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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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14761 | 2024-08-07 |
The HSP90-MYC-CDK9 network drives therapeutic resistance in mantle cell lymphoma
2024-Feb-07, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00484-9
PMID:38326887
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研究论文 | 研究探讨了在套细胞淋巴瘤中,HSP90-MYC-CDK9网络如何驱动对Bruton酪氨酸激酶抑制剂和CAR-T疗法的抗药性 | 揭示了HSP90-MYC-CDK9网络是治疗抗性的主要驱动力,并提出了药物联合靶向HSP90和CDK9以减少MYC活性的策略 | NA | 解析套细胞淋巴瘤中对Bruton酪氨酸激酶抑制剂和CAR-T疗法的连续抗药性的潜在机制 | 套细胞淋巴瘤患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 66个样本来自25名患者 |
14762 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics reveals that glial cells integrate homeostatic and circadian processes to drive sleep-wake cycles
2024-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01549-4
PMID:38263460
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研究论文 | 本研究揭示了胶质细胞如何整合生理平衡和昼夜节律过程以驱动睡眠-觉醒周期 | 发现胶质细胞在睡眠生理平衡和昼夜节律之间的交互作用,以及其基因表达如何影响睡眠动态 | 研究限制在特定的果蝇模型,结果可能无法直接推广到其他物种 | 研究不同脑细胞群体中昼夜节律和睡眠生理过程的分子影响及其相互作用 | 成年人果蝇的大脑胶质细胞及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 成年人果蝇的大脑样本 |
14763 | 2024-08-04 |
A comparative atlas of single-cell chromatin accessibility in the human brain
2023-10-13, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adf7044
PMID:37824643
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研究论文 | 本文探讨了人脑中单细胞的染色质可及性及其对神经精神障碍的影响 | 通过snATAC-seq技术,揭示了107种不同细胞类型及其在基因组中使用的候选顺式调控DNA元素 | 研究仅限于三名成年人的样本,可能影响结果的普遍性 | 研究人脑中细胞身份和功能的调控程序 | 分析来自三名成人的42个脑区的111万个细胞 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | snATAC-seq | 深度学习模型 | 细胞数据 | 3名成年人的42个脑区,合计111万个细胞 |
14764 | 2024-08-07 |
Protein arginine N-methyltransferase 4 (PRMT4) contributes to lymphopenia in experimental sepsis
2023-04, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thoraxjnl-2021-217526
PMID:35354645
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研究论文 | 本文研究了蛋白质精氨酸N-甲基转移酶4(PRMT4)在实验性脓毒症中对淋巴细胞减少的作用 | 发现了PRMT4在脓毒症患者和实验模型中系统性升高,并揭示了其在淋巴细胞凋亡中的关键作用 | NA | 探讨PRMT4在脓毒症中对淋巴细胞减少的影响及其机制 | PRMT4在脓毒症患者和实验模型中的表达及其对淋巴细胞和单核细胞的影响 | NA | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及脓毒症患者的人体样本以及细胞和动物脓毒症模型 |
14765 | 2024-08-04 |
LINE-1 retrotransposon expression in cancerous, epithelial and neuronal cells revealed by 5' single-cell RNA-Seq
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad049
PMID:36744437
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研究论文 | 本研究开发了一种新方法以测量癌细胞、上皮细胞和神经细胞中LINE-1逆转录子表达 | 提出了5' scL1seq方法,能够在成千上万的单细胞中测量LINE-1的表达,并发现了人类上皮细胞和小鼠海马神经元中的LINE-1表达 | 缺乏对LINE-1在健康与疾病中作用的全面理解 | 准确理解LINE-1在不同细胞中的表达及其与衰老相关疾病的联系 | 癌细胞、上皮细胞和神经细胞 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 5'单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA数据 | 成千上万的单细胞 |
14766 | 2024-08-07 |
A comprehensive single cell data analysis of lymphoblastoid cells reveals the role of super-enhancers in maintaining EBV latency
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28362
PMID:36453088
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了淋巴母细胞中的Epstein-Barr病毒(EBV)生命周期,揭示了超级增强子在维持EBV潜伏期中的作用 | 发现了两个新的细胞簇,它们在EBV裂解基因表达上有所不同,并且通过CRISPR-mediated扰动证明了宿主超级增强子及其目标基因对于维持EBV潜伏期是必需的 | NA | 探究EBV在淋巴母细胞中的生命周期及其与宿主基因表达的关系 | 淋巴母细胞中的Epstein-Barr病毒(EBV) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 九个公开可用的淋巴母细胞系 |
14767 | 2024-08-07 |
Langerhans cells are essential components of the angiogenic niche during murine skin repair
2022-12-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.012
PMID:36493773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析小鼠皮肤伤口愈合过程中的早期血管生成微环境,揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用 | 首次揭示朗格汉斯细胞在皮肤修复中的血管生成作用,扩展了其在抗原呈递和T细胞免疫之外的功能 | NA | 研究朗格汉斯细胞在小鼠皮肤修复中的血管生成作用 | 小鼠皮肤伤口愈合过程中的朗格汉斯细胞和血管生成 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠皮肤伤口样本 |
14768 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveals a distinct developmental state of KMT2A-rearranged infant B-cell acute lymphoblastic leukemia
2022-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-022-01720-7
PMID:35288693
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研究论文 | 本研究通过批量mRNA元分析和单个淋巴母细胞转录组的检查,揭示了KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)的独特发育状态 | 发现KMT2A重排的婴儿B-ALL主要由早期淋巴细胞前体(ELP)状态主导,并具有混合髓系-淋巴系特征 | 研究强调细胞起源不能仅从转录状态推断,但未详细说明其他潜在限制 | 探究KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病的发育状态 | KMT2A重排的婴儿B细胞急性淋巴细胞白血病 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
14769 | 2024-08-07 |
An interactive single cell web portal identifies gene and cell networks in COVID-19 host responses
2021-Oct-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103115
PMID:34522848
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研究论文 | 本文通过整合COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据,开发了一个交互式单细胞网络门户ToppCell,用于探索和比较细胞特征,以发现新的基因和细胞网络。 | 本文创新性地开发了一个交互式网络门户ToppCell,允许用户探索和比较不同条件下的单细胞转录组数据,从而发现新的基因和细胞网络。 | NA | 开发一个数据挖掘工具,使用户能够比较和探索细胞特征,以获得洞察并发展新的假设。 | COVID-19和其他对照条件下的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本的单细胞转录组数据。 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞转录组 | NA | 基因表达数据 | 多个COVID-19和其他对照条件的血液、支气管肺泡灌洗液和组织样本 |
14770 | 2024-08-07 |
Single-dose intranasal vaccination elicits systemic and mucosal immunity against SARS-CoV-2
2021-Sep-24, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103037
PMID:34462731
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研究论文 | 本文报道了一种鼻内单剂次亚单位疫苗的开发,该疫苗使用冻干刺突蛋白和脂质体STING激动剂作为佐剂,能够诱导系统性中和抗体、肺和鼻腔中的IgA以及肺部T细胞反应。 | 该疫苗能够在鼻相关淋巴组织中以类似生发中心的方式协调激活T/B细胞反应,确认其作为诱导持久免疫的诱导位点的作用。 | NA | 验证针对SARS-CoV-2的疫苗平台的更广泛应用。 | SARS-CoV-2病毒的免疫反应。 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
14771 | 2024-08-07 |
Sample processing and single cell RNA-sequencing of peripheral blood immune cells from COVID-19 patients
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100582
PMID:34002169
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研究论文 | 本文描述了从COVID-19患者的外周血单核细胞(PBMCs)中进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)的样本处理和分析协议 | 提出了针对COVID-19患者PBMCs样本的采集、处理和分析的新方法 | 血液样本可能含有传染性病毒,免疫细胞亚型的识别可能困难,分析结果的生物学解释复杂 | 深入评估COVID-19患者免疫细胞的转录变化 | COVID-19患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
14772 | 2024-08-07 |
Dynamics of B cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in patients with different severities of COVID-19
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109173
PMID:33991510
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研究论文 | 研究分析了不同严重程度的COVID-19患者B细胞受体(BCR)库的动态变化及交叉反应性反应的出现 | 首次详细描述了COVID-19患者BCR库的特征,并识别出与疾病严重程度相关的差异性BCR特征 | 研究样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 探究COVID-19患者BCR库的特征及其与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的B细胞受体库 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 |
14773 | 2024-08-07 |
Divergent and self-reactive immune responses in the CNS of COVID-19 patients with neurological symptoms
2021-05-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100288
PMID:33969321
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞因子分析,探讨了COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的免疫反应机制 | 发现了COVID-19患者中枢神经系统中特定区域的T细胞和B细胞活化,以及与自体免疫相关的抗体反应 | NA | 揭示COVID-19患者中枢神经系统中神经症状的生物学基础 | COVID-19患者的脑脊液和血液 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 7名患者 |
14774 | 2024-08-07 |
Systems biological assessment of human immunity to BNT162b2 mRNA vaccination
2021-Apr-22, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-438662/v1
PMID:34013244
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研究论文 | 本研究采用系统生物学方法,全面分析了56名健康志愿者接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗后的先天和适应性免疫反应 | 首次详细描述了mRNA疫苗接种后免疫系统的反应,包括中和抗体的产生和免疫细胞的激活 | 研究样本仅限于56名健康志愿者,可能无法完全代表所有人群的免疫反应 | 探讨mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫反应 | 56名接种了辉瑞-BioNTech mRNA疫苗的健康志愿者的免疫反应 | 疫苗学 | COVID-19 | 系统生物学方法 | NA | 免疫细胞转录组数据 | 56名健康志愿者 |
14775 | 2024-08-07 |
Multi-cohort analysis of host immune response identifies conserved protective and detrimental modules associated with severity across viruses
2021-04-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.03.002
PMID:33765435
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研究论文 | 本研究通过分析多个队列中宿主免疫反应,识别出与病毒感染严重程度相关的保守保护性和有害模块 | 本研究首次整合了大量血液转录组和单细胞RNA测序数据,揭示了不同病毒感染下宿主反应的共性和差异 | 研究主要集中在血液样本,可能无法全面反映所有组织中的宿主反应 | 探索不同病毒感染下宿主免疫反应与疾病严重程度的关系 | 16种病毒感染的患者血液转录组和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4,780个血液转录组样本和702,970个免疫细胞样本 |
14776 | 2024-08-07 |
Dynamics of B-cell repertoires and emergence of cross-reactive responses in COVID-19 patients with different disease severity
2021-Apr-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.07.13.20153114
PMID:32699862
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研究论文 | 本文通过高通量测序技术研究了COVID-19患者在感染期间B细胞受体(BCR)库的动态变化及其与疾病严重程度的关系 | 首次详细描述了COVID-19患者中B细胞反应的特征,并发现了对SARS-CoV-1和SARS-CoV-2具有交叉反应性的BCR | 研究样本量较小,仅涉及19名患者 | 探究COVID-19患者B细胞库的动态变化及其与疾病严重程度的关联 | COVID-19患者的B细胞库及其对SARS-CoV-2的反应 | NA | COVID-19 | 高通量测序 | NA | 序列数据 | 19名COVID-19患者 |
14777 | 2024-08-07 |
Impaired local intrinsic immunity to SARS-CoV-2 infection in severe COVID-19
2021-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.02.20.431155
PMID:33619488
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研究论文 | 研究分析了35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者的鼻咽样本,通过单细胞RNA测序揭示了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化及其对病毒病理的影响。 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后上呼吸道上皮细胞的重组织化过程,并揭示了细胞类型多样性和异质性对病毒复制的影响。 | 研究样本量有限,且未涵盖所有可能的疾病状态和年龄组,可能影响结果的普遍性。 | 探讨SARS-CoV-2感染对上呼吸道上皮细胞的影响及其在COVID-19严重程度中的作用。 | COVID-19患者的鼻咽样本和非COVID-19患者的鼻咽样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 35名COVID-19患者和23名非COVID-19患者 |
14778 | 2024-08-07 |
Diversified transcriptional responses of myeloid and glial cells in spinal cord injury shaped by HDAC3 activity
2021-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd8811
PMID:33637528
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research paper | 本研究结合骨髓特异性转录组学和单细胞RNA测序,揭示了脊髓损伤后激活的微胶质细胞和巨噬细胞的共同核心及时间上独特的基因程序 | 发现了脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的多样化转录反应,并揭示了HDAC3在这些过程中的广泛影响 | NA | 探究脊髓损伤后微胶质细胞和巨噬细胞的转录反应及HDAC3的作用 | 脊髓损伤后的微胶质细胞和巨噬细胞 | digital pathology | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
14779 | 2024-08-07 |
Targeted Single-Cell RNA and DNA Sequencing With Fluorescence-Activated Droplet Merger
2020-11-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03059
PMID:33049138
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光激活液滴合并技术进行靶向单细胞RNA和DNA测序的新方法 | 该方法通过选择性地合并细胞与试剂,实现酶促反应,无需物理隔离细胞,简化了单细胞工作流程 | NA | 旨在解决在分析异质性细胞群时,稀有细胞类型数据代表性不足的问题 | 特定细胞亚群的单细胞转录组和基因组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和DNA测序 | NA | RNA和DNA | NA |
14780 | 2024-08-07 |
Inflammatory Signals Induce AT2 Cell-Derived Damage-Associated Transient Progenitors that Mediate Alveolar Regeneration
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.06.020
PMID:32750316
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序结合体内谱系追踪和类器官模型,精细绘制了损伤修复和肺再生过程中肺泡谱系细胞的轨迹,并识别出一种特定的AT2谱系群体——损伤相关短暂前体细胞(DATPs)。 | 本文首次发现并描述了损伤相关短暂前体细胞(DATPs)在肺泡再生中的作用,并揭示了炎症信号如何通过HIF1α介导的糖酵解途径调控这些细胞的形成和功能。 | NA | 研究肺泡再生过程中细胞谱系的变化及其调控机制。 | 肺泡谱系细胞及其在损伤修复和肺再生中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |