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当前共找到 40973 篇文献,本页显示第 1461 - 1480 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1461 2026-06-13
Lactylation-driven metabolic reprogramming promotes osteosarcoma malignancy via HDGF-mediated proliferation and immune modulation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学整合分析揭示乳酰化驱动的代谢重编程通过HDGF促进骨肉瘤恶性进展和免疫调节的机制 首次发现乳酰化-HDGF调控轴在骨肉瘤中的作用,并结合单细胞测序、空间转录组学和机器学习预后模型系统解析乳酰化相关网络 文章未提及明显局限性 探究代谢重编程通过乳酰化修饰驱动骨肉瘤进展和免疫微环境调节的机制 骨肉瘤组织样本和细胞系 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习 SHAP可解释性框架, 共表达网络分析 基因表达数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1462 2026-06-13
Exploring glycerophospholipid metabolism in nasopharyngeal carcinoma: interactions between malignant epithelial cells and CCL11-expressing fibroblasts
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 探究鼻咽癌中甘油磷脂代谢的机制及其与CCL11表达成纤维细胞的相互作用 整合单细胞转录组学、10x空间转录组学和空间代谢组学的多组学方法,首次揭示恶上皮细胞与CCL11表达成纤维细胞间的代谢相互作用 未提及具体局限性 阐明鼻咽癌中甘油磷脂代谢的作用,特别是恶上皮细胞与成纤维细胞间的相互作用 鼻咽癌组织中的恶上皮细胞和成纤维细胞 数字病理学, 机器学 鼻咽癌 单细胞转录组学, 空间转录组学, 空间代谢组学 NA 图像, 文本 鼻咽癌组织样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x 空间转录组学 10x 空间转录组学平台
1463 2026-06-13
Characterizing malignant prognostic signatures in primary glioma based on single-cell and bulk transcriptome sequencing
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 基于单细胞和批量转录组测序表征原发性胶质瘤的恶性预后标志 整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,通过Cox回归和LASSO方法识别出三个新的恶性预后标志IGFBP2、MDK和RARRES2,并验证其预测准确性 NA 识别原发性胶质瘤的恶性预后标志并探索其与药物反应和免疫细胞浸润的相关性 原发性胶质瘤患者的肿瘤组织样本 机器学习 胶质瘤 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 Cox回归, LASSO 基因表达数据 TCGA和CGGA队列的批量RNA测序数据以及GEO数据集和内部样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
1464 2026-06-13
Integrative Multiomics Analysis Identifies a Novel Gene Signature That Predicts Chemotherapy Resistance and Poor Survival in Osteosarcoma
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 通过整合多组学分析,鉴定出一个预测骨肉瘤化疗耐药和不良预后的新型基因特征 首次通过WGCNA筛选出13基因特征,结合单细胞和空间转录组学揭示高风险肿瘤的免疫冷表型及肿瘤-基质相互作用机制 未在临床前瞻性队列中验证该基因特征 开发可预测骨肉瘤化疗耐药和预后的基因标志物并阐明耐药机制 化疗耐药与敏感的骨肉瘤转录组数据(TARGET-OS、GSE21257、GSE16091、GSE39055四个独立队列) 机器学习 骨肉瘤 WGCNA, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 WGCNA 转录组数据 四个独立队列的骨肉瘤样本(TARGET-OS、GSE21257、GSE16091、GSE39055) NA NA NA NA
1465 2026-06-13
GPX7 marks fibroblast-associated stromal-innate immune crosstalk in ulcerative colitis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究整合孟德尔随机化、跨队列结肠转录组学和单细胞RNA测序,发现GPX7是溃疡性结肠炎中成纤维细胞相关基质-先天免疫交互作用的标志物 首次将丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢与溃疡性结肠炎的成纤维细胞-巨噬细胞交互作用联系起来,并通过基因支持、临床分层和共培养模型等多维度验证 研究局限于相关性分析和初步扰动实验,缺乏体内功能验证和因果机制的深入解析;分子对接和动力学模拟仅作为假设生成的结构分析,尚需实验验证 探究丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢在溃疡性结肠炎成纤维细胞-巨噬细胞交互作用中的作用 溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜组织样本、成纤维细胞和巨噬细胞 生物信息学 溃疡性结肠炎 孟德尔随机化、全转录组测序、单细胞RNA测序、qPCR、共培养模型、分子对接与动力学模拟 NA 转录组数据、单细胞测序数据、临床队列数据 多个队列的结肠组织样本(具体数量未在摘要中提供);一个独立临床队列中因夫利昔单抗应答者与非应答者的活检样本 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
1466 2026-06-13
Integrative multi-omics analysis identifies SNRPE as a key driver gene in uterine corpus endometrial carcinoma: promoting tumor progression, and mediating immune evasion
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学分析发现SNRPE是子宫内膜癌关键驱动基因,促进肿瘤进展并介导免疫逃逸 首次鉴定SNRPE通过调控可变剪接同时影响肿瘤内在恶性进展和外在免疫抑制的机制 未充分阐明SNRPE调控剪接的具体分子机制及临床应用潜力 探究SNRPE在子宫内膜癌中驱动肿瘤进展和免疫逃逸的分子机制 子宫内膜癌患者样本及细胞系 数字病理学 子宫内膜癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, sQTL, eQTL, GWAS NA 基因表达数据, 剪接定量数据, 单细胞转录组数据 TCGA-UCEC队列及独立临床样本队列 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq NA
1467 2026-06-13
Research progress of CMTM4 in the tumor immune microenvironment and immunotherapy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了CMTM4在肿瘤免疫微环境及免疫治疗中的研究进展 首次系统总结CMTM4在PD-L1稳定性调控、与TME相关膜蛋白互作、以及作为免疫检查点抑制剂耐药潜在生物标志物和治疗靶点的三方面机制 当前研究模型存在局限性,临床转化面临挑战,且CMTM4的功能具有环境依赖性,尚未解决许多机制性问题 阐明CMTM4在肿瘤免疫调控中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 CMTM4蛋白及其在肿瘤免疫微环境中的功能 数字病理学 肿瘤 NA NA NA NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
1468 2026-06-13
Integrative multi-omics analysis reveals inflammation-related molecular networks in acute mountain sickness
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学分析揭示急性高山病中炎症相关的分子网络 首次通过整合bulk RNA-seq、非编码RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统揭示单核细胞介导的炎症和ErbB通路在高海拔脑水肿中的关键机制,并鉴定HBEGF为潜在治疗靶点 未提及具体局限性 探索急性高山病中炎症相关的分子调控网络 急性高山病和脑水肿的分子机制 机器学习 急性高山病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因本体分析, KEGG通路分析 NA 基因表达数据 多个公开数据集(GSE75665, GSE90500)及小鼠模型 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 非编码RNA-seq NA NA
1469 2026-06-13
Integrated transcriptomic identification and validation reveal key autophagy-associated biomarkers in sleep deprivation
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 通过整合转录组和实验验证,识别睡眠剥夺相关的关键自噬生物标志物 首次通过整合转录组分析、机器学习算法和实验验证,从自噬角度筛选出睡眠剥夺的关键生物标志物CDKN1A、HSPA5和NR4A1,并构建了诊断模型 未提及明显的局限性 识别与睡眠剥夺相关的自噬基因生物标志物,并揭示其在睡眠剥夺发病机制中的作用 小鼠脑组织、人外周血样本、大鼠脑组织 机器学习 睡眠剥夺 RNA-seq, RT-qPCR, 单细胞RNA测序 机器学习算法 基因表达数据 小鼠脑组织数据集GSE33302和GSE9442、人外周血样本数据集GSE9441和GSE3767、单细胞RNA-seq数据集GSE37665;大鼠模型:雄性Sprague-Dawley大鼠连续睡眠剥夺7天 Illumina RNA-seq, 单细胞RNA测序 未明确指定 未明确指定
1470 2026-06-12
The prognostic factors and immune microenvironment of primary plasma cell leukemia: the KMMWP-2204 study
2026-Jun-11, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 基于韩国多中心队列,分析原发性浆细胞白血病的预后因素及免疫微环境特征,并结合单细胞RNA测序探索其生物学机制 确认了2021年国际骨髓瘤工作组5%循环浆细胞诊断阈值的临床一致性,并首次通过scRNA-seq揭示pPCL中免疫分化异常和骨髓源性免疫调节信号特征 回顾性研究设计存在基线风险差异偏倚,scRNA-seq样本量较小(仅4例pPCL),发现需在大规模队列和正交功能研究中验证 明确原发性浆细胞白血病的预后因素、治疗结局及其免疫微环境特征 127例新诊断pPCL患者(韩国20个中心),4例pPCL、2例多发性骨髓瘤和3例健康供者的骨髓样本 数字病理学 浆细胞白血病 单细胞RNA测序 NA 医学数据 127例患者临床数据(其中9例骨髓样本用于单细胞测序:4例pPCL、2例多发性骨髓瘤、3例健康供者) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1471 2026-06-12
In vitro ibuprofen has gene regulatory and anti-inflammatory properties in peripheral blood mononuclear cells of individuals with infection-provoked neurodevelopmental disorders
2026-Jun-11, Inflammopharmacology IF:4.6Q1
研究论文 研究布洛芬对感染诱发的神经发育障碍患者外周血单个核细胞的基因调控和抗炎作用 首次通过单细胞RNA测序在体外研究布洛芬对感染诱发的神经发育障碍患者的转录和抗炎效应 样本量小(仅2例患者),需进一步验证 探讨布洛芬对感染诱发的神经发育障碍的治疗机制 18名伴有感染诱发症状的神经发育障碍儿童(PANS或自闭症退行)及其外周血单个核细胞 机器学习 神经发育障碍 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 45,134个细胞(来自2例患者及对应的年龄、性别匹配对照) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
1472 2026-06-11
A 4-guanidinobutanoic acid-SLC36A1 axis drives a microbiota‒host feedback loop to regulate intestinal homeostasis
2026-Dec-31, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究揭示了肠道微生物代谢物4-胍基丁酸通过SLC36A1轴驱动微生物-宿主反馈回路,调控肠道稳态 首次发现4-胍基丁酸作为关键调节因子,通过SLC36A1与Hedgehog信号通路增强肠道干细胞功能和杯状细胞分化,形成微生物-宿主反馈循环,并揭示其在溃疡性结肠炎中的诊断和治疗潜力 NA(摘要未提供明确局限性信息) 探究肠道微生物代谢物4-胍基丁酸在调节肠道稳态中的作用机制 肠道干细胞、杯状细胞、肠道屏障功能 机器学习 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、类器官共培养、小鼠模型 NA 基因表达数据、代谢组学数据 NA(未明确样本数量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1473 2026-06-11
scMAG: Integrating single-cell multi-omics data via multi-stage deep fusion with manifold-aware gating
2026-Aug, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 提出了scMAG算法,一种通过多阶段深度融合与流形感知门控策略整合单细胞多组学数据的方法 创新性地提出了多阶段特征深度融合形式化方法,结合多核心流形保持与引导门控优化策略,实现了自适应对齐多组学潜在空间并优化数据分布 未明确提及局限性 提高单细胞多组学数据的聚类精度和可视化效果,同时实现多组学潜在空间的自适应对齐并抑制生物噪声与测量误差 单细胞多组学数据集,包括scRNA-seq、scATAC-seq和ADT数据 机器学习 NA 单细胞多组学测序 深度融合网络 单细胞多组学数据 配对数据集(scRNA-seq与scATAC-seq和ADT) NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞多组学 NA NA
1474 2026-06-11
Dynamic Reprogramming of PDGFRA-Expressing Stromal Cells Facilitates WNT-Driven Transformation by Promoting a Fetal-Like State in the Intestinal Epithelium
2026-Jun-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示PDGFRA表达的成纤维细胞通过分泌配体促进肠上皮进入胎儿样状态,从而驱动WNT介导的肿瘤转化 首次阐明PDGFRA+成纤维细胞在WNT驱动的肿瘤发生早期动态重编程并促进肠上皮胎儿样状态,发现TGFβ信号在此过程中的关键作用 主要基于小鼠模型和体外类器官实验,缺乏人体组织样本验证;胎儿样状态与肿瘤形成的因果关系需进一步确认 探究PDGFRA+基质成纤维细胞在WNT介导的肠道肿瘤发生中的动态变化及其对上皮细胞状态的影响 PDGFRA表达的成纤维细胞、WNT驱动的肿瘤上皮细胞、肠隐窝绒毛轴 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
1475 2026-06-11
Targeting noncanonical nuclear factor kappa B signalling in CYLD cutaneous syndrome by selective inhibition of IκB kinase alpha
2026-May-19, The British journal of dermatology
研究论文 通过选择性抑制IκB激酶α靶向CYLD皮肤综合征中的非经典核因子κB信号 首次在CYLD皮肤综合征肿瘤角质形成细胞中发现非经典NF-κB信号激活,并鉴定IKKα为候选治疗靶点 主要基于患者来源的体外模型,缺乏体内实验和临床验证 探究CCS肿瘤中NF-κB信号通路,识别可药物靶向的分子 CCS患者肿瘤细胞及肿瘤球体培养模型 医学研究 CYLD皮肤综合征 转录组学,蛋白质组学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 患者来源的CCS肿瘤细胞分群和肿瘤球体培养 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1476 2026-06-11
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-May-15, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 利用Scissor算法识别与结直肠癌预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,并据此对结直肠癌亚型进行分类及评估免疫景观 首次利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据,筛选出与结直肠癌极差预后显著相关的Scissor+成纤维细胞亚群,并揭示其激活促转移通路及免疫活化但功能耗竭的特征 未明确提及,但可能包括数据来源的偏倚、Scissor算法对细胞亚群识别的可重复性、以及预测标志物的临床验证需求 通过整合单细胞与批量转录组数据,识别与预后相关的成纤维细胞亚群特征基因,从而对结直肠癌进行亚型分类并评估其免疫景观 结直肠癌患者的批量RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据及临床信息 机器学习 结直肠癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Scissor算法 转录组数据, 单细胞转录组数据, 临床数据 来自TCGA和GEO数据库的多个结直肠癌数据集 NA NA NA NA
1477 2026-06-11
Mapping cellular heterogeneity and dynamic interactions in pancreatic cancer
2026-May-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示胰腺导管腺癌中细胞异质性与动态相互作用方面的应用,包括样本制备、数据分析流程及治疗靶点发现 系统整合了scRNA-seq在解析PDAC肿瘤内异质性、微环境动态变化及生物标志物鉴定中的技术流程与关键发现,并探讨了联合免疫治疗策略 未提及Meta分析或计算方法的定量比较,对scRNA-seq技术在PDAC中的临床应用挑战讨论较为笼统 阐明单细胞转录组学在胰腺癌异质性及微环境研究中的应用价值与工作流程 胰腺导管腺癌肿瘤组织中的肿瘤细胞、免疫细胞、肿瘤相关成纤维细胞及微环境成分 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
1478 2026-06-11
BPHL promotes TNBC stemness by resolving R-loops via POLR2A lactylation inhibition and BARD1-mediated ubiquitination
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本文揭示了BPHL通过抑制POLR2A乳酸化修饰和BARD1介导的泛素化来解析R-loop,从而维持三阴性乳腺癌干细胞的干性 首次发现BPHL通过调控R-loop稳态维持三阴性乳腺癌干细胞干性,并阐明了其通过POLR2A乳酸化抑制和BARD1介导的泛素化解决R-loop的分子机制 结果主要基于体外和动物模型,临床验证样本量有限 阐明三阴性乳腺癌干细胞中R-loop稳态的调控机制及BPHL的作用 三阴性乳腺癌干细胞和肿瘤样本 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 26个乳腺癌样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
1479 2026-06-11
Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Transporter Gene Programs in Human Spermatogonial Stem Cells
2026-May, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2
研究论文 整合批量芯片和单细胞转录组数据分析揭示人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因程序 首次系统性描绘人类精原干细胞中线粒体转运蛋白(TOM/TIM复合体)和转运蛋白基因的转录谱,并识别关键枢纽基因和潜在miRNA调控机制 未在功能水平验证预测的miRNA调控关系,且样本量有限可能影响结果的普适性 阐明人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因的表达特征和调控网络 人类精原干细胞富集群体(每组3个生物学重复) 机器学习 NA 微阵列芯片, scRNA-seq WGCNA, STRING/cytoHubba, limma 基因表达数据, 单细胞转录组数据 3组生物学重复(微阵列芯片)和多个单细胞RNA-seq数据集 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1480 2026-06-11
SEAL: Semantic-Aware Contrastive Learning for scRNA-Seq Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出一种语义感知对比学习方法SEAL用于单细胞RNA测序数据聚类 首次将语义感知对比学习应用于scRNA-seq数据聚类,通过随机掩码生成增强数据并利用伪标签捕获语义不变表示 未明确说明局限性,但文中提到现有方法在高缺失率和噪声数据中无法完全捕获细胞内在特性,该方法可能仍面临类似挑战 开发一种稳定的无监督scRNA-seq聚类方法以准确区分不同细胞类型 单细胞RNA测序数据中的细胞 机器学习 不适用 scRNA-seq 对比学习(语义感知对比学习) 基因表达数据 不适用 不适用 单细胞RNA-seq 不适用 不适用
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