单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 14581 - 14600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14581 | 2024-08-04 |
Revealing the role of necroptosis microenvironment: FCGBP + tumor-associated macrophages drive primary liver cancer differentiation towards cHCC-CCA or iCCA
2024-Apr, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01908-3
PMID:38017206
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研究论文 | 本文揭示了与坏死性凋亡相关的肿瘤微环境在原发性肝癌分化过程中的作用 | 首次识别了调控坏死性凋亡微环境的特定细胞，并探讨了其对原发性肝癌进展的影响 | 本研究的样本量相对较小，仅涉及4例HCC患者和3例iCCA患者 | 探讨坏死性凋亡微环境如何调节肿瘤细胞转化及其对肝癌的影响 | 研究对象为HCC和iCCA患者的肿瘤微环境中不同细胞的作用 | 数字病理学 | 原发性肝癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 34个样本来自4名HCC患者和3名iCCA患者 |
| 14582 | 2024-08-07 |
Apoptosis-related prognostic biomarkers and potential targets for acute kidney injury based on machine learning algorithm and in vivo experiments
2024-Apr, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01896-4
PMID:37789227
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和体内实验，识别与急性肾损伤（AKI）相关的凋亡相关生物标志物和潜在治疗靶点 | 本研究首次验证了包含三个核心凋亡相关基因（ARGs）的诊断模型，并探讨了这些基因在AKI进展中的作用 | NA | 探索急性肾损伤的诊断生物标志物和治疗靶点 | 急性肾损伤及其相关凋亡基因 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了叶酸和顺铂诱导的AKI小鼠模型 |
| 14583 | 2024-08-07 |
Crosstalk between endothelial cells with a non-canonical EndoMT phenotype and cardiomyocytes/fibroblasts via IGFBP5 aggravates TAC-induced cardiac dysfunction
2024-Mar-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2024.176378
PMID:38309679
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在横断主动脉缩窄（TAC）后两周内识别出经历纤维化分化的内皮细胞，并探讨了这些内皮细胞在病理性心脏重塑中的作用。 | 本研究首次描述了一种非经典的内皮细胞向肌成纤维细胞转化（EndoMT）表型，称为短暂纤维化样表型（EndoFP），并揭示了其在心脏重塑中的关键作用。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未来需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 探讨内皮细胞在心脏纤维化和重塑中的作用及其分子机制。 | 内皮细胞、心肌细胞和成纤维细胞在心脏纤维化过程中的相互作用。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及内皮细胞、心肌细胞和成纤维细胞的单细胞样本 |
| 14584 | 2024-08-04 |
Mapping the cellular landscape of Atlantic salmon head kidney by single cell and single nucleus transcriptomics
2024-Mar, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109357
PMID:38181891
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析大西洋鲑鱼头肾的细胞异质性 | 比较了单细胞RNA-seq和单核RNA-seq两种转录组学方法，以揭示细胞类型及其亚群体的复杂性 | 在单细胞悬液准备过程中，某些细胞类型可能丢失，这影响了对特定细胞群体的全面捕捉 | 研究大西洋鲑鱼头肾中免疫细胞类型及其功能 | 健康的养殖大西洋鲑鱼(Salmo salar)头肾中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq(scRNA-seq)和单核RNA-seq(snRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 14,149个细胞转录组和18,067个细胞核转录组 |
| 14585 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of MC1R-inhibited melanocytes
2024-Mar, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13141
PMID:37972124
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了MC1R抑制的黑色素细胞，揭示了与黑色素生成和肿瘤转化相关的新基因集。 | 首次定义了MC1R抑制的基因签名（MiGS），并发现TBX3基因在黑色素生成和细胞衰老逃避中的作用。 | NA | 探究MC1R信号减弱如何影响黑色素生成和增加黑色素瘤易感性的机制。 | MC1R抑制的黑色素细胞。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自红色头发颜色（RHC）小鼠模型的黑色素细胞 |
| 14586 | 2024-08-07 |
Adipose tissue macrophage dysfunction is associated with a breach of vascular integrity in NASH
2024-Mar, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.10.039
PMID:37977244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者内脏脂肪组织中的脂肪组织巨噬细胞（ATM）异质性，并探讨了其在NAFLD进展中的作用及其与血管完整性丧失的关系。 | 首次在单细胞水平上描述了人类内脏脂肪组织中的髓系细胞景观，并揭示了非酒精性脂肪肝炎（NASH）特异性的代谢活性巨噬细胞（MMacs）和血管相关巨噬细胞（ResVAMs）的转录变化及其在血管周围的定位。 | NA | 评估脂肪组织巨噬细胞在NAFLD患者中的异质性，并探讨其在NAFLD进展中的作用及其与血管完整性丧失的关系。 | 内脏脂肪组织中的巨噬细胞及其在NAFLD中的作用。 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质水平数据 | 来自瘦和肥胖患者的内脏脂肪组织巨噬细胞，根据NAFLD表型进行分层。 |
| 14587 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome landscape of zebrafish liver reveals hepatocytes and immune cell interactions in understanding nonalcoholic fatty liver disease
