单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 14621 - 14640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14621 | 2024-08-07 |
Gut microbiome dysbiosis in men who have sex with men increases HIV infection risk through immunity homeostasis alteration
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1260068
PMID:38035339
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研究论文 | 本研究旨在比较HIV感染者与男男性行为者（MSM）肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | 本研究首次揭示了MSM相关肠道微生物群失调通过影响免疫稳态增加HIV感染风险 | 需要进一步研究阐明MSM肠道微生物群失调调节HIV易感性的机制 | 比较HIV感染者与MSM肠道微生物群变化的差异，并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | HIV感染者与男男性行为者（MSM）的肠道微生物群 | NA | HIV感染 | 生物信息学技术，单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因和代谢物数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14622 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals common and unique gene expression profiles in primary CD4+ T cells latently infected with HIV under different conditions
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1286168
PMID:38156317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的基因表达谱 | 研究揭示了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的共同和独特基因表达模式 | NA | 识别潜伏感染HIV的单个CD4+ T细胞的基因表达谱，并探索这些基因表达谱以优先考虑未来实验验证的基因 | 潜伏感染HIV的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14623 | 2024-08-07 |
The epigenetic basis of cellular heterogeneity
2021-04, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-00300-0
PMID:33244170
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序方法揭示的细胞间基因表达水平的异质性，并分析了表观遗传信息如染色质可及性、核小体定位、组蛋白尾部修饰和增强子-启动子相互作用对基因表达调控的影响。 | 本文介绍了单细胞表观基因组分析方法的最新进展，这些方法能够高分辨率地映射单个细胞中的染色质状态。 | NA | 研究细胞间基因表达异质性的表观遗传基础。 | 研究对象包括单细胞测序数据、染色质状态及其对基因表达的影响。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 14624 | 2024-08-04 |
Mapping the developmental potential of mouse inner ear organoids at single-cell resolution
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109069
PMID:38375227
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研究论文 | 本文使用单细胞测序研究小鼠内耳类器官的细胞异质性 | 本研究揭示了支持细胞亚型和耳蜗样及前庭样毛细胞的发展轨迹 | 尚未明确改进突触连接和区域特异性的未来策略 | 研究内耳类器官的发育潜能及其对基本科学研究的应用 | 小鼠内耳类器官的感官上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | late-stage小鼠内耳类器官的细胞 |
| 14625 | 2024-08-07 |
SinCMat: A single-cell-based method for predicting functional maturation transcription factors
2024-Feb-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.12.006
PMID:38215756
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research paper | 本文开发了一种基于单细胞RNA测序的计算方法SinCMat，用于预测细胞功能成熟转录因子 | SinCMat是首个专门考虑功能细胞成熟过程的方法，通过识别身份转录因子和信号依赖转录因子的配对，共同靶向驱动功能成熟的基因 | NA | 旨在生成组织特异性成熟和功能细胞的再生医学的主要目标 | 细胞功能成熟转录因子 | natural language processing | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 大规模应用于Mouse Cell Atlas和Tabula Sapiens |
| 14626 | 2024-08-04 |
A comprehensive pan-cancer analysis of prognostic value and potential clinical implications of FTH1 in cancer immunotherapy
2024-Jan-28, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03625-x
PMID:38281198
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研究论文 | 本文系统探讨了FTH1在癌症免疫疗法中的预后意义和免疫角色 | 本研究揭示了FTH1在肿瘤免疫微环境中的重要作用及其与免疫疗法抵抗之间的关联 | 本文未明确评估不同类型肿瘤对FTH1表达的影响及其潜在机制 | 探讨FTH1在多种癌症免疫治疗中的预后价值和临床潜力 | 探究FTH1作为各种实体癌免疫治疗靶点的潜力 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析和多重免疫荧光染色技术 | NA | NA | NA |
| 14627 | 2024-08-04 |
Integrating bulk-RNA sequencing and single-cell sequencing analyses to characterize adenosine-enriched tumor microenvironment landscape and develop an adenosine-related prognostic signature predicting immunotherapy in lung adenocarcinoma
2024-Jan-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01281-z
PMID:38265702
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研究论文 | 该文章探讨了腺苷信号在肺腺癌肿瘤微环境中的生物学作用，并开发了与腺苷相关的预后特征。 | 文章创新点在于量化腺苷信号，并建立了腺苷相关的预后特征，预测免疫治疗的有效性。 | 数据分析主要集中在腺苷信号与免疫微环境的关系，可能未涵盖其他重要的生物标志物。 | 探讨腺苷信号在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其在免疫治疗中的预后价值。 | 研究对象为肺腺癌样本中的腺苷信号和肿瘤免疫微环境。 | 数字病理学 | 肺癌 | bulk-RNA测序和单细胞测序 | NA | 样本数据 | LUAD样本的具体样本数量未提及 |
| 14628 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptional heterogeneity of Tbx18-positive cardiac cells during heart development
2024-Jan-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01290-6
PMID:38265516
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了Tbx18阳性心脏细胞在心脏发育过程中的转录异质性 | 首次全面揭示了Tbx18阳性心脏细胞在发育过程中的转录景观和细胞异质性 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据，未涉及实验验证 | 探索Tbx18阳性心脏细胞在心脏发育过程中的异质性和转录景观 | Tbx18阳性心脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了已发表的小鼠心脏单细胞RNA测序数据 |
| 14629 | 2024-08-04 |
Transcription Factor IRF7 is Involved in Psoriasis Development and Response to Guselkumab Treatment
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S450048
PMID:38375022
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子IRF7在银屑病发生和guselkumab治疗反应中的作用 | 该研究首次确认了IRF7在银屑病及其对guselkumab治疗反应中的重要性 | 研究可能在样本数量和多样性上存在局限性 | 研究银屑病病因及guselkumab治疗的新治疗策略 | 针对银屑病患者的基因表达及单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对12周guselkumab治疗前后的银屑病皮肤样本进行分析 |
| 14630 | 2024-08-04 |
Modelling the distinct roles of epithelial and stromal androgen receptor in the regulation of prostate epithelial dynamics
2023-Nov, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16900
PMID:37424435
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研究论文 | 本文提出了一个简单的概念框架，阐述了雄激素在前列腺细胞动态中的调控作用 | 提出了基于框架的数学模型，定量拟合了描述前列腺回退和再生的实验数据 | 该模型的复杂性可能不足以全面描述健康和疾病前列腺的所有动态 | 探讨雄激素在前列腺上皮动态调控中的作用及机制 | 前列腺上皮及其微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 实验数据 | NA |
| 14631 | 2024-08-07 |
Immune checkpoint inhibitor-induced colitis is mediated by polyfunctional lymphocytes and is dependent on an IL23/IFNγ axis
2023-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41798-2
PMID:37872166
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研究论文 | 研究免疫检查点抑制剂（CPIs）引起的结肠炎，通过分析小鼠模型中的免疫细胞和分子机制 | 首次揭示了CPIs引起的结肠炎依赖于IL23/IFNγ轴和多功能的淋巴细胞 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探究免疫检查点抑制剂引起的结肠炎的机制，并寻找可能的治疗策略 | 免疫检查点抑制剂引起的结肠炎及其相关免疫细胞和分子机制 | 免疫学 | 结肠炎 | RNA测序，单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 14632 | 2024-08-04 |
Meta-Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data Reveals the Mechanism of Formation and Heterogeneity of Tertiary Lymphoid Organ in Vascular Disease
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318762
PMID:37589134
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meta-analysis | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了血管疾病中三级淋巴器官的形成机制及其异质性 | 首次系统性研究了血管疾病模型中三级淋巴器官的存在及其生长环境 | 未详细描述不同血管疾病模型各自的具体机制 | 探索不同血管疾病中三级淋巴器官的存在及其形成机制 | 分析28个单细胞RNA测序数据集，涉及5种血管疾病模型 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 28个单细胞RNA测序数据集 |
| 14633 | 2024-08-07 |
The parenting hub of the hypothalamus is a focus of imprinted gene action
2023-10, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010961
PMID:37856383
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研究论文 | 本文通过系统生物学方法，利用单细胞RNA测序数据，研究了印记基因在调控亲代行为中的作用，特别是在下丘脑的亲代行为中枢中的表达情况。 | 首次发现并验证了印记基因Magel2在下丘脑亲代行为中枢中的表达，及其对亲代行为的调控作用。 | 研究仅限于Magel2基因，未涵盖所有印记基因在亲代行为中的作用。 | 探讨印记基因在调控亲代行为中的作用及其在下丘脑亲代行为中枢中的表达。 | 印记基因Magel2及其在下丘脑亲代行为中枢中的表达和功能。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | Magel2-null(+/p)小鼠的母鼠、父鼠和未交配雌鼠 |
| 14634 | 2024-08-04 |
Core conserved transcriptional regulatory networks define the invasive trophoblast cell lineage
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201826
PMID:37417811
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研究论文 | 该研究探讨了老鼠和人类侵袭性滋养层细胞谱系的转录调控网络 | 首次整合了单核ATAC-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了跨物种的基因调控相似性 | 该研究主要集中于老鼠模型，可能无法完全代表人类系统 | 研究侵袭性滋养层细胞的调控机制及其在妊娠中的作用 | 老鼠的侵袭性滋养层细胞及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq和RNA-seq | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量，涉及孕期15.5天和19.5天的老鼠子宫-胎盘界面组织 |
| 14635 | 2024-08-04 |
Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad029
PMID:36727460
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研究论文 | 本研究探讨了JPX和FTX同源基因对XIST的物种特异性调控 | 揭示了人类和小鼠之间JPX对XIST表达的调控差异，尽管其主要序列没有保守性 | 本研究主要集中于人类和小鼠的比较，可能无法推广到其他物种 | 研究X染色体失活过程中XIST的调控机制及其在不同物种中的功能保守性 | 主要研究FTX和JPX这两个lncRNA基因在不同物种中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 分析了早期人类胚胎发育中单细胞的RNA-seq数据以及小鼠的多能干细胞或分化后细胞 |
| 14636 | 2024-08-07 |
Comparing engineered nuclear-localized reporter cassettes
2023, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.001014
PMID:38021170
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研究论文 | 本文通过CRISPR/Cas9基因编辑技术，为6种不同的神经肽编码基因生成了报告基因等位基因，并比较了不同报告基因盒的表达水平 | 首次比较了不同核定位报告基因盒在神经肽基因表达分析中的应用效果 | NA | 分析神经肽基因表达的动态变化及其调控机制 | 6种不同的神经肽编码基因 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因表达数据 | 6种不同的神经肽编码基因 |
| 14637 | 2024-08-07 |
Single cell multi-omics characterise discrete human tendon cells populations that persist in vitro and on fibrous scaffolds
2022-08-02, European cells & materials
IF:3.2Q1
DOI:10.22203/eCM.v044a01
PMID:35916474
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研究论文 | 本文通过单细胞表面蛋白质组学和无偏倚的单细胞转录组学（CITE-Seq）技术，研究了体外培养的健康人腿筋成纤维细胞在组织培养塑料或可吸收聚二恶烷酮电纺纤维上的持久性及其细胞亚群特征。 | 首次使用CITE-Seq技术结合单细胞表面蛋白质组学，识别并描述了体外培养的人类腱细胞的多个离散亚群及其在电纺纤维上的生存情况。 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内环境，且样本量较小，可能影响结果的普遍性。 | 旨在识别和分离关键的致病性和修复性细胞，以开发精准治疗和可植入材料，改善腱愈合。 | 健康人腿筋成纤维细胞及其在不同培养条件下的细胞亚群。 | 数字病理学 | 腱病 | CITE-Seq | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 14638 | 2024-08-07 |
XIAP restrains TNF-driven intestinal inflammation and dysbiosis by promoting innate immune responses of Paneth and dendritic cells
2021-Nov-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf7235
PMID:34739338
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研究论文 | 本文研究了XIAP蛋白在抑制TNF驱动的肠道炎症和菌群失调中的作用，通过促进潘氏细胞和树突状细胞的先天免疫反应 | 首次揭示了XIAP通过调节TLR5和TNFR2信号通路，维持潘氏细胞和树突状细胞的功能，从而防止肠道炎症和菌群失调 | NA | 探究XIAP在肠道炎症和菌群失调中的作用机制 | XIAP缺陷小鼠和XLP2患者样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | XIAP缺陷小鼠和XLP2患者样本 |
| 14639 | 2024-08-07 |
GLP-1 receptor signaling increases PCSK1 and β cell features in human α cells
2021-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.141851
PMID:33554958
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研究论文 | 研究探讨了GLP-1受体信号如何增加人α细胞中的PCSK1表达及β细胞特征 | 首次展示了GLP-1受体激动剂liraglutide在人胰岛中通过DART-Seq技术增加α细胞PC1/3 mRNA表达的效果，并发现这一过程与β细胞样基因表达增加相关 | 研究主要集中在α细胞的特定亚群，可能未涵盖所有α细胞的反应 | 揭示α细胞PC1/3表达激活的机制，为糖尿病治疗提供新靶点 | 人胰岛中的α细胞和β细胞 | NA | 糖尿病 | scRNA-seq | NA | RNA | 研究涉及人胰岛和小鼠模型 |
| 14640 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of equine mesenchymal stromal cells from primary donor-matched tissue sources reveals functional heterogeneity in immune modulation and cell motility
2020-12-04, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-02043-5
PMID:33276815
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了从马的三种不同组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）获得的间充质干细胞，揭示了这些细胞在免疫调节和细胞迁移功能上的异质性 | 首次在马的间充质干细胞中使用单细胞RNA测序技术，并结合功能实验验证了转录差异与细胞迁移和免疫调节功能的关系 | NA | 研究间充质干细胞的异质性及其对治疗潜力的影响 | 马的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从三种植入匹配的组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）收集的马间充质干细胞 |