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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1441 | 2025-10-05 |
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Sep-11, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2025.101379
PMID:40939573
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研究论文 | 评估小直径无细胞组织工程血管在灵长类动物模型中作为冠状动脉搭桥移植物的可行性和耐久性 | 首次在灵长类动物模型中验证小直径无细胞组织工程血管作为冠状动脉搭桥移植物的长期性能,并发现宿主细胞从旁路冠状动脉向内生长可调节血管直径 | 研究样本量较小(n=5),仅观察了6个月的短期效果 | 解决冠状动脉搭桥手术中自体血管不足或质量差的问题,开发替代性血管移植物 | 成年狒狒(非人灵长类动物) | 组织工程 | 心血管疾病 | 空间转录组学,计算机断层扫描血管成像,组织学分析 | NA | 影像数据,基因表达数据,组织学数据 | 5只成年狒狒 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1442 | 2025-10-05 |
OmicsTweezer: A distribution-independent cell deconvolution model for multi-omics Data
2025-Sep-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100950
PMID:40675159
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研究论文 | 开发了一种分布无关的细胞反卷积模型OmicsTweezer,用于多组学数据中的细胞类型比例估计 | 通过整合最优传输与深度学习,在共享潜在空间中对齐模拟和真实数据,有效缓解数据偏移和组学间分布差异 | NA | 开发能够克服批次效应和分布差异的细胞反卷积方法 | 批量组学数据中的细胞类型比例估计 | 机器学习 | 前列腺癌, 结肠癌 | 最优传输, 深度学习 | 深度学习模型 | 批量RNA-seq, 批量蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 批量蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | NA |
1443 | 2025-10-05 |
Paired single-cell and spatial transcriptional profiling reveals a central osteopontin macrophage response mediating tuberculous granuloma formation
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01559-25
PMID:40772762
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研究论文 | 通过配对单细胞和空间转录组分析揭示骨桥蛋白巨噬细胞在结核性肉芽肿形成中的核心作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组技术系统解析结核肉芽肿的细胞组成和空间结构,发现骨桥蛋白高表达巨噬细胞群的核心调控作用 | 研究样本来自患者活检标本,样本数量有限;斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 | 阐明结核性肉芽肿的细胞组成、空间结构和形成机制 | 结核病患者肉芽肿活检标本和斑马鱼感染模型 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 轨迹分析, 空间去卷积 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 结核病患者肉芽肿活检标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1444 | 2025-10-05 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01010-25
PMID:40815167
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研究论文 | 本研究通过全基因组CRISPR敲除筛选和单细胞RNA测序技术,揭示了RSV感染过程中宿主决定因素及感染细胞与未感染旁观者细胞的转录差异 | 首次结合全基因组CRISPR筛选和单细胞RNA测序分析RSV感染,揭示了感染细胞与旁观者细胞的不同转录模式,并将发现与17种其他病毒的29项已发表研究进行对比 | 未明确说明样本来源和具体样本数量 | 阐明RSV感染的宿主依赖性因素和转录特征 | 呼吸道合胞病毒(RSV)感染的宿主细胞反应 | 功能基因组学 | 呼吸道病毒感染 | 全基因组CRISPR敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1445 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell atlas of human atherosclerotic plaques
2025-Sep-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63202-x
PMID:40931012
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研究论文 | 构建人类动脉粥样硬化斑块整合单细胞图谱,揭示斑块进展的细胞机制 | 首次创建全面整合的人类动脉粥样硬化斑块单细胞图谱,通过专家共识和表面蛋白测量验证细胞类型注释,识别斑块中性粒细胞特异性标志物、促血管生成内皮细胞簇和特殊巨噬细胞亚群 | NA | 阐明动脉粥样硬化斑块进展的免疫机制和结构细胞转化 | 人类动脉粥样硬化斑块 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 约25万个高质量注释细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1446 | 2025-10-05 |
GPR91 mediates low shear stress-induced endothelial ferroptosis via EGR1-dependent GPX4 repression
2025-Sep-10, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112127
PMID:40939914
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研究论文 | 本研究揭示了低剪切应力通过GPR91/EGR1/GPX4信号轴诱导血管内皮细胞铁死亡的新机制 | 首次发现GPR91作为机械敏感受体连接低剪切应力与铁死亡信号通路,并阐明EGR1介导的GPX4转录抑制机制 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏在体动物模型验证 | 探究低剪切应力诱导内皮细胞铁死亡的分子机制 | 血管内皮细胞、HEK293T细胞、动脉粥样硬化斑块 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、RNA-seq、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1447 | 2025-10-05 |
Comparative efficacy and safety of PSCA CAR-engineered Vδ1 γδ T cells for immunotherapy of pancreatic cancer
2025-Sep-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011890
PMID:40930745
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研究论文 | 本研究比较了PSCA CAR工程化Vδ1 γδ T细胞在胰腺癌免疫治疗中的疗效和安全性 | 首次直接比较CAR工程化Vδ1 γδ T细胞、Vδ2 γδ T细胞和传统αβ T细胞在胰腺癌治疗中的安全性和有效性 | Vδ1 γδ T细胞在外周血中丰度较低且体外扩增困难 | 评估CAR工程化Vδ1 γδ T细胞对胰腺癌的免疫治疗效果和安全性 | 前列腺干细胞抗原(PSCA)表达的胰腺肿瘤细胞 | 免疫治疗 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1448 | 2025-10-05 |
EP300 as a potential mediator of stress-induced sleep disruption through blood-brain barrier dysfunction and neuroinflammation
2025-Sep-09, Sleep medicine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.sleep.2025.106802
PMID:40939466
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了EP300基因在应激诱导睡眠障碍中的潜在作用机制 | 首次发现EP300在睡眠障碍中的潜在作用,并揭示其通过血脑屏障功能障碍和神经炎症介导睡眠紊乱的机制 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 识别影响睡眠障碍的关键基因,为理解、预防和治疗睡眠障碍提供新视角 | 睡眠障碍相关基因、小鼠模型的前额叶皮质组织 | 生物信息学 | 睡眠障碍 | 差异表达分析,加权基因共表达网络分析,孟德尔随机化,qPCR,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 慢性不可预测应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1449 | 2025-10-05 |
The RNA-Binding Protein RBMX Mediates the Immunosuppressive Microenvironment of Osteosarcoma by Regulating CD8+T Cells
2025-Sep-06, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172928
PMID:40941025
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白RBMX通过调控CD8+T细胞介导骨肉瘤免疫抑制微环境的机制 | 首次发现RBMX在骨肉瘤中高表达并通过调控H2-K1和THBS1影响CD8+T细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究RBMX在骨肉瘤免疫微环境中的调控机制 | 骨肉瘤细胞、CD8+T细胞、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、多重免疫荧光、PCR | 小鼠皮下移植瘤模型 | 转录组测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | 人类骨肉瘤数据库和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1450 | 2025-10-05 |
Long Noncoding RNAs as Emerging Regulators of Seed Development, Germination, and Senescence
2025-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178702
PMID:40943616
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA在种子发育、萌发和衰老过程中的调控作用 | 整合了lncRNAs在种子发育关键阶段的多重调控机制,包括染色质重塑、RNA指导的DNA甲基化等新兴功能 | NA | 探讨lncRNAs在种子发育生理过程中的调控功能 | 种子发育过程(胚胎发生、成熟、休眠、萌发和衰老) | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、直接RNA测序、RNA-染色质相互作用图谱 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1451 | 2025-10-05 |
Application of Single-Cell Sequencing and Machine Learning in Prognosis and Immune Profiling of Lung Adenocarcinoma: Exploring Disease Mechanisms and Treatment Strategies Based on Circadian Rhythm Gene Signatures
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172911
PMID:40941008
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习方法,基于昼夜节律基因构建肺腺癌预后模型并探索其免疫特征 | 首次结合单细胞测序和机器学习分析昼夜节律基因在肺腺癌中的作用,发现ARNTL2基因的关键促癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分相对有限 | 探索昼夜节律基因在肺腺癌预后和免疫特征中的作用机制 | 肺腺癌患者组织和细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 转录组测序 | Stepwise Cox回归, SuperPC | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1452 | 2025-10-05 |
An Update on Single-Cell RNA Sequencing in Illuminating Disease Mechanisms of Cutaneous T-Cell Lymphoma
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172921
PMID:40941016
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在皮肤T细胞淋巴瘤疾病机制研究中的最新应用进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在揭示CTCL肿瘤微环境异质性和相互作用网络中的最新发现 | CTCL疾病本身具有高度异质性,现有研究仍存在样本量有限等局限 | 更新单细胞RNA测序在皮肤T细胞淋巴瘤研究中的应用现状和发现 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL) | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1453 | 2025-10-05 |
PIAS1 Shapes a Tumor-Suppressive Microenvironment by Suppressing Immune Evasion in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Sep-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172905
PMID:40941002
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研究论文 | 本研究通过免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境中抑制免疫逃逸并塑造肿瘤抑制性微环境的作用机制 | 首次系统阐明PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境非恶性基质和免疫细胞中的表达特征和功能,发现PIAS1阳性细胞具有肿瘤抑制特性而阴性细胞富集免疫抑制信号 | 研究主要基于观察性数据分析,需要进一步的功能实验验证PIAS1的具体作用机制 | 探究PIAS1在口腔鳞癌肿瘤微环境中的表达特征和功能相关性 | 口腔鳞癌组织样本和正常组织样本 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,差异基因表达分析,通路分析,细胞间通讯推断 | NA | 组织图像,单细胞RNA测序数据 | 口腔鳞癌组织微阵列和单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1454 | 2025-10-05 |
Unraveling the developmental heterogeneity of human retinal ganglion cells within the developing retina to study to the continuity of maturation
2025-Sep-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.08.025
PMID:40912448
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的连续成熟轨迹 | 首次构建了人类胎儿视网膜从第8周到第27周的单细胞图谱,并应用伪时间分析揭示了视网膜神经节细胞成熟的连续性过程 | 研究仅涵盖胎儿发育阶段,缺乏成年期视网膜发育数据 | 解析人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的成熟异质性和连续性 | 人类胎儿视网膜组织中的视网膜神经节细胞 | 单细胞基因组学 | 视网膜发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 人类胎儿视网膜样本(孕周8-27周) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1455 | 2025-10-05 |
Machine Learning Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data Reveals Cathepsin B as a Central PANoptosis Regulator in Influenza
2025-Sep-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178533
PMID:40943452
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,揭示了组织蛋白酶B在流感病毒感染中作为PANoptosis核心调控因子的作用 | 首次将bulk和单细胞RNA测序数据整合分析,采用多种机器学习算法识别PANoptosis关键调控基因,发现组织蛋白酶B在流感相关肺损伤中的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的验证尚需进一步研究 | 探究流感病毒感染中PANoptosis的分子调控机制 | 流感A病毒感染的肺组织 | 机器学习 | 流感 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SVM, Random Forest, LASSO回归 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1456 | 2025-10-05 |
BMP5 signalling in beta cells and the impact on insulin secretion in the context of type 2 diabetes
2025-Sep, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06457-9
PMID:40471239
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研究论文 | 本研究探讨BMP5信号在胰岛β细胞中的表达及其对胰岛素分泌的影响 | 首次揭示BMP5是β细胞中主要表达的BMP配体,并发现其在2型糖尿病中上调会损害β细胞功能 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探究BMP5信号在胰岛β细胞功能维持中的作用机制 | 人胰岛细胞和EndoC-βH1细胞系 | 细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因敲低,线粒体呼吸测量,葡萄糖刺激胰岛素分泌测试 | NA | 基因表达数据,生理功能数据 | 来自有无2型糖尿病供体的人胰岛细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1457 | 2025-10-05 |
CXCL6 Is a Novel Biliary Marker and a Downstream Target of MMP7 in Biliary Atresia
2025-Sep, Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/hepr.14217
PMID:40515742
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CXCL6是MMP7的下游靶点,并验证其作为胆道闭锁新型胆道标志物的潜力 | 首次发现CXCL6是MMP7在胆道闭锁中的下游靶点,并证实其在肝纤维化过程中的病理作用 | 未阐明MMP7-CXCL6信号通路在胆道闭锁发病机制中的完整分子机制 | 探究MMP7在胆道闭锁发病机制中的下游信号通路 | 胆道闭锁患者肝脏组织和血清样本,胆管上皮细胞 | 单细胞组学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,ELISA,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据,蛋白表达数据 | 胆道闭锁患者、非胆道闭锁胆汁淤积患者和正常对照的肝脏及血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1458 | 2025-10-05 |
Heterogeneity in Osteosarcoma Revealed by scRNA Sequencing: CLU+ Endothelial Cells as Key Players in Tumor Progression
2025-Sep, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70138
PMID:40623412
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤的空间异质性,发现外周区域CLU+内皮细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 首次在骨肉瘤中系统比较中心区域和外周区域的单细胞转录组差异,鉴定出CLU+内皮细胞亚群通过ITGB1介导的胶原蛋白家族成员促进肿瘤转移,并通过Nectin2-TIGIT通路诱导CD8+ T细胞耗竭 | 样本量较小(仅6例患者),需要更大规模研究验证发现 | 探索骨肉瘤瘤内异质性在肿瘤进展中的作用机制 | 骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本(中心区域和外周区域) | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1459 | 2025-10-05 |
Investigating cytotoxic and inflammatory human IL-7 receptor low effector memory CD8+ T cells in lupus
2025-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105898
PMID:40857939
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研究论文 | 本研究通过分析狼疮患者外周血和肾脏组织中的CD8+ T细胞异质性,揭示了IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的关键作用 | 首次发现IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮患者中积累,并证明其通过TNF-α和IFN-γ依赖性方式诱导中性粒细胞胞外诱捕网形成 | 研究主要基于转录组数据和体外实验,需要进一步的功能验证和机制研究 | 探讨CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的作用及其异质性意义 | 狼疮患者的外周血和肾脏组织样本 | 免疫学 | 狼疮 | 单细胞RNA测序,微阵列,成像质谱流式细胞术 | NA | RNA测序数据,微阵列数据,图像数据 | 狼疮患者和正常人的外周血及肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
1460 | 2025-10-05 |
Hematopoietic EphA4 Deficiency Alters Microglial Heterogeneity and Improves Chronic Spatial Memory After Brain Injury
2025-Aug-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7265717/v1
PMID:40909780
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研究论文 | 本研究探讨造血细胞特异性EphA4缺失对脑损伤后小胶质细胞异质性和空间记忆功能的长期影响 | 首次揭示外周免疫来源的EphA4信号通过调节小胶质细胞异质性影响脑损伤后的长期神经免疫重塑和功能恢复 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究EphA4在调节脑损伤后急性和慢性小胶质细胞反应及功能恢复中的作用 | 造血特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, 骨髓嵌合模型, 控制性皮质撞击损伤 | 动物模型 | 基因表达数据, 行为学数据, 形态学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |