单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 14881 - 14900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14881 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of human islet ontogeny defines the molecular basis of β-cell dedifferentiation in T2D
2020-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.101057
PMID:32739450
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了人类发育过程中α-和β-细胞的成熟过程，并比较了非糖尿病和2型糖尿病个体的胰岛细胞。 | 首次揭示了2型糖尿病患者胰岛β细胞的去分化现象及其分子基础。 | NA | 探讨2型糖尿病中胰岛β细胞去分化的分子机制。 | 人类胰岛细胞的成熟过程及2型糖尿病中的变化。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及非糖尿病和2型糖尿病个体的胰岛细胞样本 |
| 14882 | 2024-08-07 |
Sexually Dimorphic Crosstalk at the Maternal-Fetal Interface
2020-12-01, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgaa503
PMID:32772088
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研究论文 | 研究胎儿性别如何影响母胎界面的受体配体相互作用，并探讨其在早期胎盘形成中的作用 | 首次定义了早期胎盘形成阶段的性别二态性信号 | NA | 探究胎儿性别对母胎界面相互作用的影响 | 母胎界面的受体配体相互作用及早期胎盘形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 晚期第一孕期（约10-13周）的胎盘（胎儿）和蜕膜（母体）样本 |
| 14883 | 2024-08-07 |
Integrative genomics approach identifies conserved transcriptomic networks in Alzheimer's disease
2020-10-10, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaa182
PMID:32803238
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研究论文 | 本研究采用系统生物学元分析方法，结合多尺度数据集，分析了阿尔茨海默病（AD）的遗传结构，并识别了AD相关的转录组网络。 | 本研究通过整合多种数据类型，包括DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录组和全基因组关联研究等，识别了AD中未在正常衰老中改变的稳健转录组失调。 | NA | 进一步阐明阿尔茨海默病的遗传结构 | 阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录组和全基因组关联研究 | 共表达网络分析 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 超过1200个人脑样本，27,321个来自人类死后前额叶皮质组织的细胞核 |
| 14884 | 2024-08-07 |
Single-cell deconstruction of post-sepsis skeletal muscle and adipose tissue microenvironments
2020-10, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12596
PMID:32643301
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研究论文 | 本研究全面评估了实验性脓毒症诱导后肌肉和脂肪在单细胞分辨率下的转录变化 | 首次从组织微环境的角度全面评估了脓毒症后肌肉和脂肪的单细胞转录变化 | NA | 研究脓毒症后肌肉和脂肪组织的微环境变化 | 小鼠的骨骼肌和内脏白色脂肪组织 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达 | 骨骼肌1438个单细胞，脂肪组织2281个单细胞 |
| 14885 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in cardiovascular development, disease and medicine
2020-08, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-020-0359-y
PMID:32231331
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其在心血管系统发育、疾病和精准医学中的应用 | scRNA-seq技术使得能够在前所未有的分辨率和通量下对单细胞转录组进行分析，促进了新细胞类型和罕见细胞类型的鉴定，以及健康和疾病相关组织在单细胞水平上的比较 | NA | 总结当前可用的scRNA-seq技术和分析工具，并讨论使用scRNA-seq的最新发现，这些发现显著提高了我们对心血管系统发育和心血管疾病机制的认识 | 心血管系统的发育、心血管疾病以及心血管精准医学 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 14886 | 2024-08-07 |
Alveolar wars: The rise of in vitro models to understand human lung alveolar maintenance, regeneration, and disease
2020-08, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0433
PMID:32272001
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研究论文 | 本文讨论了利用体外模型，特别是单细胞RNA测序和人类肺泡类器官，来研究人类肺泡的维持、再生和疾病 | 文章介绍了通过单细胞RNA测序技术识别肺泡细胞的分子异质性和细胞多样性，以及从人类多能干细胞、胚胎祖细胞和成人组织中建立的肺泡类器官模型 | 文章指出了现有系统的局限性，并提出了可能的解决方案，如使用芯片上的类器官和精确切割的肺切片等 | 旨在深入理解人类肺泡干细胞/祖细胞的生物学特性，并探索未来对晚期肺疾病患者的治疗或药物干预 | 研究对象包括人类肺泡的维持、再生和疾病，特别是与肺泡细胞相关的疾病如特发性肺纤维化、慢性阻塞性肺病和支气管肺发育不良 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及从健康和疾病肺组织中提取的多种样本 |
| 14887 | 2024-08-07 |
Cell type-specific immune dysregulation in severely ill COVID-19 patients
2020-Jul-24, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.07.23.20161182
PMID:32743611
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了COVID-19患者外周血单个核细胞的转录组，以揭示严重病例中的免疫失调反应 | 首次详细描述了COVID-19患者中ARDS相关的特定免疫缺陷和炎症反应 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 进一步阐明SARS-CoV-2感染导致严重临床过程的免疫失调反应 | COVID-19患者的免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 17名COVID-19患者，包括5名轻症患者、6名发展为ARDS的患者和6名从ARDS恢复的患者 |
| 14888 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of alloreactive CD4+ T cells over time reveals divergent fates during gut graft-versus-host disease
2020-07-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.137990
PMID:32484791
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序和计算建模，探讨了在小鼠模型中，供体树突细胞介导的GVHD加剧过程中，同种异体反应性CD4+ T细胞在肠道GVHD中的分化途径 | 首次在单细胞水平上揭示了GVHD过程中同种异体反应性CD4+ T细胞的分化轨迹，包括一个意外的第二轨迹，表现为低增殖、低细胞因子表达、高tcf7表达和较高的静息状态 | 研究基于小鼠模型，其结果在人类患者中的适用性需要进一步验证 | 探讨同种异体反应性CD4+ T细胞在肠道GVHD中的分化途径及其在GVHD过程中的作用 | 同种异体反应性CD4+ T细胞在肠道GVHD中的分化途径 | 单细胞测序 | GVHD | scRNA-Seq | 计算模型 | 转录组数据 | 小鼠模型中的CD4+ T细胞样本 |
| 14889 | 2024-08-07 |
Joint single cell DNA-seq and RNA-seq of gastric cancer cell lines reveals rules of in vitro evolution
2020-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa016
PMID:32215369
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研究论文 | 本研究通过单细胞DNA测序和RNA测序技术，分析了九种胃癌细胞系的细胞多样性，并揭示了体外进化的规律 | 首次量化了细胞系中共存的克隆数量及其特征，并通过单细胞RNA测序独立验证了单细胞DNA分析的克隆结构 | NA | 探究胃癌细胞系中的细胞多样性及其对实验重复性的影响 | 九种胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞DNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 8824个细胞的基因组，超过28000个单细胞的转录组 |
| 14890 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Fibrosis Development in Nonalcoholic Steatohepatitis
2020-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2019.11.311
PMID:32044315
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病如何进展为非酒精性脂肪性肝炎（NASH）并导致肝纤维化的机制，重点探讨了肝细胞、巨噬细胞和肝星状细胞之间的相互作用及其对纤维化发展的影响。 | 讨论了通过单细胞RNA测序揭示的肝星状细胞和巨噬细胞的异质性，以及这些发现对治疗干预的潜在影响。 | NA | 探讨非酒精性脂肪性肝炎中肝纤维化的发生机制及其治疗干预的可能性。 | 非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的肝纤维化机制。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14891 | 2024-08-07 |
scBatch: batch-effect correction of RNA-seq data through sample distance matrix adjustment
2020-05-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa097
PMID:32053185
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research paper | 本文介绍了一种名为scBatch的数值算法，用于批量和单细胞RNA测序数据的批次效应校正 | scBatch算法不依赖于批次效应生成机制的假设，并且在模拟和实际数据分析中表现优于现有的批次效应校正方法 | NA | 旨在改进批次效应校正方法，特别是在单细胞RNA测序数据分析中 | 批量和单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq data | NA |
| 14892 | 2024-08-07 |
IL-2 enhances ex vivo-expanded regulatory T-cell persistence after adoptive transfer
2020-04-28, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2019001248
PMID:32311015
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-2（IL-2）与雷帕霉素联合使用对体外扩增的调节性T细胞（Treg）在非人类灵长类动物模型中持久性的影响 | 研究发现IL-2与雷帕霉素联合使用能显著增加体外扩增Treg的半衰期，有效双倍增加外周血Treg细胞数量 | 研究仅在非人类灵长类动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 探讨免疫调节剂与Treg细胞的最佳配对，以实现Treg细胞的持久性和抑制功能的稳定 | 体外扩增的Treg细胞及其在体内的持久性和功能稳定性 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用非人类灵长类动物模型进行研究 |
| 14893 | 2024-08-07 |
Single Cell Sequencing and Kidney Organoids Generated from Pluripotent Stem Cells
2020-04-07, Clinical journal of the American Society of Nephrology : CJASN
IF:8.5Q1
DOI:10.2215/CJN.07470619
PMID:31992574
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）与从多能干细胞生成的肾脏类器官结合使用的进展和未来应用 | 结合scRNA-seq和肾脏类器官技术，以更好地理解肾脏发育和疾病，并预测未来应用 | NA | 探讨scRNA-seq在类器官领域的应用及未来发展 | 单细胞RNA测序技术和肾脏类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 14894 | 2024-08-07 |
TooManyCells identifies and visualizes relationships of single-cell clades
2020-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0748-5
PMID:32123397
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研究论文 | 本文介绍了TooManyCells，一套基于图的算法，用于高效且无偏地识别和可视化单细胞类群 | TooManyCells引入了一种与降维方法正交的可视化模型，并配备了不同于流行单分辨率聚类方法的高效无矩阵分裂层次谱聚类 | NA | 开发一种新的算法工具，用于更好地识别和可视化单细胞转录组数据中的细胞多样性 | 单细胞转录组数据中的细胞类群 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | 图算法 | 转录组数据 | 使用现有单细胞转录组数据集和新数据模型，研究白血病T细胞中的药物抗性获取 |
| 14895 | 2024-08-07 |
Astrocyte layers in the mammalian cerebral cortex revealed by a single-cell in situ transcriptomic map
2020-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-0602-1
PMID:32203496
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研究论文 | 本研究开发了一种高含量的大面积空间转录组（LaST）图谱，用于在原位定量单细胞基因表达，揭示了哺乳动物大脑皮层中星形胶质细胞的分层模式 | 首次通过单细胞原位转录组图谱揭示了星形胶质细胞在大脑皮层中的分层模式，并证实这些模式在成年鼠和人类皮层中持续存在 | 研究主要集中在小鼠和人类皮层，其他物种的星形胶质细胞分层模式尚未探讨 | 探究大脑皮层中星形胶质细胞是否具有特定的分层结构 | 大脑皮层中的星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间重建分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类的大脑皮层样本 |
| 14896 | 2024-08-07 |
Trajectory-based differential expression analysis for single-cell sequencing data
2020-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-14766-3
PMID:32139671
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研究论文 | 本文介绍了tradeSeq方法，一种基于负二项分布的广义加性模型框架，用于单细胞测序数据中的轨迹推断下游分析，能够灵活推断同系和异系间的差异表达 | tradeSeq方法能够充分利用轨迹推断提供的连续分辨率，并精确识别差异表达的类型，同时通过引入观测级别的权重来考虑零膨胀问题 | NA | 开发一种新的方法来分析单细胞RNA测序数据中的基因表达动态变化 | 单细胞RNA测序数据中的基因差异表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义加性模型 | 基因表达数据 | 使用了模拟数据集和真实数据集（包括基于液滴和全长协议的数据） |
| 14897 | 2024-08-07 |
Interleukin 27 Protects From Gastric Atrophy and Metaplasia During Chronic Autoimmune Gastritis
2020, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2020.04.014
PMID:32376420
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研究论文 | 研究白细胞介素27（IL27）在自身免疫性胃炎小鼠模型中对胃萎缩、增生和化生的作用 | 发现IL27通过抑制CD4+ T细胞介导的炎症来抑制胃炎和化生 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探讨免疫细胞和细胞因子如何调节慢性炎症与胃癌发生之间的关系 | 自身免疫性胃炎小鼠模型中的胃萎缩、增生和化生 | NA | 胃炎 | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | TxA23小鼠（对照组）和TxA23xEbi3-/-小鼠 |
| 14898 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Uncovers Distinct Functional Human NKT Cell Sub-Populations in Peripheral Blood
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00384
PMID:32528956
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人外周血中的NKT细胞，揭示了不同的功能性NKT细胞亚群 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了多个先前未被识别的NKT细胞亚群及其潜在的功能特异性 | 研究中使用的样本数量有限，可能影响对NKT细胞亚群的全面理解 | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人NKT细胞的功能性亚群，以推动针对特定NKT亚群的个性化治疗 | 人外周血中的NKT细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 超过4000个未刺激和7000个刺激的人外周血NKT细胞 |
| 14899 | 2024-08-07 |
Non-cell autonomous mechanism of Parkinson's disease pathology caused by G2019S LRRK2 mutation in Ashkenazi Jewish patient: Single cell analysis
2019-11-01, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2019.146342
PMID:31330122
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研究论文 | 本研究通过从携带G2019S LRRK2突变的阿什肯纳兹犹太患者中提取诱导多能干细胞（iPSCs），分离出自我更新的多能神经干细胞（NSCs），并在体外模拟这种形式的帕金森病，利用单细胞RNA测序转录组分析探讨NSCs中的细胞多样性和疾病病理。 | 研究首次揭示了G2019S LRRK2突变可能通过非细胞自主机制影响多种细胞类型的帕金森病病理，并展示了无偏见的单细胞转录组学在个性化医学中的潜力。 | NA | 探讨G2019S LRRK2突变如何导致帕金森病病理。 | 从携带G2019S LRRK2突变的阿什肯纳兹犹太患者中提取的诱导多能干细胞（iPSCs）及其分离出的神经干细胞（NSCs）。 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 一个阿什肯纳兹犹太患者 |
| 14900 | 2024-08-07 |
Cell type-specific transcriptional programs in mouse prefrontal cortex during adolescence and addiction
2019-09-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12054-3
PMID:31519873
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，全面分类了小鼠前额叶皮层中的所有独特细胞亚型，并分析了这些细胞亚型在自然适应和诱导条件下的转录动力学。 | 首次详细描述了小鼠前额叶皮层在青春期和慢性可卡因成瘾期间各神经元亚型的特异性转录程序。 | NA | 研究小鼠前额叶皮层在青春期和成瘾状态下各神经元亚型的特异性转录程序。 | 小鼠前额叶皮层的神经元亚型及其在青春期和成瘾状态下的转录动力学。 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 从P21到P60的小鼠前额叶皮层样本 |