2024-Mar, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2024.109428
PMID:38325594
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了斑马鱼肝脏的转录组图谱，揭示了肝细胞与免疫细胞在非酒精性脂肪肝病发展中的相互作用 | 首次构建了斑马鱼肝脏的单细胞转录组图谱，并揭示了肝细胞与免疫细胞在非酒精性脂肪肝病中的相互作用 | NA | 研究非酒精性脂肪肝病中肝细胞与免疫细胞的相互作用 | 斑马鱼肝脏中的肝细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及10种细胞类型 |
| 14588 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis dissects lncRNA-associated gene networks in Arabidopsis
2024-Feb-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100717
PMID:37715446
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了拟南芥中长非编码RNA（lncRNA）相关的基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下绘制了lncRNA及其相关基因调控网络的转录异质性图谱 | NA | 探索植物lncRNA生物学中的单细胞数据整合分析能力，并深入了解lncRNA表达特异性和相关基因调控 | 拟南芥中的lncRNA及其相关基因调控网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 28个已发表的单细胞RNA测序数据集 |
| 14589 | 2024-08-07 |
Systems Analysis of Immune Changes after B-cell Depletion in Autoimmune Multiple Sclerosis
2024-Feb-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.07.576204
PMID:38370778
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了B细胞耗竭后在多发性硬化症患者中免疫景观的变化 | 首次全面揭示了B细胞耗竭治疗多发性硬化症后免疫细胞类型特异性变化及其功能影响 | NA | 探索B细胞耗竭疗法对多发性硬化症患者免疫系统的影响 | 多发性硬化症患者的免疫细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14590 | 2024-08-04 |
Breaks for Precision Medicine in Cancer: Development and Prospects of Spatiotemporal Transcriptomics
2024-Feb, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2023.0116
PMID:38181185
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综述 | 本文回顾了时空转录组学在癌症研究中的整合策略及其最新进展 | 提出时空转录组学与单细胞RNA测序的数据整合，为癌症精确治疗提供新思路 | 对时空转录组学的整体应用仍处于初步探索阶段 | 揭示癌症的基因表达空间模式和细胞群体的空间异质性 | 癌症患者与细胞群体的基因表达及微环境相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | 生物数据 | NA |
| 14591 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA sequencing in melanoma: what have we learned so far?
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104969
PMID:38241976
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序在黑色素瘤中的应用及其带来的见解 | 探讨了单细胞测序技术如何促进对黑色素瘤异质性的理解 | 未明确列出局限性 | 分析黑色素瘤中的肿瘤内异质性及其对治疗反应的影响 | 黑色素瘤细胞及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 14592 | 2024-08-07 |
Genomic profiling and associated B cell lineages delineate the efficacy of neoadjuvant anti-PD-1-based therapy in oesophageal squamous cell carcinoma
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104971
PMID:38244291
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研究论文 | 本研究通过整合全外显子测序、单细胞RNA测序和免疫荧光数据，分析了24名接受新辅助PD-1抑制剂联合紫杉醇和铂类化疗的食管鳞状细胞癌（ESCC）患者的样本，以确定与治疗反应的相关性 | 研究发现DNA错配修复（MMR）途径的改变在最佳反应患者中频繁出现，并与肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）相关。此外，识别了B细胞在ESCC中的二分发展轨迹，其中LMO2+生发中心B细胞在响应肿瘤中富集，而CD55+记忆B细胞与组合治疗的较差反应相关 | NA | 旨在通过全面的肿瘤MMR途径改变和肿瘤内B细胞特征评估，改进接受新辅助化疗免疫治疗的ESCC患者的筛选和管理 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 全外显子测序、单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因组数据、转录组数据、免疫数据 | 24名患者 |
| 14593 | 2024-08-07 |
High-dimensional profiling of regulatory T cells in psoriasis reveals an impaired skin-trafficking property
2024-Feb, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.104985
PMID:38306895
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研究论文 | 本研究通过高维39标记质谱流式细胞术(CyTOF)面板，深入分析了31名银屑病患者和32名健康对照者的皮肤归巢调节性T细胞(Tregs)的免疫景观，并结合体外趋化因子介导的Treg迁移实验、免疫荧光成像以及公共单细胞RNA测序数据，揭示了银屑病患者Tregs的皮肤归巢特性受损。 | 首次深入探索了银屑病患者皮肤归巢Tregs的分子特性，发现CLAhi Tregs和CLAhiCCR5+ Tregs在银屑病患者中的总体减少，以及功能标记物CD39和FoxP3的升高，CCR7表达增加而CCR4和CLA表达减少，这些变化与疾病严重程度相关。 | NA | 探究银屑病患者皮肤归巢调节性T细胞的分子特性和功能状态。 | 银屑病患者的皮肤归巢调节性T细胞。 | 免疫学 | 银屑病 | 质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 31名银屑病患者和32名健康对照者 |
| 14594 | 2024-08-04 |
Glycogen metabolism-mediated intercellular communication in the tumor microenvironment influences liver cancer prognosis
2024, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2023.029697
PMID:38361757
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研究论文 | 本研究揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的作用 | 首次揭示了糖原代谢在肝细胞癌微环境中介导细胞间通信的机制 | 暂无该研究的局限性信息 | 探讨糖原代谢在肝细胞癌微环境中的功能及其对预后的影响 | 肝细胞癌肿瘤样本中的69个细胞簇和65个糖原代谢基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 10个HCC肿瘤样本，共计64,545个细胞 |
| 14595 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals the trajectory of FOLR2-expressing tumor-associated macrophages to regulatory T cells in the progression of lung adenocarcinoma
2023-08-02, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06021-6
PMID:37532692
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌（LUAD）中免疫抑制微环境的形成机制，揭示了FOLR2表达的肿瘤相关巨噬细胞向调节性T细胞的转变轨迹。 | 首次通过单细胞转录组图谱揭示了从癌前到侵袭性LUAD的免疫抑制微环境形成的潜在轨迹，包括ARM-RETN/TAM-FOLR2/DCs/CD4NR4A3/CD4FOXP3的转变。 | 研究样本量较小，仅包括12个LUAD样本和3个正常肺样本，可能影响结果的普遍性。 | 探究肺腺癌中免疫抑制微环境的细胞机制。 | 肺腺癌样本和正常肺样本中的细胞成分和转录组。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 12个肺腺癌样本和3个正常肺样本 |
| 14596 | 2024-08-07 |
Cell Layers: uncovering clustering structure in unsupervised single-cell transcriptomic analysis
2022, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbac051
PMID:35967929
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研究论文 | 本文开发了一种名为Cell Layers的交互式Sankey工具，用于在不同聚类分辨率下定量研究基因表达、共表达、生物过程和聚类完整性 | Cell Layers工具通过链接分子数据和聚类评估指标，增强了单细胞聚类的可解释性，并提供了对细胞群体的新见解 | NA | 开发一种新的工具来提高单细胞转录组无监督聚类的解释性 | 单细胞转录组数据及其聚类结果 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14597 | 2024-08-04 |
scRNA-seq revealed high stemness epithelial malignant cell clusters and prognostic models of lung adenocarcinoma
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54135-4
PMID:38355636
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA-seq分析识别肿瘤干细胞相关的预后模型，以预测肺腺癌的预后、化疗药物及免疫治疗效果 | 本研究提出了一种基于干细胞相关基因的模型，以预测肺腺癌的预后和免疫微环境 | 该研究的样本量及数据来源可能限制了结论的广泛适用性 | 研究肺腺癌的预后因素及干细胞特征 | 样本包括高干细胞特征的恶性上皮细胞和肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CoxBoost + RSF模型 | 转录组数据 | NA |
| 14598 | 2024-08-07 |
Hybrid Oncocytic Tumors (HOTs) in Birt-Hogg-Dubé Syndrome Patients-A Tale of Two Cities: Sequencing Analysis Reveals Dual Lineage Markers Capturing the 2 Cellular Populations of HOT
2024-Feb-01, The American journal of surgical pathology
DOI:10.1097/PAS.0000000000002152
PMID:37994665
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，揭示了Birt-Hogg-Dubé综合征相关混合性嗜酸性肿瘤（HOT）中的两个细胞系标记物L1CAM和LINC01187，这些标记物在HOT中以独特的棋盘模式相互排斥表达，有助于区分HOT与其他肾细胞癌亚型。 | 本研究首次揭示了L1CAM和LINC01187作为HOT的独特标记物，能够区分HOT与其他肾细胞癌亚型，并捕捉到HOT中两种不同的肿瘤上皮细胞群体。 | NA | 研究Birt-Hogg-Dubé综合征相关混合性嗜酸性肿瘤（HOT）的分子标记物，以提高其诊断准确性。 | Birt-Hogg-Dubé综合征患者的混合性嗜酸性肿瘤（HOT）及其与其他肾细胞癌亚型的区分。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及肾肿瘤和正常肾组织样本 |
| 14599 | 2024-08-04 |
An aging-related immune landscape in the hematopoietic immune system
2024-Jan-02, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00403-2
PMID:38169405
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研究论文 | 本文描述了年轻和老年小鼠的脾脏和骨髓的造血免疫图谱 | 研究揭示了老化过程中造血干细胞的功能和组成发生了重大变化 | 未提及具体的样本数量和多样性 | 探讨老龄化对造血免疫系统的整体影响 | 年轻和老年小鼠的造血免疫系统 | 数字病理 | 老年疾病 | 单细胞测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 14600 | 2024-08-07 |
leptin b and its regeneration enhancer illustrate the regenerative features of zebrafish hearts
2024-Jan, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.556
PMID:36495292
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研究论文 | 本研究利用leptin b及其组织再生增强子元素（TREE）分析了斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞（CMs）的异质性 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析，揭示了损伤后内皮/心内膜（EC）的激活及其在再生过程中的作用 | NA | 探讨斑马鱼心脏再生过程中的细胞类型和因子 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞（CMs） | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |