单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 14721 - 14740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14721 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101337
PMID:38118404
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出来自皮下脂肪组织的CD271前体细胞，在肢体缺血中具有增强的血管生成能力 | 指出CD271前体细胞独特的促血管生成基因特征，并展示其在肢体缺血模型中的优越效果 | 未提及具体的局限性 | 研究CD271前体细胞在肢体缺血中的血管生成作用 | 主要研究皮下脂肪组织中的CD271前体细胞 | 数字病理学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组分析 | 异种移植物模型 | 基因表达数据 | NA |
| 14722 | 2024-08-04 |
Bexmarilimab-induced macrophage activation leads to treatment benefit in solid tumors: The phase I/II first-in-human MATINS trial
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101307
PMID:38056464
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研究论文 | 本研究探讨了bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的安全性和耐受性。 | 首次在人类中研究Clever-1阻断的疗效，并显示了bexmarilimab诱导的巨噬细胞激活对成瘤免疫的积极影响。 | 本研究主要集中于早期的安全性和耐受性评估，缺乏长期疗效的完整数据。 | 评估bexmarilimab对治疗难治性实体肿瘤患者的初步抗肿瘤疗效及免疫相关性。 | 治疗难治性实体肿瘤患者，参与者总数为138。 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤、胃癌、肝细胞癌、雌激素受体阳性乳腺癌和胆道癌 | NA | NA | 临床试验数据 | 138名患者 |
| 14723 | 2024-08-07 |
iPSC-derived hypoimmunogenic tissue resident memory T cells mediate robust anti-tumor activity against cervical cancer
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101327
PMID:38091985
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研究论文 | 本文开发了一种HLA-A24&-E双整合的HPV-rejTs，通过消除HLA I类抗原来有效抑制受体免疫排斥，同时保持比原始细胞毒性T淋巴细胞更强的细胞毒性 | 通过单细胞RNA测序发现HPV-rejTs富含组织驻留记忆T细胞，增强了通过TGFβR信号通路对宫颈癌的细胞毒性，并上调了与免疫突触相关的基因，促进了T细胞受体（TCR）的更强激活和TCR介导的目标细胞死亡 | NA | 开发一种可行的“即用型”T细胞疗法，具有强大的抗宫颈癌效果 | 从诱导多能干细胞生成的功能性恢复的人乳头瘤病毒特异性细胞毒性T淋巴细胞（HPV-rejTs） | 免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14724 | 2024-08-07 |
Dapagliflozin protects against chronic heart failure in mice by inhibiting macrophage-mediated inflammation, independent of SGLT2
2023-12-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101334
PMID:38118414
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研究论文 | 本研究使用SGLT2全局敲除小鼠评估SGLT2抑制剂对心力衰竭的作用机制，发现达格列净通过抑制巨噬细胞介导的炎症来保护心脏，且这一作用独立于SGLT2。 | 达格列净对心力衰竭的保护作用独立于SGLT2，主要通过抑制巨噬细胞炎症来实现。 | NA | 阐明SGLT2抑制剂在心力衰竭中的具体作用机制。 | SGLT2全局敲除小鼠及其在心肌梗死和主动脉缩窄诱导的心力衰竭模型中的表现。 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | SGLT2全局敲除小鼠 |
| 14725 | 2024-08-04 |
Metabolic predictors of response to immune checkpoint blockade therapy
2023-Nov-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108188
PMID:37965137
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤微环境中免疫细胞代谢与免疫检查点抑制剂反应之间的关系 | 首次对接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者肿瘤微环境中免疫细胞的代谢特征进行了分析，并建立了基于代谢基因特征的预测模型 | 目前只分析了部分代谢基因，可能未涵盖所有相关的代谢途径 | 旨在通过代谢特征预测癌症患者对免疫检查点抑制剂的反应 | 参与研究的对象为大约230例接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约230个样本，涉及超过100万个免疫细胞 |
| 14726 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the key genes associated with macrophage polarization in liver cancer
2023-11-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000304
PMID:37889536
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研究论文 | 本研究揭示了与肝癌巨噬细胞极化相关的关键基因 | 通过单细胞转录组分析识别了6个与巨噬细胞极化相关的关键基因，并建立了预后模型 | 尚未提及研究的具体限制 | 揭示与肝癌巨噬细胞极化相关的关键基因 | 肝癌组织中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 涉及2000个高变基因和15个细胞簇 |
| 14727 | 2024-08-04 |
Genetic vulnerability to Crohn's disease reveals a spatially resolved epithelial restitution program
2023-10-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg5252
PMID:37878672
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研究论文 | 本文解剖了肠黏膜愈合反应，通过单细胞分辨率绘制细胞间通信图谱并与空间转录组学结合 | 揭示了与克罗恩病相关的遗传变异如何破坏损伤感知通路，在愈合机制上提供了空间分辨的生物学模型 | 主要使用小鼠模型进行研究，可能与人类的生物学过程存在差异 | 研究肠道组织修复过程中的细胞间通信与信号传导机制 | 研究对象为克罗恩病相关的HGFAC基因变异及其在小鼠模型中的表现 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | 器官oid共培养模型 | 细胞数据 | 使用R509H小鼠模型进行实验 |
| 14728 | 2024-08-07 |
ETV6 represses inflammatory response genes and regulates HSPC function during stress hematopoiesis in mice
2023-09-26, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009313
PMID:37522715
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研究论文 | 本研究通过生成携带Etv6R355X失活突变的小鼠模型，探讨ETV6基因在HSPC功能和炎症反应基因调控中的作用 | 首次揭示了ETV6在HSPC中抑制炎症基因表达的机制，特别是在应激造血过程中的作用 | NA | 阐明ETV6基因变异如何影响HSPC功能并导致疾病 | ETV6基因在HSPC中的功能及其对炎症反应基因的调控作用 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 转座酶可及染色质测序、高吞吐量染色体构象捕获、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，包括Etv6R355X/+和Etv6+/+小鼠的骨髓细胞 |
| 14729 | 2024-08-07 |
A Frizzled4-LRP5 agonist promotes blood-retina barrier function by inducing a Norrin-like transcriptional response
2023-Aug-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107415
PMID:37559903
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研究论文 | 本研究通过使用四价抗体模式F4L5.13，在因NDP信号受损而表现出复杂视网膜病理的幼鼠中，发现FZD4-LRP5激动剂的活动，并探讨其在发育期和成熟期对血视网膜屏障（BRB）功能的恢复作用。 | 本研究首次使用F4L5.13抗体模式，识别并验证了FZD4-LRP5激动剂在恢复血视网膜屏障功能中的作用，揭示了其在视网膜和神经疾病治疗中的潜在价值。 | 研究主要集中在幼鼠和成熟鼠模型上，未涉及其他年龄段的动物模型，可能影响结果的普遍性。 | 探讨FZD4-LRP5激动剂在维持和恢复血视网膜屏障功能中的作用及其潜在治疗价值。 | 幼鼠和成熟鼠的视网膜病理模型。 | 生物医学 | 视网膜疾病 | scRNA-seq | NA | RNA | 幼鼠和成熟鼠 |
| 14730 | 2024-08-07 |
EZH2 inhibition promotes tumor immunogenicity in lung squamous cell carcinomas
2023-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543919
PMID:37333199
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研究论文 | 本研究探讨了EZH2甲基转移酶抑制剂在肺鳞状细胞癌（LSCC）中增强免疫检查点抑制剂（ICI）反应的可能性 | 首次证明EZH2抑制剂能增加主要组织相容性复合体I和II（MHCI/II）的表达，并改变肿瘤微环境，使其更具免疫原性 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的效果 | 肺鳞状细胞癌（LSCC）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用2D人类癌细胞系以及3D鼠源和患者来源的类器官进行实验 |
| 14731 | 2024-08-07 |
A TREM2-activating antibody with a blood-brain barrier transport vehicle enhances microglial metabolism in Alzheimer's disease models
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01240-0
PMID:36635496
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研究论文 | 本文描述了一种高亲和力的人源TREM2激活抗体，该抗体通过单价的转铁蛋白受体（TfR）结合位点工程化，称为抗体运输载体（ATV），以促进血脑屏障的转运，从而增强阿尔茨海默病模型中的小胶质细胞代谢。 | 开发了一种新型的高亲和力TREM2激活抗体，结合了抗体运输载体（ATV）技术，以改善血脑屏障的穿透性和小胶质细胞的代谢活性。 | NA | 探索通过激活TREM2受体来改善阿尔茨海默病患者脑内小胶质细胞功能和代谢的治疗策略。 | TREM2激活抗体及其在阿尔茨海默病模型中的应用。 | 生物技术 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的小胶质细胞和阿尔茨海默病小鼠模型进行研究。 |
| 14732 | 2024-08-04 |
Single cell transcriptomics identifies adipose tissue CD271+ progenitors for enhanced angiogenesis in limb ischemia
2023-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.09.527726
PMID:36865239
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，我们识别了来自皮下脂肪组织的CD271+前体细胞，具有增强的血管生成能力 | 该研究首次识别出皮下脂肪组织CD271+前体细胞，展示了它们在小鼠肢体缺血模型中显著的血管生成潜力 | 研究未涉及体内实验以进一步验证CD271+前体细胞在临床应用中的效果 | 探讨在肢体缺血中采用CD271+前体细胞作为治疗方法的潜力 | 主要研究对象为CD271+前体细胞及其在小鼠模型中的血管生成能力 | 数字病理学 | 肢体缺血 | 单细胞转录组分析 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 未提供具体样本数量 |
| 14733 | 2024-08-04 |
A Novel Molecular Classification Method for Glioblastoma Based on Tumor Cell Differentiation Trajectories
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/2826815
PMID:37964983
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研究论文 | 本文提出了一种基于肿瘤细胞分化轨迹的新的胶质母细胞瘤分子分类方法 | 探索了基于单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据的分化轨迹推断在胶质母细胞瘤分子分类中的应用 | 该研究仅使用了10个胶质母细胞瘤样本的单细胞数据，并在公共队列中验证其结果 | 研究新的胶质母细胞瘤分子分类，以便于治疗选择和提高癌症患者的反应率 | 10个胶质母细胞瘤样本的单细胞转录组测序数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序(串行单细胞RNA测序) | NA | 基因表达数据 | 10个胶质母细胞瘤样本 |
| 14734 | 2024-08-04 |
Tsp-1+ microglia attenuate retinal neovascularization by maintaining the expression of Smad3 in endothelial cells through exosomes with decreased miR-27a-5p
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.84236
PMID:37441592
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研究论文 | 本文探讨了微胶质细胞通过调节Smad3的表达而影响视网膜新血管生成的机制 | 揭示了Tsp-1/miR-27a-5p/Smad3轴在微胶质细胞相关和外泌体介导的抗血管生成调控中的新机制 | 文章中未提到实验样本的多样性和长期效果的观察 | 研究视网膜微胶质细胞在病理性新血管生成中的作用及其机制 | 小鼠视网膜中微胶质细胞和内皮细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序，外泌体分离，miRNA测序，荧光素酶报告试验 | NA | RNA数据 | 小鼠视网膜样本 |
| 14735 | 2024-08-04 |
Ferritin light chain promotes the reprogramming of glioma immune microenvironment and facilitates glioma progression
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.82975
PMID:37441589
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研究论文 | 这篇文章研究了铁蛋白轻链（FTL）如何促进胶质瘤的免疫微环境重编程和胶质瘤进展 | 本研究首次揭示了FTL在胶质瘤免疫微环境中的作用机制，并探索了抑制FTL对改进抗PD-1治疗效果的潜在策略 | 尚不清楚FTL在胶质瘤免疫微环境中的所有调控机制，未来研究需要进一步验证 | 研究FTL在胶质瘤免疫微环境中的作用以及其对胶质瘤进展的影响 | 研究对象为胶质瘤相关的巨噬细胞（TAMs）及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序 | NA | 生物信息学数据 | 在胶质瘤的TAMs中分析了bulk和单细胞RNA-seq水平的样本 |
| 14736 | 2024-08-07 |
Microtubule stabilization targeting regenerative chondrocyte cluster for cartilage regeneration
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.85077
PMID:37351173
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研究论文 | 本研究旨在探索骨关节炎（OA）病理条件下软骨细胞（CHs）再生的潜在机制及其治疗策略 | 发现微管稳定化在促进软骨再生中的作用，并揭示了其通过抑制YAP活性来实现的效果 | NA | 探索软骨细胞在骨关节炎病理条件下的再生机制及其治疗策略 | 从不同OA阶段的人体软骨中分离出的软骨细胞 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人源性软骨细胞及大鼠软骨损伤模型 |
| 14737 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies critical transcription factors of tumor cell invasion induced by hypoxia microenvironment in glioblastoma
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.81407
PMID:37441593
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了低氧微环境对胶质母细胞瘤细胞侵袭的影响，并识别了关键的转录因子 | 提出了一个数据驱动的建模框架CHPF，用于预测细胞低氧状态，并揭示了低氧亚群中具有高度侵袭潜力的关键调控因子 | NA | 阐明低氧对胶质母细胞瘤侵袭的影响 | 胶质母细胞瘤细胞及其在低氧微环境中的侵袭行为 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 数据驱动的建模框架 | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14738 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of castration-resistant prostate cancers to identify potential biomarkers for diagnosis and prognosis of neuroendocrine prostate cancer
2023, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:37970364
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研究论文 | 本文通过单细胞分析去势抵抗性前列腺癌，旨在识别神经内分泌前列腺癌的潜在诊断和预后生物标志物。 | 本文首次采用重新聚类特定细胞类型的方法，研究神经内分泌前列腺癌的异质性，并识别出三种神经内分泌状态，其中N-Myc和REST在介导谱系可塑性和分类神经内分泌表型中起中心作用。 | 文章指出，前列腺癌中神经内分泌细胞的高异质性和低比例限制了传统批量RNA测序和单细胞RNA测序在寻找更好生物标志物方面的应用。 | 识别神经内分泌前列腺癌的潜在诊断和预后生物标志物。 | 去势抵抗性前列腺癌样本中的神经内分泌细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个去势抵抗性前列腺癌样本 |
| 14739 | 2024-08-07 |
Exploring tissue architecture using spatial transcriptomics
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03634-9
PMID:34381231
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综述 | 本文综述了空间转录组技术及其在生物学研究中的应用 | 介绍了空间转录组技术在探索组织结构中的创新应用 | NA | 探讨基因活动如何调控多细胞生物中的复杂细胞排列 | 空间转录组技术在神经科学、发育生物学、植物生物学及疾病研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 下一代测序技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14740 | 2024-08-07 |
De novo gene signature identification from single-cell RNA-seq with hierarchical Poisson factorization
2019-02-22, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20188557
PMID:30796088
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞层次泊松分解（scHPF）的贝叶斯分解方法，用于从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中发现连续和离散的表达模式 | scHPF方法不需要预先归一化，并且能更好地捕捉单细胞数据的统计特性 | NA | 开发一种新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的基因特征 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 层次泊松分解（HPF） | 基因表达数据 | 高级别胶质瘤的核心和边缘区域的单细胞RNA测序数据 |