单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 14921 - 14940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14921 | 2024-08-07 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.08.539879
PMID:37215034
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研究论文 | 本文通过使用稳态、新生和单细胞RNA测序策略，全面分析了雄性生殖细胞群体中的基因表达，揭示了RNA聚合酶II（Pol II）在精子分化早期暂停的必要性及其在调控基因活性和完成减数分裂中的作用。 | 发现RNA聚合酶II在精子分化早期暂停对于建立发育过程中的基因活性景观至关重要，并揭示了Pol II暂停在减数分裂调控中的新角色。 | NA | 旨在解析雄性生殖细胞发育过程中基因调控的机制，并为治疗相关不孕症提供新见解。 | 雄性生殖细胞及其在精子发生过程中的基因表达调控。 | NA | 不孕症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及多个雄性生殖细胞群体 |
| 14922 | 2024-08-07 |
scDisInFact: disentangled learning for integration and prediction of multi-batch multi-condition single-cell RNA-sequencing data
2023-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.01.538975
PMID:37205545
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研究论文 | 介绍了一种名为scDisInFact的深度学习框架，用于处理和预测多批次、多条件的单细胞RNA测序数据，该框架能够分离批次效应和条件效应 | scDisInFact能够同时执行批次效应去除、条件相关关键基因检测和扰动预测，这在现有方法中是独特的 | NA | 开发一种能够同时处理批次效应和条件效应的深度学习框架，以提高单细胞RNA测序数据整合和预测的准确性 | 多批次、多条件的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 14923 | 2024-08-07 |
An artificial neural network model to diagnose non-obstructive azoospermia based on RNA-binding protein-related genes
2023-04-24, Aging
DOI:10.18632/aging.204674
PMID:37116198
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研究论文 | 本文构建了一种基于RNA结合蛋白相关基因的人工神经网络模型，用于诊断非阻塞性无精症 | 首次开发了一种基于RNA结合蛋白DDX20和NCBP2的人工神经网络诊断模型，并在多个数据集上进行了验证 | NA | 研究RNA结合蛋白在非阻塞性无精症中的功能和诊断价值 | 非阻塞性无精症及其相关RNA结合蛋白 | 机器学习 | 男性不育症 | RNA测序 | 人工神经网络 | 基因表达数据 | 训练集包含58个睾丸样本，验证集包含多个公共数据集和44个临床样本，总计约500个样本 |
| 14924 | 2024-08-07 |
Assessing the effects of aging on the liver endothelial cell landscape using single-cell RNA sequencing
2023-02-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000021
PMID:36724124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝脏内皮细胞在老化过程中的转录组变化 | 首次详细描述了老化对肝脏内皮细胞分子调控机制的影响，并发现了两种特异性表达于老年小鼠内皮细胞的亚型 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探究老化对肝脏内皮细胞分子机制的影响 | 肝脏内皮细胞及其在老化过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的肝脏内皮细胞 |
| 14925 | 2024-08-07 |
Exosomal proteomics identifies RAB13 as a potential regulator of metastasis for HCC
2023-01-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000006
PMID:36633475
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法和体内外实验，首次鉴定了RAB13作为肝细胞癌（HCC）来源外泌体中调控转移的关键蛋白 | 首次发现RAB13在HCC转移中的调控作用，并通过体内外实验验证了其功能 | NA | 探索癌症细胞来源的外泌体蛋白在肿瘤转移中的生物学功能和分子机制 | 肝细胞癌（HCC）的转移机制 | 数字病理学 | 肝癌 | 批量基因表达分析、单细胞RNA测序数据分析、基因集富集分析 | NA | RNA测序数据 | 包括体外HCC细胞系和体内移植瘤小鼠模型 |
| 14926 | 2024-08-07 |
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.005
PMID:33207244
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研究论文 | 研究分析了正常器官捐赠者和COVID-19患者胰腺中SARS-CoV-2进入因子ACE2的表达情况 | 首次详细分析了COVID-19患者胰腺中ACE2的表达及其与糖尿病的可能关联 | 研究主要基于公共数据集和有限的样本，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨SARS-CoV-2感染与糖尿病之间的关系 | 胰腺中ACE2的表达及COVID-19患者的胰腺病理变化 | NA | COVID-19 | scRNA-seq, 荧光原位杂交, 蛋白质印迹, 免疫定位 | NA | RNA, 蛋白质 | 五个公共scRNA-seq胰腺数据集及来自正常人和COVID-19患者的胰腺组织 |
| 14927 | 2024-08-04 |
Integrating leiomyoma genetics, epigenomics, and single-cell transcriptomics reveals causal genetic variants, genes, and cell types
2024-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45382-0
PMID:38326302
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研究论文 | 本研究整合了基因组学、表观基因组学和单细胞转录组学，以揭示与子宫纤维瘤相关的遗传变异、基因和细胞类型 | 首次将多组学数据与特定位点的表观遗传编辑方法相结合，识别与疾病相关的基因和细胞类型 | 具体的遗传变异和基因靶点之间的因果关系仍然理解不足 | 探讨与子宫纤维瘤相关的遗传因素及其生物机制 | 与子宫纤维瘤相关的遗传变异和基因 | 数字病理学 | NA | CRISPR | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞基因表达数据 | 24个与子宫纤维瘤相关的风险位点，394个基因 |
| 14928 | 2024-08-07 |
The HSP90-MYC-CDK9 network drives therapeutic resistance in mantle cell lymphoma
2024-Feb-07, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00484-9
PMID:38326887
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研究论文 | 研究探讨了在套细胞淋巴瘤中，HSP90-MYC-CDK9网络如何驱动对Bruton酪氨酸激酶抑制剂和CAR-T疗法的抗药性 | 揭示了HSP90-MYC-CDK9网络是治疗抗性的主要驱动力，并提出了药物联合靶向HSP90和CDK9以减少MYC活性的策略 | NA | 解析套细胞淋巴瘤中对Bruton酪氨酸激酶抑制剂和CAR-T疗法的连续抗药性的潜在机制 | 套细胞淋巴瘤患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 66个样本来自25名患者 |
| 14929 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals that glial cells integrate homeostatic and circadian processes to drive sleep-wake cycles
2024-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01549-4
PMID:38263460
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研究论文 | 本研究揭示了胶质细胞如何整合生理平衡和昼夜节律过程以驱动睡眠-觉醒周期 | 发现胶质细胞在睡眠生理平衡和昼夜节律之间的交互作用，以及其基因表达如何影响睡眠动态 | 研究限制在特定的果蝇模型，结果可能无法直接推广到其他物种 | 研究不同脑细胞群体中昼夜节律和睡眠生理过程的分子影响及其相互作用 | 成年人果蝇的大脑胶质细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 成年人果蝇的大脑样本 |
| 14930 | 2024-08-04 |
A comparative atlas of single-cell chromatin accessibility in the human brain
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf7044
PMID:37824643
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研究论文 | 本文探讨了人脑中单细胞的染色质可及性及其对神经精神障碍的影响 | 通过snATAC-seq技术，揭示了107种不同细胞类型及其在基因组中使用的候选顺式调控DNA元素 | 研究仅限于三名成年人的样本，可能影响结果的普遍性 | 研究人脑中细胞身份和功能的调控程序 | 分析来自三名成人的42个脑区的111万个细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | snATAC-seq | 深度学习模型 | 细胞数据 | 3名成年人的42个脑区，合计111万个细胞 |
| 14931 | 2024-08-07 |
Protein arginine N-methyltransferase 4 (PRMT4) contributes to lymphopenia in experimental sepsis
2023-04, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thoraxjnl-2021-217526
PMID:35354645
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研究论文 | 本文研究了蛋白质精氨酸N-甲基转移酶4（PRMT4）在实验性脓毒症中对淋巴细胞减少的作用 | 发现了PRMT4在脓毒症患者和实验模型中系统性升高，并揭示了其在淋巴细胞凋亡中的关键作用 | NA | 探讨PRMT4在脓毒症中对淋巴细胞减少的影响及其机制 | PRMT4在脓毒症患者和实验模型中的表达及其对淋巴细胞和单核细胞的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及脓毒症患者的人体样本以及细胞和动物脓毒症模型 |
| 14932 | 2024-08-04 |
LINE-1 retrotransposon expression in cancerous, epithelial and neuronal cells revealed by 5' single-cell RNA-Seq
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad049
PMID:36744437
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研究论文 | 本研究开发了一种新方法以测量癌细胞、上皮细胞和神经细胞中LINE-1逆转录子表达 | 提出了5' scL1seq方法，能够在成千上万的单细胞中测量LINE-1的表达，并发现了人类上皮细胞和小鼠海马神经元中的LINE-1表达 | 缺乏对LINE-1在健康与疾病中作用的全面理解 | 准确理解LINE-1在不同细胞中的表达及其与衰老相关疾病的联系 | 癌细胞、上皮细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 5'单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 成千上万的单细胞 |
| 14933 | 2024-08-07 |
A comprehensive single cell data analysis of lymphoblastoid cells reveals the role of super-enhancers in maintaining EBV latency
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28362
PMID:36453088
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了淋巴母细胞中的Epstein-Barr病毒（EBV）生命周期，揭示了超级增强子在维持EBV潜伏期中的作用 | 发现了两个新的细胞簇，它们在EBV裂解基因表达上有所不同，并且通过CRISPR-mediated扰动证明了宿主超级增强子及其目标基因对于维持EBV潜伏期是必需的 | NA | 探究EBV在淋巴母细胞中的生命周期及其与宿主基因表达的关系 | 淋巴母细胞中的Epstein-Barr病毒（EBV） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 九个公开可用的淋巴母细胞系 |
| 14934 | 2024-08-07 |
Langerhans cells are essential components of the angiogenic niche during murine skin repair
2022-12-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.012
PMID:36493773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析小鼠皮肤伤口愈合过程中的早期血管生成微环境，揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用 | 首次揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用，扩展了其在抗原呈递和T细胞免疫之外的功能 | NA | 研究朗格汉斯细胞在小鼠皮肤修复中的血管生成作用 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的朗格汉斯细胞和血管生成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮肤伤口样本 |
| 14935 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
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研究论文 | 本研究通过批量mRNA元分析和单个淋巴母细胞转录组的检查，揭示了KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）的独特发育状态 | 发现KMT2A重排的婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体（ELP）状态主导，并具有混合髓系-淋巴系特征 | 研究强调细胞起源不能仅从转录状态推断，但未详细说明其他潜在限制 | 探究KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态 | KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 14936 | 2024-08-07 |
An interactive single cell web portal identifies gene and cell networks in COVID-19 host responses
2021-Oct-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103115
PMID:34522848
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研究论文 | 本文通过整合COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据，开发了一个交互式单细胞网络门户ToppCell，用于探索和比较细胞特征，以发现新的基因和细胞网络。 | 本文创新性地开发了一个交互式网络门户ToppCell，允许用户探索和比较不同条件下的单细胞转录组数据，从而发现新的基因和细胞网络。 | NA | 开发一个数据挖掘工具，使用户能够比较和探索细胞特征，以获得洞察并发展新的假设。 | COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据。 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 基因表达数据 | 多个COVID-19和其他对照条件的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本 |
| 14937 | 2024-08-07 |
Single-dose intranasal vaccination elicits systemic and mucosal immunity against SARS-CoV-2
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103037
PMID:34462731
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研究论文 | 本文报道了一种鼻内单剂次亚单位疫苗的开发，该疫苗使用冻干刺突蛋白和脂质体STING激动剂作为佐剂，能够诱导系统性中和抗体、肺和鼻腔中的IgA以及肺部T细胞反应。 | 该疫苗能够在鼻相关淋巴组织中以类似生发中心的方式协调激活T/B细胞反应，确认其作为诱导持久免疫的诱导位点的作用。 | NA | 验证针对SARS-CoV-2的疫苗平台的更广泛应用。 | SARS-CoV-2病毒的免疫反应。 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 14938 | 2024-08-07 |
Sample processing and single cell RNA-sequencing of peripheral blood immune cells from COVID-19 patients
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100582
PMID:34002169
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研究论文 | 本文描述了从COVID-19患者的外周血单核细胞（PBMCs）中进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）的样本处理和分析协议 | 提出了针对COVID-19患者PBMCs样本的采集、处理和分析的新方法 | 血液样本可能含有传染性病毒，免疫细胞亚型的识别可能困难，分析结果的生物学解释复杂 | 深入评估COVID-19患者免疫细胞的转录变化 | COVID-19患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 14939 | 2024-08-07 |
Dynamics of B cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in patients with different severities of COVID-19
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109173
PMID:33991510
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研究论文 | 研究分析了不同严重程度的COVID-19患者B细胞受体（BCR）库的动态变化及交叉反应性反应的出现 | 首次详细描述了COVID-19患者BCR库的特征，并识别出与疾病严重程度相关的差异性BCR特征 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19患者BCR库的特征及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的B细胞受体库 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 |
| 14940 | 2024-08-07 |
Divergent and self-reactive immune responses in the CNS of COVID-19 patients with neurological symptoms
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100288
PMID:33969321
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞因子分析，探讨了COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的免疫反应机制 | 发现了COVID-19患者中枢神经系统中特定区域的T细胞和B细胞活化，以及与自体免疫相关的抗体反应 | NA | 揭示COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的生物学基础 | COVID-19患者的脑脊液和血液 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7名患者 |