单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
14801	2024-08-07	Decoding the mechanisms of chimeric antigen receptor (CAR) T cell-mediated killing of tumors: insights from granzyme and Fas inhibition 2024-02-02, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06461-8 PMID:38307835	研究论文	研究揭示了嵌合抗原受体（CAR）T细胞介导的肿瘤杀伤机制，特别是通过抑制粒酶B和Fas的途径	发现CAR T细胞杀伤肿瘤的机制具有冗余性，需要同时抑制多个特定于肿瘤细胞的途径	研究主要集中在特定的细胞系和特定的抑制剂，可能需要进一步的临床验证	提高CAR T细胞治疗癌症的疗效并识别导致肿瘤逃逸的T细胞失败机制	CAR T细胞、肿瘤细胞、粒酶B抑制剂PI9、Fas途径	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	涉及多种肿瘤细胞系和患者输注产品
14802	2024-08-04	Single-cell transcriptomics of the immune system in ME/CFS at baseline and following symptom provocation 2024-01-16, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101373 PMID:38232699	研究论文	本文研究了慢性疲劳综合症 (ME/CFS) 中免疫系统的单细胞转录组特征	首次通过单细胞RNA测序揭示ME/CFS患者在基线和剧烈运动后免疫细胞的变化	样本大小和特定群体的选择可能限制了研究结果的普遍适用性	探讨ME/CFS中免疫系统的失调	ME/CFS患者与对照组的免疫细胞	数字病理学	慢性疲劳综合症	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	ME/CFS患者和对照组的免疫细胞样本
14803	2024-08-07	Targeting cell-type-specific, choroid-peripheral immune signaling to treat age-related macular degeneration 2024-01-16, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101353 PMID:38232696	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了65名包括AMD患者和对照组的外周血单核细胞，并整合现有脉络膜数据，生成AMD中失调的脉络膜-外周免疫交互网络，验证了CYR61在抑制CNV中的作用。	首次揭示了CYR61在脉络膜静脉中的上调及其对循环中单核细胞的信号作用，并验证了其在小鼠模型中抑制CNV的作用。	NA	旨在通过靶向细胞特异性、脉络膜外周免疫信号来治疗年龄相关性黄斑变性。	年龄相关性黄斑变性患者的外周血单核细胞和脉络膜。	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	65名个体
14804	2024-08-07	Melatonin alleviates the toxic effect of di(2-ethylhexyl) phthalate on oocyte quality resulting from CEBPB suppression during primordial follicle formation 2024-03-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132997 PMID:38008054	研究论文	本研究通过建立暴露于邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯（DEHP）和褪黑素的怀孕小鼠模型，利用单细胞转录组技术探讨了褪黑素对卵巢细胞中DEHP影响的缓解作用	研究发现褪黑素通过增强CEBPB表达，改善了由DEHP引起的原始卵泡形成过程中的损害，并减少了卵巢细胞的凋亡	NA	探讨褪黑素如何缓解DEHP对卵子质量的毒性影响，特别是在原始卵泡形成过程中CEBPB抑制的作用	怀孕小鼠及其卵巢细胞	NA	生殖健康	单细胞转录组技术	NA	基因表达数据	NA
14805	2024-08-07	Defining Endogenous Mitochondrial Transfer in Muscle After Rotator Cuff Injury 2024-02, The American journal of sports medicine DOI:10.1177/03635465231214225 PMID:38174367	研究论文	研究肩袖损伤后肌肉中纤维脂肪原性前体细胞（FAPs）向肌源性细胞的线粒体横向转移及其对β-激动剂处理的反应	描述了一种新的内源性线粒体转移过程，该过程在肩袖损伤后FAPs和肌源性细胞之间发生	尚未完全阐明FAPs发挥其有益作用的机制	研究FAPs向肌源性细胞的线粒体横向转移，并探讨β-激动剂对此过程的影响	纤维脂肪原性前体细胞（FAPs）和肌源性细胞	NA	肩袖损伤	单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选，流式细胞术，荧光显微镜，旋转盘共聚焦显微镜，双光子显微镜	NA	RNA	小鼠模型，C2C12肌母细胞
14806	2024-08-07	Intercellular crosstalk shapes purinergic metabolism and signaling in cancer cells 2024-01-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2023.113643 PMID:38175748	研究论文	本文评估了五种癌症细胞系在常氧和缺氧条件下所有关键嘌呤外酶的酶动力学，并结合单细胞RNA测序数据分析了嘌呤代谢的异质性	发现嘌呤代谢在癌症组织中具有空间异质性，且在不同细胞类型间存在差异	NA	研究细胞间对话如何影响癌症细胞中的嘌呤代谢和信号传导	五种癌症细胞系（霍奇金淋巴瘤、多发性骨髓瘤、胰腺腺癌、膀胱癌和胶质母细胞瘤）的嘌呤外酶酶动力学	NA	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA	五种癌症细胞系，包括恶性细胞、基质细胞和免疫细胞
14807	2024-08-07	Single-Cell Transcriptional Analysis of Lamina Propria Lymphocytes in the Jejunum Reveals Innate Lymphoid Cell-like Cells in Pigs 2024-01-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.4049/jimmunol.2300463 PMID:37975680	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析猪空肠中的淋巴细胞，发现猪空肠固有层淋巴细胞中存在类似先天淋巴细胞的细胞	首次详细描述了猪空肠先天淋巴细胞的基因表达、亚型分类及各种先天淋巴细胞的标记物	NA	探索猪肠道黏膜免疫的深入研究	猪空肠固有层淋巴细胞中的先天淋巴细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	猪空肠中的多种细胞类型
14808	2024-08-04	Single-cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia 2023-12-19, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101337 PMID:38118404	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析，识别出来自皮下脂肪组织的CD271前体细胞，在肢体缺血中具有增强的血管生成能力	指出CD271前体细胞独特的促血管生成基因特征，并展示其在肢体缺血模型中的优越效果	未提及具体的局限性	研究CD271前体细胞在肢体缺血中的血管生成作用	主要研究皮下脂肪组织中的CD271前体细胞	数字病理学	肢体缺血	单细胞转录组分析	异种移植物模型	基因表达数据	NA
14809	2024-08-04	Bexmarilimab-induced macrophage activation leads to treatment benefit in solid tumors: The phase I/II first-in-human MATINS trial 2023-12-19, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101307 PMID:38056464	研究论文	本研究探讨了bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的安全性和耐受性。	首次在人类中研究Clever-1阻断的疗效，并显示了bexmarilimab诱导的巨噬细胞激活对成瘤免疫的积极影响。	本研究主要集中于早期的安全性和耐受性评估，缺乏长期疗效的完整数据。	评估bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的初步抗肿瘤疗效及免疫相关性。	治疗难治性实体肿瘤患者，参与者总数为138。	数字病理学	皮肤黑色素瘤、胃癌、肝细胞癌、雌激素受体阳性乳腺癌和胆道癌	NA	NA	临床试验数据	138名患者
14810	2024-08-07	iPSC-derived hypoimmunogenic tissue resident memory T cells mediate robust anti-tumor activity against cervical cancer 2023-12-19, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101327 PMID:38091985	研究论文	本文开发了一种HLA-A24&-E双整合的HPV-rejTs，通过消除HLA I类抗原来有效抑制受体免疫排斥，同时保持比原始细胞毒性T淋巴细胞更强的细胞毒性	通过单细胞RNA测序发现HPV-rejTs富含组织驻留记忆T细胞，增强了通过TGFβR信号通路对宫颈癌的细胞毒性，并上调了与免疫突触相关的基因，促进了T细胞受体（TCR）的更强激活和TCR介导的目标细胞死亡	NA	开发一种可行的“即用型”T细胞疗法，具有强大的抗宫颈癌效果	从诱导多能干细胞生成的功能性恢复的人乳头瘤病毒特异性细胞毒性T淋巴细胞（HPV-rejTs）	免疫学	宫颈癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
14811	2024-08-07	Dapagliflozin protects against chronic heart failure in mice by inhibiting macrophage-mediated inflammation, independent of SGLT2 2023-12-19, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101334 PMID:38118414	研究论文	本研究使用SGLT2全局敲除小鼠评估SGLT2抑制剂对心力衰竭的作用机制，发现达格列净通过抑制巨噬细胞介导的炎症来保护心脏，且这一作用独立于SGLT2。	达格列净对心力衰竭的保护作用独立于SGLT2，主要通过抑制巨噬细胞炎症来实现。	NA	阐明SGLT2抑制剂在心力衰竭中的具体作用机制。	SGLT2全局敲除小鼠及其在心肌梗死和主动脉缩窄诱导的心力衰竭模型中的表现。	心血管疾病	心力衰竭	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	SGLT2全局敲除小鼠
14812	2024-08-04	Metabolic predictors of response to immune checkpoint blockade therapy 2023-Nov-17, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2023.108188 PMID:37965137	研究论文	本研究探讨了肿瘤微环境中免疫细胞代谢与免疫检查点抑制剂反应之间的关系	首次对接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者肿瘤微环境中免疫细胞的代谢特征进行了分析，并建立了基于代谢基因特征的预测模型	目前只分析了部分代谢基因，可能未涵盖所有相关的代谢途径	旨在通过代谢特征预测癌症患者对免疫检查点抑制剂的反应	参与研究的对象为大约230例接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者的免疫细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	约230个样本，涉及超过100万个免疫细胞
14813	2024-08-04	Single-cell transcriptome analysis reveals the key genes associated with macrophage polarization in liver cancer 2023-11-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000304 PMID:37889536	研究论文	本研究揭示了与肝癌巨噬细胞极化相关的关键基因	通过单细胞转录组分析识别了6个与巨噬细胞极化相关的关键基因，并建立了预后模型	尚未提及研究的具体限制	揭示与肝癌巨噬细胞极化相关的关键基因	肝癌组织中的单细胞转录组数据	数字病理学	肝癌	单细胞测序	Cox回归模型	基因表达数据	涉及2000个高变基因和15个细胞簇
14814	2024-08-04	Genetic vulnerability to Crohn's disease reveals a spatially resolved epithelial restitution program 2023-10-25, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adg5252 PMID:37878672	研究论文	本文解剖了肠黏膜愈合反应，通过单细胞分辨率绘制细胞间通信图谱并与空间转录组学结合	揭示了与克罗恩病相关的遗传变异如何破坏损伤感知通路，在愈合机制上提供了空间分辨的生物学模型	主要使用小鼠模型进行研究，可能与人类的生物学过程存在差异	研究肠道组织修复过程中的细胞间通信与信号传导机制	研究对象为克罗恩病相关的HGFAC基因变异及其在小鼠模型中的表现	数字病理学	克罗恩病	空间转录组学，单细胞转录组学	器官oid共培养模型	细胞数据	使用R509H小鼠模型进行实验
14815	2024-08-07	ETV6 represses inflammatory response genes and regulates HSPC function during stress hematopoiesis in mice 2023-09-26, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2022009313 PMID:37522715	研究论文	本研究通过生成携带Etv6R355X失活突变的小鼠模型，探讨ETV6基因在HSPC功能和炎症反应基因调控中的作用	首次揭示了ETV6在HSPC中抑制炎症基因表达的机制，特别是在应激造血过程中的作用	NA	阐明ETV6基因变异如何影响HSPC功能并导致疾病	ETV6基因在HSPC中的功能及其对炎症反应基因的调控作用	NA	血液系统恶性肿瘤	转座酶可及染色质测序、高吞吐量染色体构象捕获、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型，包括Etv6R355X/+和Etv6+/+小鼠的骨髓细胞
14816	2024-08-07	A Frizzled4-LRP5 agonist promotes blood-retina barrier function by inducing a Norrin-like transcriptional response 2023-Aug-18, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2023.107415 PMID:37559903	研究论文	本研究通过使用四价抗体模式F4L5.13，在因NDP信号受损而表现出复杂视网膜病理的幼鼠中，发现FZD4-LRP5激动剂的活动，并探讨其在发育期和成熟期对血视网膜屏障（BRB）功能的恢复作用。	本研究首次使用F4L5.13抗体模式，识别并验证了FZD4-LRP5激动剂在恢复血视网膜屏障功能中的作用，揭示了其在视网膜和神经疾病治疗中的潜在价值。	研究主要集中在幼鼠和成熟鼠模型上，未涉及其他年龄段的动物模型，可能影响结果的普遍性。	探讨FZD4-LRP5激动剂在维持和恢复血视网膜屏障功能中的作用及其潜在治疗价值。	幼鼠和成熟鼠的视网膜病理模型。	生物医学	视网膜疾病	scRNA-seq	NA	RNA	幼鼠和成熟鼠
14817	2024-08-07	EZH2 inhibition promotes tumor immunogenicity in lung squamous cell carcinomas 2023-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.06.06.543919 PMID:37333199	研究论文	本研究探讨了EZH2甲基转移酶抑制剂在肺鳞状细胞癌（LSCC）中增强免疫检查点抑制剂（ICI）反应的可能性	首次证明EZH2抑制剂能增加主要组织相容性复合体I和II（MHCI/II）的表达，并改变肿瘤微环境，使其更具免疫原性	NA	研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的效果	肺鳞状细胞癌（LSCC）及其免疫微环境	数字病理学	肺鳞状细胞癌	ChIP-seq, 单细胞RNA测序	NA	mRNA, 蛋白质	使用2D人类癌细胞系以及3D鼠源和患者来源的类器官进行实验
14818	2024-08-07	A TREM2-activating antibody with a blood-brain barrier transport vehicle enhances microglial metabolism in Alzheimer's disease models 2023-03, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-022-01240-0 PMID:36635496	研究论文	本文描述了一种高亲和力的人源TREM2激活抗体，该抗体通过单价的转铁蛋白受体（TfR）结合位点工程化，称为抗体运输载体（ATV），以促进血脑屏障的转运，从而增强阿尔茨海默病模型中的小胶质细胞代谢。	开发了一种新型的高亲和力TREM2激活抗体，结合了抗体运输载体（ATV）技术，以改善血脑屏障的穿透性和小胶质细胞的代谢活性。	NA	探索通过激活TREM2受体来改善阿尔茨海默病患者脑内小胶质细胞功能和代谢的治疗策略。	TREM2激活抗体及其在阿尔茨海默病模型中的应用。	生物技术	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	NA	RNA	使用人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的小胶质细胞和阿尔茨海默病小鼠模型进行研究。
14819	2024-08-04	Single cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia 2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.02.09.527726 PMID:36865239	研究论文	通过单细胞转录组分析，我们识别了来自皮下脂肪组织的CD271+前体细胞，具有增强的血管生成能力	该研究首次识别出皮下脂肪组织CD271+前体细胞，展示了它们在小鼠肢体缺血模型中显著的血管生成潜力	研究未涉及体内实验以进一步验证CD271+前体细胞在临床应用中的效果	探讨在肢体缺血中采用CD271+前体细胞作为治疗方法的潜力	主要研究对象为CD271+前体细胞及其在小鼠模型中的血管生成能力	数字病理学	肢体缺血	单细胞转录组分析	小鼠异种移植模型	基因表达数据	未提供具体样本数量
14820	2024-08-04	A Novel Molecular Classification Method for Glioblastoma Based on Tumor Cell Differentiation Trajectories 2023, Stem cells international IF:3.8Q2 DOI:10.1155/2023/2826815 PMID:37964983	研究论文	本文提出了一种基于肿瘤细胞分化轨迹的新的胶质母细胞瘤分子分类方法	探索了基于单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据的分化轨迹推断在胶质母细胞瘤分子分类中的应用	该研究仅使用了10个胶质母细胞瘤样本的单细胞数据，并在公共队列中验证其结果	研究新的胶质母细胞瘤分子分类，以便于治疗选择和提高癌症患者的反应率	10个胶质母细胞瘤样本的单细胞转录组测序数据	数字病理学	胶质瘤	单细胞转录组测序(串行单细胞RNA测序)	NA	基因表达数据	10个胶质母细胞瘤样本