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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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14701 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Human Lung Provides Insights into the Pathobiology of Pulmonary Fibrosis
2019-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201712-2410OC
PMID:30554520
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人肺组织,以揭示肺纤维化发病机制中的细胞群体变化 | 发现了在肺纤维化患者中特有的一类促纤维化肺泡巨噬细胞,并识别出在肺纤维化过程中出现的稀有细胞群体,如气道干细胞和衰老细胞 | 研究样本量相对较小,且仅限于肺移植捐赠者和接受者以及一例特发性肺纤维化患者的样本 | 探究单细胞RNA测序是否能揭示肺纤维化患者肺组织中肺泡巨噬细胞、上皮细胞等细胞类型的疾病相关异质性 | 肺纤维化患者的肺组织细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8名肺移植捐赠者、8名肺纤维化接受者及1名特发性肺纤维化患者的肺组织样本 |
14702 | 2024-08-07 |
Adaptive Immune Resistance Emerges from Tumor-Initiating Stem Cells
2019-05-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.03.025
PMID:31031009
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研究论文 | 本文通过设计一种皮肤癌模型,研究了肿瘤起始干细胞(tSCs)如何通过适应性免疫抵抗机制克服免疫监视 | 发现tSCs通过表达CD80并结合CTLA4直接抑制细胞毒性T细胞活性,从而抵抗免疫疗法 | NA | 探讨肿瘤起始干细胞如何克服免疫监视并形成肿瘤复发的机制 | 肿瘤起始干细胞(tSCs)及其在皮肤鳞状细胞癌(SCC)中的免疫抵抗机制 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | NA |
14703 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Embryonic Stem Cell Differentiation Delineates Adverse Effects of Nicotine on Embryonic Development
2019-04-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.01.022
PMID:30827876
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了尼古丁对人类胚胎干细胞(hESC)衍生的胚胎体(EB)的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了尼古丁对hESC分化的直接影响,并提供了一种新的方法来评估药物和环境毒素对人类胚胎发育的影响 | NA | 探讨尼古丁对人类胚胎发育的不良影响及其相关机制 | 人类胚胎干细胞(hESC)及其衍生的胚胎体(EB) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
14704 | 2024-08-07 |
Macrophages in wound healing: activation and plasticity
2019-03, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12236
PMID:30746824
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研究论文 | 本文综述了巨噬细胞在伤口愈合中的作用,包括其激活和可塑性 | 介绍了最新的体内和转化伤口模型、巨噬细胞特异性缺失以及区分巨噬细胞亚群的新技术 | NA | 总结伤口愈合中巨噬细胞激活和功能的主要参与者,并探讨其对伤口愈合的影响 | 巨噬细胞在伤口愈合中的作用及其激活和可塑性 | NA | NA | 细胞追踪和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
14705 | 2024-08-07 |
Seizing Sequencing Data to Consider Cell and Circuit Complexity
2019 Mar-Apr, Epilepsy currents
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/1535759719835658
PMID:30955433
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析海马CA1区抑制性神经元的类别和连续性变异 | 揭示了海马CA1区抑制性神经元的10个主要GABA能群体和49个细粒度集群,并发现连续变异在描述这些细胞多样性中的重要性 | 研究仅限于海马CA1区的抑制性神经元,未涉及其他脑区或神经元类型 | 理解脑回路中的神经元分类 | 海马CA1区的抑制性神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | 潜在因子分析 | 转录组数据 | 3663个CA1区抑制性细胞 |
14706 | 2024-08-07 |
Single T Cell Sequencing Demonstrates the Functional Role of αβ TCR Pairing in Cell Lineage and Antigen Specificity
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.01516
PMID:31417541
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析了近10万个独特的CD4和CD8 T细胞的配对TCR序列,探讨了αβ配对在T细胞谱系和抗原特异性中的功能作用 | 首次在谱系水平上分析了αβ TCR配对对T细胞功能的影响,并利用信息论和机器学习工具展示了αβ配对在TCR-MHC相互作用中的协同作用 | NA | 探讨αβ TCR配对在T细胞谱系和抗原特异性中的功能作用 | 近10万个独特的CD4和CD8 T细胞的配对TCR序列 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | 机器学习 | 序列数据 | 近10万个独特的CD4和CD8 T细胞 |
14707 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal the mechanism for a breast cancer prognostic gene panel
2018-Sep-07, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.26044
PMID:30279960
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了乳腺癌预后基因面板与细胞周期扰动之间的关系 | 首次详细描述了MammaPrint签名基因在细胞周期中的精细扰动,并发现这些基因的细胞周期活动与临床预后相关 | NA | 探讨乳腺癌预后基因面板与细胞周期扰动之间的关系 | 乳腺癌细胞的单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 70个MammaPrint签名基因中的38个 |
14708 | 2024-08-07 |
Induced pluripotent stem cell-based mapping of β-globin expression throughout human erythropoietic development
2018-08-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2018020560
PMID:30108108
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研究论文 | 本文报道了一种基于诱导多能干细胞(iPSCs)的β-珠蛋白报告细胞系,该细胞系能够在单细胞分辨率下实时映射人类红细胞生成过程中β-珠蛋白的表达 | 通过结合单细胞RNA测序(scRNAseq),本文能够区分β-珠蛋白表达细胞的特征,并解析iPSC衍生红细胞系细胞的发育和成熟状态 | NA | 提高β-珠蛋白表达的量化,并解析其在人类红细胞生成中的作用 | 诱导多能干细胞衍生的红细胞系细胞中的β-珠蛋白表达 | 再生医学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 单细胞分辨率 |
14709 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveal the dynamic of haematopoietic stem cell production in the aorta
2018-06-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04893-3
PMID:29955049
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了小鼠胚胎主动脉中的非造血内皮细胞、造血内皮细胞、正在经历内皮-造血转化的细胞、主动脉内造血簇细胞及其整体,揭示了造血干细胞产生的动态过程。 | 本研究首次提供了完整的资源,深入研究体内造血干细胞的生成,并为进一步改善体外造血干细胞生产提供了基础。 | NA | 研究造血干细胞在体内的生成过程及其分子调控机制。 | 小鼠胚胎主动脉中的非造血内皮细胞、造血内皮细胞、正在经历内皮-造血转化的细胞、主动脉内造血簇细胞及其整体。 | 数字病理学 | 血液相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自小鼠胚胎主动脉的多种细胞类型样本 |
14710 | 2024-08-07 |
shinyheatmap: Ultra fast low memory heatmap web interface for big data genomics
2017, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0176334
PMID:28493881
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研究论文 | 本文介绍了一种名为shinyheatmap的先进用户友好型热图软件套件,能够在网络浏览器中高效创建高度可定制的静态和交互式生物热图 | shinyheatmap具有低内存占用特性,特别适合于交互式可视化由于大小限制而无法在内存中计算的极大数据集。此外,它内置了高性能的web插件fastheatmap,能够快速绘制包含多达105-107行的数据集的交互式热图,显著超越了之前的热图渲染速度基准 | NA | 开发一种能够高效处理和可视化大型基因组数据集的工具 | 转录组学、代谢组学、宏基因组学等下一代测序领域产生的大数据集 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | NA | 数值数据 | 数据集大小可达105-107行 |
14711 | 2024-08-07 |
Defining the three cell lineages of the human blastocyst by single-cell RNA-seq
2015-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.131235
PMID:26487783
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correction | 纠正了先前发表在《Development》杂志上的文章中的图3标签错误 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
14712 | 2024-08-07 |
ADAR1 Inhibits Macrophage Apoptosis and Alleviates Sepsis-induced Liver Injury Through miR-122/BCL2A1 Signaling
2024-Feb-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2023.00171
PMID:38343614
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研究论文 | 研究探讨了ADAR1通过miR-122/BCL2A1信号通路抑制巨噬细胞凋亡并减轻脓毒症引起的肝损伤的作用机制 | 首次揭示了ADAR1通过miR-122/BCL2A1信号通路减轻脓毒症引起的肝损伤 | NA | 研究ADAR1在脓毒症引起肝损伤中的作用及其机制 | ADAR1在脓毒症中的作用及通过miR-122/BCL2A1信号通路的影响 | NA | 脓毒症 | 转录组和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括来自脓毒症患者的PBMCs和CLP诱导的脓毒症小鼠模型 |
14713 | 2024-08-04 |
Prior dengue virus serotype 3 infection modulates subsequent plasmablast responses to Zika virus infection in rhesus macaques
2024-Feb-13, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03160-23
PMID:38349142
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研究论文 | 本研究探讨了先前登革热病毒3型感染如何影响恒河猴对寨卡病毒的浆细胞响应 | 本研究揭示了先前登革热病毒感染对后续寨卡病毒感染的抗体反应质量的影响 | 样本量较小,仅包括4只恒河猴 | 理解先前的登革热病毒感染如何影响后续的寨卡病毒免疫反应 | 研究对象为感染过登革热病毒3型的恒河猴 | 免疫学 | 寨卡病毒感染 | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 4只恒河猴 |
14714 | 2024-08-07 |
Decoding the mechanisms of chimeric antigen receptor (CAR) T cell-mediated killing of tumors: insights from granzyme and Fas inhibition
2024-02-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-024-06461-8
PMID:38307835
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研究论文 | 研究揭示了嵌合抗原受体(CAR)T细胞介导的肿瘤杀伤机制,特别是通过抑制粒酶B和Fas的途径 | 发现CAR T细胞杀伤肿瘤的机制具有冗余性,需要同时抑制多个特定于肿瘤细胞的途径 | 研究主要集中在特定的细胞系和特定的抑制剂,可能需要进一步的临床验证 | 提高CAR T细胞治疗癌症的疗效并识别导致肿瘤逃逸的T细胞失败机制 | CAR T细胞、肿瘤细胞、粒酶B抑制剂PI9、Fas途径 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及多种肿瘤细胞系和患者输注产品 |
14715 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics of the immune system in ME/CFS at baseline and following symptom provocation
2024-01-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101373
PMID:38232699
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研究论文 | 本文研究了慢性疲劳综合症 (ME/CFS) 中免疫系统的单细胞转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示ME/CFS患者在基线和剧烈运动后免疫细胞的变化 | 样本大小和特定群体的选择可能限制了研究结果的普遍适用性 | 探讨ME/CFS中免疫系统的失调 | ME/CFS患者与对照组的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性疲劳综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | ME/CFS患者和对照组的免疫细胞样本 |
14716 | 2024-08-07 |
Targeting cell-type-specific, choroid-peripheral immune signaling to treat age-related macular degeneration
2024-01-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101353
PMID:38232696
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了65名包括AMD患者和对照组的外周血单核细胞,并整合现有脉络膜数据,生成AMD中失调的脉络膜-外周免疫交互网络,验证了CYR61在抑制CNV中的作用。 | 首次揭示了CYR61在脉络膜静脉中的上调及其对循环中单核细胞的信号作用,并验证了其在小鼠模型中抑制CNV的作用。 | NA | 旨在通过靶向细胞特异性、脉络膜外周免疫信号来治疗年龄相关性黄斑变性。 | 年龄相关性黄斑变性患者的外周血单核细胞和脉络膜。 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 65名个体 |
14717 | 2024-08-07 |
Melatonin alleviates the toxic effect of di(2-ethylhexyl) phthalate on oocyte quality resulting from CEBPB suppression during primordial follicle formation
2024-03-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132997
PMID:38008054
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研究论文 | 本研究通过建立暴露于邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯(DEHP)和褪黑素的怀孕小鼠模型,利用单细胞转录组技术探讨了褪黑素对卵巢细胞中DEHP影响的缓解作用 | 研究发现褪黑素通过增强CEBPB表达,改善了由DEHP引起的原始卵泡形成过程中的损害,并减少了卵巢细胞的凋亡 | NA | 探讨褪黑素如何缓解DEHP对卵子质量的毒性影响,特别是在原始卵泡形成过程中CEBPB抑制的作用 | 怀孕小鼠及其卵巢细胞 | NA | 生殖健康 | 单细胞转录组技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
14718 | 2024-08-07 |
Defining Endogenous Mitochondrial Transfer in Muscle After Rotator Cuff Injury
2024-02, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/03635465231214225
PMID:38174367
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研究论文 | 研究肩袖损伤后肌肉中纤维脂肪原性前体细胞(FAPs)向肌源性细胞的线粒体横向转移及其对β-激动剂处理的反应 | 描述了一种新的内源性线粒体转移过程,该过程在肩袖损伤后FAPs和肌源性细胞之间发生 | 尚未完全阐明FAPs发挥其有益作用的机制 | 研究FAPs向肌源性细胞的线粒体横向转移,并探讨β-激动剂对此过程的影响 | 纤维脂肪原性前体细胞(FAPs)和肌源性细胞 | NA | 肩袖损伤 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选,流式细胞术,荧光显微镜,旋转盘共聚焦显微镜,双光子显微镜 | NA | RNA | 小鼠模型,C2C12肌母细胞 |
14719 | 2024-08-07 |
Intercellular crosstalk shapes purinergic metabolism and signaling in cancer cells
2024-01-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113643
PMID:38175748
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研究论文 | 本文评估了五种癌症细胞系在常氧和缺氧条件下所有关键嘌呤外酶的酶动力学,并结合单细胞RNA测序数据分析了嘌呤代谢的异质性 | 发现嘌呤代谢在癌症组织中具有空间异质性,且在不同细胞类型间存在差异 | NA | 研究细胞间对话如何影响癌症细胞中的嘌呤代谢和信号传导 | 五种癌症细胞系(霍奇金淋巴瘤、多发性骨髓瘤、胰腺腺癌、膀胱癌和胶质母细胞瘤)的嘌呤外酶酶动力学 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五种癌症细胞系,包括恶性细胞、基质细胞和免疫细胞 |
14720 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Analysis of Lamina Propria Lymphocytes in the Jejunum Reveals Innate Lymphoid Cell-like Cells in Pigs
2024-01-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300463
PMID:37975680
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析猪空肠中的淋巴细胞,发现猪空肠固有层淋巴细胞中存在类似先天淋巴细胞的细胞 | 首次详细描述了猪空肠先天淋巴细胞的基因表达、亚型分类及各种先天淋巴细胞的标记物 | NA | 探索猪肠道黏膜免疫的深入研究 | 猪空肠固有层淋巴细胞中的先天淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 猪空肠中的多种细胞类型 |