单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1461	2025-05-19	C/EBPβ-dependent autophagy inhibition hinders NK cell function in cancer 2024-11-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54355-2 PMID:39609420	研究论文	该研究揭示了自噬在NK细胞抗肿瘤功能中的核心调控作用，并提出了通过调节自噬增强NK细胞免疫疗法的新策略	首次将自噬识别为NK细胞内的一个细胞内检查点，并证明通过基因和药物激活自噬可以改善NK细胞的效应和细胞毒功能	研究主要基于前列腺癌模型和小鼠实验，结果在人类其他癌症类型中的普适性需要进一步验证	探索癌症如何使NK细胞功能失调以及如何克服这种抵抗，以增强基于NK细胞的免疫治疗效果	NK细胞（自然杀伤细胞）及其在肿瘤微环境中的功能变化	免疫肿瘤学	前列腺癌	scRNA-seq（单细胞RNA测序）、流式细胞术	NA	基因表达数据、流式细胞数据	晚期人类前列腺癌患者的肿瘤浸润和非肿瘤NK细胞，以及多种小鼠癌症模型
1462	2025-05-19	Transcription factors ASCL1 and OLIG2 drive glioblastoma initiation and co-regulate tumor cell types and migration 2024-11-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54750-9 PMID:39609428	研究论文	研究探讨了转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤（GBM）起始过程中的作用及其对肿瘤细胞类型和迁移的共调控	揭示了ASCL1和OLIG2在GBM形成中的冗余功能及其通过相互结合和调控下游靶基因决定肿瘤细胞类型和迁移程度的新机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类GBM中的适用性尚需进一步验证	探究ASCL1和OLIG2在GBM起始和肿瘤细胞异质性调控中的作用	胶质母细胞瘤（GBM）细胞和小鼠模型中的SVZ祖细胞	肿瘤生物学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠GBM模型	基因表达数据	NA
1463	2025-05-19	Spatial Pathomics Toolkit for Quantitative Analysis of Podocyte Nuclei with Histology and Spatial Transcriptomics Data in Renal Pathology 2024-Feb, Proceedings of SPIE--the International Society for Optical Engineering DOI:10.1117/12.3006318 PMID:40375953	research paper	介绍了一种名为空间病理组学工具包（SPT）的新工具，用于定量分析肾脏病理学中的足细胞核与组织学和空间转录组学数据	开发了SPT工具包，能够精确识别足细胞核、提取定量特征并分析空间关系，为肾脏病理学研究提供了创新方法	未提及具体样本量或工具在更广泛病理学应用中的验证情况	推进肾脏病理学中的细胞空间病理组学研究	足细胞核的形态和纹理特征及其空间分布	digital pathology	renal pathology	spatial transcriptomics, Whole Slide Images (WSIs)	NA	image, spatial transcriptomics data	NA
1464	2025-05-19	Glioblastoma initiation, migration, and cell types are regulated by core bHLH transcription factors ASCL1 and OLIG2 2023-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.09.30.560206 PMID:37873200	research paper	该研究探讨了核心bHLH转录因子ASCL1和OLIG2在胶质母细胞瘤（GBM）起始、迁移和细胞类型调控中的作用	揭示了ASCL1和OLIG2在GBM肿瘤细胞异质性和层级结构中的调控机制，以及它们在肿瘤形成和迁移中的动态作用	研究主要基于小鼠模型，人类GBM中的具体机制仍需进一步验证	探究ASCL1和OLIG2在GBM肿瘤发生和发展中的功能	胶质母细胞瘤（GBM）和胶质瘤干细胞（GSCs）	肿瘤生物学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠GBM模型	基因表达数据	NA
1465	2025-05-18	Faecalibacterium prausnitzii prevents age-related heart failure by suppressing ferroptosis in cardiomyocytes through butyrate-mediated LCN2 regulation 2025-Dec, Gut microbes IF:12.2Q1 DOI:10.1080/19490976.2025.2505119 PMID:40364435	研究论文	本研究探讨了老年肠道微生物群变化与心力衰竭（HF）之间的潜在联系，发现Faecalibacterium prausnitzii及其代谢产物丁酸盐通过抑制心肌细胞铁死亡来预防老年相关心力衰竭	首次揭示了老年肠道微生物群通过铁死亡机制影响心力衰竭，并提出Faecalibacterium prausnitzii和丁酸盐作为潜在治疗靶点	研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在人类临床试验中验证	探索老年肠道微生物群变化与心力衰竭之间的关系及其潜在机制	老年心力衰竭患者、大鼠模型、心肌细胞	微生物组学与心血管疾病	心血管疾病	16S rRNA测序、PCR定量、单细胞测序、基因编辑技术	动物模型（大鼠）	测序数据、PCR数据、单细胞数据	老年心力衰竭患者和健康老年人的肠道微生物样本、大鼠模型
1466	2025-05-18	Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs 2025-Jul-15, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205 PMID:40209410	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索孕期暴露于Cyfluthrin对后代神经发育的毒性机制	首次构建了孕期暴露于Cyfluthrin的后代大脑海马单细胞图谱，揭示了神经干细胞命运改变是发育毒性的主要原因	研究仅针对大鼠模型，人类相关性尚需进一步验证	探究孕期Cyfluthrin暴露导致后代神经发育毒性的分子机制	孕期暴露于Cyfluthrin的大鼠后代海马组织	神经毒理学	神经发育障碍	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	不同年龄段的孕期暴露大鼠后代
1467	2025-05-18	Aboral cell types of Clytia and coral larvae have shared features and link taurine to the regulation of settlement 2025-May-16, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adv1159 PMID:40378222	research paper	该研究通过比较三种刺胞动物幼虫的前端转录组和单细胞RNA测序数据，定义了幼虫前端细胞的共同特征，并发现了与牛磺酸摄取和分解代谢相关的基因在调节幼虫定居中的作用	首次整合多种刺胞动物幼虫的单细胞RNA测序数据，揭示了前端细胞的共同分子特征，并发现牛磺酸在调节幼虫定居中的新功能	研究仅针对三种刺胞动物物种，可能无法完全代表整个刺胞动物门的多样性	理解刺胞动物幼虫定居的细胞和分子调控机制	刺胞动物（水母、珊瑚、海葵和水螅）的幼虫	进化生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	三种刺胞动物物种的幼虫
1468	2025-05-18	Intratumoral Fusobacterium nucleatum Recruits Tumor-Associated Neutrophils to Promote Gastric Cancer Progression and Immune Evasion 2025-May-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2580 PMID:39992708	研究论文	研究探讨了瘤内微生物群对胃癌进展和免疫逃逸的影响，特别是梭杆菌属（Fusobacterium nucleatum）如何通过招募肿瘤相关中性粒细胞（TAN）重塑肿瘤免疫微环境	揭示了F. nucleatum通过激活IL17/NF-κB/RelB信号通路诱导TAN招募，并促进TAN向促肿瘤亚型分化，进而增强PD-L1表达和免疫逃逸的机制	研究主要基于小鼠模型和人类胃癌组织样本，尚未在更广泛的临床环境中验证	探究瘤内微生物群对胃癌免疫微环境的影响及其在免疫逃逸中的作用	胃癌组织和瘤内微生物群，特别是Fusobacterium nucleatum	肿瘤免疫学	胃癌	16S rRNA扩增子测序，单细胞RNA测序	小鼠模型	基因测序数据，组织样本	人类胃癌组织样本和小鼠模型
1469	2025-05-18	Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution 2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2040 PMID:40029262	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化	首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序揭示转录异质性和克隆进化，并鉴定出TSPAN8作为潜在治疗靶点	样本量较小（7例未治疗患者），需要更大规模研究验证发现	探究尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化特征，寻找新的治疗靶点	尤文肉瘤肿瘤组织、循环肿瘤细胞(CTC)及其微环境	癌症基因组学	尤文肉瘤	单细胞RNA测序、免疫荧光	NA	RNA测序数据、免疫荧光图像	7例未治疗尤文肉瘤患者的肿瘤样本及循环肿瘤细胞
1470	2025-05-18	IGFBP3 enhances adipose-derived stem cell function in soft tissue injury repair via ITGB1 and ERK pathway activation 2025-May-15, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-025-10024-8 PMID:40369223	研究论文	本研究探讨了IGFBP3蛋白在脂肪来源干细胞（ADSCs）中对软组织损伤修复的作用及其分子机制	利用单细胞多组学技术和3D生物打印模型揭示了IGFBP3通过ITGB1和ERK通路激活促进ADSCs功能的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明IGFBP3在ADSCs中介导软组织损伤修复的分子机制	脂肪来源干细胞（ADSCs）和软组织损伤修复	组织工程与再生医学	软组织损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、3D生物打印、高通量转录组学	小鼠软组织损伤模型	单细胞转录组数据、图像数据	NA
