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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 14581 - 14600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14581 | 2024-08-27 |
Dirichlet process mixture models for single-cell RNA-seq clustering
2022-04-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.059001
PMID:35237784
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研究论文 | 本文比较了贝叶斯隐狄利克雷分配（LDA）方法与其非参数对应方法——分层狄利克雷过程（HDP）在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据聚类中的应用 | 首次详细比较了LDA和HDP在scRNA-seq数据聚类中的性能 | LDA和HDP的性能依赖于数据集，且HDP有时会过度细分聚类 | 提高单细胞RNA测序数据分析中定义有意义聚类分辨率的过程 | 比较LDA和HDP在scRNA-seq数据聚类中的性能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 隐狄利克雷分配（LDA），分层狄利克雷过程（HDP） | 基因表达数据 | 四个scRNA-seq数据集（免疫细胞、肾脏、胰腺和绒毛膜/胎盘） | NA | NA | NA | NA |
| 14582 | 2024-08-27 |
Explainable multiview framework for dissecting spatial relationships from highly multiplexed data
2022-04-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02663-5
PMID:35422018
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研究论文 | 本文介绍了MISTy框架，一个灵活、可扩展且可解释的机器学习框架，用于从高度多重化的空间组学数据中提取关系 | MISTy框架通过构建多个关注不同空间或功能上下文的视图来解析不同效应 | NA | 开发一种可扩展的方法，利用空间信息从高度多重化的空间技术中提取关系 | 高度多重化的空间组学数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | NA | 机器学习框架 | 空间组学数据 | 数十到数千个测量标记 | NA | NA | NA | NA |
| 14583 | 2024-08-27 |
Identification of germline monoallelic mutations in IKZF2 in patients with immune dysregulation
2022-04-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021006367
PMID:34920454
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研究论文 | 本文报道了在免疫失调患者中发现的IKZF2基因的种系单等位基因突变，并探讨了这些突变对人类造血和免疫功能的影响 | 首次鉴定出IKZF2基因的种系突变，并揭示了这些突变导致T滤泡辅助细胞和NK细胞数量减少以及免疫功能障碍的机制 | NA | 研究IKZF2基因种系突变对人类造血和免疫功能的影响 | 患有系统性红斑狼疮、免疫性血小板减少症或EBV相关噬血细胞性淋巴组织细胞增生症的患者 | 免疫学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序，蛋白质组分析 | NA | RNA，蛋白质 | 6名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 14584 | 2024-08-27 |
Single-cell transcriptomic analysis of the immune cell landscape in the aged mouse brain after ischemic stroke
2022-Apr-07, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02447-5
PMID:35392936
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了老年小鼠脑部缺血性中风后的免疫细胞景观 | 首次在单细胞分辨率下描绘了老年中风脑部的免疫细胞群体，并发现至少6种微胶质细胞亚型，包括一种潜在的中风特异性亚型 | NA | 旨在确定中风如何影响老年脑部的免疫细胞群体 | 老年小鼠脑部缺血性中风后的免疫细胞 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 分子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14585 | 2024-08-27 |
Characterization of the treatment-naive immune microenvironment in melanoma with BRAF mutation
2022-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-004095
PMID:35383113
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研究论文 | 本研究探讨了BRAF突变型黑色素瘤在未经治疗情况下的免疫微环境特征，并分析了其与免疫检查点阻断疗法反应差异的关系。 | 首次详细描述了BRAF突变型黑色素瘤在未经治疗情况下的免疫微环境特征，并探讨了其与免疫疗法反应差异的潜在机制。 | 研究主要基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，可能需要更多实验验证和临床数据支持。 | 探讨BRAF突变型黑色素瘤的免疫微环境特征及其与免疫疗法反应差异的关系。 | BRAF突变型和野生型黑色素瘤患者的免疫微环境。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | RNA | 涉及BRAF突变型和野生型黑色素瘤患者的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14586 | 2024-08-27 |
Clinical and translational values of spatial transcriptomics
2022-04-01, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-022-00960-w
PMID:35365599
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研究论文 | 本文综述了空间转录组学（ST）的发展及其与单细胞RNA测序（scRNA-seq）结合在理解分子发病机制和发现疾病特异性生物标志物中的临床和转化价值 | 结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了人类组织病理表型与分子改变之间的联系，定义了细胞间分子通信和时空分子医学知识 | 讨论了基于测序和基于成像技术的优缺点，并强调了空间转录组学面临的机会和挑战 | 评估空间转录组学在理解分子发病机制和发现疾病特异性生物标志物中的临床和转化价值 | 空间转录组学技术及其在神经学、胚胎发育、肿瘤学和炎症等领域的应用 | 分子医学 | NA | 空间转录组学（ST），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14587 | 2024-08-27 |
Single Cell RNA Sequencing Identifies a Unique Inflammatory Macrophage Subset as a Druggable Target for Alleviating Acute Kidney Injury
2022-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202103675
PMID:35112806
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，在缺血再灌注损伤诱导的急性肾损伤（IRI-AKI）小鼠模型中，识别出一种独特的炎症性巨噬细胞亚群S100a9 Ly6c IMs，并探讨了其作为药物靶点缓解AKI的潜力。 | 首次在IRI-AKI模型中识别出S100a9 Ly6c IMs这一早期响应AKI的独特巨噬细胞亚群，并验证了针对S100A8/A9信号通路的小分子抑制剂在保护肾脏功能和减少炎症反应方面的效果。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类AKI中进行临床试验验证。 | 探索急性肾损伤的治疗新策略，特别是通过靶向特定巨噬细胞亚群来调节炎症反应。 | 急性肾损伤（AKI）中的巨噬细胞异质性及其在炎症和组织修复中的作用。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠IRI模型中的单核吞噬细胞系统 | NA | NA | NA | NA |
| 14588 | 2024-08-27 |
Ontogeny and Vulnerabilities of Drug-Tolerant Persisters in HER2+ Breast Cancer
2022-04-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1265
PMID:34911733
|
研究论文 | 研究探讨了HER2阳性乳腺癌中药物耐受持久细胞（DTP）的发育及其脆弱性 | 首次详细描述了HER2酪氨酸激酶抑制剂暴露后DTP的特征，并揭示了其通过雌激素受体依赖性诱导SGK3来重塑PI3K/AKT/mTORC1通路以实现AKT非依赖性mTORC1激活的机制 | NA | 研究HER2阳性乳腺癌中药物耐受持久细胞的特性和耐药机制 | HER2阳性乳腺癌细胞及其对酪氨酸激酶抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 慢病毒条码/单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 14589 | 2024-08-27 |
Spatial CRISPR genomics identifies regulators of the tumor microenvironment
2022-03-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.02.015
PMID:35290801
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研究论文 | 本文开发了一种名为Perturb-map的空间功能基因组学方法，用于在肺肿瘤小鼠模型中并行敲除多个基因，并评估这些敲除对肿瘤生长、组织病理学和免疫组成的影响。 | Perturb-map方法能够在保持空间结构的同时，以单细胞分辨率进行组织内的功能基因组学研究。 | NA | 探索CRISPR筛选技术在识别组织环境中细胞外基因功能方面的应用。 | 肺肿瘤小鼠模型中的基因敲除及其对肿瘤微环境的影响。 | 数字病理学 | 肺癌 | CRISPR | NA | 基因组数据 | 数十个基因在小鼠模型中被敲除 | NA | NA | NA | NA |
| 14590 | 2024-08-27 |
Single-cell genomics revolutionizes plant development studies across scales
2022-03-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200179
PMID:35285482
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在植物发育研究中的应用及其技术发展 | 介绍了单细胞和单核分离技术在植物物种中的广泛应用，以及这些技术如何促进了植物器官中单细胞基因组学的研究 | NA | 强调单细胞基因组学在揭示植物器官内不同细胞类型发育轨迹中的贡献，并展示单细胞水平上组织和器官比较分析的努力 | 植物的组织、器官和整个生物体的发育 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14591 | 2024-08-27 |
Precision medicine in rheumatoid arthritis
2022-03, Best practice & research. Clinical rheumatology
DOI:10.1016/j.berh.2022.101742
PMID:35248489
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综述 | 本文综述了类风湿性关节炎（RA）的病理新见解，并讨论了将这些发现转化为临床实践中的可操作变化的关键步骤 | 应用单细胞转录组学和空间转录组学等细胞分析技术，揭示了RA关节组织中新的致病细胞类型和患者间细胞组成的显著异质性 | NA | 旨在强调RA病理学的新见解，并讨论将这些发现转化为临床实践中的可操作变化的关键步骤 | 类风湿性关节炎的病理机制及临床应用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14592 | 2024-08-27 |
Computational exploration of cellular communication in skin from emerging single-cell and spatial transcriptomic data
2022-02-28, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20210863
PMID:35191953
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学和空间转录组学数据推断细胞间通信的计算工具，并强调了这些工具在探索皮肤发育、稳态、疾病和衰老中的细胞通信方面的生物学见解 | 利用空间转录组学数据结合细胞间通信分析，为理解组织结构和功能提供了新的方向 | 单细胞转录组学数据 inherently 丢失了细胞的空间信息 | 探索细胞间通信在组织发育和稳态中的作用 | 皮肤中的细胞间通信机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14593 | 2024-08-27 |
Single-cell eQTL analysis of activated T cell subsets reveals activation and cell type-dependent effects of disease-risk variants
2022-02-25, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abm2508
PMID:35213211
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研究论文 | 本文通过激活来自89名健康供体的CD4 T细胞并进行单细胞RNA测序，研究了遗传变异在细胞类型特异性和激活依赖性效应中的作用。 | 首次在单细胞水平上探讨了遗传变异对激活T细胞亚群的影响，并发现了新的疾病风险变异基因关联。 | 研究样本仅限于健康供体，可能限制了对疾病相关遗传变异效应的全面理解。 | 探索遗传变异在生物学相关背景下对细胞的影响。 | CD4 T细胞及其亚群。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 89名健康供体的CD4 T细胞，超过100万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 14594 | 2024-08-27 |
Single-Cell RNA Sequencing of Urinary Cells Reveals Distinct Cellular Diversity in COVID-19-Associated AKI
2022-01-27, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0005522021
PMID:35368565
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了COVID-19相关急性肾损伤患者的尿液细胞，揭示了其细胞多样性和基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术非侵入性地研究COVID-19相关急性肾损伤的细胞变化，并提供了尿液膀胱细胞直接被SARS-CoV-2感染的初步证据 | 样本量较小，且仅包括住院患者 | 探究COVID-19相关急性肾损伤在尿液细胞中的表现和机制 | COVID-19相关急性肾损伤患者的尿液细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 共分析了30,076个细胞，来自8名COVID-19患者和4名非COVID-19急性肾损伤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 14595 | 2024-08-27 |
Loss of Function of the Neural Cell Adhesion Molecule NrCAM Regulates Differentiation, Proliferation and Neurogenesis in Early Postnatal Hypothalamic Tanycytes
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.832961
PMID:35464310
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研究论文 | 本文研究了神经细胞粘附分子NrCAM在早期新生小鼠下丘脑tanycytes中的功能丧失对分化、增殖和神经发生的影响 | 首次提供了NrCAM在成年小鼠tanycytes中调控作用的证据，并使用单细胞RNA测序技术揭示了tanycyte特异性基因表达的变化 | NrCAM缺陷小鼠中观察到的tanycyte减少和标记物丢失仅与轻微的代谢表型相关，可能需要进一步研究以揭示更深层次的影响 | 探讨NrCAM在tanycytes中的功能及其对细胞稳态的调控作用 | 下丘脑tanycytes及NrCAM的功能 | 神经科学 | NA | 免疫组织化学分析、杂交分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠及E16胚胎小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 14596 | 2024-08-27 |
Next-Generation and Single-Cell Sequencing Approaches to Study Atherosclerosis and Vascular Inflammation Pathophysiology: A Systematic Review
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.849675
PMID:35419441
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综述 | 本文综述了利用单细胞和下一代测序技术研究动脉粥样硬化和血管炎症病理生理学的现有数据 | 单细胞和下一代测序方法提供了比以往方法更高分辨率的阐明动脉粥样硬化的新手段 | 研究主要集中在平滑肌细胞、巨噬细胞和干细胞/祖细胞对疾病的贡献上，而对其他细胞类型如淋巴细胞和内皮细胞的贡献关注较少 | 旨在全面评估利用单细胞和下一代测序技术发表的数据，以识别动脉粥样硬化和血管炎症的关键细胞和分子贡献 | 动脉粥样硬化和血管炎症的病理生理学 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序和下一代测序 | NA | 基因组数据 | 34项研究符合叙事综合分析，其中16篇文章仅使用单细胞测序，10篇使用下一代测序，8篇使用这两种方法的组合 | NA | NA | NA | NA |
| 14597 | 2024-08-27 |
Analysis of Half a Billion Datapoints Across Ten Machine-Learning Algorithms Identifies Key Elements Associated With Insulin Transcription in Human Pancreatic Islet Cells
2022, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2022.853863
PMID:35399953
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研究论文 | 本研究通过分析超过4.9亿个数据点，比较了10种不同的机器学习工作流程，以识别与人类胰腺单细胞转录组中胰岛素转录相关基因 | 本研究首次在大规模数据集上比较了多种机器学习算法，特别是随机森林算法显示出高预测能力和敏感性 | NA | 比较不同机器学习工作流程在大数据分析中的表现，并识别与胰岛素转录相关的关键元素 | 人类胰腺单细胞转录组数据 | 机器学习 | 糖尿病 | 机器学习 | 随机森林 | 转录组数据 | 训练数据集包含11,652个样本，验证数据集包含2,913个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 14598 | 2024-08-27 |
Inference of high-resolution trajectories in single-cell RNA-seq data by using RNA velocity
2021-10-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2021.100095
PMID:35474895
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellPath的方法，通过整合单细胞基因表达和RNA速度信息来推断细胞轨迹 | CellPath方法能够发现多条高分辨率的轨迹，不受轨迹结构的限制，并能自动检测每条轨迹路径的方向 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据中细胞发育轨迹推断的准确性和细节 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | RNA速度 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14599 | 2024-08-27 |
Regulation of cancer stem cells in triple negative breast cancer
2021, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2020.106
PMID:35582030
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌中癌症干细胞的调控机制 | 聚焦于三阴性乳腺癌特有的机制，这些机制促进了自我更新癌症干细胞的扩张和活性 | NA | 探讨三阴性乳腺癌中癌症干细胞的特定机制及其对临床结果的影响 | 三阴性乳腺癌中的癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14600 | 2024-08-27 |
The need to reassess single-cell RNA sequencing datasets: the importance of biological sample processing
2021, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.54864.2
PMID:35399227
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研究论文 | 本文重新分析了迄今为止最大的单细胞RNA测序数据集，探讨了细胞数量增加对分析结果的影响 | 提出了对当前科学界普遍认为的“越多越好”方法的质疑，指出大规模数据集可能导致分析结果的偏差 | 文章指出大规模数据集可能由于长时间的计算处理时间而影响分析的深度 | 旨在通过分析大规模单细胞RNA测序数据集，识别健康成人皮肤中先前描述的成纤维细胞亚群 | 健康成人皮肤中的成纤维细胞亚群 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 无监督群体匹配算法 | 转录组数据 | 528,253个测序细胞 | NA | NA | NA | NA |