单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 14681 - 14700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14681 | 2024-08-04 |
BACH1 promotes tissue necrosis and Mycobacterium tuberculosis susceptibility
2024-Jan, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-023-01523-7
PMID:38066332
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研究论文 | 本文研究了转录因子BACH1在结核分枝杆菌感染中的作用及其对组织坏死的促进作用 | 该研究首次揭示了BACH1作为细胞和组织坏死及宿主对结核分枝杆菌感染抵抗力的关键调节因子 | 本研究主要基于动物模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探索BACH1在结核分枝杆菌感染中的作用及其对宿主抵抗力的影响 | 研究对象为感染结核分枝杆菌的小鼠模型 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 感染结核分枝杆菌的小鼠样本 |
| 14682 | 2024-08-07 |
Data Analysis Pipeline for scRNA-seq Experiments to Study Early Oogenesis
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3698-5_15
PMID:38351456
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研究论文 | 本文介绍了一种用于分析早期卵母细胞发育的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析流程 | 通过使用scRNA-seq技术，能够在单细胞分辨率下解析卵母细胞发育的转录组，克服了传统批量RNA测序中细胞异步分化和高细胞异质性的挑战 | NA | 旨在揭示调控配子发生过程中细胞和分子机制的转录调控机制 | 早期卵母细胞发育的转录组分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 从E11.5到E14.5的小鼠卵巢中生成的scRNA-seq数据 |
| 14683 | 2024-08-07 |
Cross-species analysis of transcriptome emphasizes a critical role of TNF-α in mediating MAP2K7/AKT2 signaling in zearalenone-induced apoptosis
2023-10-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132226
PMID:37549580
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研究论文 | 本研究通过跨物种转录组分析，探讨了玉米赤霉烯酮（ZEN）诱导的细胞凋亡中TNF-α介导的MAP2K7/AKT2信号通路的关键作用 | 首次综合运用比较转录组分析、单细胞转录组分析和加权基因共表达网络分析（WGCNA），结合体内基因敲除和体外RNA干扰技术，揭示了ZEN诱导的细胞凋亡中TNF-α-MAP2K7/AKT2轴的主要信号通路 | NA | 探究ZEN诱导的细胞凋亡机制，并为因ZEN导致的畜牧业和人类生殖健康损失提供新的潜在治疗靶点 | 猪和鼠的颗粒细胞（pGCs和mGCs） | 数字病理学 | 生殖健康风险 | 比较转录组分析、单细胞转录组分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、基因敲除、RNA干扰 | NA | 转录组数据 | 涉及猪和鼠的颗粒细胞 |
| 14684 | 2024-08-04 |
Neural connectivity molecules best identify the heterogeneous clock and dopaminergic cell types in the Drosophila adult brain
2023-02-22, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade8500
PMID:36812309
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研究论文 | 这篇文章研究了果蝇成年脑中时钟和多巴胺细胞类型的异质性 | 首次揭示了成体脑中多巴胺神经元与时钟神经元在基因表达上的相似异质性，并强调了神经连接分子在识别细胞类型中的重要性 | 研究主要集中于果蝇成年大脑的特定神经元类型，结果可能不适用于其他物种或更广泛的神经元类型 | 确定果蝇成体大脑中多巴胺神经元和时钟神经元的异质性及其基因表达特点 | 成年果蝇的大脑多巴胺神经元和时钟神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 成年果蝇的大脑多个神经元群体 |
| 14685 | 2024-08-04 |
Reactive astrogliosis in the era of single-cell transcriptomics
2023, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2023.1173200
PMID:37153637
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综述 | 本文概述了通过单细胞转录组学定义的反应性星形胶质细胞群体在多种神经病理中的作用 | 揭示了反应性星形胶质细胞在神经病理中的多样性及其时间和空间上的不同表达模式 | 未详细探讨特定疾病模型中的机制，可能影响对复杂病理的理解 | 探讨反应性星形胶质细胞在不同神经病理中的作用及其转录组特征 | 反应性星形胶质细胞及其在神经病理中的表现 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多种神经病理的数据集，具体样本量未明确 |
| 14686 | 2024-08-07 |
SpotClean adjusts for spot swapping in spatial transcriptomics data
2022-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-30587-y
PMID:35624112
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpotClean的概率模型，用于调整空间转录组学数据中的点交换伪影，以提供更准确的基因特异性UMI计数估计 | SpotClean模型能够显著改善标记基因分析和聚类效果，特别是在组织区域不易分离的情况下 | NA | 提高空间转录组学实验中下游分析的效力和精度 | 空间转录组学数据中的点交换伪影 | 分子医学 | 癌症 | 空间转录组学 | 概率模型 | 转录组数据 | 数千个点 |
| 14687 | 2024-08-07 |
An Overview on Single-Cell Technology for Hepatocellular Carcinoma Diagnosis
2022-01-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23031402
PMID:35163329
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综述 | 本文综述了单细胞技术在肝细胞癌诊断中的应用 | 单细胞技术能够分析肿瘤组织样本中的每个单细胞，从而深入了解癌症的遗传异质性，有助于识别和评估罕见的细胞群体 | 文章中提到的挑战包括单细胞技术的局限性和实施中的困难 | 促进肝细胞癌的个性化诊断和治疗 | 肝细胞癌的诊断、肿瘤微环境分析、单细胞基因组测序、单细胞转录组学、单细胞组学测序用于生物标志物开发、肝细胞癌的起源和进化 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞技术 | NA | 基因表达模式 | NA |
| 14688 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis with childhood and adult systemic lupus erythematosus
2024-Dec, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2023.2281228
PMID:38347676
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了儿童和成人系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMC）的组成和转录特征 | 首次比较了儿童和成人系统性红斑狼疮患者的PBMC组成和转录变异，并发现了潜在的治疗靶点 | NA | 探讨儿童和成人系统性红斑狼疮患者的PBMC组成和转录特征的差异 | 儿童和成人系统性红斑狼疮患者及健康对照者的PBMC | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 儿童和成人系统性红斑狼疮患者及健康对照者的PBMC样本 |
| 14689 | 2024-08-07 |
Cuproptosis/OXPHOS tendency prediction of prognosis and immune microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma: Bioinformatics analysis and experimental validation
2024-Apr-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148156
PMID:38211899
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了氧化磷酸化（OXPHOS）与铜死亡（cuproptosis）在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的关联及其对预后的影响 | 首次揭示了OXPHOS与ESCC中铜死亡倾向的关系，并构建了铜死亡-OXPHOS预后标志物 | NA | 研究OXPHOS与ESCC中铜死亡倾向的关系及其对预后的影响 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）中的铜死亡和氧化磷酸化 | 生物信息学 | 食管癌 | scRNA-seq | CNN | 单细胞数据 | 10种核心细胞类型 |
| 14690 | 2024-08-07 |
Single cell RNA-sequencing data generated from mouse adipose tissue during the development of obesity
2024-Apr, Data in brief
IF:1.0Q3
DOI:10.1016/j.dib.2024.110119
PMID:38348326
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠附睾脂肪组织在肥胖发展过程中免疫微环境的变化及其细胞类型和基因的变化 | 首次探讨了肥胖早期阶段脂肪组织是否释放促炎细胞因子的问题，并分析了肥胖发展过程中脂肪组织免疫微环境的变化 | NA | 研究肥胖发展过程中脂肪组织的免疫微环境和细胞类型及基因的变化 | 小鼠附睾脂肪组织在肥胖发展过程中的免疫微环境 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 14691 | 2024-08-04 |
Microfluidic platform for omics analysis on single cells with diverse morphology and size: A review
2024-Mar-15, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.342217
PMID:38336406
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综述 | 本文综述了基于微流体的单细胞组学分析及其在形态学和大小多样性上的应用 | 本文的创新之处在于全面概述了基于微流体的单细胞组学最新成就，强调了不同微流体平台的整合及其在以细胞形态为基础的分离中的意义 | 当前缺乏对复杂形态和尺寸细胞的组学信息的综合分析 | 探讨最佳平台技术以解码复杂形态和尺寸细胞的组学数据 | 研究微流体技术在植物和动物单细胞分离中的应用 | 数字病理学 | NA | 微流体技术 | NA | NA | NA |
| 14692 | 2024-08-07 |
Predicting Radiation-Induced Lung Injury in Patients With Lung Cancer: Challenges and Opportunities
2024-Mar-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2023.10.044
PMID:37924986
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研究论文 | 本文探讨了预测肺癌患者放射治疗引发的肺损伤（RILI）的挑战与机遇 | 结合细胞因子评估、γH2AX-白细胞检测或表观遗传标记物等方法，以及使用计算机断层扫描密度测量、氟脱氧葡萄糖正电子发射断层扫描摄取、肺功能测量变化和呼气分析等工具，以更好地定义和量化RILI | RILI缺乏客观定义，且其严重程度的广泛范围和机制仅部分被理解 | 开发新的生物标志物，以更好地预测患者风险并实现个性化治疗决策 | 肺癌患者放射治疗引发的肺损伤 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、质谱细胞术、患者特异性体外细胞培养模型 | NA | 生物标志物 | NA |
| 14693 | 2024-08-07 |
Induction of lung progenitor cell-like organoids by porcine pluripotent stem cells
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302402R
PMID:38334430
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研究论文 | 本研究通过猪多能干细胞诱导生成肺祖细胞样类器官，并探讨了猪肺发育过程中的细胞类型和信号通路 | 首次报道了猪肺细胞的生成和发展，并确定了NKX2.1和FOXA2作为猪肺发育的关键核心转录因子 | NA | 研究猪肺发育和再生 | 猪多能干细胞诱导的肺祖细胞样类器官 | 数字病理学 | 肺部疾病 | scRNA-seq | Monocle算法 | 细胞 | NA |
| 14694 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of aging mouse liver
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202302282R
PMID:38334462
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了衰老小鼠肝脏的分子和细胞过程 | 首次全面分析了衰老过程中肝脏的单细胞转录组变化，揭示了衰老相关的细胞组成和基因表达变化 | NA | 探究衰老对小鼠肝脏的分子和细胞影响 | 衰老小鼠肝脏的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14695 | 2024-08-07 |
Integrated Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Kidney Endothelial Cells
2024-Feb-14, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000320
PMID:38351505
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研究论文 | 本文通过重新处理和整合7个关于人类肾脏控制单细胞/单核RNA测序数据集，构建了一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱 | 首次系统地描述了人类肾脏内皮细胞的异质性，并发现了7个具有不同分子特征和生理功能的内皮细胞亚群 | NA | 构建一个全面的人类肾脏内皮细胞单细胞转录组图谱，以理解这些细胞在疾病、衰老和物种间的变化 | 人类肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞/单核RNA测序 (sc/snRNAseq) | NA | 转录组数据 | 超过200,000个肾脏细胞 |
| 14696 | 2024-08-04 |
vissE: a versatile tool to identify and visualise higher-order molecular phenotypes from functional enrichment analysis
2024-Feb-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05676-y
PMID:38331751
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研究论文 | vissE是一个灵活的网络分析和可视化工具，用于从功能富集分析中识别和可视化高阶分子表型 | 本研究提出的vissE工具通过组织信息和提供多种可视化模块，克服了路径分析中结果冗余的问题 | 未提及具体的限制信息 | 旨在增强分子发现过程中的基因集富集和路径分析工作流程 | 应用vissE于三种不同技术的功能分析，包括乳腺癌的空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14697 | 2024-08-07 |
UPP1 promotes lung adenocarcinoma progression through the induction of an immunosuppressive microenvironment
2024-Feb-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45340-w
PMID:38331898
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研究论文 | 本研究通过综合单细胞RNA测序数据分析，揭示了UPP1通过诱导免疫抑制微环境促进肺腺癌进展的机制 | 首次发现UPP1肿瘤细胞与免疫抑制微环境的关联，并通过多种技术手段验证了UPP1在肺腺癌中的免疫抑制作用 | NA | 深入了解肺腺癌进展的分子机制 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 377,574个细胞来自117名肺腺癌患者样本 |
| 14698 | 2024-08-07 |
Tricarboxylic Acid Cycle Metabolite-Coordinated Biohydrogels Augment Cranial Bone Regeneration Through Neutrophil-Stimulated Mesenchymal Stem Cell Recruitment and Histone Acetylation-Mediated Osteogenesis
2024-Feb-07, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.3c15473
PMID:38284176
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研究论文 | 本文开发了一种由柠檬酸（NaCit, Cit）协同的三羧酸（TCA）循环代谢物修饰的生物仿生水凝胶，显著促进了颅骨再生 | 首次展示了柠檬酸协同的CGG水凝胶通过调节免疫微环境和间充质干细胞命运，有效促进颅骨再生 | NA | 开发新型生物仿生水凝胶以改善颅骨再生 | 颅骨缺陷的再生 | 生物医学工程 | 颅骨疾病 | RNA测序 | NA | 生物材料 | 涉及大鼠和小鼠的颅骨缺陷模型 |
| 14699 | 2024-08-04 |
KIF20B and MET, hub genes of DIAPHs, predict poor prognosis and promote pancreatic cancer progression
2024-Feb, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2023.155046
PMID:38266456
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研究论文 | 这篇文章探讨了KIF20B和MET作为DIAPH基因的中心基因在胰腺癌中的预后和治疗价值 | 研究发现KIF20B和MET的共同下调可以抑制胰腺癌的进展，揭示了其潜在的治疗靶点 | 尚需进一步研究以验证KIF20B和MET联合预后在临床应用中的有效性 | 旨在评估KIF20B和MET在胰腺癌中的预后价值和治疗前景 | 研究对象为胰腺腺癌样本中KIF20B和MET的基因表达 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，质量谱，Co-IP实验 | NA | 基因组数据 | NA |
| 14700 | 2024-08-04 |
In-Depth Genomic Analysis: The New Challenge in Congenital Heart Disease
2024-Feb-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25031734
PMID:38339013
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研究论文 | 本研究通过深度基因组分析探讨先天性心脏病的成因和机制 | 利用下一代测序技术揭示了先天性心脏病（CHD）相关的基因变异和组织发生的通路 | 未提及具体的样本大小和实验设置限制 | 研究先天性心脏病的遗传成因和机制 | 关注先天性心脏病患者及伴随外部异常的基因类群 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 下一代测序 | NA | 基因组数据 | NA |