和空间转录组学的工具和方法 | 介绍了从非空间单细胞RNA测序中推断细胞-细胞相互作用的快速发展的计算工具，以及空间转录组数据的有限但逐渐增多的方法 | 空间转录组学数据的相关方法仍然有限 | 探讨细胞-细胞相互作用在癌症发展中的作用以及相关分析工具 | 单细胞转录组学和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14962 | 2024-08-04 |
Suppression of FOXO1 attenuates inflamm-aging and improves liver function during aging
2023-10, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13968
PMID:37602516
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研究论文 | 本研究探讨了FOXO1在衰老过程中对肝脏功能和炎症的影响 | 发现FOXO1在衰老小鼠肝脏中活性显著增加，其抑制可以缓解衰老引起的肝脏炎症和功能障碍 | FOXO1抑制对单核细胞衍生巨噬细胞功能静止的影响有限 | 研究衰老如何通过影响肝脏巨噬细胞引起肝功能变化的分子机制 | 使用小鼠模型研究老年小鼠肝脏的炎症和功能状态 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 老年小鼠 |
| 14963 | 2024-08-05 |
SMASH: Scalable Method for Analyzing Spatial Heterogeneity of genes in spatial transcriptomics data
2023-Oct, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010983
PMID:37862362
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研究论文 | 提出了一种名为SMASH的非参数方法，用于分析空间转录组数据中的基因空间异质性 | SMASH在计算需求和统计能力之间取得了平衡，解决了现有方法的不足 | 现有方法在计算需求或统计能力上存在显著缺陷 | 旨在识别与细胞/点的空间位置共变的基因 | 研究对象为空间可变基因（SVGs），这些基因在不同组织中的表达水平与细胞位置相关 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 非参数方法 | 转录组数据 | 四个不同平台的空间转录组数据集 |
| 14964 | 2024-08-07 |
A Drosophila glial cell atlas reveals a mismatch between transcriptional and morphological diversity
2023-Oct, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002328
PMID:37862379
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研究论文 | 本文通过分析果蝇中枢神经系统中胶质细胞的单细胞RNA测序数据，探讨了胶质细胞形态与转录特征之间的关系 | 发现了新的形态学和转录学上独特的表面胶质细胞群体，并揭示了胶质细胞在形态学上的多样性超过转录学上的多样性 | 许多胶质细胞的形态学类别无法通过转录学区分，且胚胎和成年星形胶质细胞在转录学上相似 | 研究胶质细胞形态与转录特征之间的关系 | 果蝇中枢神经系统中的胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含胚胎腹部神经索和成年视叶两个不同发育阶段的组织 |
| 14965 | 2024-08-07 |
S100a9 Protects Against the Effects of Repeated Social Defeat Stress
2023-Oct, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.12.002
PMID:37881565
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研究论文 | 本研究探讨了S100a9在重复社交挫败应激（RSDS）模型中对炎症和氧化还原状态的影响 | 发现缺失钙卫蛋白显著增强了T淋巴细胞的代谢需求，表明该蛋白可能在线粒体调控中发挥未被描述的作用 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类中验证这些发现 | 探究心理创伤后炎症和氧化还原状态的机制 | S100a9基因和钙卫蛋白在心理创伤后的作用 | NA | 创伤后应激障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 186只小鼠（93只对照，93只RSDS） |
| 14966 | 2024-08-07 |
Virally encoded interleukin-6 facilitates KSHV replication in monocytes and induction of dysfunctional macrophages
2023-Oct, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011703
PMID:37883374
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研究论文 | 本研究探讨了卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）通过其编码的病毒性白细胞介素-6（vIL-6）在单核细胞中促进病毒复制和诱导功能失调的巨噬细胞的机制 | 首次展示了vIL-6在KSHV感染单核细胞中的关键作用，以及其如何通过诱导功能失调的巨噬细胞来维持病毒池 | NA | 揭示KSHV如何通过vIL-6增加感染细胞数量，为治疗KSHV相关疾病提供关键机制 | KSHV感染的单核细胞及其向巨噬细胞的分化 | NA | 卡波西肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 14967 | 2024-08-07 |
Cellular heterogeneity of the developing worker honey bee (Apis mellifera) pupa: a single cell transcriptomics analysis
2023-09-30, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkad178
PMID:37548242
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学分析方法，探讨了工蜂（Apis mellifera）蛹发育阶段的细胞异质性 | 这是首次对蜜蜂在任何发育阶段的完整单细胞图谱进行研究，展示了在细胞水平上进一步研究其生物学的潜力 | NA | 旨在通过单细胞转录组学分析，揭示工蜂蛹发育阶段的细胞类型及其基因表达特征 | 工蜂（Apis mellifera）蛹的细胞类型及其基因表达 | NA | NA | scRNA-Seq | NA | 转录组 | 涉及11天龄的预蛹和15天龄的蛹，共识别出63个不同的细胞簇，其中17个在两个阶段都可识别 |
