单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 14801 - 14820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14801 | 2024-08-07 |
Integrated bioinformatics analysis of SEMA3C in tongue squamous cell carcinoma using machine-learning strategies
2024-Feb-06, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03247-y
PMID:38321460
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习策略，识别并验证了舌鳞状细胞癌（TSCC）中的关键生物标志物SEMA3C | 首次报道SEMA3C在舌鳞状细胞癌中的作用，表明其上调可能成为未来预测诊断、预防、预后评估和个性化医疗服务的关键潜在生物标志物 | NA | 旨在通过生物信息学分析识别和验证舌鳞状细胞癌的潜在生物标志物 | 舌鳞状细胞癌（TSCC）及其生物标志物SEMA3C | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | RNA表达数据 | 涉及来自Gene Expression Omnibus（GEO）数据库的舌鳞状细胞癌患者的临床和RNA表达信息 |
| 14802 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals alterations in cellular composition and cell-cell communication associated with airway inflammation and remodeling in asthma
2024-Feb-05, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-024-02706-4
PMID:38317239
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了哮喘中气道炎症和重塑相关的细胞组成变化和细胞间通讯机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了哮喘模型中细胞组成和细胞间通讯的变化，特别是GdT17细胞和巨噬细胞在炎症和重塑中的作用 | 研究仅使用了小鼠模型，且样本量较小，可能限制了结果的普遍性和可靠性 | 确定哮喘中的关键细胞类型及其病理机制 | 哮喘中的细胞组成和细胞间通讯 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 16周龄的尘螨诱导哮喘小鼠模型3只和对照组3只 |
| 14803 | 2024-08-04 |
Targeting Tumor Heterogeneity with Neoantigen-Based Cancer Vaccines
2024-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2042
PMID:38055891
|
综述 | 这篇综述讨论了以新抗原为基础的癌症疫苗的最新进展，强调了肿瘤异质性的挑战。 | 文章创新性地探讨了单细胞测序和人工智能在识别免疫原性新抗原方面的应用 | 文章提到当前在开发有效的新抗原疫苗方面的局限性 | 研究以新抗原为基础的疫苗的设计，以应对肿瘤异质性 | 主要研究对象是新抗原及其在癌症疫苗中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序, 人工智能 | NA | NA | NA |
| 14804 | 2024-08-07 |
Patterning ganglionic eminences in developing human brain organoids using a morphogen-gradient-inducing device
2024-Jan-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100689
PMID:38228151
|
研究论文 | 本文开发了一种利用聚二甲基硅氧烷装置生成持续化学梯度的方法，用于制备具有空间模式的大脑类器官，称为形态素梯度诱导的大脑类器官（MIBOs） | MIBOs能够在体外复制早期神经发育中的背腹模式，并通过单细胞RNA测序揭示了不同类型的神经元 | NA | 建立更精确的体外大脑发育模型 | 大脑类器官及其在神经发育和疾病模型中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | MIBOs培养时间长达5.5个月 |
| 14805 | 2024-08-07 |
[Research Progress in the Molecular Regulatory Mechanisms of Alveolar Bone Restoration]
2024-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20240160501
PMID:38322519
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研究论文 | 本文综述了牙槽骨修复的分子调控机制的研究进展 | 探讨了Notch、Wnt、Toll样受体（TLR）和核因子-κB（NF-κB）等多种信号通路在牙槽骨修复中的作用 | 目前研究尚未构建成熟的牙槽骨修复分子调控网络 | 深入理解牙槽骨修复的分子调控机制，探索新的治疗靶点 | 牙槽骨、成骨细胞、破骨细胞、牙周韧带细胞等多种细胞类型及其信号通路 | NA | 口腔炎症疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组测序 | NA | 转录组 | NA |
| 14806 | 2024-08-07 |
Human iPSC modeling recapitulates in vivo sympathoadrenal development and reveals an aberrant developmental subpopulation in familial neuroblastoma
2024-Jan-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108096
PMID:38222111
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研究论文 | 本文通过人类多能干细胞和单细胞RNA测序技术，重现了交感肾上腺系的正常发育过程，并识别出与家族性神经母细胞瘤相关的异常发育亚群 | 开发了一种新的分化模型，用于重现交感肾上腺系的正常发育过程，并利用单细胞RNA测序技术揭示了分子事件 | NA | 研究神经嵴相关疾病如儿童癌症神经母细胞瘤的早期破坏事件 | 人类多能干细胞及其在交感肾上腺系发育中的应用 | 数字病理学 | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 来自携带生殖系激活突变的患者来源的iPSC细胞 |
| 14807 | 2024-08-07 |
In-depth transcriptomic analysis of Anopheles gambiae hemocytes uncovers novel genes and the oenocytoid developmental lineage
2024-Jan-19, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09986-6
PMID:38243165
|
research paper | 本研究通过大规模RNA测序和组装，构建了成年雌性A. gambiae蚊子的血细胞转录组，发现了大量新的基因和转录本，并重新定义了血细胞的分化路径 | 本研究首次构建了详细的血细胞转录组，发现了大量新的基因和转录本，为低丰度细胞的单细胞转录组数据分析提供了全面的参考转录本 | NA | 研究蚊子血细胞的转录组，揭示血细胞发育和功能的新方面 | 成年雌性A. gambiae蚊子的血细胞 | digital pathology | NA | RNA sequencing | NA | RNA | 约24亿个短Illumina高质量读取和约940万个长PacBio高质量读取 |
| 14808 | 2024-08-07 |
PancrESS - a meta-analysis resource for understanding cell-type specific expression in the human pancreas
2024-Jan-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-09964-y
PMID:38238687
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meta-analysis | 本文通过分析胰腺单细胞RNA测序数据，提供了一个数据库和工具，用于理解人类胰腺中细胞类型特异性表达 | 本文介绍了一个多功能工具，该工具可自由获取为R包，并允许集成到现有工作流程中，且适用于其他生物系统 | NA | 理解人类胰腺中细胞类型特异性的转录程序，以开发胰腺疾病的疗法 | 人类胰腺中的细胞类型特异性表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14809 | 2024-08-04 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal a Cancer-Associated Fibroblast Subset in HNSCC That Restricts Infiltration and Antitumor Activity of CD8+ T Cells
2024-01-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1448
PMID:37930937
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了一种与肿瘤免疫逃逸相关的癌相关成纤维细胞亚群 | 该研究首次识别了高表达MHC-I和Galectin-9的癌相关成纤维细胞亚群，并探讨了它们对CD8+ T细胞浸润和功能的抑制作用 | 本研究仅通过五对肿瘤及相邻组织进行分析，样本数量较少，可能影响结果的普遍适用性 | 阐明调节HNSCC肿瘤微环境中CD8+ T细胞浸润和功能障碍的关键机制 | 研究对象为头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤样本及其相邻组织 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | 肿瘤组织样本 | 五对肿瘤及相邻组织样本 |
| 14810 | 2024-08-04 |
Integration of Pan-Cancer Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals Stromal Cell Features and Therapeutic Targets in Tumor Microenvironment
2024-01-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1418
PMID:38225927
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤微环境中基质细胞的特征及治疗靶点 | 首次进行泛癌症分析，识别了39种基质亚群并探讨其功能特征与治疗相关性 | 分析仅限于258名患者，可能无法代表所有癌症类型的基质细胞特征 | 设计针对基质细胞的抗肿瘤策略 | 214,972个非免疫基质细胞及来自16种癌症类型的患者样本 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 258名患者的样本和16名患者的空间转录组数据 |
| 14811 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the immune microenvironment landscape of osteosarcoma before and after chemotherapy
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23601
PMID:38332885
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了化疗前后骨肉瘤患者的免疫微环境变化 | 首次详细描述了化疗对骨肉瘤免疫微环境的具体影响，包括免疫细胞组成的变化及其功能调整 | 研究样本量较小，且仅包括化疗前后的骨肉瘤组织，可能影响结果的普遍性 | 探讨化疗对骨肉瘤免疫微环境的影响及其机制 | 骨肉瘤患者的免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名未接受化疗的骨肉瘤患者和7名接受化疗的骨肉瘤患者的组织样本 |
| 14812 | 2024-08-07 |
Multiscale spatial mapping of cell populations across anatomical sites in healthy human skin and basal cell carcinoma
2024-Jan-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313326120
PMID:38165934
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研究论文 | 本文创建了一个多尺度的健康皮肤和基底细胞癌（BCC）空间图谱，结合了光学相干断层扫描、单细胞RNA测序、空间全局转录组分析和原位测序技术，揭示了不同细胞群在特定组织环境中的定位。 | 本文首次通过多尺度空间图谱揭示了健康皮肤和基底细胞癌中细胞群的定位及其与组织环境的关系，特别是发现了与毛囊相关的细胞群在癌症中的扩张。 | NA | 旨在深入理解人体皮肤细胞在不同解剖部位和肿瘤形成中的差异。 | 健康人体皮肤和基底细胞癌中的细胞群及其空间分布。 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 光学相干断层扫描、单细胞RNA测序、空间全局转录组分析、原位测序 | NA | 图像、基因序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14813 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of ovarian cancer
2024-01-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05733-x
PMID:38182756
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研究论文 | 本研究揭示了卵巢癌微环境中的基质动态和肿瘤特异性特征 | 通过单细胞转录组学分析，识别了高基质和低基质肿瘤中免疫细胞和非免疫细胞的独特转录组景观 | 样本量较小，仅包括20个数据集 | 研究高级别浆液性卵巢癌微环境中基质细胞的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 卵巢癌（HGSOC）的微环境中的基质细胞亚型及其相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 20个样本 |
| 14814 | 2024-08-04 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160300
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研究论文 | 该文章探讨了利用空间组学数据与对比跨模态预训练机制相结合，提高基于图的深度学习模型对癌症病理分析的提取能力 | 将空间转录组学数据与图形化深度学习结合的对比跨模态预训练机制，展示了对形态和分子层面理解的提升 | 未提及具体的局限性 | 提高用于癌症病理分析的图基深度学习模型的性能 | 癌症病理图像中的形态和分子信息 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | 图形神经网络 | 图像和转录组数据 | 具体样本数量未明确提供 |
| 14815 | 2024-08-04 |
Pan-cancer and single-cell analysis reveal THRAP3 as a prognostic and immunological biomarker for multiple cancer types
2024, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2024.1277541
PMID:38333620
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研究论文 | 本研究揭示了THRAP3在多种癌症中的预后和免疫学标志物的潜力 | 首次全面分析了THRAP3在泛癌症中的作用，并验证了其在肺癌中的表达水平 | THRAP3的低表达在肺鳞状细胞癌中未得到详细探讨 | 探讨THRAP3在多种癌症中的生物学活性及其作为预后标志物的有效性 | 研究了THRAP3在肺癌及其他多种癌症中的表达和预后关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组化(IHC)和单细胞测序(ScRNA-seq) | NA | 生物信息学数据库数据 | 在研究中利用了多种癌症类型的样本，具体样本数量未明示 |
| 14816 | 2024-08-04 |
The use of single-cell RNA-seq to study heterogeneity at varying levels of virus-host interactions
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011898
PMID:38236826
|
综述 | 本研究描述了利用单细胞RNA测序技术研究病毒感染异质性的方法。 | 提出使用单细胞RNA测序技术来研究病毒与宿主相互作用中存在的复杂性和细胞异质性。 | 强调了在不同尺度上分析单细胞RNA测序数据时的一些关键实验限制和方法选择。 | 研究病毒感染过程中的异质性及感染细胞人群的动态变化。 | 研究对象包括个别病毒粒子和感染个体之间的免疫反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成千上万的个体细胞 |
| 14817 | 2024-08-07 |
BHLHE40 drives protective polyfunctional CD4 T cell differentiation in the female reproductive tract against Chlamydia
2024-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011983
PMID:38271477
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | 首次揭示了Bhlhe40在调节CD4 T细胞分化和多功能反应中的关键作用，对抗沙眼衣原体感染 | NA | 研究Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应中的作用 | Bhlhe40在女性生殖道中对沙眼衣原体感染的保护性T细胞反应 | 免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序结合TCR分析 | NA | RNA | Bhlhe40缺陷小鼠和野生型小鼠的CD4 T细胞 |
| 14818 | 2024-08-07 |
MAPK-activated protein kinase 2 is associated with poor prognosis of glioma patients and immune inhibition in glioma
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1307992
PMID:38322416
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研究论文 | 本研究探讨了MAPK激活蛋白激酶2（MAPKAPK2）在胶质瘤中的表达及其对患者预后和免疫抑制的影响 | 首次揭示了MAPKAPK2在胶质瘤中的临床意义和分子功能，特别是在细胞增殖、迁移、DNA损伤修复和免疫调节中的作用 | NA | 研究MAPKAPK2在胶质瘤中的临床意义和分子功能 | MAPKAPK2在胶质瘤组织中的表达及其对患者预后和免疫抑制的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | 免疫组织化学、转录组测序、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 组织样本、RNA序列 | 使用了来自TCGA和CGGA的数据，具体样本数量未详细说明 |
| 14819 | 2024-08-07 |
Development and Validation of a Novel Nomogram Integrated with Hypoxic and Lactate Metabolic Characteristics for Prognosis Prediction in Hepatocellular Carcinoma
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S446313
PMID:38333220
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种新型诺模图，该诺模图整合了缺氧和乳酸代谢特征，用于预测肝细胞癌的预后 | 本研究创新性地构建了一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型（HLPM），并开发了一个整合HLPM和临床特征的诺模图，用于肝细胞癌的预后预测 | NA | 旨在构建一个与缺氧和乳酸代谢相关的预后模型，以评估肝细胞癌患者的生存和治疗反应，并开发一个整合这些特征的诺模图用于预后预测 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 诺模图 | 组织样本 | 14对组织样本和单细胞RNA测序数据集 |
| 14820 | 2024-08-04 |
Enrichment of a neutrophil-like monocyte transcriptional state in glioblastoma myeloid suppressor cells
2023-Dec-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3793353/v1
PMID:38234734
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研究论文 | 研究发现胶质母细胞瘤（GBM）患者的单核细胞来源的抑制细胞（M-MDSC）表现出异质性，尤其是富集在类中性粒细胞的转录状态中 | 首次描述了GBM患者M-MDSC的发育来源和表型特征，并识别出了一种新型的单核细胞生成途径NeuMo | 未完全阐明M-MDSC的确切发育过程和所有表型标记 | 揭示胶质母细胞瘤中M-MDSC的异质性和其在肿瘤免疫抑制中的作用 | 胶质母细胞瘤患者的血液样本中的单核细胞来源抑制细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 来自多位（具体数量未提供）胶质母细胞瘤患者的血液样本 |