单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 14781 - 14800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14781 | 2024-08-07 |
A cell atlas of the adult Drosophila midgut
2020-01-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1916820117
PMID:31915294
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对成年果蝇中肠上皮细胞的转录组进行了表征，并识别出22个不同的细胞群 | 本研究通过无偏倚的方法恢复了大多数已知的肠道干细胞/成肠细胞和内分泌细胞标记，并揭示了肠道干细胞生物学、细胞类型特异性细胞器特征、新转录因子在祖细胞中的作用以及沿肠道区域的变异 | NA | 旨在提供一个全面的资源，用于解决中肠上皮中基因的功能 | 成年果蝇中肠上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 22个不同的细胞群 |
| 14782 | 2024-08-07 |
Postnatal Alveologenesis Depends on FOXF1 Signaling in c-KIT+ Endothelial Progenitor Cells
2019-11-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201812-2312OC
PMID:31233341
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研究论文 | 本文研究了c-KIT+内皮祖细胞中的FOXF1信号传导对产后肺泡形成的影响 | 首次揭示了c-KIT EC祖细胞在肺泡隔形成中的作用及其治疗潜力 | NA | 探讨c-KIT EC祖细胞是否促进新生儿肺泡形成 | c-KIT+内皮祖细胞在肺泡形成中的作用 | NA | 儿童肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新生儿人鼠肺组织样本 |
| 14783 | 2024-08-07 |
SNV identification from single-cell RNA sequencing data
2019-11-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddz207
PMID:31504520
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研究论文 | 本文评估了两种单核苷酸变异（SNV）识别管道（GATK和Monovar）在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的应用，以检测细胞类型特异性基因表达变异背后的功能性遗传变异。 | 本文首次探讨了仅使用scRNA-seq数据进行SNV识别的可行性，并提供了实际应用的参数设置建议。 | 尽管两种管道在某些情况下能识别高质量的SNV，但它们在单个细胞中识别SNV的准确性仍有限。 | 旨在通过scRNA-seq数据识别SNV，以最大化现有scRNA-seq研究的价值。 | 研究对象为scRNA-seq数据中的单核苷酸变异（SNV）。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 14784 | 2024-08-07 |
Transcriptome analysis of LRRK2 knock-out microglia cells reveals alterations of inflammatory- and oxidative stress-related pathways upon treatment with α-synuclein fibrils
2019-09, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2019.05.012
PMID:31102768
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析了LRRK2敲除的微胶质细胞在α-突触核蛋白纤维处理后的转录组变化，揭示了炎症和氧化应激相关通路的改变 | 首次详细探讨了LRRK2敲除微胶质细胞在α-突触核蛋白纤维处理后氧化应激相关通路的改变，并验证了SOD2在mRNA和蛋白质水平上的表达 | 研究主要集中在体外细胞实验，需要进一步的体内实验验证 | 探讨LRRK2基因在帕金森病发病机制中通过改变氧化应激信号的作用 | LRRK2野生型和敲除的微胶质细胞，以及α-突触核蛋白预形成纤维和脂多糖处理后的细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及LRRK2野生型和敲除的微胶质细胞样本 |
| 14785 | 2024-08-07 |
A pooled single-cell genetic screen identifies regulatory checkpoints in the continuum of the epithelial-to-mesenchymal transition
2019-09, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-019-0489-5
PMID:31477929
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研究论文 | 本文通过整合单细胞轨迹分析与聚合遗传筛选，探索了控制上皮-间质转化（EMT）的遗传电路 | 本文首次将单细胞RNA测序与CRISPR-Cas9筛选相结合，揭示了EMT过程中的连续基因调控波和关键调控点 | NA | 揭示在发育和疾病中指导细胞决策的遗传结构 | 上皮-间质转化（EMT）过程中的遗传电路 | NA | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9 | NA | RNA | NA |
| 14786 | 2024-08-07 |
A large pool of actively cycling progenitors orchestrates self-renewal and injury repair of an ectodermal appendage
2019-09, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-019-0378-2
PMID:31481792
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、小鼠遗传学和组织损伤方法，揭示了小鼠门齿维持和修复的细胞层次结构和机制 | 发现了一组活跃分裂的上皮祖细胞在稳态下产生牙釉质产生的成釉细胞和相邻的非成釉细胞层，并在损伤后通过祖细胞增殖和Notch1表达细胞直接转化为成釉细胞来实现组织修复 | NA | 解析干细胞身份和组织结构，以理解组织更新 | 小鼠门齿的维持和修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14787 | 2024-08-07 |
Application of single-cell RNA sequencing methodologies in understanding haematopoiesis and immunology
2019-07-03, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20180072
PMID:31186287
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在理解造血和免疫学中的应用 | 揭示了造血是一个连续而非阶梯式过程，挑战了传统的造血谱系树模型，并发现了新的免疫细胞类型 | 讨论了当前的挑战和未来方向 | 推动对生理和疾病状态下造血和免疫反应过程的理解 | 血液和免疫系统的细胞多样性 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 14788 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Human Lung Provides Insights into the Pathobiology of Pulmonary Fibrosis
2019-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201712-2410OC
PMID:30554520
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人肺组织，以揭示肺纤维化发病机制中的细胞群体变化 | 发现了在肺纤维化患者中特有的一类促纤维化肺泡巨噬细胞，并识别出在肺纤维化过程中出现的稀有细胞群体，如气道干细胞和衰老细胞 | 研究样本量相对较小，且仅限于肺移植捐赠者和接受者以及一例特发性肺纤维化患者的样本 | 探究单细胞RNA测序是否能揭示肺纤维化患者肺组织中肺泡巨噬细胞、上皮细胞等细胞类型的疾病相关异质性 | 肺纤维化患者的肺组织细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8名肺移植捐赠者、8名肺纤维化接受者及1名特发性肺纤维化患者的肺组织样本 |
| 14789 | 2024-08-07 |
Adaptive Immune Resistance Emerges from Tumor-Initiating Stem Cells
2019-05-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.03.025
PMID:31031009
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研究论文 | 本文通过设计一种皮肤癌模型，研究了肿瘤起始干细胞（tSCs）如何通过适应性免疫抵抗机制克服免疫监视 | 发现tSCs通过表达CD80并结合CTLA4直接抑制细胞毒性T细胞活性，从而抵抗免疫疗法 | NA | 探讨肿瘤起始干细胞如何克服免疫监视并形成肿瘤复发的机制 | 肿瘤起始干细胞（tSCs）及其在皮肤鳞状细胞癌（SCC）中的免疫抵抗机制 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 14790 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Embryonic Stem Cell Differentiation Delineates Adverse Effects of Nicotine on Embryonic Development
2019-04-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.01.022
PMID:30827876
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了尼古丁对人类胚胎干细胞（hESC）衍生的胚胎体（EB）的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了尼古丁对hESC分化的直接影响，并提供了一种新的方法来评估药物和环境毒素对人类胚胎发育的影响 | NA | 探讨尼古丁对人类胚胎发育的不良影响及其相关机制 | 人类胚胎干细胞（hESC）及其衍生的胚胎体（EB） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 14791 | 2024-08-07 |
Macrophages in wound healing: activation and plasticity
2019-03, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12236
PMID:30746824
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研究论文 | 本文综述了巨噬细胞在伤口愈合中的作用，包括其激活和可塑性 | 介绍了最新的体内和转化伤口模型、巨噬细胞特异性缺失以及区分巨噬细胞亚群的新技术 | NA | 总结伤口愈合中巨噬细胞激活和功能的主要参与者，并探讨其对伤口愈合的影响 | 巨噬细胞在伤口愈合中的作用及其激活和可塑性 | NA | NA | 细胞追踪和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 14792 | 2024-08-07 |
Seizing Sequencing Data to Consider Cell and Circuit Complexity
2019 Mar-Apr, Epilepsy currents
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/1535759719835658
PMID:30955433
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析海马CA1区抑制性神经元的类别和连续性变异 | 揭示了海马CA1区抑制性神经元的10个主要GABA能群体和49个细粒度集群，并发现连续变异在描述这些细胞多样性中的重要性 | 研究仅限于海马CA1区的抑制性神经元，未涉及其他脑区或神经元类型 | 理解脑回路中的神经元分类 | 海马CA1区的抑制性神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 潜在因子分析 | 转录组数据 | 3663个CA1区抑制性细胞 |
| 14793 | 2024-08-07 |
Single T Cell Sequencing Demonstrates the Functional Role of αβ TCR Pairing in Cell Lineage and Antigen Specificity
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.01516
PMID:31417541
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析了近10万个独特的CD4和CD8 T细胞的配对TCR序列，探讨了αβ配对在T细胞谱系和抗原特异性中的功能作用 | 首次在谱系水平上分析了αβ TCR配对对T细胞功能的影响，并利用信息论和机器学习工具展示了αβ配对在TCR-MHC相互作用中的协同作用 | NA | 探讨αβ TCR配对在T细胞谱系和抗原特异性中的功能作用 | 近10万个独特的CD4和CD8 T细胞的配对TCR序列 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | 机器学习 | 序列数据 | 近10万个独特的CD4和CD8 T细胞 |
| 14794 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal the mechanism for a breast cancer prognostic gene panel
2018-Sep-07, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.26044
PMID:30279960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了乳腺癌预后基因面板与细胞周期扰动之间的关系 | 首次详细描述了MammaPrint签名基因在细胞周期中的精细扰动，并发现这些基因的细胞周期活动与临床预后相关 | NA | 探讨乳腺癌预后基因面板与细胞周期扰动之间的关系 | 乳腺癌细胞的单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 70个MammaPrint签名基因中的38个 |
| 14795 | 2024-08-07 |
Induced pluripotent stem cell-based mapping of β-globin expression throughout human erythropoietic development
2018-08-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2018020560
PMID:30108108
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研究论文 | 本文报道了一种基于诱导多能干细胞（iPSCs）的β-珠蛋白报告细胞系，该细胞系能够在单细胞分辨率下实时映射人类红细胞生成过程中β-珠蛋白的表达 | 通过结合单细胞RNA测序（scRNAseq），本文能够区分β-珠蛋白表达细胞的特征，并解析iPSC衍生红细胞系细胞的发育和成熟状态 | NA | 提高β-珠蛋白表达的量化，并解析其在人类红细胞生成中的作用 | 诱导多能干细胞衍生的红细胞系细胞中的β-珠蛋白表达 | 再生医学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 单细胞分辨率 |
| 14796 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveal the dynamic of haematopoietic stem cell production in the aorta
2018-06-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04893-3
PMID:29955049
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了小鼠胚胎主动脉中的非造血内皮细胞、造血内皮细胞、正在经历内皮-造血转化的细胞、主动脉内造血簇细胞及其整体，揭示了造血干细胞产生的动态过程。 | 本研究首次提供了完整的资源，深入研究体内造血干细胞的生成，并为进一步改善体外造血干细胞生产提供了基础。 | NA | 研究造血干细胞在体内的生成过程及其分子调控机制。 | 小鼠胚胎主动脉中的非造血内皮细胞、造血内皮细胞、正在经历内皮-造血转化的细胞、主动脉内造血簇细胞及其整体。 | 数字病理学 | 血液相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自小鼠胚胎主动脉的多种细胞类型样本 |
| 14797 | 2024-08-07 |
shinyheatmap: Ultra fast low memory heatmap web interface for big data genomics
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0176334
PMID:28493881
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研究论文 | 本文介绍了一种名为shinyheatmap的先进用户友好型热图软件套件，能够在网络浏览器中高效创建高度可定制的静态和交互式生物热图 | shinyheatmap具有低内存占用特性，特别适合于交互式可视化由于大小限制而无法在内存中计算的极大数据集。此外，它内置了高性能的web插件fastheatmap，能够快速绘制包含多达105-107行的数据集的交互式热图，显著超越了之前的热图渲染速度基准 | NA | 开发一种能够高效处理和可视化大型基因组数据集的工具 | 转录组学、代谢组学、宏基因组学等下一代测序领域产生的大数据集 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | 数值数据 | 数据集大小可达105-107行 |
| 14798 | 2024-08-07 |
Defining the three cell lineages of the human blastocyst by single-cell RNA-seq
2015-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.131235
PMID:26487783
|
correction | 纠正了先前发表在《Development》杂志上的文章中的图3标签错误 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14799 | 2024-08-07 |
ADAR1 Inhibits Macrophage Apoptosis and Alleviates Sepsis-induced Liver Injury Through miR-122/BCL2A1 Signaling
2024-Feb-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2023.00171
PMID:38343614
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过miR-122/BCL2A1信号通路抑制巨噬细胞凋亡并减轻脓毒症引起的肝损伤的作用机制 | 首次揭示了ADAR1通过miR-122/BCL2A1信号通路减轻脓毒症引起的肝损伤 | NA | 研究ADAR1在脓毒症引起肝损伤中的作用及其机制 | ADAR1在脓毒症中的作用及通过miR-122/BCL2A1信号通路的影响 | NA | 脓毒症 | 转录组和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括来自脓毒症患者的PBMCs和CLP诱导的脓毒症小鼠模型 |
| 14800 | 2024-08-04 |
Prior dengue virus serotype 3 infection modulates subsequent plasmablast responses to Zika virus infection in rhesus macaques
2024-Feb-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03160-23
PMID:38349142
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研究论文 | 本研究探讨了先前登革热病毒3型感染如何影响恒河猴对寨卡病毒的浆细胞响应 | 本研究揭示了先前登革热病毒感染对后续寨卡病毒感染的抗体反应质量的影响 | 样本量较小，仅包括4只恒河猴 | 理解先前的登革热病毒感染如何影响后续的寨卡病毒免疫反应 | 研究对象为感染过登革热病毒3型的恒河猴 | 免疫学 | 寨卡病毒感染 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 4只恒河猴 |