| 14968 | 2024-08-07 |
Nuclear corepressors NCOR1 and NCOR2 entrain thymocyte signaling, selection, and emigration
2023-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.27.559810
PMID:37808728
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研究论文 | 本文研究了核共抑制因子NCOR1和NCOR2在胸腺细胞信号传导、选择和迁移中的作用 | 首次揭示了NCOR1和NCOR2在胸腺细胞发育中的多个关键作用，包括影响T细胞受体信号传导、CD4/CD8谱系决定和胸腺细胞迁移 | NA | 探讨NCOR1和NCOR2在胸腺细胞发育中的作用 | 胸腺细胞的发育过程 | NA | NA | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和RNA | 使用小鼠模型进行实验 |
| 14969 | 2024-08-05 |
SpaRx: elucidate single-cell spatial heterogeneity of drug responses for personalized treatment
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad338
PMID:37798249
|
研究论文 | 本研究展示了如何利用SpaRx模型揭示肿瘤中单细胞对药物反应的空间异质性 | 提出了一种基于图的领域适应模型SpaRx，以识别药物抵抗的空间定位细胞异质性 | 未提及具体的样本或实验条件限制 | 研究单细胞空间转录组学中药物反应的异质性，以个性化治疗 | 肿瘤细胞对不同位置的药物反应能力 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 图形领域适应模型 | 转录组数据 | NA |
| 14970 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling reveals inflammatory polarization of human carotid versus femoral plaque leukocytes
2023-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171359
PMID:37471165
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研究论文 | 该研究探讨了人类颈动脉与股动脉斑块内白细胞的炎症极化特征 | 通过单细胞RNA测序揭示了股动脉和颈动脉斑块中免疫细胞的不同转录组特征 | 主要集中于49名患者的数据，样本量较小且仅限于特定地区的斑块分析 | 比较不同血管部位的动脉粥样硬化斑块及其微环境的免疫特征 | 49名接受股动脉或颈动脉内膜切除术的患者的斑块内白细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、流式细胞术（flow cytometry）、免疫组化（IHC） | NA | 细胞数据 | 49名患者（股动脉斑块23名，颈动脉斑块26名） |
| 14971 | 2024-08-04 |
Control of energy homeostasis by the lateral hypothalamic area
2023-09, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2023.05.010
PMID:37353461
|
综述 | 这篇综述文章探讨了外侧下丘脑区域在能量平衡中的控制作用。 | 文章突出了外侧下丘脑不同神经元群体如何通过与其他脑区的复杂连接调节能量平衡的最新发现 | 许多LHA细胞类型的功能仍然不清楚，研究覆盖面可能有限 | 研究外侧下丘脑在能量平衡及其调节中的作用 | 探讨不同的外侧下丘脑神经元类型及其对能量平衡的影响 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 14972 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics: Technologies, applications and experimental considerations
2023-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2023.110671
PMID:37353093
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综述 | 本文概述了空间转录组技术的现状及其应用 | 强调了商业化空间转录组技术的发展以及实验的注意事项 | 未充分探讨所有类型的空间转录组技术 | 旨在理解基因在细胞中的空间表达及其对细胞功能的影响 | 空间转录组技术与其在生物医学研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14973 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral blood mononuclear immune cell landscape associated with operational tolerance in a kidney transplant recipient
2023-09, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2023.04.035
PMID:37201755
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾移植后操作性耐受患者的免疫细胞景观 | 首次使用单细胞分析技术评估肾移植后操作性耐受患者的免疫景观 | 研究样本量较小，需要在大规模队列中进行进一步验证 | 探究肾移植后操作性耐受患者的细胞和分子通路 | 肾移植后操作性耐受患者的周围单核细胞 | 数字病理学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包括一名操作性耐受的肾移植受者、两名健康个体和一名接受标准免疫抑制治疗的肾移植受者 |
| 14974 | 2024-08-07 |
Vaccine adjuvant-elicited CD8+ T cell immunity is co-dependent on T-bet and FOXO1
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112911
PMID:37516968
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研究论文 | 本研究探讨了疫苗佐剂引发的CD8+ T细胞免疫中T-bet和FOXO1转录因子的协同作用 | 研究发现，与感染反应不同，疫苗佐剂引发的CD8 T细胞反应需要T-bet和FOXO1转录程序的协调调控 | NA | 研究疫苗佐剂引发的CD8+ T细胞免疫中T-bet和FOXO1的作用 | CD8+ T细胞在疫苗佐剂引发的免疫反应中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 14975 | 2024-08-07 |
