单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 14781 - 14800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14781 | 2024-08-07 |
A deep learning adversarial autoencoder with dynamic batching displays high performance in denoising and ordering scRNA-seq data
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109027
PMID:38361616
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研究论文 | 本文提出了一种动态批量对抗自编码器（DB-AAE），用于提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的去噪效果和生物信号保留 | DB-AAE能够直接从输入数据中捕获最优特征，并增强特征保留，包括细胞类型特异性基因表达模式 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的质量和可靠性 | scRNA-seq数据的去噪和生物信号保留 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 对抗自编码器（AAE） | 基因表达数据 | NA |
| 14782 | 2024-08-04 |
Biomarkers and prognostic factors of PD-1/PD-L1 inhibitor-based therapy in patients with advanced hepatocellular carcinoma
2024-Feb-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-023-00535-z
PMID:38355603
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综述 | 本文总结了PD-1/PD-L1抑制剂在晚期肝细胞癌患者中的生物标志物和预后因素。 | 首次通过评估单细胞测序和空间转录组学的最新进展，揭示肿瘤异质性以及其生物标志物与预后的关系 | 可能缺乏关于某些预后因素和生物标志物的具体临床应用示例 | 探讨晚期肝细胞癌患者中使用PD-1/PD-L1抑制剂的生物标志物与预后因素 | 晚期肝细胞癌患者及其肿瘤微环境中的相关标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 生物标志物分析 | NA |
| 14783 | 2024-08-07 |
Glycosylation-related genes mediated prognostic signature contribute to prognostic prediction and treatment options in ovarian cancer: based on bulk and single‑cell RNA sequencing data
2024-Feb-14, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11908-4
PMID:38355446
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据，识别与卵巢癌相关的糖基化相关基因，构建预测预后和免疫治疗的基因签名 | 首次基于单细胞和批量RNA测序数据构建糖基化相关基因签名，用于卵巢癌的预后预测和治疗策略 | NA | 识别卵巢癌中的主要糖基化相关基因，并构建有效的基因签名以预测预后和免疫治疗 | 卵巢癌患者的糖基化相关基因及其在预后和免疫治疗中的作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | COX回归, LASSO回归 | RNA测序数据 | 1187个糖基化相关基因, 16个基因签名 |
| 14784 | 2024-08-07 |
Fine particulate matter 2.5 induces susceptibility to Pseudomonas aeruginosa infection via expansion of PD-L1high neutrophils in mice
2024-Feb-14, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02640-x
PMID:38355515
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研究论文 | 本研究探讨了细颗粒物PM2.5暴露如何通过扩张表达PD-L1的高中性粒细胞导致小鼠对铜绿假单胞菌感染的易感性增加 | 首次揭示了PM2.5暴露通过扩张PD-L1高表达的中性粒细胞，影响其吞噬功能，从而增加对铜绿假单胞菌感染的易感性 | 研究主要在动物模型中进行，未来需在人体中验证相关发现 | 探讨PM2.5暴露对呼吸系统健康的影响及其分子机制 | 小鼠模型中的中性粒细胞和铜绿假单胞菌感染 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据 | 多只小鼠 |
| 14785 | 2024-08-04 |
Integrated transcriptomics uncovers an enhanced association between the prion protein gene expression and vesicle dynamics signatures in glioblastomas
2024-Feb-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-11914-6
PMID:38347462
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研究论文 | 本研究揭示了朊蛋白基因表达与胶质母细胞瘤中的囊泡动力学特征之间增强的关联。 | 本研究首次展示了PrPC作为胶质母细胞瘤中囊泡生物学调节因子的潜在角色，并且引入了一种新的研究工具GBMdiscovery。 | 本研究主要依赖于公开的RNA测序数据，可能存在数据偏倚和适用性限制。 | 研究PRNP/PrPC在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其分子机制。 | 以患者来源的胶质母细胞瘤为研究对象，分析其RNA测序数据。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及来自四项独立研究的患者来源胶质母细胞瘤的公开RNA测序数据 |
| 14786 | 2024-08-04 |
Residual ANTXR1+ myofibroblasts after chemotherapy inhibit anti-tumor immunity via YAP1 signaling pathway
2024-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45595-3
PMID:38346978
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研究论文 | 这篇文章探讨了化疗后残留的ANTXR1+肌成纤维细胞如何通过YAP1信号通路抑制抗肿瘤免疫。 | 首次揭示了高分级浆液性卵巢癌中化疗对CAF群体的影响及其与抗肿瘤免疫的关系，特别是YAP1信号通路的作用。 | 研究主要集中在高分级浆液性卵巢癌，可能不适用于其他类型的癌症。 | 研究化疗对癌症相关成纤维细胞群体的影响，并探讨其对抗肿瘤免疫的作用。 | 针对在高分级浆液性卵巢癌中发现的不同CAF群体进行研究，特别是CAF-S1群体。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞分析、空间转录组学和免疫组化 | NA | 生物组织样本 | NA |
| 14787 | 2024-08-04 |
Hypoblast from human pluripotent stem cells regulates epiblast development
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06871-2
PMID:38052228
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研究论文 | 本文报告了利用人类多能干细胞生成真实的原始膜细胞的方法及其在胚胎发育中的作用 | 提出了利用人类多能干细胞生成的原始膜细胞在体外自组织模型中的创新应用 | 受伦理和法律限制，后植入阶段的研究受到限制 | 研究人类胚胎发育过程中的原始膜细胞及其机制 | 人类多能干细胞及其衍生的原始膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 三维双层结构模型 | 细胞 | NA |
| 14788 | 2024-08-07 |
Sstr2 Defines the Cone Differentiation-Competent Late-Stage Retinal Progenitor Cells in the Developing Mouse Retina
2024-Jan-12, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad073
PMID:37935630
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了C57BL/6J小鼠发育中视网膜的转录组，发现生长抑素受体2（Sstr2）在具有光感受器分化潜能的晚期视网膜祖细胞（RPCs）中特异性表达，并验证了Sstr2+细胞在体内分化为视锥细胞、无长突细胞和水平细胞的能力。 | 首次揭示了Sstr2在晚期RPCs中的特异性表达，并证明了Sstr2+细胞具有分化为视锥细胞的能力，为视网膜退行性疾病的治疗提供了新的生物标志物。 | NA | 旨在识别和富集能够分化为视锥细胞的视网膜祖细胞，以用于视网膜退行性疾病的干细胞治疗。 | C57BL/6J小鼠的发育中视网膜及其祖细胞。 | NA | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14789 | 2024-08-07 |
High migratory activity of dermal sheath cup cells associated with the clinical efficacy of autologous cell-based therapy for pattern hair loss
2024-Jan, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.11.003
PMID:38016881
|
研究论文 | 本文研究了真皮鞘杯细胞（DSC）在自体细胞疗法中治疗男性及女性脱发的效果及其机制 | 首次揭示了ITGA6阳性DSC细胞的高迁移活性可能通过促进细胞迁移到附近的毛囊来增强细胞疗法的效果 | NA | 探究DSC细胞在细胞疗法中的有效性及其作用机制 | DSC细胞的基因表达及其在细胞疗法中的效果 | NA | 脱发 | bulk转录组分析、定量聚合酶链反应、单细胞转录组分析、活细胞成像结合免疫染色 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | NA |
| 14790 | 2024-08-07 |
Predicting drug response from single-cell expression profiles of tumours
2023-12-01, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-03182-1
PMID:38041118
|
研究论文 | 本文介绍了DREEP方法，用于从肿瘤单细胞表达谱预测药物反应，并验证了其在多个独立单细胞数据集上的准确性和鲁棒性 | DREEP利用公开的药理基因组屏幕数据和功能富集分析，从转录组数据预测单细胞药物敏感性 | NA | 提高癌症治疗的疗效和精确性 | 肿瘤单细胞表达谱和药物反应 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 计算方法 | 转录组数据 | 超过200个癌症细胞系 |
| 14791 | 2024-08-07 |
Characterization of Intestinal Mesenchymal Stromal Cells From Patients With Inflammatory Bowel Disease for Autologous Cell Therapy
2023-03-03, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad003
PMID:36869704
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研究论文 | 研究评估了来自炎症性肠病患者自体肠道间充质基质细胞（MSCs）的适应性和功能性，作为细胞疗法的潜在平台 | 首次详细分析了自体肠道MSCs的基因表达、细胞亚型组成及表面标记物和分泌组在IFN-γ刺激后的变化 | 研究未涉及长期临床试验结果，未评估细胞疗法的长期安全性和有效性 | 评估自体肠道MSCs作为炎症性肠病细胞疗法的潜力 | 来自克罗恩病、溃疡性结肠炎患者及对照组的黏膜活检衍生的MSCs | NA | 炎症性肠病 | 流式细胞术，RNA测序，Luminex分析 | NA | 细胞 | 克罗恩病11例，溃疡性结肠炎12例，对照组14例 |
| 14792 | 2024-08-04 |
Molecular and spatial signatures of mouse brain aging at single-cell resolution
2023-01-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.12.010
PMID:36580914
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研究论文 | 本研究生成了小鼠大脑衰老的高分辨率细胞图谱 | 首次通过空间分辨的单细胞转录组学量化了小鼠大脑在衰老过程中细胞类型的基因表达和空间组织变化 | 主要集中在前额叶皮层和纹状体，可能不代表大脑其他区域的变化 | 理解与衰老相关的细胞和分子结构变化机制 | 小鼠大脑的非神经细胞和神经元 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间分辨的单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠样本 |
| 14793 | 2024-08-07 |
Selective Photomechanical Detachment and Retrieval of Divided Sister Cells from Enclosed Microfluidics for Downstream Analyses
2017-05-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.7b00413
PMID:28480715
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research paper | 本研究开发了一种光机械方法，用于从封闭的微流控室中有选择地分离和可靠地检索目标细胞，以便进行进一步分析。 | 首次使用碳纳米管-聚二甲基硅氧烷复合表面和纳秒脉冲激光诱导的剪切力来分离细胞，并保持细胞活性和分子表达水平。 | NA | 开发一种新的方法来分离和检索封闭微流控室中的姐妹细胞，以便进行下游分析。 | 癌症干细胞样细胞的自更新和分化过程中的基因变化。 | microfluidics | NA | photomechanical method | NA | single-cell transcriptome | 96个单细胞 |
| 14794 | 2024-08-07 |
Single cell dual adherent-suspension co-culture micro-environment for studying tumor-stromal interactions with functionally selected cancer stem-like cells
2016-08-07, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c6lc00062b
PMID:27381658
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研究论文 | 本文介绍了一种单细胞双粘附-悬浮共培养微环境装置，用于研究肿瘤-基质相互作用中的功能选择性癌症干细胞样细胞 | 提出了一种结合悬浮环境和粘附环境的共培养装置，通过在凹形微孔中选择性图案化聚HEMA，实现了单细胞肿瘤球形成和基质细胞共培养 | NA | 研究肿瘤-基质相互作用对功能选择性癌症干细胞样细胞的影响 | 乳腺癌细胞T47D和癌症相关成纤维细胞（CAF） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 少于100个细胞 |
| 14795 | 2024-08-07 |
Construction of a New Ferroptosis-related Prognosis Model for Survival Prediction in Colorectal Cancer
2024-Feb-14, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究旨在构建一个新的铁死亡相关预后模型，用于结直肠癌（CRC）患者的生存预测，并探索该基因签名的分子功能潜力 | 本研究开发了一个基于铁死亡相关基因的预后签名，并验证了其在结直肠癌预后评估中的有效性 | NA | 开发一个铁死亡相关基因签名，用于指导结直肠癌的预后预测并探索其潜在的分子功能 | 结直肠癌（CRC）患者的预后预测 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），基因表达综合分析（ssGSEA），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的单细胞RNA测序数据GSE161277和转录组测序数据GSE17537及TCGA-CRC，共259个与铁死亡相关的基因 |
| 14796 | 2024-08-07 |
Author Correction: Deciphering driver regulators of cell fate decisions from single-cell transcriptomics data with CEFCON
2024-Feb-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45929-1
PMID:38351163
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14797 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics reveals alterations in perivascular macrophage lipid metabolism in the onset of Wooden Breast myopathy in broiler chickens
2024-02-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53904-5
PMID:38342952
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研究论文 | 本研究旨在利用空间转录组学特征化与木胸肌病微观特征相关的细胞类型特异性表达谱 | 揭示了在木胸肌病早期阶段中周围血管巨噬细胞脂质代谢的改变 | 样本量较小，仅使用了三只鸡的肌肉样本 | 研究木胸肌病早期的细胞互作和基因表达模式 | 23天大肉鸡的右胸大肌的肌肉样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 肌肉样本 | 3只肉鸡 |
| 14798 | 2024-08-04 |
A call for a unified and multimodal definition of cellular identity in the enteric nervous system
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.15.575794
PMID:38293133
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研究论文 | 本研究呼吁在肠神经系统中建立统一和多模态的细胞身份定义 | 强调了技术和数据整合的重要性，并提出了使用多种先进技术以推动对肠神经元身份的全面理解 | 主要依赖转录组学数据，缺乏对组织的充分验证，导致在功能注释方面存在显著差异 | 旨在通过实施各种先进的技术和方法，以更全面地理解肠神经系统中的细胞身份 | 比较和分析小鼠与人类的肠神经系统数据集以及不同的研究结果 | 神经科学 | 肠道神经病 | 单细胞转录组技术，复合成像，电生理学，空间转录组学 | 人类多能干细胞（hPSC）模型 | 基因表达数据，组织样本数据 | NA |
| 14799 | 2024-08-07 |
CD40 is expressed in the subsets of endothelial cells undergoing partial endothelial-mesenchymal transition in tumor microenvironment
2024-Feb, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16045
PMID:38111334
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研究论文 | 本文研究了肿瘤微环境中部分内皮-间质转化过程中表达CD40的特定内皮细胞亚群 | 建立了新的EndoMT报告细胞系统EMRECs，并鉴定了CD40作为部分EndoMT特异性标记物 | NA | 深入理解TGF-β诱导的EndoMT机制，并促进针对EndoMT驱动的癌症进展和转移的新治疗策略的开发 | 内皮细胞在部分内皮-间质转化过程中的基因表达和CD40的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类肿瘤细胞 |
| 14800 | 2024-08-07 |
A Data-Distribution and Successive Spline Points based discretization approach for evolving gene regulatory networks from scRNA-Seq time-series data using Cartesian Genetic Programming
2024-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2024.105126
PMID:38278505
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研究论文 | 本文提出了一种基于数据分布和连续样条点的离散化方法，用于从scRNA-Seq时间序列数据中进化基因调控网络，使用笛卡尔遗传编程 | 本文提出的分布和连续样条点离散化（DSSPD）方法考虑了数据分布和适当的预处理步骤，改进了基因调控网络的推断结果 | NA | 推断基因调控网络 | scRNA-Seq时间序列数据 | 系统生物学 | NA | scRNA-Seq | 笛卡尔遗传编程（CGP） | 时间序列数据 | NA |