单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 14641 - 14660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14641 | 2024-08-07 |
Prothioconazole exposure disrupts oocyte maturation and fertilization by inducing mitochondrial dysfunction and apoptosis in mice
2024-03, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究探讨了新型广谱三唑类杀菌剂普托康唑（PTC）对小鼠卵母细胞成熟和受精的影响，发现PTC通过诱导线粒体功能障碍和细胞凋亡来破坏卵母细胞的发育和受精能力 | 首次报道了PTC对卵母细胞发育能力和受精能力的具体影响，包括破坏纺锤体形态、染色体排列、α-微管蛋白乙酰化水平及动粒-微管连接，以及影响精子结合能力和Juno、皮质颗粒和Ovastacin的动态 | 研究主要集中在PTC对卵母细胞的影响，未涉及对其他生殖细胞或整个生殖系统的影响 | 探究PTC对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响 | 小鼠的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 14642 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals a link of ovule abortion and sugar transport in Camellia oleifera
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1274013
PMID:38371413
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了油茶中胚珠流产与糖运输之间的关联 | 首次报道了木本作物卵巢的单细胞转录组图谱，并探讨了胚珠流产可能与胎盘和胚珠中的糖运输有关 | NA | 探讨胚珠流产的机制及其与糖运输的关系 | 油茶的不同胚珠流产率品种的成熟卵巢细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 20,526个高质量细胞 |
| 14643 | 2024-08-07 |
Sputum Transcriptomics Reveals FCN1+ Macrophage Activation in Mild Eosinophilic Asthma Compared to Non-Asthmatic Eosinophilic Bronchitis
2024-Jan, Allergy, asthma & immunology research
DOI:10.4168/aair.2024.16.1.55
PMID:38262391
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研究论文 | 本文通过痰液转录组学分析，比较了轻度嗜酸性哮喘与非哮喘性嗜酸性支气管炎中FCN1+巨噬细胞活化的差异。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了FCN1+巨噬细胞在嗜酸性哮喘中的活化及其与气道重塑过程的关系。 | 研究样本量较小，且未涉及更广泛的哮喘类型和更深入的分子机制探讨。 | 比较嗜酸性哮喘与非哮喘性嗜酸性支气管炎在痰液转录组学层面的差异，探讨其背后的分子机制。 | 嗜酸性哮喘患者、非哮喘性嗜酸性支气管炎患者及健康对照者的痰液细胞。 | 数字病理学 | 哮喘 | RNA测序 | 单细胞RNA测序 | 转录组数据 | 嗜酸性哮喘患者18例，非哮喘性嗜酸性支气管炎患者15例，健康对照者28例 |
| 14644 | 2024-08-07 |
Pyroptosis-Related Subtypes Predict the Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma to Targeted Therapy
2023-12-08, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2812334
PMID:38179741
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研究论文 | 本研究基于焦亡相关基因的共识聚类对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进行分子分型，并探讨其对靶向治疗的反应预测 | 首次揭示了焦亡相关基因在ccRCC中的作用，并基于此开发了预测ccRCC对靶向治疗反应的分子亚型 | NA | 探讨焦亡在透明细胞肾细胞癌进展中的作用，并开发个性化治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，CIBERSORT分析，Lasso回归 | NA | 基因组，转录组，蛋白质 | NA |
| 14645 | 2024-08-07 |
Transcriptional diversity in specific synaptic gene sets discriminates cortical neuronal identity
2023-05-09, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00372-y
PMID:37161421
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研究论文 | 本文通过结合SynGO数据库和单细胞RNA测序数据，研究了小鼠新皮质中神经元细胞类型的转录多样性，并展示了通过突触基因可以有效区分细胞类型。 | 首次系统地识别了大脑中所有突触群体的转录多样性，并发现突触基因在区分细胞类型方面与所有基因具有相同的能力。 | NA | 量化并识别神经元细胞类型的特定突触特征。 | 小鼠新皮质中的神经元细胞类型。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠新皮质中的所有突触群体 |
| 14646 | 2024-08-07 |
A Comparison of the Various Methods for Selecting Features for Single-Cell RNA Sequencing Data in Alzheimer's Disease
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31982-2_27
PMID:37486500
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研究论文 | 本文比较了用于阿尔茨海默病中单细胞RNA测序数据特征选择的不同方法 | 本文采用了专门为单细胞RNA测序设计的特征选择算法，并将其应用于阿尔茨海默病的研究 | NA | 研究旨在评估和比较不同标记基因选择方法在阿尔茨海默病中的性能 | 阿尔茨海默病中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 (SVM), k-最近邻算法 (k-NN), 线性判别分析 (LDA) | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 14647 | 2024-08-07 |
Construction and evaluation of endometriosis diagnostic prediction model and immune infiltration based on efferocytosis-related genes
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1298457
PMID:38370978
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研究论文 | 本研究构建并评估了基于吞噬作用相关基因的子宫内膜异位症诊断预测模型及免疫浸润 | 本研究首次识别并验证了与子宫内膜异位症相关的13个吞噬作用相关差异表达基因，并构建了诊断模型 | 研究主要基于公共数据库和机器学习技术，临床样本验证有限 | 旨在识别子宫内膜异位症的诊断标志物并构建诊断模型 | 子宫内膜异位症及其相关的吞噬作用相关基因 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和SVM回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据库中的数据集 |
| 14648 | 2024-08-07 |
Development of a single-cell atlas for woodland strawberry (Fragaria vesca) leaves during early Botrytis cinerea infection using single cell RNA-seq
2022-Jan-19, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhab055
PMID:35043166
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，构建了林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的单细胞图谱，并分析了不同细胞类型的基因表达模式 | 首次报道了植物病原入侵过程中单细胞转录组景观，为宿主-病原体相互作用的全面动态提供了新见解 | NA | 研究植物在病原体入侵时的防御反应及信号转导过程 | 林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的细胞类型及基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过50,000个单细胞 |
| 14649 | 2024-08-07 |
Single-cell trajectories of melanoma cell resistance to targeted treatment
2021-Oct-01, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了BRAFV600E突变的黑色素瘤细胞系在不同治疗条件下的反应，以探索黑色素瘤细胞对靶向治疗产生耐药性的机制 | 研究首次详细描述了单药和双药治疗耐药黑色素瘤细胞的分子轨迹，并验证了这些发现 | NA | 深入理解黑色素瘤细胞在治疗诱导下的细胞重编程和可塑性，并识别可能与耐药管理相关的靶点 | BRAFV600E突变的黑色素瘤细胞系在不同治疗条件下的反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入和自组织映射 | RNA | 涉及四种治疗条件的黑色素瘤细胞系 |
| 14650 | 2024-08-07 |
EZH2 identifies the precursors of human natural killer cells with trained immunity
2021-Sep-24, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究旨在识别和探索人类自然杀伤细胞（NK细胞）中训练免疫的前体细胞亚群及其调控靶点 | 首次识别出CD57-NKG2A+EZH2+IFNG+MKI67+IL12R+IL15R+IL18R+ NK细胞亚群作为训练免疫的前体细胞，并揭示EZH2在训练免疫诱导中的关键作用 | NA | 识别训练免疫的人类NK细胞前体亚群并探索可能的药物干预调控靶点 | 人类自然杀伤细胞（NK细胞）及其训练免疫特性 | 免疫学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14651 | 2024-08-07 |
Examining heterogeneity of stromal cells in tumor microenvironment based on pan-cancer single-cell RNA sequencing data
2021-Aug-17, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文综述了基于泛癌单细胞RNA测序数据研究肿瘤微环境中基质细胞异质性的研究 | 展示了不同癌症类型中内皮细胞和成纤维细胞/肌成纤维细胞可以被分类为共同亚型，并且亚型组成与癌症特征和治疗反应明显相关 | NA | 评估多种癌症类型中主要细胞类型组成的异质性 | 肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多种癌症类型 |
| 14652 | 2024-08-04 |
Revealing the role of necroptosis microenvironment: FCGBP + tumor-associated macrophages drive primary liver cancer differentiation towards cHCC-CCA or iCCA
2024-Apr, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01908-3
PMID:38017206
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研究论文 | 本文揭示了与坏死性凋亡相关的肿瘤微环境在原发性肝癌分化过程中的作用 | 首次识别了调控坏死性凋亡微环境的特定细胞，并探讨了其对原发性肝癌进展的影响 | 本研究的样本量相对较小，仅涉及4例HCC患者和3例iCCA患者 | 探讨坏死性凋亡微环境如何调节肿瘤细胞转化及其对肝癌的影响 | 研究对象为HCC和iCCA患者的肿瘤微环境中不同细胞的作用 | 数字病理学 | 原发性肝癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 34个样本来自4名HCC患者和3名iCCA患者 |
| 14653 | 2024-08-07 |
Apoptosis-related prognostic biomarkers and potential targets for acute kidney injury based on machine learning algorithm and in vivo experiments
2024-Apr, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01896-4
PMID:37789227
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和体内实验，识别与急性肾损伤（AKI）相关的凋亡相关生物标志物和潜在治疗靶点 | 本研究首次验证了包含三个核心凋亡相关基因（ARGs）的诊断模型，并探讨了这些基因在AKI进展中的作用 | NA | 探索急性肾损伤的诊断生物标志物和治疗靶点 | 急性肾损伤及其相关凋亡基因 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了叶酸和顺铂诱导的AKI小鼠模型 |
| 14654 | 2024-08-07 |
Crosstalk between endothelial cells with a non-canonical EndoMT phenotype and cardiomyocytes/fibroblasts via IGFBP5 aggravates TAC-induced cardiac dysfunction
2024-Mar-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176378
PMID:38309679
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在横断主动脉缩窄（TAC）后两周内识别出经历纤维化分化的内皮细胞，并探讨了这些内皮细胞在病理性心脏重塑中的作用。 | 本研究首次描述了一种非经典的内皮细胞向肌成纤维细胞转化（EndoMT）表型，称为短暂纤维化样表型（EndoFP），并揭示了其在心脏重塑中的关键作用。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未来需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 探讨内皮细胞在心脏纤维化和重塑中的作用及其分子机制。 | 内皮细胞、心肌细胞和成纤维细胞在心脏纤维化过程中的相互作用。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及内皮细胞、心肌细胞和成纤维细胞的单细胞样本 |
| 14655 | 2024-08-04 |
Mapping the cellular landscape of Atlantic salmon head kidney by single cell and single nucleus transcriptomics
2024-Mar, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109357
PMID:38181891
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析大西洋鲑鱼头肾的细胞异质性 | 比较了单细胞RNA-seq和单核RNA-seq两种转录组学方法，以揭示细胞类型及其亚群体的复杂性 | 在单细胞悬液准备过程中，某些细胞类型可能丢失，这影响了对特定细胞群体的全面捕捉 | 研究大西洋鲑鱼头肾中免疫细胞类型及其功能 | 健康的养殖大西洋鲑鱼(Salmo salar)头肾中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq(scRNA-seq)和单核RNA-seq(snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 14,149个细胞转录组和18,067个细胞核转录组 |
| 14656 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of MC1R-inhibited melanocytes
2024-Mar, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13141
PMID:37972124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了MC1R抑制的黑色素细胞，揭示了与黑色素生成和肿瘤转化相关的新基因集。 | 首次定义了MC1R抑制的基因签名（MiGS），并发现TBX3基因在黑色素生成和细胞衰老逃避中的作用。 | NA | 探究MC1R信号减弱如何影响黑色素生成和增加黑色素瘤易感性的机制。 | MC1R抑制的黑色素细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自红色头发颜色（RHC）小鼠模型的黑色素细胞 |
| 14657 | 2024-08-07 |
Adipose tissue macrophage dysfunction is associated with a breach of vascular integrity in NASH
2024-Mar, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.10.039
PMID:37977244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者内脏脂肪组织中的脂肪组织巨噬细胞（ATM）异质性，并探讨了其在NAFLD进展中的作用及其与血管完整性丧失的关系。 | 首次在单细胞水平上描述了人类内脏脂肪组织中的髓系细胞景观，并揭示了非酒精性脂肪肝炎（NASH）特异性的代谢活性巨噬细胞（MMacs）和血管相关巨噬细胞（ResVAMs）的转录变化及其在血管周围的定位。 | NA | 评估脂肪组织巨噬细胞在NAFLD患者中的异质性，并探讨其在NAFLD进展中的作用及其与血管完整性丧失的关系。 | 内脏脂肪组织中的巨噬细胞及其在NAFLD中的作用。 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质水平数据 | 来自瘦和肥胖患者的内脏脂肪组织巨噬细胞，根据NAFLD表型进行分层。 |
| 14658 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome landscape of zebrafish liver reveals hepatocytes and immune cell interactions in understanding nonalcoholic fatty liver disease
2024-Mar, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109428
PMID:38325594
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了斑马鱼肝脏的转录组图谱，揭示了肝细胞与免疫细胞在非酒精性脂肪肝病发展中的相互作用 | 首次构建了斑马鱼肝脏的单细胞转录组图谱，并揭示了肝细胞与免疫细胞在非酒精性脂肪肝病中的相互作用 | NA | 研究非酒精性脂肪肝病中肝细胞与免疫细胞的相互作用 | 斑马鱼肝脏中的肝细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及10种细胞类型 |
| 14659 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis dissects lncRNA-associated gene networks in Arabidopsis
2024-Feb-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100717
PMID:37715446
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了拟南芥中长非编码RNA（lncRNA）相关的基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下绘制了lncRNA及其相关基因调控网络的转录异质性图谱 | NA | 探索植物lncRNA生物学中的单细胞数据整合分析能力，并深入了解lncRNA表达特异性和相关基因调控 | 拟南芥中的lncRNA及其相关基因调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 28个已发表的单细胞RNA测序数据集 |
| 14660 | 2024-08-07 |
Systems Analysis of Immune Changes after B-cell Depletion in Autoimmune Multiple Sclerosis
2024-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.576204
PMID:38370778
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了B细胞耗竭后在多发性硬化症患者中免疫景观的变化 | 首次全面揭示了B细胞耗竭治疗多发性硬化症后免疫细胞类型特异性变化及其功能影响 | NA | 探索B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的影响 | 多发性硬化症患者的免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 |