The pseudokinase Trib1 regulates the transition of exhausted T cells to a KLR+ CD8+ effector state, and its deletion improves checkpoint blockade
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112905
PMID:37527035
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研究论文 | 本文研究了伪激酶Trib1在调节耗竭T细胞向KLR+ CD8+效应状态转变中的作用，并发现其缺失能增强检查点阻断疗法的效果 | 首次揭示了Trib1在调节CD8 T细胞中的重要作用，并证明了其作为靶点可以增强T细胞效应状态及改善检查点抑制剂疗法 | NA | 探讨Trib1在调节耗竭T细胞向效应状态转变中的作用及其对检查点阻断疗法的影响 | 耗竭的CD8 T细胞及伪激酶Trib1 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、RNA速度分析、单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | 单细胞RNA序列、T细胞受体序列 | 未具体说明样本数量 |
| 14976 | 2024-08-04 |
Key patient demographics shape innate immune topography in noncritical hypoxic COVID-19 pneumonia
2023-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.166110
PMID:37606044
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研究论文 | 这篇文章研究了人口特征如何影响非危重状态COVID-19肺炎患者的先天免疫特征 | 揭示了人口特征对免疫细胞反应的影响，尤其是在老年和男性患者中 | 样本量有限，仅涉及38名患者，可能未能全面代表所有风险群体 | 研究与人口风险因素相关的免疫异质性 | 住院的COVID-19肺炎患者，氧饱和度低于94%的群体 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本和单细胞基因表达数据 | 38名COVID-19肺炎患者 |
| 14977 | 2024-08-04 |
Transcriptomic forecasting with neural ordinary differential equations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100793
PMID:37602211
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研究论文 | 本文提出了一种基于神经常微分方程的RNA表达预测方法RNAForecaster | 创新点在于开发了一种能在嵌入无关的方式下预测单细胞基因表达状态的方法 | NA | 研究单细胞基因表达的动态过程 | 针对单细胞转录组数据的发展进行预测 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 神经常微分方程 | 单细胞转录组数据 | 在模拟数据和一项3天的实验中使用了多个单细胞样本 |
| 14978 | 2024-08-04 |
Multi-transcriptomics reveals brain cellular responses to peripheral infection in Alzheimer's disease model mice
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112785
PMID:37436901
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研究论文 | 本研究揭示了外周感染对阿尔茨海默病模型小鼠大脑细胞反应的影响 | 通过多转录组技术，识别了与脑屏障功能和神经炎症相关的细胞类型和空间特异性转录变化 | 研究主要集中于特定的感染模型，可能限制了结果的广泛适用性 | 探讨外周轻度感染如何影响阿尔茨海默病相关的脑转录组和病理变化 | APP/PS1小鼠模型，及其在遭受金黄色葡萄球菌感染后的反应 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14979 | 2024-08-04 |
A cellular and molecular spatial atlas of dystrophic muscle
2023-Jul-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221249120
PMID:37410813
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研究论文 | 本文生成了严重肌营养不良小鼠模型的高分辨率细胞和分子空间图谱 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，提供了一个无偏聚类的独特细胞群体分布和表型数据，以揭示延续的肌肉再生机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表人类DMD的病理情况 | 研究肌营养不良症的生物机制及治疗靶点 | 使用D2-mdx小鼠模型 | 数字病理学 | 肌营养不良症 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14980 | 2024-08-07 |
Functional interrogation of lymphocyte subsets in alopecia areata using single-cell RNA sequencing
2023-07-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2305764120
PMID:37428932
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了斑秃（Alopecia areata, AA）中皮肤浸润免疫细胞的异质性，并探讨了特定细胞类型在AA中的功能作用 | 首次系统地揭示了AA中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病发展中的关键作用，为AA的治疗策略提供了新的框架 | 研究主要基于C3H/HeJ小鼠模型，未来研究需要进一步验证在人类AA中的发现 | 深入理解斑秃的免疫学基础，为开发新的治疗策略提供依据 | 斑秃中的淋巴细胞亚群及其功能 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及C3H/HeJ小鼠模型及人类AA皮肤样本 |