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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1461 | 2025-10-05 |
EP300 as a potential mediator of stress-induced sleep disruption through blood-brain barrier dysfunction and neuroinflammation
2025-Sep-09, Sleep medicine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.sleep.2025.106802
PMID:40939466
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了EP300基因在应激诱导睡眠障碍中的潜在作用机制 | 首次发现EP300在睡眠障碍中的潜在作用,并揭示其通过血脑屏障功能障碍和神经炎症介导睡眠紊乱的机制 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 识别影响睡眠障碍的关键基因,为理解、预防和治疗睡眠障碍提供新视角 | 睡眠障碍相关基因、小鼠模型的前额叶皮质组织 | 生物信息学 | 睡眠障碍 | 差异表达分析,加权基因共表达网络分析,孟德尔随机化,qPCR,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 慢性不可预测应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1462 | 2025-10-05 |
The RNA-Binding Protein RBMX Mediates the Immunosuppressive Microenvironment of Osteosarcoma by Regulating CD8+T Cells
2025-Sep-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172928
PMID:40941025
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白RBMX通过调控CD8+T细胞介导骨肉瘤免疫抑制微环境的机制 | 首次发现RBMX在骨肉瘤中高表达并通过调控H2-K1和THBS1影响CD8+T细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究RBMX在骨肉瘤免疫微环境中的调控机制 | 骨肉瘤细胞、CD8+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、多重免疫荧光、PCR | 小鼠皮下移植瘤模型 | 转录组测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | 人类骨肉瘤数据库和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1463 | 2025-10-05 |
Long Noncoding RNAs as Emerging Regulators of Seed Development, Germination, and Senescence
2025-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178702
PMID:40943616
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA在种子发育、萌发和衰老过程中的调控作用 | 整合了lncRNAs在种子发育关键阶段的多重调控机制,包括染色质重塑、RNA指导的DNA甲基化等新兴功能 | NA | 探讨lncRNAs在种子发育生理过程中的调控功能 | 种子发育过程(胚胎发生、成熟、休眠、萌发和衰老) | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、直接RNA测序、RNA-染色质相互作用图谱 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1464 | 2025-10-05 |
Application of Single-Cell Sequencing and Machine Learning in Prognosis and Immune Profiling of Lung Adenocarcinoma: Exploring Disease Mechanisms and Treatment Strategies Based on Circadian Rhythm Gene Signatures
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172911
PMID:40941008
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习方法,基于昼夜节律基因构建肺腺癌预后模型并探索其免疫特征 | 首次结合单细胞测序和机器学习分析昼夜节律基因在肺腺癌中的作用,发现ARNTL2基因的关键促癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分相对有限 | 探索昼夜节律基因在肺腺癌预后和免疫特征中的作用机制 | 肺腺癌患者组织和细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 转录组测序 | Stepwise Cox回归, SuperPC | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1465 | 2025-10-05 |
An Update on Single-Cell RNA Sequencing in Illuminating Disease Mechanisms of Cutaneous T-Cell Lymphoma
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172921
PMID:40941016
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在皮肤T细胞淋巴瘤疾病机制研究中的最新应用进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在揭示CTCL肿瘤微环境异质性和相互作用网络中的最新发现 | CTCL疾病本身具有高度异质性,现有研究仍存在样本量有限等局限 | 更新单细胞RNA测序在皮肤T细胞淋巴瘤研究中的应用现状和发现 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL) | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1466 | 2025-10-05 |
PIAS1 Shapes a Tumor-Suppressive Microenvironment by Suppressing Immune Evasion in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Sep-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172905
PMID:40941002
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研究论文 | 本研究通过免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境中抑制免疫逃逸并塑造肿瘤抑制性微环境的作用机制 | 首次系统阐明PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境非恶性基质和免疫细胞中的表达特征和功能,发现PIAS1阳性细胞具有肿瘤抑制特性而阴性细胞富集免疫抑制信号 | 研究主要基于观察性数据分析,需要进一步的功能实验验证PIAS1的具体作用机制 | 探究PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境中的表达特征和功能相关性 | 口腔鳞癌组织样本和正常组织样本 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,差异基因表达分析,通路分析,细胞间通讯推断 | NA | 组织图像,单细胞RNA测序数据 | 口腔鳞癌组织微阵列和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1467 | 2025-10-05 |
Unraveling the developmental heterogeneity of human retinal ganglion cells within the developing retina to study to the continuity of maturation
2025-Sep-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.08.025
PMID:40912448
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的连续成熟轨迹 | 首次构建了人类胎儿视网膜从第8周到第27周的单细胞图谱,并应用伪时间分析揭示了视网膜神经节细胞成熟的连续性过程 | 研究仅涵盖胎儿发育阶段,缺乏成年期视网膜发育数据 | 解析人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的成熟异质性和连续性 | 人类胎儿视网膜组织中的视网膜神经节细胞 | 单细胞基因组学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 人类胎儿视网膜样本(孕周8-27周) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1468 | 2025-10-05 |
Machine Learning Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data Reveals Cathepsin B as a Central PANoptosis Regulator in Influenza
2025-Sep-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178533
PMID:40943452
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,揭示了组织蛋白酶B在流感病毒感染中作为PANoptosis核心调控因子的作用 | 首次将bulk和单细胞RNA测序数据整合分析,采用多种机器学习算法识别PANoptosis关键调控基因,发现组织蛋白酶B在流感相关肺损伤中的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的验证尚需进一步研究 | 探究流感病毒感染中PANoptosis的分子调控机制 | 流感A病毒感染的肺组织 | 机器学习 | 流感 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SVM, Random Forest, LASSO回归 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1469 | 2025-10-05 |
BMP5 signalling in beta cells and the impact on insulin secretion in the context of type 2 diabetes
2025-Sep, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06457-9
PMID:40471239
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研究论文 | 本研究探讨BMP5信号在胰岛β细胞中的表达及其对胰岛素分泌的影响 | 首次揭示BMP5是β细胞中主要表达的BMP配体,并发现其在2型糖尿病中上调会损害β细胞功能 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探究BMP5信号在胰岛β细胞功能维持中的作用机制 | 人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞系 | 细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因敲低,线粒体呼吸测量,葡萄糖刺激胰岛素分泌测试 | NA | 基因表达数据,生理功能数据 | 来自有无2型糖尿病供体的人胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1470 | 2025-10-05 |
CXCL6 Is a Novel Biliary Marker and a Downstream Target of MMP7 in Biliary Atresia
2025-Sep, Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/hepr.14217
PMID:40515742
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CXCL6是MMP7的下游靶点,并验证其作为胆道闭锁新型胆道标志物的潜力 | 首次发现CXCL6是MMP7在胆道闭锁中的下游靶点,并证实其在肝纤维化过程中的病理作用 | 未阐明MMP7-CXCL6信号通路在胆道闭锁发病机制中的完整分子机制 | 探究MMP7在胆道闭锁发病机制中的下游信号通路 | 胆道闭锁患者肝脏组织和血清样本,胆管上皮细胞 | 单细胞组学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,ELISA,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据,蛋白表达数据 | 胆道闭锁患者、非胆道闭锁胆汁淤积患者和正常对照的肝脏及血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1471 | 2025-10-05 |
Heterogeneity in Osteosarcoma Revealed by scRNA Sequencing: CLU+ Endothelial Cells as Key Players in Tumor Progression
2025-Sep, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70138
PMID:40623412
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤的空间异质性,发现外周区域CLU+内皮细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 首次在骨肉瘤中系统比较中心区域和外周区域的单细胞转录组差异,鉴定出CLU+内皮细胞亚群通过ITGB1介导的胶原蛋白家族成员促进肿瘤转移,并通过Nectin2-TIGIT通路诱导CD8+ T细胞耗竭 | 样本量较小(仅6例患者),需要更大规模研究验证发现 | 探索骨肉瘤瘤内异质性在肿瘤进展中的作用机制 | 骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本(中心区域和外周区域) | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1472 | 2025-10-05 |
Investigating cytotoxic and inflammatory human IL-7 receptor low effector memory CD8+ T cells in lupus
2025-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105898
PMID:40857939
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研究论文 | 本研究通过分析狼疮患者外周血和肾脏组织中的CD8+ T细胞异质性,揭示了IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的关键作用 | 首次发现IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮患者中积累,并证明其通过TNF-α和IFN-γ依赖性方式诱导中性粒细胞胞外诱捕网形成 | 研究主要基于转录组数据和体外实验,需要进一步的功能验证和机制研究 | 探讨CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的作用及其异质性意义 | 狼疮患者的外周血和肾脏组织样本 | 免疫学 | 狼疮 | 单细胞RNA测序,微阵列,成像质谱流式细胞术 | NA | RNA测序数据,微阵列数据,图像数据 | 狼疮患者和正常人的外周血及肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
1473 | 2025-10-05 |
Hematopoietic EphA4 Deficiency Alters Microglial Heterogeneity and Improves Chronic Spatial Memory After Brain Injury
2025-Aug-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7265717/v1
PMID:40909780
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研究论文 | 本研究探讨造血细胞特异性EphA4缺失对脑损伤后小胶质细胞异质性和空间记忆功能的长期影响 | 首次揭示外周免疫来源的EphA4信号通过调节小胶质细胞异质性影响脑损伤后的长期神经免疫重塑和功能恢复 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究EphA4在调节脑损伤后急性和慢性小胶质细胞反应及功能恢复中的作用 | 造血特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, 骨髓嵌合模型, 控制性皮质撞击损伤 | 动物模型 | 基因表达数据, 行为学数据, 形态学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1474 | 2025-10-05 |
Neuromodulatory Signaling in Chronic Pain Patients: A Narrative Review
2025-Aug-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171320
PMID:40940732
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综述 | 本叙述性综述综合分析了神经调节信号系统在慢性疼痛中的作用机制及治疗潜力 | 整合转录组分析、功能性神经影像和单细胞RNA测序等新技术发现患者特异性神经调节功能障碍模式,提出精准医疗干预点 | 叙述性综述缺乏系统性文献检索和定量分析,证据质量受原始研究限制 | 探讨神经调节信号通路在慢性疼痛病理生理机制中的作用及治疗靶点 | 慢性疼痛患者及相关的神经调节系统 | 神经科学 | 慢性疼痛 | 转录组分析,功能性神经影像,单细胞RNA测序 | NA | 临床观察数据,临床前研究数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1475 | 2025-10-05 |
Artificial Intelligence in Ocular Transcriptomics: Applications of Unsupervised and Supervised Learning
2025-Aug-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171315
PMID:40940727
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综述 | 本文综述了2019-2025年间人工智能在眼科转录组学中的应用,重点介绍了无监督和监督学习方法在生物标志物发现、细胞类型分类及眼部疾病建模方面的进展 | 系统总结了AI在眼科转录组学中的最新应用,涵盖单细胞工作流程标准方法和深度学习框架在多组学整合中的潜力 | 存在可解释性和标准化方面的挑战 | 探讨人工智能在眼科转录组学数据分析中的应用 | 眼部组织转录组数据,包括视网膜、角膜、黄斑等 | 自然语言处理 | 年龄相关性黄斑变性 | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | PCA, t-SNE, UMAP, WGCNA, LASSO, SVM, 随机森林, 变分自编码器, 神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1476 | 2025-10-05 |
Current Role and Future Frontiers of Spatial Transcriptomics in Genitourinary Cancers
2025-Aug-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172774
PMID:40940870
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综述 | 本文概述了空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症中的新兴作用和未来潜力 | 聚焦空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症中的独特应用,区别于传统转录组学仅关注基因表达水平 | NA | 探讨空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症研究中的当前作用和未来发展方向 | 泌尿生殖系统恶性肿瘤 | 空间转录组学 | 泌尿生殖系统癌症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1477 | 2025-10-05 |
A fibroblast-centric network drives cold fibrosis in the tumor microenvironment of lung squamous cell carcinoma
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.25.668405
PMID:40909739
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了肺鳞癌肿瘤微环境中由癌症相关成纤维细胞驱动的冷纤维化网络 | 首次将非癌性纤维化中的热/冷纤维化概念应用于肺鳞癌,发现了由CAF自分泌生长因子环路维持的冷纤维化结构 | 样本量相对较小(16例患者),仅针对初治患者进行研究 | 探究慢性炎症相关癌症中纤维化基质的组织原则 | 肺鳞癌患者的肿瘤和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 16例初治肺鳞癌患者的匹配肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1478 | 2025-10-05 |
CCL26 and CXCL12 Promote Release of Insulin-Sensitizing Adipose Tissue Macrophage sEVs from Subcutaneous Adipose Tissue in Obesity
2025-Aug-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.670151
PMID:40894782
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研究论文 | 本研究揭示皮下脂肪组织巨噬细胞通过释放小细胞外囊泡改善胰岛素敏感性的新机制 | 首次发现CCL26和CXCL12调控皮下脂肪组织巨噬细胞释放具有胰岛素增敏作用的小细胞外囊泡 | NA | 探究肥胖状态下皮下脂肪组织对代谢功能障碍的保护机制 | 皮下脂肪组织巨噬细胞及其释放的小细胞外囊泡 | 单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1479 | 2025-10-05 |
Genomic Insights into Tumorigenesis in Newly Diagnosed Multiple Myeloma
2025-Aug-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15172130
PMID:40941618
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新诊断多发性骨髓瘤患者的遗传突变,揭示疾病进展的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较MGUS、SMM和新诊断MM各阶段的遗传突变特征,发现新的肿瘤发生相关基因 | 样本数量未明确说明,研究仅关注遗传突变而可能忽略其他分子机制 | 识别导致多发性骨髓瘤进展和肿瘤发生的遗传突变 | MGUS、SMM和新诊断多发性骨髓瘤患者样本 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 计算分析流程 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1480 | 2025-10-05 |
Dynamic Intercellular Networks in the CNS: Mechanisms of Crosstalk from Homeostasis to Neurodegeneration
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178155
PMID:40943076
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综述 | 本文综述了中枢神经系统中动态细胞间通讯网络在健康稳态到神经退行性疾病过程中的作用机制 | 通过整合单细胞和空间转录组学最新发现,系统比较了不同疾病背景下细胞间通讯网络的动态变化 | 作为综述文章,主要基于现有文献分析,缺乏原始实验数据验证 | 探讨中枢神经系统中细胞间通讯网络在健康稳态和疾病状态下的作用机制 | 神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞等中枢神经系统细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |