单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 14941 - 14960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14941 | 2024-08-04 |
Robust discovery of gene regulatory networks from single-cell gene expression data by Causal Inference Using Composition of Transactions
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad370
PMID:37897702
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research paper | 使用因果推断方法从单细胞RNA-seq数据中发现基因调控网络 | 提出了一种新的因果推断方法CICT，以预测因果调控关系并推断基因调控网络 | NA | 揭示基因调控网络的结构和功能 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | 机器学习算法 | RNA表达数据 | 使用了模拟和实验的单细胞RNA-seq数据 |
| 14942 | 2024-08-07 |
Cell-type specific molecular signatures of aging revealed in a brain-wide transcriptomic cell-type atlas
2023-Jul-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.26.550355
PMID:38168182
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研究论文 | 本文通过高分辨率单细胞RNA测序技术，分析了年轻成年和老年小鼠大脑中约120万个高质量单细胞转录组数据，揭示了与年龄相关的细胞类型特异性分子特征。 | 本文首次在大脑全转录组细胞类型图谱中揭示了与年龄相关的基因表达特征，特别是在下丘脑第三脑室周围的细胞类型中发现了显著的基因表达变化。 | NA | 揭示大脑中与正常衰老相关的细胞类型特异性转录组变化，为研究衰老过程的功能变化及其与疾病的关系提供基础。 | 年轻成年和老年小鼠的大脑细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约120万个高质量单细胞转录组数据，来自年轻成年和老年小鼠的大脑细胞。 |
| 14943 | 2024-08-04 |
Human neural stem cells restore spatial memory in a transgenic Alzheimer's disease mouse model by an immunomodulating mechanism
2023, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2023.1306004
PMID:38155736
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研究论文 | 这篇文章探讨了人类神经干细胞在阿尔茨海默病模型小鼠中通过免疫调节机制恢复空间记忆的作用 | 研究首次揭示了人类神经干细胞通过调节小胶质细胞介导的神经炎症改善空间记忆的机制 | 该研究未能观察到淀粉样斑块负荷的变化 | 阐明人类神经干细胞在阿尔茨海默病治疗中的作用机制 | 采用5XFAD小鼠模型研究人类神经干细胞的治疗效果 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 研究使用了5XFAD小鼠作为实验对象 |
| 14944 | 2024-08-07 |
Loss of Cadherin-11 in pancreatic ductal adenocarcinoma alters tumor-immune microenvironment
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1286861
PMID:37954069
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研究论文 | 研究了Cadherin-11在胰腺导管腺癌中的缺失如何改变肿瘤免疫微环境 | 首次详细阐明了Cadherin-11缺失对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的影响，特别是对癌症相关成纤维细胞和免疫细胞的影响 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类胰腺导管腺癌存在差异 | 探讨Cadherin-11缺失对胰腺导管腺癌进展和抗肿瘤免疫反应的影响 | 胰腺导管腺癌中的Cadherin-11及其对肿瘤微环境的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | KPC肿瘤携带的小鼠模型，包括Cadherin-11表达和缺失的小鼠 |
| 14945 | 2024-08-07 |
Development and function of chicken XCR1+ conventional dendritic cells
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1273661
PMID:37954617
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序等技术，详细描述了鸡脾脏中XCR1阳性常规树突状细胞的发育和功能 | 首次详细描述了鸡脾脏中XCR1阳性常规树突状细胞的特征，并揭示了其在抗原呈递和T细胞反应中的作用 | NA | 研究鸡脾脏中常规树突状细胞的特征及其在免疫反应中的作用 | 鸡脾脏中的XCR1阳性常规树突状细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | CRISPR-Cas9 | RNA | 鸡脾脏中的多个单细胞样本 |
| 14946 | 2024-08-07 |
Systematic single cell RNA sequencing analysis reveals unique transcriptional regulatory networks of Atoh1-mediated hair cell conversion in adult mouse cochleae
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0284685
PMID:38079436
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了成年小鼠耳蜗中Atoh1介导的支持细胞向毛细胞转化的独特转录调控网络 | 本文通过使用多种高通量测序分析工具，揭示了先前未被识别的关键调控因子，这些因子指导转化后的毛细胞分化 | NA | 研究成年哺乳动物耳蜗中毛细胞再生的调控机制 | 成年小鼠耳蜗中的支持细胞向毛细胞的转化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 成年小鼠耳蜗中的支持细胞和毛细胞样本 |
| 14947 | 2024-08-07 |
Endothelial anthrax toxin receptor 2 plays a protective role in liver fibrosis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1278968
PMID:38322497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析临床肝脏非实质细胞数据，探讨了内皮细胞中的炭疽毒素受体2（ANTXR2）在肝纤维化中的保护作用 | 首次揭示了ANTXR2通过促进MMP2活化降解细胞外基质（ECM）在肝纤维化中的保护作用 | NA | 识别肝纤维化中的关键细胞和分子机制，以开发控制肝脏相关疾病的新策略 | 肝脏非实质细胞中的ANTXR2表达及其在肝纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了GSE136103和GSE181483两个数据集的临床肝脏非实质细胞样本 |
| 14948 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome profiling highlights the role of APP in blood vessels in assessing the risk of patients with proliferative diabetic retinopathy developing Alzheimer's disease
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1328979
PMID:38328307
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了增殖性糖尿病视网膜病变（PDR）与阿尔茨海默病（AD）之间血管中APP信号通路的关键作用 | 首次揭示了APP信号通路在PDR和AD血管病变中的重要作用，并验证了APP基因表达与AD相关基因的显著关联 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和细胞间通信预测，未来需更多实验验证 | 探究PDR与AD之间血管病变的关键因素和共享信号通路 | 增殖性糖尿病视网膜病变和阿尔茨海默病的血管 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变，阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 人类纤维血管膜（PDR）和人类海马血管（AD）的单细胞RNA测序数据 |
| 14949 | 2024-08-07 |
Exploring the tumor micro-environment in primary and metastatic tumors of different ovarian cancer histotypes
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1297219
PMID:38328306
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研究论文 | 本研究利用高分辨率单细胞RNA测序技术，探索了不同卵巢癌组织类型中肿瘤微环境的细胞组成及其相互作用 | 首次在不同卵巢癌组织类型中全面描绘了肿瘤微环境的细胞类型及其相互作用 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 进一步阐明肿瘤进展、转移及不同组织类型的分子特征，以实现个性化诊断和治疗 | 21个实体肿瘤样本，来自12名患有六种卵巢癌组织类型的患者，包括原发和转移部位 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 21个实体肿瘤样本，来自12名患者 |
| 14950 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell alternative splicing analyses reveal roles of TRA2B in myogenic differentiation
2024-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13545
PMID:37705195
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研究论文 | 本研究采用Iso-seq和scRNA-seq技术分析在肌肉发生过程中TRA2B的作用及其选择性剪接的复杂性 | 本研究识别了61,146种全长异构体和38,022个选择性剪接事件，并发现了TRA2B在肌肉分化中的不同作用 | 未具体提到样本来源和数量的具体信息 | 探索肌肉发生过程中的选择性剪接模式及其调控机制 | 主要研究TRA2B在肌肉细胞中的选择性剪接调控 | 数字病理学 | NA | Iso-seq和scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 14951 | 2024-08-07 |
Sequencing of Physically Interacting Cells in Human Kidney Allograft Rejection to Infer Contact-dependent Immune Cell Transcription
2024-Feb-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000004762
PMID:37638864
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研究论文 | 本研究通过结合CD45阳性富集策略和基于测序的细胞表面蛋白定量方法，分析了11例人肾移植活检样本中的细胞间相互作用，并使用单细胞RNA测序技术推断接触依赖的免疫细胞转录情况。 | 本研究采用了一种新的计算方法来解析异型物理相互作用细胞的转录谱，这种方法补充了以往从单细胞RNA测序数据估计细胞间物理接触的方法。 | 由于空间信息的丢失，从单细胞RNA测序数据中推断细胞间相互作用的转录程序具有挑战性。 | 研究目的是推断人肾移植排斥反应中细胞间接触依赖的免疫细胞转录情况。 | 研究对象包括11例人肾移植活检样本中的免疫细胞及其相互作用。 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 11例人肾移植活检样本，生成了31,203个高质量的单细胞库 |
| 14952 | 2024-08-07 |
The efficient generation of functional human hepatocytes from chemically induced pluripotent stem cells
2024-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13540
PMID:37814474
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研究论文 | 本文开发了一种模拟肝母细胞两阶段发育的分化协议，从化学诱导的多能干细胞（hCiPSCs）高效生成肝前体细胞 | 首次通过模拟肝母细胞的两阶段发育过程，实现了从hCiPSCs高效生成肝前体细胞和肝细胞 | NA | 探索从多能干细胞中高效生成功能性人肝细胞的方法 | 化学诱导的多能干细胞（hCiPSCs）及其分化生成的肝前体细胞和肝细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 14953 | 2024-08-07 |
Antibody dependent cell-mediated cytotoxicity selection pressure induces diverse mechanisms of resistance
2023-12-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2023.2269637
PMID:37878417
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研究论文 | 本研究探讨了抗体依赖性细胞介导的细胞毒性（ADCC）选择压力下肿瘤细胞的抗性机制 | 揭示了ADCC选择压力下肿瘤细胞的共享和独特抗性机制，并利用单细胞RNA测序和蛋白质组筛选探究了分子抗性机制 | ADCC抗性无法通过组合治疗策略逆转 | 研究ADCC选择压力下的肿瘤细胞抗性机制 | ADCC抗性机制及肿瘤细胞的免疫逃逸策略 | NA | NA | 单细胞RNA测序，蛋白质组筛选 | NA | RNA，蛋白质 | 多个ADCC选择压力模型中的细胞 |
| 14954 | 2024-08-07 |
FGFR3 Alterations in Bladder Cancer Stimulate Serine Synthesis to Induce Immune-Inert Macrophages That Suppress T-cell Recruitment and Activation
2023-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1065
PMID:37768887
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研究论文 | 本文研究了膀胱癌中FGFR3突变如何通过增加丝氨酸合成诱导免疫惰性巨噬细胞，从而抑制T细胞招募和激活 | 发现FGFR3突变通过增加丝氨酸合成在膀胱癌细胞中诱导免疫惰性巨噬细胞，为改善治疗反应提供了新策略 | NA | 探讨FGFR3突变在膀胱癌中的免疫抑制机制，并评估联合治疗策略的有效性 | 膀胱癌中的FGFR3突变、巨噬细胞和T细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14955 | 2024-08-05 |
CellNeighborEX: deciphering neighbor-dependent gene expression from spatial transcriptomics data
2023-Nov-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202311670
PMID:37815040
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研究论文 | 提出了一种新方法CellNeighborEX，用于研究细胞邻域依赖的基因表达 | 通过空间转录组数据揭示了细胞邻里对基因表达的影响，超越了传统的配体-受体共表达分析 | 未提供特定的限制信息 | 探讨细胞微环境对基因表达的影响 | 不同组织中细胞类型及其邻近细胞的基因表达 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠胚胎及肝癌样本 |
| 14956 | 2024-08-04 |
Targeting TREM1 augments antitumor T cell immunity by inhibiting myeloid-derived suppressor cells and restraining anti-PD-1 resistance
2023-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI167951
PMID:37651197
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研究论文 | 该研究探讨了靶向TREM1在抑制免疫抑制微环境中增强抗肿瘤T细胞免疫的潜力 | 开发了一种新的TREM1小分子抑制剂VJDT，并证明其能显著延缓肿瘤生长和增强抗PD-1治疗的效果 | 研究主要基于小鼠模型，需要更多临床研究验证结果 | 探讨TREM1在肿瘤免疫中的作用以及其抑制机制 | 使用Trem1缺失的小鼠和新开发的TREM1抑制剂 | 肿瘤学 | 黑色素瘤 | RNA-Seq | 小鼠模型 | 生物检测数据和基因表达数据 | 使用了B16F10和MCA205小鼠模型 |
| 14957 | 2024-08-07 |
90K/LGALS3BP expression is upregulated in COVID-19 but may not restrict SARS-CoV-2 infection
2023-Nov, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-023-01077-2
PMID:37162650
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研究论文 | 研究分析了90K/LGALS3BP在COVID-19患者中的表达情况及其对SARS-CoV-2感染的影响 | 首次详细探讨了90K/LGALS3BP在SARS-CoV-2感染中的表达及其潜在的抗病毒作用 | 实验仅限于体外细胞实验，未涉及动物模型或更广泛的临床样本 | 探究90K/LGALS3BP在COVID-19中的表达及其对SARS-CoV-2感染的潜在影响 | COVID-19患者的血清、外周血单个核细胞（PBMCs）以及呼吸道样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 44名COVID-19住院患者 |
| 14958 | 2024-08-07 |
E2F1 Mediates SOX17 Deficiency-Induced Pulmonary Hypertension
2023-11, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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research paper | 本研究探讨了SOX17基因缺陷在特发性肺动脉高压（PAH）发病机制中的作用，并发现E2F1信号通路在其中起关键作用。 | 首次报道了SOX17基因变异在PAH发病机制中的具体作用，并揭示了E2F1信号通路在SOX17缺陷引起的肺动脉高压中的关键作用。 | NA | 研究SOX17基因缺陷在特发性肺动脉高压发病机制中的作用。 | SOX17基因在肺动脉高压中的表达及功能。 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、RNA测序分析、荧光素酶 assay | NA | RNA | 包括患者的肺和肺内皮细胞，以及经过基因编辑的小鼠模型。 |
| 14959 | 2024-08-07 |
DNA-binding protein PfAP2-P regulates parasite pathogenesis during malaria parasite blood stages
2023-Nov, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01497-6
PMID:37884813
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研究论文 | 本文研究了DNA结合蛋白PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的作用及其对病原性的调控 | 首次详细描述了PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的两个表达高峰期，并揭示了其在trophozoite发育、var基因调控、merozoite发育和寄生虫出胞中的关键作用 | NA | 探讨PfAP2-P在疟原虫红细胞阶段发育中的分子调控机制 | Plasmodium falciparum中的PfAP2-P蛋白及其在疟原虫红细胞阶段的作用 | NA | 疟疾 | 染色质免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序, 荧光激活细胞分选 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14960 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling coupled with lineage analysis reveals vagal and sacral neural crest contributions to the developing enteric nervous system
2023-10-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79156
PMID:37877560
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研究论文 | 本研究揭示了迷走和骶神经嵴对发育中的肠神经系统的贡献 | 首次结合单细胞转录组学与特定轴水平的谱系追踪比较了鸡胚中两种神经嵴细胞的贡献 | 研究集中于鸟类胚胎，可能无法直接推导到其他物种 | 研究迷走神经嵴和骶神经嵴在肠神经系统中的贡献 | 鸡胚胎中的迷走和骶神经嵴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | NA |