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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2026-05-12 |
Deubiquitinase USP2 promotes hepatic stellate cell activation via p300 stabilization
2026-May, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70301
PMID:41703985
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研究论文 | 该研究通过去泛素化酶抑制剂筛选发现USP2在肝星状细胞活化中稳定p300,促进肝纤维化 | 首次识别USP2作为p300的新型去泛素化酶,揭示其在肝星状细胞活化和肝纤维化中的关键调控作用,为纤维化治疗提供新靶点 | 未明确说明研究局限 | 探索肝星状细胞活化过程中p300稳定性的上游调控机制 | 肝星状细胞、纤维化肝脏组织、慢性肝病患者样本 | 数字病理学 | 肝纤维化、代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序、去泛素化酶抑制剂筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 人纤维化肝脏组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1442 | 2026-05-12 |
Single-cell transcriptomics reveals the impact of sex and age in the healthy human liver
2026-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101773
PMID:41990579
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析了37个健康人肝脏样本,揭示性别和年龄对肝脏细胞类型基因表达和细胞间相互作用的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了性别和年龄对人肝脏所有细胞类型基因表达谱、信号通路和细胞间通讯的影响 | 未说明具体限制 | 通过单细胞测序技术研究性别和年龄如何影响健康人肝脏的基因表达和细胞功能 | 37个健康人肝脏样本,包含女性和男性捐赠者,年龄跨度超过七十年 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序, 差异表达分析, 通路富集分析, 配体-受体和蛋白-蛋白相互作用预测 | NA | 基因表达数据 | 37个健康人肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1443 | 2026-05-12 |
Multiomics and multi-region spatial transcriptome analysis reveal cellular networks and pathways associated with HCC recurrence
2026-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101790
PMID:41950768
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研究论文 | 通过多组学和多区域空间转录组分析,揭示与肝细胞癌复发相关的细胞网络和信号通路 | 发现了INTS6+内皮细胞亚群,其在复发患者的肿瘤中富集并与肿瘤细胞空间共定位,且与微血管侵犯区域相关 | 研究样本量有限,仅涉及4名患者和17个组织样本 | 研究肝细胞癌复杂肿瘤微环境中不同细胞类型间的相互作用及其在疾病复发中的作用 | 肝细胞癌手术切除后的多区域组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学,批量RNA测序,免疫荧光,多重免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 4名患者的17个组织样本(空间转录组),90名患者的329个分区(批量RNA测序) | NA | 空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1444 | 2026-05-12 |
Tocilizumab Mitigates Immune Checkpoint Inhibitor-Induced Colitis and Inhibits Tumor Growth by Targeting the IL-6-JAK2-STAT3 Signaling Pathway
2026-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.70293
PMID:42051049
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研究论文 | 该研究通过建立PD-1抑制剂诱导的结肠炎小鼠模型,探究IL-6-JAK2-STAT3信号通路在免疫检查点抑制剂相关结肠炎中的作用,并验证托珠单抗通过靶向该通路缓解结肠炎症并抑制肿瘤生长的治疗效果 | 首次揭示托珠单抗通过靶向IL-6-JAK2-STAT3通路同时缓解PD-1抑制剂诱导的结肠炎和抑制肿瘤生长,为临床治疗提供了新思路 | 仅基于小鼠模型验证,尚需临床试验进一步评估托珠单抗在人类患者中的安全性和有效性 | 阐明免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制并探索潜在治疗策略 | PD-1抑制剂诱导的结肠炎小鼠模型 | 机器学习 | 结肠炎 | RNA测序,单细胞RNA测序,HE染色,免疫组化,ELISA,Western blot,小动物活体成像,肿瘤细胞功能分析 | NA | 基因表达数据,图像 | 小鼠模型(具体数量未说明) | Illumina | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 1445 | 2026-05-12 |
Integrated Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Transcriptional Activation of PTGS2 by FOS in Progression From T2DM to T2DM-Associated NAFLD
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71182
PMID:42108421
|