1471	2025-05-18	scRNA-seq and scATAC-seq reveal that Sertoli cell mediates spermatogenesis disorders through stage-specific communications in non-obstructive azoospermia 2025-May-15, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.97958 PMID:40371706	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和单细胞染色质可及性测序揭示了非梗阻性无精子症中Sertoli细胞通过阶段特异性通讯介导精子发生障碍的机制	鉴定了三种新的Sertoli细胞亚型表型(SC4/未成熟型、SC7/成熟型和SC8/进一步成熟型)，并发现了生殖细胞与Sertoli细胞亚型之间存在阶段特异性匹配的相互作用模式	样本量相对有限，且仅针对特定类型的无精子症患者进行研究	探究非梗阻性无精子症中精子发生障碍的细胞类型特异性异常	梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织	生殖医学	男性不育症	scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本
1472	2025-05-18	Differential memory enrichment of cytotoxic CD4 T cells in Parkinson's disease patients reactive to α-synuclein 2025-May-14, NPJ Parkinson's disease DOI:10.1038/s41531-025-00981-6 PMID:40368950	research paper	该研究探讨了帕金森病(PD)患者中对α-突触核蛋白(α-syn)有反应的细胞毒性CD4 T细胞的记忆富集差异	发现CELSR2在PD患者CD4效应记忆T细胞中的表达显著增加，并揭示了PD患者中细胞毒性T细胞的减少	研究样本量有限，且需要进一步验证细胞毒性T细胞在PD病理中的作用	深入了解对α-syn有反应的PD患者中T细胞亚群的扰动	帕金森病患者和健康对照组的CD4 T细胞	神经免疫学	帕金森病	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	基因表达数据、蛋白质表达数据	PD患者和健康对照组
1473	2025-05-18	Single-cell RNA sequencing reveals immunological link between house dust mite allergy and childhood asthma 2025-May-14, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-01538-6 PMID:40368964	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了儿童哮喘与屋尘螨过敏之间的免疫学联系，并探索了潜在的诊断标志物	首次在单细胞分辨率下揭示了屋尘螨过敏儿童哮喘的免疫特征，并鉴定了HLA-DR和HLA-DP作为主要标志受体	样本量较小（仅8名儿童），且年龄范围有限（4-11岁）	探索屋尘螨过敏儿童哮喘的免疫学特征，寻找潜在的诊断标志物	屋尘螨过敏的哮喘儿童	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	LASSO回归	基因表达数据	8名4-11岁的经医生诊断的哮喘儿童
1474	2025-05-18	Taurine from tumour niche drives glycolysis to promote leukaemogenesis 2025-May-14, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-09018-7 PMID:40369079	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了骨髓基质微环境中的牛磺酸-牛磺酸转运体(TAUT)轴在促进白血病干细胞(LSCs)生长和白血病发生中的关键作用	首次系统描绘了白血病进展过程中基质信号的时序变化，并鉴定出牛磺酸作为髓系恶性肿瘤的关键调节因子	研究主要聚焦于髓系白血病，对其他类型白血病的适用性尚不明确	探索骨髓微环境信号在白血病发生发展中的作用机制	白血病干细胞(LSCs)和骨髓基质细胞	癌症生物学	急性髓系白血病(AML)	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR筛选、多组学分析	TAUT功能缺失小鼠模型	单细胞转录组数据、CRISPR筛选数据、多组学数据	患者来源的AML细胞和小鼠模型
1475	2025-05-18	The surface protein Gbp of Fusobacterium nucleatum inhibits osteogenic differentiation by inactivating the Wnt/β-catenin pathway via binding to Annexin A2 2025-May-14, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06569-1 PMID:40369630	研究论文	本研究揭示了具核梭杆菌及其效应蛋白Gbp通过结合ANXA2抑制Wnt/β-catenin通路，从而破坏成骨细胞分化的机制	首次发现具核梭杆菌的Gbp蛋白通过结合宿主蛋白ANXA2抑制Wnt/β-catenin通路，揭示了牙周炎中成骨功能障碍的新机制	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人体内的实际作用机制仍需进一步验证	阐明牙周炎中成骨细胞功能障碍的细胞和分子机制	具核梭杆菌(Fn)及其效应蛋白Gbp对成骨细胞分化的影响	分子生物学	牙周炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因集富集分析(GSEA)、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析	小鼠实验性牙周炎模型	RNA测序数据、蛋白质相互作用数据	人类牙龈组织样本(牙周炎患者和健康对照)、小鼠模型、原代成骨细胞培养
1476	2025-05-18	Disrupting lipid homeostasis with CAV2 in OSCC triggers apoptosis, lipolysis, and mitochondrial dysfunction by transcriptional repression of PPARγ 2025-May-14, Cell & bioscience DOI:10.1186/s13578-025-01399-6 PMID:40369665	研究论文	本研究探讨了CAV2在口腔鳞状细胞癌(OSCC)脂质稳态和进展中的作用，揭示了其通过转录抑制PPARγ触发细胞凋亡、脂解和线粒体功能障碍的机制	首次揭示了CAV2通过PPARγ/NCOR1轴调控OSCC脂质代谢的分子机制，并发现PPARγ反向激动剂T0070907可增强CAV2敲除的治疗效果	研究主要基于细胞和小鼠模型，临床转化潜力需要进一步验证	探究CAV2在OSCC脂质代谢异常和肿瘤进展中的分子机制	口腔鳞状细胞癌细胞系和裸鼠移植瘤模型	癌症生物学	口腔鳞状细胞癌	转录组测序、单细胞测序、RNA测序、脂质组学、分子对接、Seahorse线粒体功能分析	shRNA基因敲低模型	基因表达数据、脂质组数据、线粒体功能数据	未明确说明细胞系数量，使用裸鼠进行体内实验
1477	2025-05-18	A Cold-Active Protease Tissue Dissociation Protocol for the Preservation of the Tendon Fibroblast Transcriptome 2025-May-05, Bio-protocol IF:1.0Q3 DOI:10.21769/BioProtoc.5293 PMID:40364987	research paper	本文提出了一种使用冷活性蛋白酶在4°C下解离组织的方案，以保护肌腱成纤维细胞的转录组	使用冷活性蛋白酶在低温下解离组织，减少转录细胞应激，提高RNA测序数据的质量	研究主要针对斑马鱼的肌腱和韧带，对其他组织和物种的适用性尚待验证	开发一种减少转录伪影的组织解离方法，以更好地反映体内组织微环境	斑马鱼的肌腱和韧带	digital pathology	NA	bulk RNA sequencing	NA	RNA-seq数据	斑马鱼肌腱和韧带组织
1478	2025-05-18	Targeting HPV for the prevention, diagnosis, and treatment of cervical cancer 2025-May-02, Journal of molecular cell biology IF:5.3Q2 DOI:10.1093/jmcb/mjae046 PMID:39402008	综述	本文综述了人乳头瘤病毒（HPV）在宫颈癌预防、诊断和治疗中的关键作用，重点介绍了筛查和疾病干预的最新进展	整合HPV检测与现有方法（如宫颈细胞学和视觉检查）以提高筛查的敏感性和特异性，以及利用HPV感染相关生物标志物进行个性化干预	NA	探讨HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的作用	宫颈癌及其与HPV感染的关系	医学研究	宫颈癌	单细胞RNA测序分析、类器官模型开发	NA	NA	NA
1479	2025-05-18	High-Viability Circulating Tumor Cells Sorting From Whole Blood at Single Cell Level Using Laser-Induced Forward Transfer-Assisted Microfiltration 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414195 PMID:39868845	research paper	该研究开发了一种激光诱导前向转移辅助微滤系统（LIFT-AMFS），用于从全血中高效富集和回收高活性的循环肿瘤细胞（CTCs）	采用激光诱导前向转移辅助微滤系统（LIFT-AMFS）和双步微滤器（DSMF）设计，实现了高捕获效率和高细胞活性的单细胞回收	NA	开发一种高效分离和分子分析循环肿瘤细胞（CTCs）的方法，以促进肿瘤转移研究和个性化治疗	循环肿瘤细胞（CTCs）	生物医学工程	肿瘤	激光诱导前向转移（LIFT）、微滤、RNA测序	NA	细胞样本、RNA测序数据	NA
1480	2025-05-18	Dissecting the Spatial and Single-Cell Transcriptomic Architecture of Cancer Stem Cell Niche Driving Tumor Progression in Gastric Cancer 2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413019 PMID:39950944	研究论文	本文通过空间和单细胞RNA测序技术，解析了胃癌中癌症干细胞（CSCs）微环境的转录组架构及其在肿瘤进展中的作用	揭示了CSCs微环境中肿瘤上皮的表型可塑性及从成熟胃主细胞到CSC状态的转录轨迹，发现了iCAFs通过AREG-ERBB2轴促进肿瘤干细胞性和耐药性的新机制	样本量相对较小（32例），且仅关注了胃癌，结果在其他癌症类型中的普适性有待验证	解析胃癌中CSCs微环境的转录组特征及其在肿瘤干细胞性和进展中的作用机制	人类胃黏膜组织（32例，不同恶性阶段）	数字病理学	胃癌	空间RNA测序，单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	32例人类胃黏膜组织