单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 14741 - 14760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14741 | 2024-08-07 |
CellMeSH: probabilistic cell-type identification using indexed literature
2022-02-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab834
PMID:34893819
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellMeSH的新自动化方法，用于基于先前文献识别细胞类型 | CellMeSH结合了基因-细胞类型关联数据库与概率方法进行数据库查询，相比手动构建的数据库更全面且易于更新 | NA | 开发一种自动化方法来识别和量化单细胞RNA测序实验中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 概率方法 | 文本 | 多个小鼠和人类数据集 |
| 14742 | 2024-08-07 |
Coding and long non-coding gene expression changes in the CNS traumatic injuries
2022-Feb-07, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04092-2
PMID:35129669
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综述 | 本文综述了创伤性脑损伤（TBI）和脊髓损伤（SCI）中编码和长非编码基因表达变化的研究进展 | 强调了长非编码RNA（lncRNAs）在CNS损伤中的重要作用及其作为诊断、治疗和预后潜在靶点的可能性 | NA | 探讨TBI和SCI中基因表达变化及其分子机制 | 创伤性脑损伤和脊髓损伤中的基因表达变化 | NA | 神经系统损伤 | RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 14743 | 2024-08-07 |
Temporal analyses of postnatal liver development and maturation by single-cell transcriptomics
2022-02-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.01.004
PMID:35134346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析了小鼠出生后1、3、7、21和56天的肝脏发育和成熟过程 | 首次揭示了发育中肝脏内肝细胞的高度异质性以及从中心到门静脉肝细胞的代谢功能分区的逐步构建过程 | NA | 深入理解肝脏在出生后的发育和成熟过程 | 小鼠出生后不同时间点的肝脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 52,834个单细胞 |
| 14744 | 2024-08-07 |
Complement activation induces excessive T cell cytotoxicity in severe COVID-19
2022-02-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.12.040
PMID:35032429
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和单细胞蛋白质组学结合机制研究，评估了严重COVID-19中病理性T细胞功能及其诱导信号 | 发现了在严重COVID-19中高度激活的CD16 T细胞，其具有增强的细胞毒性功能，并通过免疫复合物介导的T细胞受体非依赖性脱颗粒和细胞毒性作用，这在其他疾病中未见 | NA | 研究严重COVID-19中T细胞是否参与疾病病理过程 | 严重COVID-19患者的T细胞功能及诱导信号 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，单细胞蛋白质组学 | NA | 单细胞数据 | COVID-19患者的CD16 T细胞 |
| 14745 | 2024-08-07 |
Biologic correlates of beneficial convalescent plasma therapy in a COVID-19 patient reveal disease resolution mechanisms
2022-Feb-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.02.03.22269612
PMID:35132422
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研究论文 | 本研究报告了一例由于恢复期血浆输注导致严重COVID-19完全缓解的病例，并通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了与疾病从严重到无病状态过渡相关的关键生物学过程。 | 本研究首次通过纵向无偏蛋白质组学和单细胞转录组学分析，揭示了恢复期血浆治疗COVID-19患者后，疾病缓解的生物学机制。 | 本研究仅基于单一病例，可能缺乏广泛的代表性，需要更多病例验证研究结果。 | 探究恢复期血浆治疗COVID-19的生物学机制及其在疾病缓解中的作用。 | 严重COVID-19患者及其恢复期血浆治疗后的生物学变化。 | NA | COVID-19 | 蛋白质组学、单细胞转录组学 | NA | 血液样本 | 单一病例 |
| 14746 | 2024-08-07 |
Tumor-specific T cells support chemokine-driven spatial organization of intratumoral immune microaggregates needed for long survival
2022-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004346
PMID:35217577
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研究论文 | 本文通过多模态高维度策略分析了口腔鳞状细胞癌（OPSCC）中肿瘤特异性T细胞响应的肿瘤免疫微环境（TIME），揭示了与长期生存相关的免疫微聚集物的形成机制。 | 首次揭示了肿瘤特异性T细胞通过产生趋化因子支持免疫微聚集物的形成，从而形成正反馈循环，维持DC-T细胞微聚集物的形成。 | NA | 研究肿瘤特异性T细胞响应的肿瘤免疫微环境与长期生存之间的关系。 | 口腔鳞状细胞癌（OPSCC）中的肿瘤特异性T细胞及其免疫微环境。 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | NanoString、Hyperion成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 组织样本 | 包括免疫响应阳性（IR+）和免疫响应阴性（IR-）的口腔鳞状细胞癌组织样本 |
| 14747 | 2024-08-07 |
Enhancing CDK4/6 inhibitor therapy for medulloblastoma using nanoparticle delivery and scRNA-seq-guided combination with sapanisertib
2022-Jan-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl5838
PMID:35080986
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研究论文 | 研究通过纳米颗粒递送和单细胞RNA测序指导的组合疗法，增强CDK4/6抑制剂对髓母细胞瘤的治疗效果 | 使用纳米颗粒封装减少药物毒性，改善中枢神经系统药代动力学，并通过单细胞RNA测序分析识别新的联合治疗策略 | 尽管延长了生存期，但复发问题仍未完全解决 | 探索提高CDK4/6抑制剂治疗髓母细胞瘤效果的新方法 | 髓母细胞瘤及其治疗 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用基因工程小鼠模型进行实验 |
| 14748 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics defines keratinocyte differentiation in avian scutate scales
2022-01-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-04082-1
PMID:34997067
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，探讨了鸟类鳞状鳞片中角质形成细胞的分化过程 | 首次通过单细胞转录组学技术揭示了鸟类鳞状鳞片中两种不同类型的分化角质形成细胞，并发现了与人类皮肤相似的角质形成细胞分化基因 | NA | 研究鸟类鳞状鳞片中角质形成细胞的分化过程 | 鸟类鳞状鳞片中的角质形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | mRNA | 来自1日龄小鸡腿部的皮肤细胞 |
| 14749 | 2024-08-07 |
Simultaneous Analysis of Single-Cell Transcriptomes and Cell Surface Protein Expression of Human Hematopoietic Stem Cells and Progenitors Using the 10x Genomics Platform
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1771-7_13
PMID:34766273
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研究论文 | 本文描述了使用10x Genomics平台同时分析人造血干细胞和祖细胞的单细胞转录组和细胞表面蛋白表达的工作流程 | 结合传统的单细胞转录组分析和使用寡核苷酸偶联抗体的细胞表面蛋白表达同时分析，增加了免疫表型分析到mRNA数据中 | NA | 详细表征单细胞异质性，并有助于识别用于前瞻性分离转录定义的新细胞亚群的标记 | 人脐带血单个核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据和蛋白表达数据 | 人脐带血单个核细胞和CD34+富集的造血祖细胞 |
| 14750 | 2024-08-07 |
CD161 expression and regulation defines rapidly responding effector CD4+ T cells associated with improved survival in HPV16-associated tumors
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003995
PMID:35039463
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研究论文 | 本研究探讨了CD161表达及其调控在HPV16相关肿瘤中对效应CD4+ T细胞的影响，发现CD4+CD161+效应记忆T细胞与改善生存率相关。 | 首次揭示了CD161在肿瘤特异性CD4+ T细胞中的作用及其调控机制，并发现CD161与SOX4共同参与TCR信号的放大。 | 研究主要集中在HPV16+的OPSCC患者，可能需要进一步研究以验证在其他类型癌症中的普遍性。 | 研究CD161表达在HPV16相关肿瘤中对CD4+ T细胞的影响及其临床意义。 | HPV16+的OPSCC患者中的CD4+CD161+ T细胞。 | 免疫学 | 头颈部肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包括治疗性疫苗接种患者和肿瘤浸润淋巴细胞的样本 |
| 14751 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analysis Reveals Unexpected Cellular Changes and Transposon Expression Signatures in the Colonic Epithelium of Treatment-Naïve Adult Crohn's Disease Patients
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.02.005
PMID:35158099
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析，揭示了未经治疗的成年克罗恩病患者结肠上皮细胞中意外的细胞变化和转座子表达特征。 | 首次在单细胞分辨率下直接比较了未经治疗的成年克罗恩病患者与非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞和分子景观，并发现了新的细胞类型特异性表达模式和转座子元素标记。 | NA | 旨在通过单细胞分析，定义克罗恩病患者中每种肠上皮细胞类型的分子变化，以增进对发病机制的理解并识别细胞类型特异性的治疗靶点。 | 未经治疗的成年克罗恩病患者和非炎症性肠病对照患者的结肠上皮细胞。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 14752 | 2024-08-07 |
The onset of circulation triggers a metabolic switch required for endothelial to hematopoietic transition
2021-12-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110103
PMID:34910918
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研究论文 | 本文研究了血液循环启动如何影响造血干细胞（HSC）的产生，特别是在Ncx1小鼠胚胎中，血液循环缺失对HSC前体细胞的影响。 | 首次揭示了血液循环启动触发代谢转换，这对于内皮细胞向造血细胞的转变至关重要。 | 实验仅限于Ncx1小鼠胚胎，可能需要进一步研究以验证在其他物种或模型中的适用性。 | 探讨血液循环启动对造血干细胞生成的影响及其机制。 | 研究对象为Ncx1小鼠胚胎中的造血干细胞前体细胞。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及Ncx1小鼠胚胎的单细胞转录组数据 |
| 14753 | 2024-08-07 |
Injury-induced ASCL1 expression orchestrates a transitory cell state required for repair of the neonatal cerebellum
2021-Dec-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj1598
PMID:34878841
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和命运图谱技术，研究了新生儿小脑损伤后的修复过程，特别是Bergmann胶质层中的神经发生性前体细胞（NEP）的适应性重编程 | 首次定义了NEP的分子亚型及其在稳态和修复过程中的谱系，并揭示了ASCL1表达在损伤诱导的适应性重编程中的关键作用 | NA | 理解新生儿小脑损伤后的修复机制 | 新生儿小脑中的神经发生性前体细胞（NEP）及其在损伤后的适应性重编程 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14754 | 2024-08-07 |
Intranasal priming induces local lung-resident B cell populations that secrete protective mucosal antiviral IgA
2021-Dec-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abj5129
PMID:34890255
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研究论文 | 研究通过鼻内免疫在小鼠流感病毒感染模型中诱导局部肺部IgA分泌，并探讨了IgA分泌细胞的类型及其在肺部保护性免疫中的作用 | 首次展示了鼻内免疫而非系统性免疫能诱导肺部局部IgA分泌，并发现肺部存在多种IgA表达细胞，包括组织驻留记忆B细胞、浆母细胞和浆细胞 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨肺部局部IgA分泌细胞的类型及其在保护性免疫中的作用，为设计针对呼吸道病毒感染的高效疫苗策略提供信息 | 肺部局部IgA分泌细胞及其在保护性免疫中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 14755 | 2024-08-07 |
Targeting metabotropic glutamate receptor 4 for cancer immunotherapy
2021-Dec-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abj4226
PMID:34890233
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研究论文 | 本研究报告了代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在抑制抗肿瘤免疫中的新作用，并通过遗传敲除或药物抑制在三种小鼠同源肿瘤模型中显著延迟了肿瘤生长 | 首次揭示了GRM4在抑制抗肿瘤免疫中的作用，并展示了通过靶向GRM4进行癌症免疫治疗的新方法 | NA | 探索代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在癌症免疫治疗中的作用 | 代谢型谷氨酸受体4（GRM4）及其在肿瘤免疫中的作用 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析 | NA | RNA | 三种小鼠同源肿瘤模型（B16，MC38，3LL） |
| 14756 | 2024-08-07 |
Location Matters: Profiling Diffuse Type Gastric Cancer At the Single-Cell Level
2021-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-2935
PMID:34556549
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研究论文 | 本研究利用空间单细胞转录组学技术，分析了原发性弥漫型胃癌患者肿瘤不同位置的细胞差异 | 首次揭示了弥漫型胃癌中不同位置的癌细胞和基质细胞的差异，特别是深层肿瘤区域基质细胞表达的CCL2对免疫抑制微环境的潜在驱动作用 | NA | 研究弥漫型胃癌中单细胞水平的空间转录组学特征 | 弥漫型胃癌患者的肿瘤细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14757 | 2024-08-07 |
Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00938-x
PMID:34663959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术，揭示了小鼠伏隔核中细胞的高度异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和空间信息结合的方法，全面解析了伏隔核的分子、细胞和结构异质性 | NA | 揭示伏隔核的分子、细胞和结构异质性，以及这些异质性如何影响其功能 | 小鼠伏隔核的细胞异质性 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序，多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 14758 | 2024-08-07 |
Temporal single-cell transcriptomes of zebrafish spinal cord pMN progenitors reveal distinct neuronal and glial progenitor populations
2021-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2021.07.010
PMID:34303700
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼脊髓pMN前体细胞，揭示了神经元和少突胶质前体细胞的不同前体群体 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼脊髓pMN前体细胞中神经元和少突胶质前体细胞的不同前体群体，并鉴定了标记基因gsx2 | NA | 识别运动神经元和少突胶质前体细胞的发育起源和转录组特征 | 斑马鱼胚胎脊髓pMN细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 14759 | 2024-08-07 |
Tissue factor expression, extracellular vesicles, and thrombosis after infection with the respiratory viruses influenza A virus and coronavirus
2021-11, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/jth.15509
PMID:34418279
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综述 | 本文综述了组织因子（TF）在流感A病毒（IAV）和冠状病毒感染后的表达、TF阳性外泌体（EVs）的释放、凝血激活及血栓形成的研究 | 强调了TF表达在IAV和致病性冠状病毒感染患者中与血栓形成的关系 | NA | 探讨病毒感染后组织因子表达与血栓形成的关系 | 流感A病毒和冠状病毒感染后的组织因子表达及血栓形成 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠模型和COVID-19患者的样本 |
| 14760 | 2024-08-07 |
Molecular and Cellular Dynamics of Aortic Aneurysms Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2021-11, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.315852
PMID:34615376
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review | 本文综述了单细胞转录组测序在揭示主动脉瘤的分子和细胞动态方面的最新发现 | 单细胞RNA测序提供了血管细胞类型异质性、每个细胞类型的全面分子特征以及这些细胞群体之间表型相互关系的新见解 | 讨论了单细胞RNA测序在研究主动脉生物学和疾病中的挑战和未来方向 | 总结单细胞RNA测序分析在细胞异质性、细胞转换、细胞群体间通信和血管壁关键转录因子方面的发现，并探讨其对血管疾病发病机制的理解 | 主动脉瘤的分子和细胞动态 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |