单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
14781 2024-08-07
Dynamics of B cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in patients with different severities of COVID-19
2021-05-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 研究分析了不同严重程度的COVID-19患者B细胞受体(BCR)库的动态变化及交叉反应性反应的出现 首次详细描述了COVID-19患者BCR库的特征,并识别出与疾病严重程度相关的差异性BCR特征 研究样本量较小,可能影响结果的普遍性 探究COVID-19患者BCR库的特征及其与疾病严重程度的关系 COVID-19患者的B细胞受体库 NA COVID-19 高通量测序 NA 序列数据 19名COVID-19患者
14782 2024-08-07
Divergent and self-reactive immune responses in the CNS of COVID-19 patients with neurological symptoms
2021-05-18, Cell reports. Medicine
研究论文 研究通过单细胞RNA测序和细胞因子分析,探讨了COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的免疫反应机制 发现了COVID-19患者中枢神经系统中特定区域的T细胞和B细胞活化,以及与自体免疫相关的抗体反应 NA 揭示COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的生物学基础 COVID-19患者的脑脊液和血液 NA COVID-19 单细胞RNA测序 NA RNA 7名患者
14783 2024-08-07
Systems biological assessment of human immunity to BNT162b2 mRNA vaccination
2021-Apr-22, Research square
研究论文 本研究采用系统生物学方法,全面分析了56名健康志愿者接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗后的先天和适应性免疫反应 首次详细描述了mRNA疫苗接种后免疫系统的反应,包括中和抗体的产生和免疫细胞的激活 研究样本仅限于56名健康志愿者,可能无法完全代表所有人群的免疫反应 探讨mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫反应 56名接种了辉瑞-BioNTech mRNA疫苗的健康志愿者的免疫反应 疫苗学 COVID-19 系统生物学方法 NA 免疫细胞转录组数据 56名健康志愿者
14784 2024-08-07
Multi-cohort analysis of host immune response identifies conserved protective and detrimental modules associated with severity across viruses
2021-04-13, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究通过分析多个队列中宿主免疫反应,识别出与病毒感染严重程度相关的保守保护性和有害模块 本研究首次整合了大量血液转录组和单细胞RNA测序数据,揭示了不同病毒感染下宿主反应的共性和差异 研究主要集中在血液样本,可能无法全面反映所有组织中的宿主反应 探索不同病毒感染下宿主免疫反应与疾病严重程度的关系 16种病毒感染的患者血液转录组和免疫细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 4,780个血液转录组样本和702,970个免疫细胞样本
14785 2024-08-07
Dynamics of B-cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in COVID-19 patients with different disease severity
2021-Apr-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本文通过高通量测序技术研究了COVID-19患者在感染期间B细胞受体(BCR)库的动态变化及其与疾病严重程度的关系 首次详细描述了COVID-19患者中B细胞反应的特征,并发现了对SARS-CoV-1和SARS-CoV-2具有交叉反应性的BCR 研究样本量较小,仅涉及19名患者 探究COVID-19患者B细胞库的动态变化及其与疾病严重程度的关联 COVID-19患者的B细胞库及其对SARS-CoV-2的反应 NA COVID-19 高通量测序 NA 序列数据 19名COVID-19患者
14786 2024-08-07
Impaired local intrinsic immunity to SARS-CoV-2 infection in severe COVID-19
2021-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究分析了35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者的鼻咽样本,通过单细胞RNA测序揭示了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化及其对病毒病理的影响。 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化过程,并揭示了细胞类型多样性和异质性对病毒复制的影响。 研究样本量有限,且未涵盖所有可能的疾病状态和年龄组,可能影响结果的普遍性。 探讨SARS-CoV-2感染对上呼吸道上皮细胞的影响及其在COVID-19严重程度中的作用。 COVID-19患者的鼻咽样本和非COVID-19患者的鼻咽样本。 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者
14787 2024-08-07
Diversified transcriptional responses of myeloid and glial cells in spinal cord injury shaped by HDAC3 activity
2021-02, Science advances IF:11.7Q1
research paper 本研究结合骨髓特异性转录组学和单细胞RNA测序,揭示了脊髓损伤后激活的微胶质细胞和巨噬细胞的共同核心及时间上独特的基因程序 发现了脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的多样化转录反应,并揭示了HDAC3在这些过程中的广泛影响 NA 探究脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的转录反应及HDAC3的作用 脊髓损伤后的微胶质细胞和巨噬细胞 digital pathology 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
14788 2024-08-07
Targeted Single-Cell RNA and DNA Sequencing With Fluorescence-Activated Droplet Merger
2020-11-03, Analytical chemistry IF:6.7Q1
研究论文 本文介绍了一种利用荧光激活液滴合并技术进行靶向单细胞RNA和DNA测序的新方法 该方法通过选择性地合并细胞与试剂,实现酶促反应,无需物理隔离细胞,简化了单细胞工作流程 NA 旨在解决在分析异质性细胞群时,稀有细胞类型数据代表性不足的问题 特定细胞亚群的单细胞转录组和基因组 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和DNA测序 NA RNA和DNA NA
14789 2024-08-07
Inflammatory Signals Induce AT2 Cell-Derived Damage-Associated Transient Progenitors that Mediate Alveolar Regeneration
2020-09-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序结合体内谱系追踪和类器官模型,精细绘制了损伤修复和肺再生过程中肺泡谱系细胞的轨迹,并识别出一种特定的AT2谱系群体——损伤相关短暂前体细胞(DATPs)。 本文首次发现并描述了损伤相关短暂前体细胞(DATPs)在肺泡再生中的作用,并揭示了炎症信号如何通过HIF1α介导的糖酵解途径调控这些细胞的形成和功能。 NA 研究肺泡再生过程中细胞谱系的变化及其调控机制。 肺泡谱系细胞及其在损伤修复和肺再生中的作用。 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
14790 2024-08-07
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Vascular Smooth Muscle Cell Phenotype Modulation in Marfan Syndrome Aortic Aneurysm
2020-09, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,探讨了马凡综合征(MFS)中主动脉瘤发展过程中血管平滑肌细胞(SMC)转录组变化的时间和空间动态 本研究首次在MFS小鼠模型中识别出一种独特的转录组调控的SMC(modSMC)集群,并揭示了MFS特异性的基因特征,包括纤溶酶原激活物抑制剂-1(Serpine1)和Kruppel样因子4(Klf4) NA 阐明马凡综合征中主动脉瘤发展过程中血管平滑肌细胞转录组变化的时间和空间动态 马凡综合征小鼠模型的主动脉瘤组织和健康对照组的主动脉组织 数字病理学 马凡综合征 单细胞RNA测序 NA 转录组 Fbn1C1041G/+(MFS)小鼠和健康对照小鼠的主动脉根/升主动脉瘤组织,以及人类MFS主动脉根瘤组织
14791 2024-08-07
m6A RNA methylation impacts fate choices during skin morphogenesis
2020-08-26, eLife IF:6.4Q1
研究论文 研究m6A RNA甲基化在皮肤形态发生中的作用及其对细胞命运选择的影响 揭示了m6A修饰在编码序列中与增强翻译的相关性,特别是在关键形态发生信号通路中的作用 NA 探讨m6A RNA甲基化的功能及其在皮肤胚胎发生中的生理重要性 小鼠皮肤胚胎发生过程中的m6A RNA甲基化 NA NA 单细胞转录组学和生物信息学 NA mRNA NA
14792 2024-08-07
Self-Reporting Transposons Enable Simultaneous Readout of Gene Expression and Transcription Factor Binding in Single Cells
2020-08-20, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文介绍了一种名为单细胞呼叫卡(scCC)的新技术,利用自报告转座子(SRTs)在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点(TFBS) 首次实现了在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点,为研究细胞异质性和转录因子生物学提供了新方法 NA 开发一种新技术,能够在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点 单细胞中的基因表达和转录因子结合位点 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA mRNA 多个转录因子和K562细胞,以及小鼠大脑皮层的单细胞
14793 2024-08-07
Multimodal Analysis of Composition and Spatial Architecture in Human Squamous Cell Carcinoma
2020-07-23, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文通过结合单细胞RNA测序、空间转录组学和多路离子束成像技术,研究了人皮肤鳞状细胞癌(cSCC)的细胞组成和空间结构 首次揭示了cSCC中的四种肿瘤亚群,包括三种重现正常表皮状态的亚群和一个肿瘤特异性角质形成细胞(TSK),并展示了这些细胞在癌症中的特定定位和相互作用 NA 定义皮肤鳞状细胞癌的细胞组成和结构 人皮肤鳞状细胞癌及其匹配的正常皮肤 数字病理学 皮肤癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多路离子束成像 NA RNA序列数据、图像 一系列人皮肤鳞状细胞癌样本及其匹配的正常皮肤
14794 2024-08-04
Increased heterogeneity in expression of genes associated with cancer progression and drug resistance
2024-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本文探讨了与癌症进展及药物耐受性相关的基因表达噪声的增加。 通过单细胞RNA测序数据,识别出37个在肺腺癌患者癌症进展过程中表现出表达噪声增加趋势的基因,揭示了线粒体在异质性生成中的重要作用。 该研究对实际癌症患者的表达噪声变化的探讨仍然不足,具体机制尚需进一步研究。 分析癌症进展过程中基因表达噪声的变化,以揭示肿瘤内部异质性的生成机制。 研究对象为不同阶段的肺腺癌患者的基因表达噪声。 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 不同阶段的肺腺癌患者的单细胞 RNA 数据
14795 2024-08-07
The role of tertiary lymphoid structure and B cells in nasopharyngeal carcinoma: Based on bioinformatics and experimental verification
2024-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了鼻咽癌中三级淋巴结构(TLS)和浸润B细胞的转录组特征及预后作用 首次通过单细胞RNA测序分析揭示了鼻咽癌中不同B细胞亚群的转录特征,并验证了B细胞和TLS作为鼻咽癌患者生存预后标志物的可能性 NA 探究鼻咽癌中浸润B细胞和TLS的转录组特征及其临床相关性 鼻咽癌患者的转录组数据和临床样本 数字病理学 鼻咽癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 88名鼻咽癌患者
14796 2024-08-07
Newcastle disease virus infection remodels plasma phospholipid metabolism in chickens
2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文研究了新城疫病毒感染对鸡血浆磷脂代谢网络的影响 首次揭示了新城疫病毒感染如何重塑鸡血浆磷脂代谢网络 NA 探讨新城疫病毒感染对鸡血浆代谢网络的影响 鸡血浆磷脂代谢网络及肺组织细胞 NA 新城疫 代谢组学和脂质组学分析,单细胞RNA测序 NA 代谢数据,RNA序列数据 具体样本数量未提及
14797 2024-08-07
A single cell atlas of circulating immune cells involved in diabetic retinopathy
2024-Feb-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究聚焦于探讨循环免疫细胞在糖尿病视网膜病变(DR)发展中的确切作用 首次通过单细胞RNA测序揭示了健康对照组、非糖尿病视网膜病变患者和糖尿病视网膜病变患者循环免疫细胞中独特的差异表达基因和通路,并发现JUND在糖尿病视网膜病变患者PBMCs中的上调 NA 研究循环免疫细胞在糖尿病视网膜病变发展中的作用 糖尿病视网膜病变患者的循环免疫细胞和视网膜微血管内皮细胞 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
14798 2024-08-04
Spatial and single-cell analyses uncover links between ALKBH1 and tumor-associated macrophages in gastric cancer
2024-Feb-06, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 这项研究揭示了ALKBH1与胃癌肿瘤相关巨噬细胞之间的联系 本研究通过多组学方法确认ALKBH1作为胃腺癌的潜在诊断生物标志物,并探讨了其在肿瘤免疫微环境中的作用 本研究的数据来源于公共数据库,可能受限于样本选择的代表性和数据的完整性 探讨ALKBH1在胃腺癌的临床和病理相关性及其在精准肿瘤学中的潜力 研究对象为60例胃腺癌患者样本及相关的公共基因组数据 数字病理学 胃癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据 60例胃腺癌患者样本
14799 2024-08-04
Smith-specific regulatory T cells halt the progression of lupus nephritis
2024-Feb-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 这篇文章研究了Smith特异性调节性T细胞在狼疮性肾炎进展中的作用 通过生物物理亲和力结合测定识别了HLA-DR15限制的免疫优势Sm T细胞表位,并利用高通量单细胞测序识别了高亲和力的Sm特异性T细胞受体 研究主要集中在特定的Sm T细胞受体,可能缺乏对其他自体反应性的考虑 探讨Sm特异性调节性T细胞在系统性红斑狼疮中的治疗潜力 对来自有抗Sm和HLA-DR15阳性的系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞进行研究 数字病理学 狼疮性肾炎 单细胞测序 人源化小鼠模型 细胞数据 来自系统性红斑狼疮患者的调节性T细胞
14800 2024-08-07
A clinically applicable connectivity signature for glioblastoma includes the tumor network driver CHI3L1
2024-Feb-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和染料摄取方法建立了一种适用于临床的胶质母细胞瘤(GB)连接性特征,并通过细胞钙信号记录和临床相关性进行了验证 首次建立了基于单细胞RNA测序的胶质母细胞瘤连接性特征,并验证了其在患者预后中的应用 NA 研究胶质母细胞瘤的肿瘤微管(TM)连接性对肿瘤进展和治疗抵抗的影响 胶质母细胞瘤细胞及其连接性特征 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA RNA 包括来自患者的大量胶质母细胞瘤样本
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