单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 37326 篇文献,本页显示第 1441 - 1460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1441 2026-02-25
Human microglia in brain assembloids display region-specific diversity and respond to hyperexcitable neurons carrying SCN2A mutation
2026-Feb-20, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过构建区域特异性脑类器官(皮质、纹状体和中脑)并整合人类小胶质细胞,揭示了小胶质细胞在人类大脑中的区域特异性多样性及其对携带SCN2A突变的过度兴奋神经元的反应 开发了包含人类小胶质细胞的区域特异性脑类器官和组装体模型,首次在体外模拟了皮质下区域的神经免疫相互作用,并发现了小胶质细胞对SCN2A突变介导的神经元过度活动的特异性反应 研究基于体外类器官模型,可能无法完全复制体内大脑环境的复杂性,且样本规模有限 探究人类小胶质细胞在大脑不同区域的特性及其在神经回路发育和功能中的作用,特别是在神经精神疾病相关电路中的角色 人类小胶质细胞、区域特异性脑类器官(皮质、纹状体和midbrain)以及midbrain-striatal组装体 神经科学 自闭症 单细胞RNA测序、化学遗传学、钙信号成像 脑类器官模型、组装体模型 单细胞转录组数据、钙成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1442 2026-02-25
RIPK3 Orchestrates Scar-Associated Macrophage Dysfunction to Drive Pulmonary Fibrosis
2026-Feb-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文揭示了RIPK3在特发性肺纤维化中通过调控疤痕相关巨噬细胞的免疫代谢功能,而非依赖其经典的坏死性凋亡作用,来驱动纤维化的新机制 发现了RIPK3在肺纤维化中独立于坏死性凋亡的全新免疫代谢功能,并明确了其通过AKT-mTOR通路调控精氨酸-多胺代谢轴的具体机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接验证尚需进一步开展 探究RIPK3在肺纤维化中的非经典功能及其分子机制 特发性肺纤维化患者样本、小鼠模型、巨噬细胞(特别是疤痕相关巨噬细胞亚群) 分子生物学与免疫学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、体外细胞分化与功能分析 NA 基因表达数据、细胞功能数据 特发性肺纤维化患者和小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1443 2026-02-25
3D "emboli" culture models epithelial breast cancer cell oxidative mitochondrial metabolism with relevance for lung metastasis
2026-Feb-18, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究比较了乳腺癌细胞在两种三维培养模型(mammosphere培养和'emboli'培养)中的表现,重点关注其对线粒体氧化代谢的偏好及其与肺转移的相关性 开发并验证了'emboli'培养模型,该模型能特异性富集上皮特征,模拟乳腺癌细胞的线粒体氧化代谢,并与肺转移能力增强相关 研究仅使用了三种乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3和MDA-MB-468),可能无法代表所有乳腺癌亚型 比较不同三维培养模型在模拟乳腺癌生物学特性方面的适用性,特别是针对肺转移的研究 乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3和MDA-MB-468) 细胞生物学 乳腺癌 蛋白质组学、单细胞转录组学、代谢通量分析、电子显微镜 NA 蛋白质组数据、转录组数据、代谢数据、图像数据 三种乳腺癌细胞系 NA 单细胞转录组学 NA NA
1444 2026-02-25
A method to unravel complexity in human peripheral blood B-cell subsets through multiomic cellular indexing of transcriptomes and epitopes by sequencing (CITE-seq) analyses
2026-Feb-12, ImmunoHorizons
研究论文 本文开发了一种基于CITE-seq的多组学方法,用于识别和追踪人类外周血中复杂的B细胞亚群,特别是IgM+IgDlow/- B细胞 结合CITE-seq技术,通过同时分析转录组和表面蛋白表达,克服了仅依赖转录组scRNA-seq在识别B细胞亚群时的局限性,实现了更准确的细胞分类 方法依赖于人类外周血IgM+IgDlow/- B细胞作为替代模型,可能无法完全反映小鼠脾脏BDL亚群的特性,且稀有细胞亚群的获取和分析仍具挑战性 开发一种多组学策略,以更准确地分类和追踪人类外周血中复杂的B细胞亚群,特别是那些与自身免疫疾病相关的稀有亚群 人类外周血中的B细胞亚群,重点关注IgM+IgDlow/- B细胞 单细胞多组学 自身免疫疾病 CITE-seq, scRNA-seq, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 表面蛋白表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
1445 2026-02-25
Leveraging optimized oligonucleotide-tagged antigen assemblies and single-cell sequencing for multiplexed proteogenomic profiling of human B cell reactivities
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文介绍了一种结合优化寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的方法,用于人类B细胞反应性的多重蛋白质基因组分析 开发了一种结合寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的新方法,用于并行分析不同抗原特异性的B细胞,并提高了染色灵敏度以检测低频率抗原反应性细胞 未明确说明样本量或技术验证的局限性 旨在通过并行分析不同抗原特异性的B细胞,推进对体液反应中克隆型角色的理解 人类B细胞,特别是针对SARS-CoV-2和登革热抗原的反应性细胞 免疫学 传染病 单细胞测序,流式细胞术,寡核苷酸标记抗原组装 NA 单细胞测序数据,流式细胞术数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
1446 2026-02-25
Peptide-driven identification of TCRs reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究开发了一种名为PDI-TCR的新方法,用于从人类血液中识别抗原特异性T细胞受体,并应用于结核病研究 开发了PDI-TCR方法,通过比较非重叠肽池的反应,能够区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR 研究中使用的PDI-TCR参数特定于结核分枝杆菌,但方法可适应其他抗原系统 研究抗原特异性T细胞的动态和表型,特别是在结核病背景下 结核病患者和结核分枝杆菌致敏的健康个体的CD4 T细胞 免疫学 结核病 单细胞RNA测序、TCR测序、体外扩增 NA 序列数据 结核病患者和健康个体的血液样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1447 2026-02-25
Tissue-Specific High-Quality Protoplast Isolation for Single-Cell Analyses in Arabidopsis
2026-Feb-06, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文提出了一种从拟南芥多种组织中高效分离高质量原生质体的方法,适用于单细胞分析 开发了一种针对拟南芥地上和地下组织的稳健、可重复的原生质体分离协议,优化了酶消化和纯化步骤以提高产量和细胞类型代表性 未明确提及具体样本数量或实验验证的局限性,可能仅适用于拟南芥特定组织 优化植物单细胞RNA测序中的原生质体分离技术,以支持细胞异质性研究 拟南芥的叶片、茎、花和根组织 植物生物学 NA 原生质体分离、单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 单细胞悬浮液 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1448 2026-02-25
Single-cell analysis identifies ATC-like cells driving progression in relapsed follicular thyroid carcinoma
2026-Feb-04, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了复发性滤泡性甲状腺癌中具有间变性甲状腺癌分子特征的ATC样细胞群及其驱动肿瘤进展的机制 首次在复发性滤泡性甲状腺癌中鉴定出具有间变性甲状腺癌分子特征的独特细胞群,并发现UBE2C作为其特异性标志物,揭示了该细胞群通过调控代谢通路促进肿瘤进展的新机制 样本量相对有限,且主要基于单细胞转录组数据,需要更多功能实验和临床样本验证 阐明滤泡性甲状腺癌进展及向间变性甲状腺癌转化的细胞和分子机制 甲状腺癌组织,包括乳头状甲状腺癌、滤泡亚型乳头状甲状腺癌、复发性滤泡性甲状腺癌和间变性甲状腺癌 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 46739个细胞,来自PTC、FVPTC、RFTC和ATC组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1449 2026-02-25
A spectral dimension reduction technique that improves pattern detection in multivariate spatial data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种用于多变量空间转录组学数据模式识别的统计方法,通过优化Moran's I来构建低维特征空间投影 提出了一种无需参数调优的算法,能最大化空间依赖性度量Moran's I,有效抑制非空间变异并优于主成分分析预处理 NA 提高多变量空间数据中模式检测的准确性 多变量空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 统计降维算法 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1450 2026-02-25
Inference of marker genes of subtle cell state changes via iLR: iterative logistic regression
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为迭代逻辑回归(iLR)的方法,用于从单细胞RNA测序数据中识别小规模信息性标记基因,特别适用于细胞状态间的细微差异 iLR通过迭代应用逻辑回归并结合帕累托前沿优化,在平衡基因集大小与分类性能方面具有创新性,能够跨器官和物种(如小鼠到人类)推断信息性基因 NA 开发一种高效的方法来识别单细胞RNA测序数据中的小规模标记基因集,以区分细胞状态的细微变化,如疾病或治疗诱导的差异 单细胞RNA测序数据,包括神经元细胞亚型(健康与自闭症谱系障碍患者)和肿瘤微环境中的细胞类型 机器学习 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序 逻辑回归 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1451 2026-02-25
Insights into speckled eggs provided by single-cell transcriptomics in high-yield laying hens
2026-Feb-02, Poultry science IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,分析了高产蛋鸡中斑点蛋壳形成的分子特征和细胞异质性 首次在高产蛋鸡中应用单细胞RNA测序技术,构建了子宫组织的单细胞分辨率图谱,并识别了与斑点蛋壳相关的细胞类型特异性表达模式和信号通路变化 研究样本量有限,且主要关注转录组层面,未深入探讨表观遗传或蛋白质组学的变化 探究斑点蛋壳形成的分子机制和细胞基础 高产蛋鸡的子宫组织 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 根据蛋壳斑点率分为两组的高产蛋鸡子宫组织样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics单细胞RNA测序平台
1452 2026-02-25
Unveiling metabolic pathway dysregulation in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer: a single-cell analysis of epithelial cell trajectories
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过单细胞转录组数据分析,揭示了结肠癌恶性转化过程中上皮细胞的代谢通路失调及细胞通讯变化 首次从单细胞层面构建了结肠癌进展中上皮细胞的分化轨迹,并识别了脂肪酸和胆汁酸代谢通路在早期恶性转化中的关键作用,以及乳酰化相关基因作为潜在干预靶点 研究基于转录组数据,缺乏蛋白质或代谢物水平的验证,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 探究结肠癌从正常组织到腺瘤再到癌变的恶性转化过程中,代谢通路和细胞通讯的动态变化 正常、息肉和肿瘤结肠组织中的上皮细胞及其他基质细胞 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序 轨迹分析、AUCell、细胞通讯分析 单细胞转录组数据 包括正常、息肉和肿瘤结肠组织的单细胞样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1453 2026-02-25
Research on the mechanism of compound mylabris capsules regulating ferroptosis in lung adenocarcinoma based on bioinformatics and experimental validation
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡在肺腺癌中的抗肿瘤机制 首次报道复方斑蝥胶囊通过调控铁死亡缓解肺腺癌,并利用单细胞RNA测序数据分析和多种机器学习算法筛选关键基因 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 探究复方斑蝥胶囊调控肺腺癌细胞铁死亡的机制并鉴定其活性成分 肺腺癌细胞系A549和H1650 生物信息学 肺腺癌 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 Lasso回归,Boruta,RFE算法 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1454 2026-02-25
Unveiling gastric stem cell dynamics in gastric atrophy and carcinogenesis: revisiting mechanisms and advancing experimental models - a narrative review
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
综述 本文全面评估了胃干细胞在萎缩性胃炎和癌前病变进展中的动态作用,并探讨了实验模型的优化方向 重新审视了胃干细胞在癌变过程中的耗竭与扩张范式,强调了慢性炎症下胃干细胞的克隆扩增和区域癌化效应,并提出了整合幽门螺杆菌感染模型与无他莫昔芬谱系追踪等改进实验方法 依赖多化学致癌物模型可能限制转化相关性,而他莫昔芬依赖的谱系追踪系统易受混杂效应影响 阐明胃干细胞在胃萎缩和癌变过程中的机制,并推动实验模型的进展 胃干细胞 数字病理学 胃癌 谱系追踪、空间转录组学、类器官系统 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
1455 2026-02-25
A multi-dimensional bioinformatic dissection of the molecular mechanisms in high-BMI-associated colorectal cancer: identification and validation of EGLN1 as a key target
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过多维生物信息学整合分析,系统探讨了高BMI与结直肠癌的遗传关联及潜在分子机制,并识别了关键治疗靶点EGLN1 结合全球疾病负担数据、孟德尔随机化分析、差异表达基因和加权基因共表达网络分析,首次系统揭示了EGLN1在高BMI相关结直肠癌中的核心保护作用,并通过计算药物筛选和体外实验验证了天然化合物氰啶醇作为EGLN1调节剂的抗肿瘤活性 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型或临床试验的验证,且肠道菌群的中介作用仅通过MR分析推断,需进一步实验证实 系统研究高BMI与结直肠癌之间的遗传关联及分子机制,并识别关键治疗靶点 结直肠癌患者数据、基因表达数据、蛋白质相互作用网络、肠道菌群数据以及HCT116结直肠癌细胞系 生物信息学 结直肠癌 孟德尔随机化分析、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、基因集富集分析、单细胞RNA测序分析、计算药物筛选、分子对接、体外细胞实验 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、单细胞RNA测序数据、肠道菌群数据 基于The Cancer Genome Atlas队列的结直肠癌患者数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1456 2026-02-25
Endothelial circadian rhythm genes as prognostic modulators of tumor progression and immune interactions: insights from pan-cancer single-cell RNA sequencing
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过泛癌单细胞RNA测序分析,揭示了内皮细胞昼夜节律基因在肿瘤微环境中的失调及其作为预后生物标志物的潜力 首次系统性地在泛癌水平上,利用单细胞RNA测序数据,聚焦于肿瘤微环境中的内皮细胞,研究其昼夜节律基因的失调及其与临床预后和免疫相互作用的关联 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的实验验证来确认内皮细胞昼夜节律基因在肿瘤进展中的因果作用 探究多种癌症中内皮细胞昼夜节律相关基因的失调及其临床意义 多种癌症类型中的内皮细胞 数字病理学 泛癌 单细胞RNA测序 LASSO回归 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 来自15个独立数据集的样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1457 2026-02-25
Single-cell profiling unveils the immuno-favorable tumor microenvironment remodeling after successful neoadjuvant therapy for advanced gallbladder cancer
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和多重免疫组化,揭示了晚期胆囊癌新辅助化疗-免疫联合疗法后肿瘤微环境的免疫有利重塑 首次在晚期胆囊癌中,通过单细胞分辨率描绘了新辅助化疗-免疫联合疗法成功降期后肿瘤微环境的动态变化,特别是发现了滤泡辅助性T细胞扩增、三级淋巴结构形成以及相关趋化因子CCL19和CXCL12的上调 研究样本量有限,且仅分析了治疗成功(降期)的患者,缺乏治疗无应答者的对照数据,结论的普适性有待更大规模研究验证 评估新辅助化疗-免疫联合疗法对晚期胆囊癌的疗效,并探究其引起的肿瘤微环境改变 接受新辅助化疗-免疫联合疗法(吉西他滨、白蛋白结合型紫杉醇联合抗PD-1免疫治疗)的晚期胆囊癌患者 数字病理学 胆囊癌 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,组织图像数据 成功降期的晚期胆囊癌患者样本(具体数量未明确说明,但提及50%的经治肿瘤中观察到特定现象) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1458 2026-02-25
Sex-specific associations between phthalate exposure and stroke risk: a cross-sectional study integrating molecular mechanisms of vascular dysfunction
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过横断面分析探讨了邻苯二甲酸酯暴露与中风风险之间的性别特异性关联,并整合分子机制揭示了血管功能障碍的潜在通路 首次结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据,揭示了邻苯二甲酸酯通过内皮特异性KDR-AKT1-MAPK8信号通路增加女性中风风险的性别特异性机制 横断面研究设计无法确定因果关系,且依赖自我报告的中风数据可能引入回忆偏倚 评估邻苯二甲酸酯暴露与中风风险之间的关联,并探索其潜在的分子机制 来自美国国家健康与营养调查的8184名参与者(4140名女性和4044名男性) 环境流行病学与分子毒理学 中风 加权分位数和回归、网络毒理学、蛋白质-蛋白质相互作用映射、Friends算法、分子对接分析、单细胞RNA测序 加权分位数和回归模型 尿液代谢物浓度数据、自我报告健康数据、分子相互作用数据、单细胞RNA测序数据 8184名参与者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1459 2026-02-25
Lineage-tracing technology for decoding cell evolution in pathophysiology: a bibliometric analysis
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
综述 本文通过文献计量学方法,全面回顾了谱系追踪技术在生命科学领域的研究现状、热点与趋势 首次将定量图谱绘制与技术演变分析相结合的文献计量学综述,通过数据驱动决策、算法处理、标准化分析工具和多维指标交叉验证,克服了传统叙述性综述的局限性 分析基于Web of Science数据库的3252篇文章,可能存在数据库收录偏差,且分析截止于2024年9月,未能涵盖最新进展 通过文献计量学分析,揭示谱系追踪技术在细胞演化研究领域的发展轨迹、研究前沿和应用趋势 1979年1月至2024年9月期间发表的3252篇谱系追踪技术相关学术文献 生命科学 NA 文献计量学分析、VOSviewer、CiteSpace、Bibliometrix、Pajek NA 文献元数据、引文网络、关键词 3252篇学术文章,涉及70个国家/地区、2434个机构和18906名研究人员 NA NA NA NA
1460 2026-02-25
Integrative multi-omics identifies endoplasmic reticulum stress-related prognostic biomarkers and CD99-mediated cell-cell communication in lung adenocarcinoma
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合多组学数据,识别了肺腺癌中与内质网应激相关的预后生物标志物,并揭示了CD99介导的细胞间通讯在肿瘤进展中的作用 首次整合单细胞转录组学、批量RNA测序和空间转录组学,系统分析内质网应激对肺腺癌异质性、肿瘤微环境重塑及细胞间通讯网络的影响,并构建了基于机器学习的预后模型 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分相对有限,且样本量可能不足以完全代表肺腺癌的异质性 探究内质网应激在肺腺癌进展、免疫逃逸和耐药性中的作用,识别相关预后生物标志物和治疗靶点 肺腺癌患者样本及相关的多组学数据 生物信息学 肺腺癌 单细胞转录组学, 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, qPCR 机器学习模型 转录组数据, 空间转录组数据, 临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
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