研究论文 | 通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示FOS介导的PTGS2转录激活在2型糖尿病进展为非酒精性脂肪性肝病中的作用 | 首次通过批量与单细胞转录组整合分析,揭示FOS直接结合PTGS2启动子并驱动其转录在T2DM向NAFLD进展中的机制 | 未提及体内实验验证,缺乏更大样本量的临床验证 | 探究T2DM向T2DM相关NAFLD进展过程中FOS介导的PTGS2激活的调控机制 | T2DM相关NAFLD患者的批量RNA-seq数据、单细胞转录组数据及临床样本 | 机器学习 | 2型糖尿病,非酒精性脂肪性肝病 | RNA-seq | LASSO回归,随机森林 | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1446 | 2026-05-12 |
SLA2 is Associated With Immune evasion and Exhaustion of CD8+ T Cells in Gastric Cancer
2026-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71164
PMID:42108520
|
研究论文 | 本研究探讨了Src样适配蛋白2(SLA2)在胃癌组织中高表达及其与CD8+T细胞耗竭和免疫逃逸的关系 | 首次揭示了SLA2在胃癌肿瘤微环境中通过负调控T细胞受体信号导致CD8+T细胞功能耗竭的机制,并发现启动子甲基化和组蛋白修饰可能调控其表达 | 具体实验数据和样本量未在摘要中明确说明,机制研究主要基于体外实验 | 探索SLA2在胃癌肿瘤微环境中对CD8+T细胞功能的影响及其分子机制 | 胃癌组织样本、CD8+T细胞 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1447 | 2026-05-12 |
Microenvironmentally derived fatty acid-binding proteins 4 and 5 are novel therapeutic vulnerabilities in multiple myeloma
2026-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2026.100229
PMID:42109313
|
研究论文 | 研究发现微环境来源的脂肪酸结合蛋白4和5是多发性骨髓瘤的新型治疗靶点 | 首次揭示微环境来源的FABP4/5支持多发性骨髓瘤进展,并提出双重靶向策略 | 未明确说明研究的局限性 | 验证微环境来源的FABP4/5促进多发性骨髓瘤进展的假设 | 多发性骨髓瘤患者和老鼠模型 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 多发性骨髓瘤患者数据和老鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1448 | 2026-05-12 |
Single-nucleus transcriptome profiling unveils cell-type-specific ethylene and TOR signaling in tomato
2026-May, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhag044
PMID:42111481
|
研究论文 | 利用单核转录组图谱解析番茄黄化过程中细胞类型特异的乙烯和TOR信号调控机制 | 首次在单核分辨率下整合乙烯和TOR信号通路对番茄黄化过程的调控,并鉴定出表皮细胞中JA1转录因子作为乙烯负调控因子 | 未在摘要中说明实验重复次数或统计验证的详细方法 | 阐明番茄黄化过程中乙烯和TOR信号通路的细胞类型特异性调控机制 | 番茄幼苗的黄化顶钩和下胚轴组织 | 植物单细胞转录组学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 单核转录组表达谱 | 117,929个细胞核,来自三种处理(ACC、Torin2、对照)的顶钩和下胚轴组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1449 | 2026-05-12 |
Ginsenosides exhibit potential therapeutic potential in photoaging by regulating keratinocyte ferroptosis
2026-May, Journal of ginseng research
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.jgr.2025.11.002
PMID:42112127
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研究论文 | 本研究探讨人参皂苷通过调节角质细胞铁死亡来缓解皮肤光老化的潜在治疗机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示UVB照射后角质细胞铁死亡信号变化,并发现人参皂苷C-K和C-Mc靶向铁死亡调节蛋白SLC7A11/GPX4轴和HMGB1表达的机制 | 尚未提及具体研究局限,但可能包含动物模型与人体差异、样本量有限、机制细节未完全阐明等 | 探索人参皂苷调节角质细胞铁死亡在皮肤光老化治疗中的作用机制 | 小鼠UVB照射后的皮肤组织及培养的角质细胞 | 分子生物学与皮肤药理学 | 皮肤光老化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、Western blot、RT-qPCR、斑马鱼胚胎毒性实验 | NA(未明确使用特定深度学习模型) | 基因表达数据 | 小鼠皮肤组织样本(具体数量未给出)及斑马鱼胚胎样本 | NA(未明确平台公司) | 单细胞RNA测序 | NA(未明确具体平台或试剂盒) | NA(未提供具体平台配置细节) |
| 1450 | 2026-05-12 |
Multi omics and mechanistic investigation reveals CBFB as a prognostic biomarker in gastric cancer
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05131-9
PMID:42056631
|
研究论文 | 该研究通过多组学分析发现CBFB是胃癌预后生物标志物,并探究其作用机制 | 首次系统性地利用多组学分析揭示CBFB在胃癌中的预后价值及功能机制,包括单细胞RNA测序和分子对接验证 | 未提及明显的局限性 | 探究CBFB在胃癌中的预后意义和潜在作用机制 | 胃癌患者的转录组数据及细胞样本 | 机器学习 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | CNN(机器学习) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1451 | 2026-05-12 |
CSsingle: a unified tool for robust decomposition of bulk and spatial transcriptomic data across diverse single-cell references
2026-Apr-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag410
PMID:42080261
|
研究论文 | 提出了统一框架CSsingle,鲁棒地从多种单细胞参考中解卷积bulk和空间转录组数据 | 引入细胞大小校正和跨平台数据整合,通过External RNA Controls Consortium (ERCC) spike-ins或计算估计器明确校正细胞类型特异性RNA含量差异 | 未明确讨论 | 准确解卷积bulk和空间转录组数据,以研究组织架构和疾病 | bulk转录组和空间转录组数据 | 自然语言处理 | 肺癌 | NA | 重复加权最小二乘模型 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1452 | 2026-05-12 |
Systems genetics reveals ITIH5 as a key mediator of adipocyte-Endothelial crosstalk
2026-Apr-21, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102373
PMID:42025695
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研究论文 | 使用系统遗传学方法揭示ITIH5作为脂肪细胞与内皮细胞交互的关键调节因子,影响脂肪组织稳态和全身代谢 | 通过无偏倚系统遗传学分析发现ITIH5在脂肪组织稳态和全身代谢中的中心调控作用,并结合急性重组蛋白处理、时空调控的脂肪细胞特异性过表达模型和空间转录组学揭示其通过调节内皮-免疫相互作用的机制 | 未明确提及具体限制,但可能包括动物模型向人类转化、不同饮食条件下的效应差异及潜在的混杂遗传因素 | 探索脂肪组织稳态的遗传调控机制,特别是ITIH5在脂肪细胞-内皮细胞交互和全身代谢中的作用 | 小鼠和人类脂肪组织、内皮细胞 | 系统遗传学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 空间转录组学数据 | 未明确提供具体样本量,涉及小鼠模型和人类细胞实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1453 | 2026-05-12 |
Mapping breast cancer lineage in radiation and immunotherapy using the REMAP mouse
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.15.718689
PMID:42039427
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研究论文 | 介绍REMAP小鼠模型,用于在放射和免疫治疗中绘制乳腺癌谱系,揭示肿瘤进化、转移及治疗反应由可遗传的谱系程序调控 | 首次将诱导型CRISPR记录与MMTV-PyMT小鼠模型结合,实现体内乳腺肿瘤克隆谱系的高分辨率追踪,并揭示可遗传的EMT程序在转移和治疗反应中的作用 | NA | 研究放射与抗PD1免疫治疗联合作用下激素受体阳性乳腺癌的肿瘤进化、转移及肿瘤微环境重塑机制 | REMAP小鼠模型中的激素受体阳性乳腺癌肿瘤及肿瘤微环境 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | REMAP小鼠模型中的多个肿瘤和转移灶样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达系统 |
| 1454 | 2026-05-12 |
Distinct gene signatures of human intermuscular adipose tissue expansion visualized by spatial transcriptomics in mice
2026-Apr-17, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.16.26351017
PMID:42064925
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示小鼠及人类肌间脂肪组织扩张的独特基因特征 | 首次结合人类大块转录组学与小鼠空间转录组学,跨物种比较揭示肌间脂肪组织扩张的局部化、上下文依赖性谱系转变机制,并鉴定到EBF2作为关键成脂转录因子 | 仅在小鼠模型中验证空间转录组数据,人类样本大块转录组缺乏空间分辨率;未完全解析人类与小鼠间物种特异性调控网络的差异 | 阐明肌间脂肪组织扩张的细胞组织及调控机制,以揭示其与心血管代谢疾病的关联 | 人类肌间脂肪组织样本及心血管代谢疾病模型的SAM小鼠肌间脂肪组织 | 空间转录组学 | 心血管代谢疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类肌间脂肪组织样本(具体数量未提供)、SAM小鼠(具体数量未提供) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 1455 | 2026-05-12 |
Serial Spatial Transcriptomics Reveal Divergent Routes to Therapy Resistance in Metastatic Breast Cancer
2026-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9365657/v1
PMID:42040933
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研究论文 | 通过连续空间转录组学揭示四名转移性乳腺癌患者在长达3.5年的个性化治疗过程中产生的治疗耐药性差异路径 | 将概率主题建模与空间深度学习相结合,首次在患者层面系统解析了转移性乳腺癌中治疗耐药性的三种普遍原则(通路独立性、微环境重塑和代偿性信号)及其背后的具体分子机制 | 样本量较小(仅四名患者),可能限制了结果的普遍适用性;研究主要基于空间转录组学数据,未结合其他组学数据(如蛋白质组学)进行验证 | 探索转移性乳腺癌在治疗过程中如何通过复杂的空间异质性机制产生耐药性 | 四名转移性乳腺癌患者在不同治疗时间点获取的十份活检样本中的345,207个细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 概率主题模型、空间深度学习 | 空间转录组数据 | 四名患者的十份活检样本,共计345,207个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1456 | 2026-05-12 |
sigNATURE maps cohort-specific T-cell states to reproducible programs of ICI response
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.14.718532
PMID:42039669
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研究论文 | 提出sigNATURE框架,通过参考图谱映射方法增强免疫检查点抑制剂单细胞RNA-seq研究中T细胞生物标志物的可重复性 | 提出参考引导框架sigNATURE,将查询细胞映射到大型CD4和CD8 T细胞图谱,并在图谱对齐坐标系中评估已发布的免疫检查点抑制剂响应标志物,通过细胞级可识别性评分量化图谱支持度 | 基于两个独立队列(36例非小细胞肺癌和15例皮肤癌患者)验证,样本量和癌症类型有限 | 提高单细胞RNA-seq研究中免疫检查点抑制剂响应T细胞标志物的可重复性和跨队列可比性 | 免疫检查点抑制剂治疗患者的T细胞状态 | 自然语言处理 | 非小细胞肺癌, 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | 参考图谱映射 | 单细胞RNA-seq数据 | 36例非小细胞肺癌患者和15例皮肤癌患者(11例基底细胞癌和4例鳞状细胞癌) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1457 | 2026-05-12 |
Regional and Systemic Metabolic Remodeling Promotes Longevity by Bioengineered Yeast-Derived Lipids
2026-Apr-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717033
PMID:42039507
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研究论文 | 研究发现从基因工程改造的长寿酵母菌株中提取的脂质能延长果蝇寿命,揭示其通过改善肠道完整性、代谢重编程和肠道-脑通讯等机制促进健康衰老 | 首次发现来自基因改造长寿酵母的饮食脂质能跨物种延长果蝇寿命,结合重水探针受激拉曼散射显微镜、单核RNA测序和FLY-MAP代谢分析流程,系统揭示了脂质通过改善肠道上皮结构、重编程代谢及增强肠-脑通讯的多层次长寿机制 | 研究主要基于果蝇模型,酵母脂质在哺乳动物中的功效和安全性有待验证;脂质组成复杂,具体活性成分和作用靶点需进一步阐明 | 探究基因工程改造长寿酵母来源的饮食脂质对果蝇寿命的影响及其分子机制 | 果蝇(Drosophila)以及基因工程改造的长寿酵母菌株 | 机器学习 | 老年病 | 重水探针受激拉曼散射显微镜、单核RNA测序、拉曼光谱、脂质组学 | NA | 图像、文本、序列 | 未明确说明样本量,涉及果蝇肠道和脑组织的单核RNA测序及代谢成像 | 10x Genomics | 单核RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单核RNA测序 |
| 1458 | 2026-05-12 |
MitoChontrol: Adaptive mitochondrial filtering for robust single-cell RNA sequencing quality control
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716517
PMID:41993278
|
研究论文 | 提出MitoChontrol,一种基于细胞类型感知的概率框架,用于单细胞RNA测序质量控制中的线粒体过滤 | 采用高斯混合分布建模转录相干簇内的线粒体转录本比例,动态确定过滤阈值,避免固定百分比阈值的局限性 | 未提及具体限制 | 开发更稳健的自适应线粒体过滤方法,以改进单细胞RNA测序质量控制 | 受控扰动实验和胰腺导管腺癌单细胞数据集中的细胞群体 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1459 | 2026-05-12 |
Mass cytometry uncovers distinct blood myeloid phenotypes linked to clinical responses during gastric cancer chemoimmunotherapy
2026-Mar-31, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04263-1
PMID:41915048
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研究论文 | 利用质谱流式技术揭示胃癌化疗联合免疫治疗中与临床反应相关的外周血髓系细胞表型 | 首次通过高维度质谱流式技术动态监测胃癌患者化疗联合免疫治疗过程中外周血免疫细胞的变化,发现早期单核细胞升高与良好生存率相关 | 样本量较小(24例患者),且为回顾性分析,需要更大规模前瞻性研究验证 | 探索胃癌患者在帕博利珠单抗联合XELOX化疗方案治疗下外周血免疫细胞的动态变化及其与临床反应的关系 | 转移性胃癌患者的外周血免疫细胞和配对组织样本 | 免疫学 | 胃癌 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据、基因表达数据 | 24例胃癌患者在基线、一个周期XELOX化疗后、帕博利珠单抗添加18周后采集的外周血样本 | NA | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1460 | 2026-05-12 |
Identification of suicide brain transcriptomic signatures using meta-analysis of multiple cohorts
2026-Mar-31, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-026-03978-8
PMID:41916959
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研究论文 | 通过多个队列的荟萃分析鉴定自杀大脑转录组特征 | 整合了16个队列的公开死后大脑转录组数据集及一个国内队列,采用多种荟萃分析方法并结合细胞类型特异性表达反卷积,识别出与自杀相关的差异表达基因,突出了小胶质细胞、星形胶质细胞、免疫反应及长链非编码RNA的表观遗传调控机制 | 未提及具体限制 | 识别自杀行为的转录组生物标志物,为预防和治疗提供分子靶点 | 死后大脑样本的转录组数据 | 机器学习 | 精神疾病 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA测序 | 荟萃分析 | 转录组数据 | 16个队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 多个技术平台,具体未指明 |