单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 14581 - 14600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14581 | 2024-08-07 |
Leveraging baseline transcriptional features and information from single-cell data to power the prediction of influenza vaccine response
2024, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2024.1243586
PMID:38384303
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研究论文 | 本研究利用基因表达数据和单细胞数据，探索构建流感疫苗反应预测模型的改进策略 | 本研究采用了组合建模策略，并利用单细胞水平的信息来优化流感疫苗反应预测模型 | NA | 探索利用基因表达数据和单细胞数据构建流感疫苗反应预测模型的改进策略 | 流感疫苗反应预测模型的构建 | 生物信息学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自Immune Signatures Data Resource (IS2)的基因表达和免疫反应数据，具体样本数量未提及 |
| 14582 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of genetic associations and single-cell expression profiles reveals potential links between migraine and multiple diseases: a phenome-wide association study
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1301208
PMID:38385040
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研究论文 | 本研究通过综合分析遗传关联和单细胞表达谱，揭示了偏头痛与其他多种疾病之间的潜在联系 | 首次通过单细胞RNA测序和PheWAS研究，揭示了偏头痛与多种疾病之间的多效性关系及其生物学基础 | NA | 探究偏头痛与其他复杂疾病之间的遗传和生物学联系 | 偏头痛及其与416种表型的关联 | 遗传学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, qPCR | NA | 基因表达数据 | 73个偏头痛易感基因在不同脑细胞类型中的表达 |
| 14583 | 2024-08-07 |
Tumor-derived Endothelial Cell: Important Etiological Factors in Endometriosis
2023-11, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2023.102891
PMID:37738888
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了子宫内膜异位症细胞的转录组特征，并分析了肿瘤来源的内皮细胞在疾病中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了子宫内膜异位症中细胞异质性，并发现了肿瘤来源内皮细胞在疾病中的重要作用 | 研究样本量较小，且仅包括了三名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究子宫内膜异位症中肿瘤来源内皮细胞的作用及其病理特征 | 子宫内膜异位症患者的异位和正常子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三名子宫内膜异位症患者，包括114例回顾性病例 |
| 14584 | 2024-08-07 |
DOT1L regulates lung developmental epithelial cell fate and adult alveolar stem cell differentiation after acute injury
2023-09-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.07.006
PMID:37595582
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研究论文 | 研究探讨了DOT1L在肺发育和急性损伤后成年肺泡干细胞分化中的调控作用 | 首次发现DOT1L是AT2细胞生长和分化的调控因子，并揭示了Dot1l失活后AT2细胞的新状态 | NA | 识别控制肺AT2-AT1再生反应的表观遗传途径 | 肺AT2细胞和AT1细胞的分化 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14585 | 2024-08-04 |
Temporal and spatial staging of lung alveolar regeneration is determined by the grainyhead transcription factor Tfcp2l1
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112451
PMID:37119134
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Tfcp2l1在肺泡再生过程中对细胞命运的调控作用 | 本研究揭示了Tfcp2l1在肺泡AT2细胞自我更新与分化中的时间和空间调控功能 | 本研究主要基于小鼠模型，可能限制了其在其他物种中的适用性 | 探讨Tfcp2l1在肺泡再生过程中的作用及其机制 | 焦点是肺泡上皮2型（AT2）细胞及其在再生过程中的行为 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | 通过小鼠进行的多次实验和细胞追踪 |
| 14586 | 2024-08-07 |
A proteo-transcriptomic map of non-alcoholic fatty liver disease signatures
2023-04, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00775-1
PMID:37037945
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研究论文 | 本文提供了一个详细的非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展过程中的脂肝炎和纤维化的蛋白质组-转录组图谱 | 通过多中心蛋白质组学研究，结合转录组分析，确定了与活动性脂肝炎和高级纤维化相关的循环蛋白质标志物，并通过单细胞RNA测序揭示了可能参与蛋白质变化进展的肝细胞类型 | NA | 研究NAFLD进展过程中循环蛋白质的系统性变化 | 306名具有组织学特征的NAFLD患者 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | 蛋白质组学, 转录组学, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归模型 | 蛋白质, 转录组数据 | 4,730个循环蛋白质, 31个标志物 |
| 14587 | 2024-08-04 |
Patient-Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Hepatostellate Organoids Establish a Basis for Liver Pathologies in Telomeropathies
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.06.003
PMID:37302654
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研究论文 | 研究利用患者诱导多能干细胞衍生的肝星状细胞类器官探讨端粒病中的肝脏病理机制 | 首次利用同源诱导多能干细胞衍生的类器官模型建立端粒病相关肝病的研究基础 | 尚未明确端粒功能障碍引发肝病的具体机制 | 探索端粒病中肝脏病理的机制 | 利用人类诱导多能干细胞研究有端粒病突变的肝脏细胞 | 数字病理学 | 端粒病 | CRISPR/Cas9 | 类器官 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 14588 | 2024-08-07 |
Integrative analysis implicates the significance of m6A in the liver fibrosis of biliary atresia by regulating THY1
2023-01-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000004
PMID:36633486
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研究论文 | 本研究全面评估了m6A在胆道闭锁（BA）中的表达情况，并探讨了m6A通过调控THY1在BA引起的肝纤维化中的作用 | 首次揭示了m6A在BA中的重要作用，并提出了通过靶向m6A/THY1轴来缓解BA引起的肝纤维化的新疗法 | NA | 探讨m6A在胆道闭锁肝纤维化中的作用及其调控机制 | m6A在胆道闭锁中的表达及其对THY1的调控作用 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 甲基化RNA免疫沉淀测序（MeRIP-seq） | NA | RNA序列 | 涉及大量阵列（GSE46960, GSE15235）和单细胞RNA测序（GSE136103）数据，以及体外培养的LX-2细胞和原代HSCs |
| 14589 | 2024-08-07 |
Dysregulated Cell-Cell Communication Characterizes Pulmonary Fibrosis
2022-10-21, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11203319
PMID:36291184
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研究论文 | 本研究使用NicheNet R包和公开的单细胞RNA测序数据，探讨了基因变异如何影响肺纤维化的发生，并分析了肺泡上皮细胞在不同环境中的变化 | 本研究首次验证了肺泡上皮细胞类型I的丢失与肺纤维化中单细胞RNA转录组的关系，并发现了ADAM17蛋白在肺纤维化中的潜在作用 | NA | 探讨基因变异如何影响肺纤维化的发生 | 肺泡上皮细胞在不同环境中的变化 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 控制组、基因变异组和纤维化环境中的样本 |
| 14590 | 2024-08-07 |
Resolving the Instructions for αβ T Cell Development
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.014
PMID:33326761
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研究论文 | Chopp等人利用单细胞转录组学和表观基因组学在鼠和人类样本中描绘了αβ T细胞亚群的发育轨迹，并细化了CD4和CD8 T细胞谱系承诺的动力学选择模型 | 利用单细胞转录组学和表观基因组学技术，细化了CD4和CD8 T细胞谱系承诺的动力学选择模型 | NA | 描绘αβ T细胞亚群的发育轨迹并细化T细胞谱系承诺的模型 | αβ T细胞亚群的发育轨迹 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 鼠和人类样本 |
| 14591 | 2024-08-07 |
CCDC66 mutations are associated with high myopia through affected cell mitosis
2024-Feb-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109434
PMID:37852749
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研究论文 | 本研究通过外显子测序和Sanger测序技术，鉴定了与高度近视（HM）相关的CCDC66基因突变，并探讨了其在细胞有丝分裂中的作用 | 首次发现CCDC66基因突变与高度近视的关联，并通过单细胞RNA测序和CRISPR/Cas9系统揭示了该基因在视网膜发育中的功能 | 研究样本主要集中在家族性高度近视和散发的病例，可能需要更广泛的样本验证 | 识别与高度近视相关的致病基因，并探索其在高度近视发病机制中的作用 | CCDC66基因及其在高度近视中的突变 | 遗传学 | 眼科疾病 | 外显子测序, Sanger测序, 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 基因序列, 细胞表达 | 一个高度近视家族，200例散发高度近视患者 |
| 14592 | 2024-08-07 |
Lipocalin-2 expression identifies an intestinal regulatory neutrophil population during acute graft-versus-host disease
2024-Feb-21, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adi1501
PMID:38381845
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在急性移植物抗宿主病（aGVHD）的小鼠模型中，发现了一种表达脂质运载蛋白2（LCN2）的肠道调节性中性粒细胞群体，并探讨了其在aGVHD中的作用机制。 | 首次鉴定出表达LCN2的肠道中性粒细胞群体，并揭示了LCN2通过诱导胰岛素样生长因子1受体（IGF-1R）信号在巨噬细胞中的作用，减少主要组织相容性复合体II类（MHCII）表达并增加白细胞介素-10（IL-10）产生，从而减轻aGVHD的严重程度。 | NA | 探讨LCN2在急性移植物抗宿主病中的作用及其机制，为aGVHD的治疗提供新的策略。 | 急性移植物抗宿主病（aGVHD）中的肠道中性粒细胞群体及其表达的脂质运载蛋白2（LCN2）。 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个aGVHD患者肠道活检样本 |
| 14593 | 2024-08-07 |
A single-cell transposable element atlas of human cell identity
2023-Dec-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.28.573568
PMID:38234829
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Stellarscope的工具和分析流程，用于单细胞转座子位点水平分析，通过重新分配多重映射的读取到特定的基因组位点，构建了人类PBMCs中的转座子表达图谱 | 首次系统地量化了单细胞RNA测序中的转座子表达，并发现转座子位点特异性表达可以区分细胞类型并定义新的细胞亚群 | NA | 探索转座子在人类生物学中的影响 | 人类PBMCs中的转座子表达 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 期望最大化算法 | RNA序列 | 人类PBMCs样本 |
| 14594 | 2024-08-07 |
Generation of Atp6v1g3-Cre mice for investigation of intercalated cells and the collecting duct
2023-12-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00137.2023
PMID:37823193
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/CAS技术生成了Atp6v1g3-Cre小鼠，用于研究肾间质细胞和集合管 | 开发了一种新的Atp6v1g3-Cre报告小鼠模型，该模型在肾脏细胞中具有高度特异性，且在其他器官中表达极少或无表达 | NA | 研究肾间质细胞在肾脏先天免疫功能中的作用 | 肾间质细胞和集合管 | NA | 肾脏感染、酸碱失衡和急性肾损伤 | CRISPR/CAS技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA |
| 14595 | 2024-08-04 |
Spatial Transcriptomics of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms of the Pancreas Identifies NKX6-2 as a Driver of Gastric Differentiation and Indolent Biological Potential
2023-08-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-1200
PMID:37285225
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研究论文 | 本研究通过空间转录组技术揭示了胰腺导管内乳头状粘液性肿瘤的转录因子NKX6-2对胃部分化和温和生物学潜力的影响 | 首次发现NKX6-2是推动IPMN温和胃部分化的转录因子 | 研究中未详细探讨NKX6-2在其他癌症类型中的作用 | 旨在探讨IPMN中的胃部分化的分子基础 | 以一组胰腺导管内乳头状粘液性肿瘤为研究对象 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组技术 | 小鼠IPMN模型 | 基因表达数据 | NA |
| 14596 | 2024-08-04 |
Single-cell RNA-seq reveals alterations in peripheral CX3CR1 and nonclassical monocytes in familial tauopathy
2023-07-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01205-3
PMID:37464408
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研究论文 | 这篇文章揭示了携带MAPT致病变异的家族性tau病患者在外周单核细胞中CX3CR1和非经典单核细胞的变化 | 首次系统地分析了人类外周免疫细胞在tau病理变化下的表达和丰度，特别关注CX3CR1和非经典单核细胞 | 样本量较小，仅包括8名变异携带者和8名健康对照，可能影响结果的普遍性 | 研究tau病理对人类外周免疫系统的影响 | 来自MAPT致病变异携带者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 音乐 | 16个样本（8个病变携带者和8个健康对照） |
| 14597 | 2024-08-07 |
Adult skin fibroblast state change in murine wound healing
2023-01-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-27152-4
PMID:36650180
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研究论文 | 本研究分析了小鼠正常和受伤皮肤在伤口愈合第4天的单细胞RNA测序数据，以探讨伤口愈合增殖期中成纤维细胞的异质性 | 发现了在受伤皮肤中显著增加的特定成纤维细胞亚群（cluster 3），并识别出可能促进伤口愈合的候选药物 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 研究伤口愈合过程中成纤维细胞的异质性及其对伤口愈合的影响 | 小鼠正常和受伤皮肤的成纤维细胞 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠正常和受伤皮肤的样本 |
| 14598 | 2024-08-04 |
A Comprehensive narrative review of transcriptomics and epigenomics of gallbladder cancer
2023-Jan-01, Journal of cancer research and therapeutics
IF:1.4Q4
DOI:10.4103/jcrt.jcrt_1823_23
PMID:38384011
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review | 本综述分析了胆囊癌的转录组学和表观基因组学研究 | 该文章通过对2010年至2023年间已发布的高通量测序研究的分析，揭示了胆囊癌的基因与表观基因特征 | 当前研究基于已发布的文献，可能会有限制于数据的可用性和质量 | 研究胆囊癌的分子机制，开发诊断生物标志物和靶向治疗方法 | 胆囊癌相关的转录组和表观基因组特征 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 下一代测序（NGS），RNA测序，单细胞测序，微阵列技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 14599 | 2024-08-07 |
Cellinker: a platform of ligand-receptor interactions for intercellular communication analysis
2021-Jan-20, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab036
PMID:33471060
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研究论文 | 本文开发了Cellinker平台，一个用于细胞间通信分析的配体-受体相互作用资源 | Cellinker提供了超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体蛋白-蛋白相互作用以及400多个内源性小分子相关的配体-受体相互作用，并特别收集了与冠状病毒感染相关的16个配体-受体相互作用信息 | NA | 提供一个全面的、高可信度的资源，用于检索配体-受体相互作用，以研究细胞间通信的功能效应 | 配体-受体相互作用及其在细胞间通信中的作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质-蛋白相互作用数据 | 超过3,700个人类和3,200个鼠类配体-受体相互作用，以及400多个内源性小分子相关的相互作用 |
| 14600 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics analysis showing functional heterogeneity in decidual stromal cells during labor
2020-Dec-28, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research
IF:2.5Q3
DOI:10.1136/jim-2020-001616
PMID:33372108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了分娩前后基底层间质细胞的异质性及其功能变化 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了分娩过程中基底层间质细胞的功能异质性 | NA | 研究分娩过程中基底层间质细胞的异质性及其功能变化 | 基底层间质细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6382个细胞 |