单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 14561 - 14580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14561 | 2024-08-04 |
Meta-Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data Reveals the Mechanism of Formation and Heterogeneity of Tertiary Lymphoid Organ in Vascular Disease
2023-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.318762
PMID:37589134
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meta-analysis | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了血管疾病中三级淋巴器官的形成机制及其异质性 | 首次系统性研究了血管疾病模型中三级淋巴器官的存在及其生长环境 | 未详细描述不同血管疾病模型各自的具体机制 | 探索不同血管疾病中三级淋巴器官的存在及其形成机制 | 分析28个单细胞RNA测序数据集，涉及5种血管疾病模型 | 数字病理学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 28个单细胞RNA测序数据集 |
| 14562 | 2024-08-07 |
The parenting hub of the hypothalamus is a focus of imprinted gene action
2023-10, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010961
PMID:37856383
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研究论文 | 本文通过系统生物学方法，利用单细胞RNA测序数据，研究了印记基因在调控亲代行为中的作用，特别是在下丘脑的亲代行为中枢中的表达情况。 | 首次发现并验证了印记基因Magel2在下丘脑亲代行为中枢中的表达，及其对亲代行为的调控作用。 | 研究仅限于Magel2基因，未涵盖所有印记基因在亲代行为中的作用。 | 探讨印记基因在调控亲代行为中的作用及其在下丘脑亲代行为中枢中的表达。 | 印记基因Magel2及其在下丘脑亲代行为中枢中的表达和功能。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | Magel2-null(+/p)小鼠的母鼠、父鼠和未交配雌鼠 |
| 14563 | 2024-08-04 |
Core conserved transcriptional regulatory networks define the invasive trophoblast cell lineage
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201826
PMID:37417811
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研究论文 | 该研究探讨了老鼠和人类侵袭性滋养层细胞谱系的转录调控网络 | 首次整合了单核ATAC-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了跨物种的基因调控相似性 | 该研究主要集中于老鼠模型，可能无法完全代表人类系统 | 研究侵袭性滋养层细胞的调控机制及其在妊娠中的作用 | 老鼠的侵袭性滋养层细胞及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq和RNA-seq | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量，涉及孕期15.5天和19.5天的老鼠子宫-胎盘界面组织 |
| 14564 | 2024-08-04 |
Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs
2023-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad029
PMID:36727460
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研究论文 | 本研究探讨了JPX和FTX同源基因对XIST的物种特异性调控 | 揭示了人类和小鼠之间JPX对XIST表达的调控差异，尽管其主要序列没有保守性 | 本研究主要集中于人类和小鼠的比较，可能无法推广到其他物种 | 研究X染色体失活过程中XIST的调控机制及其在不同物种中的功能保守性 | 主要研究FTX和JPX这两个lncRNA基因在不同物种中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 分析了早期人类胚胎发育中单细胞的RNA-seq数据以及小鼠的多能干细胞或分化后细胞 |
| 14565 | 2024-08-07 |
Comparing engineered nuclear-localized reporter cassettes
2023, microPublication biology
DOI:10.17912/micropub.biology.001014
PMID:38021170
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研究论文 | 本文通过CRISPR/Cas9基因编辑技术，为6种不同的神经肽编码基因生成了报告基因等位基因，并比较了不同报告基因盒的表达水平 | 首次比较了不同核定位报告基因盒在神经肽基因表达分析中的应用效果 | NA | 分析神经肽基因表达的动态变化及其调控机制 | 6种不同的神经肽编码基因 | 基因工程 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 基因表达数据 | 6种不同的神经肽编码基因 |
| 14566 | 2024-08-07 |
Single cell multi-omics characterise discrete human tendon cells populations that persist in vitro and on fibrous scaffolds
2022-08-02, European cells & materials
IF:3.2Q1
DOI:10.22203/eCM.v044a01
PMID:35916474
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研究论文 | 本文通过单细胞表面蛋白质组学和无偏倚的单细胞转录组学（CITE-Seq）技术，研究了体外培养的健康人腿筋成纤维细胞在组织培养塑料或可吸收聚二恶烷酮电纺纤维上的持久性及其细胞亚群特征。 | 首次使用CITE-Seq技术结合单细胞表面蛋白质组学，识别并描述了体外培养的人类腱细胞的多个离散亚群及其在电纺纤维上的生存情况。 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内环境，且样本量较小，可能影响结果的普遍性。 | 旨在识别和分离关键的致病性和修复性细胞，以开发精准治疗和可植入材料，改善腱愈合。 | 健康人腿筋成纤维细胞及其在不同培养条件下的细胞亚群。 | 数字病理学 | 腱病 | CITE-Seq | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 14567 | 2024-08-07 |
XIAP restrains TNF-driven intestinal inflammation and dysbiosis by promoting innate immune responses of Paneth and dendritic cells
2021-Nov-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf7235
PMID:34739338
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研究论文 | 本文研究了XIAP蛋白在抑制TNF驱动的肠道炎症和菌群失调中的作用，通过促进潘氏细胞和树突状细胞的先天免疫反应 | 首次揭示了XIAP通过调节TLR5和TNFR2信号通路，维持潘氏细胞和树突状细胞的功能，从而防止肠道炎症和菌群失调 | NA | 探究XIAP在肠道炎症和菌群失调中的作用机制 | XIAP缺陷小鼠和XLP2患者样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | scRNA-seq, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | XIAP缺陷小鼠和XLP2患者样本 |
| 14568 | 2024-08-07 |
GLP-1 receptor signaling increases PCSK1 and β cell features in human α cells
2021-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.141851
PMID:33554958
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研究论文 | 研究探讨了GLP-1受体信号如何增加人α细胞中的PCSK1表达及β细胞特征 | 首次展示了GLP-1受体激动剂liraglutide在人胰岛中通过DART-Seq技术增加α细胞PC1/3 mRNA表达的效果，并发现这一过程与β细胞样基因表达增加相关 | 研究主要集中在α细胞的特定亚群，可能未涵盖所有α细胞的反应 | 揭示α细胞PC1/3表达激活的机制，为糖尿病治疗提供新靶点 | 人胰岛中的α细胞和β细胞 | NA | 糖尿病 | scRNA-seq | NA | RNA | 研究涉及人胰岛和小鼠模型 |
| 14569 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of equine mesenchymal stromal cells from primary donor-matched tissue sources reveals functional heterogeneity in immune modulation and cell motility
2020-12-04, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-02043-5
PMID:33276815
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了从马的三种不同组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）获得的间充质干细胞，揭示了这些细胞在免疫调节和细胞迁移功能上的异质性 | 首次在马的间充质干细胞中使用单细胞RNA测序技术，并结合功能实验验证了转录差异与细胞迁移和免疫调节功能的关系 | NA | 研究间充质干细胞的异质性及其对治疗潜力的影响 | 马的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从三种植入匹配的组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）收集的马间充质干细胞 |
| 14570 | 2024-08-07 |
Prothioconazole exposure disrupts oocyte maturation and fertilization by inducing mitochondrial dysfunction and apoptosis in mice
2024-03, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究探讨了新型广谱三唑类杀菌剂普托康唑（PTC）对小鼠卵母细胞成熟和受精的影响，发现PTC通过诱导线粒体功能障碍和细胞凋亡来破坏卵母细胞的发育和受精能力 | 首次报道了PTC对卵母细胞发育能力和受精能力的具体影响，包括破坏纺锤体形态、染色体排列、α-微管蛋白乙酰化水平及动粒-微管连接，以及影响精子结合能力和Juno、皮质颗粒和Ovastacin的动态 | 研究主要集中在PTC对卵母细胞的影响，未涉及对其他生殖细胞或整个生殖系统的影响 | 探究PTC对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响 | 小鼠的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 14571 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals a link of ovule abortion and sugar transport in Camellia oleifera
2024, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2024.1274013
PMID:38371413
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了油茶中胚珠流产与糖运输之间的关联 | 首次报道了木本作物卵巢的单细胞转录组图谱，并探讨了胚珠流产可能与胎盘和胚珠中的糖运输有关 | NA | 探讨胚珠流产的机制及其与糖运输的关系 | 油茶的不同胚珠流产率品种的成熟卵巢细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 20,526个高质量细胞 |
| 14572 | 2024-08-07 |
Sputum Transcriptomics Reveals FCN1+ Macrophage Activation in Mild Eosinophilic Asthma Compared to Non-Asthmatic Eosinophilic Bronchitis
2024-Jan, Allergy, asthma & immunology research
DOI:10.4168/aair.2024.16.1.55
PMID:38262391
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研究论文 | 本文通过痰液转录组学分析，比较了轻度嗜酸性哮喘与非哮喘性嗜酸性支气管炎中FCN1+巨噬细胞活化的差异。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了FCN1+巨噬细胞在嗜酸性哮喘中的活化及其与气道重塑过程的关系。 | 研究样本量较小，且未涉及更广泛的哮喘类型和更深入的分子机制探讨。 | 比较嗜酸性哮喘与非哮喘性嗜酸性支气管炎在痰液转录组学层面的差异，探讨其背后的分子机制。 | 嗜酸性哮喘患者、非哮喘性嗜酸性支气管炎患者及健康对照者的痰液细胞。 | 数字病理学 | 哮喘 | RNA测序 | 单细胞RNA测序 | 转录组数据 | 嗜酸性哮喘患者18例，非哮喘性嗜酸性支气管炎患者15例，健康对照者28例 |
| 14573 | 2024-08-07 |
Pyroptosis-Related Subtypes Predict the Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma to Targeted Therapy
2023-12-08, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2812334
PMID:38179741
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研究论文 | 本研究基于焦亡相关基因的共识聚类对透明细胞肾细胞癌（ccRCC）进行分子分型，并探讨其对靶向治疗的反应预测 | 首次揭示了焦亡相关基因在ccRCC中的作用，并基于此开发了预测ccRCC对靶向治疗反应的分子亚型 | NA | 探讨焦亡在透明细胞肾细胞癌进展中的作用，并开发个性化治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序，CIBERSORT分析，Lasso回归 | NA | 基因组，转录组，蛋白质 | NA |
| 14574 | 2024-08-07 |
Transcriptional diversity in specific synaptic gene sets discriminates cortical neuronal identity
2023-05-09, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00372-y
PMID:37161421
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研究论文 | 本文通过结合SynGO数据库和单细胞RNA测序数据，研究了小鼠新皮质中神经元细胞类型的转录多样性，并展示了通过突触基因可以有效区分细胞类型。 | 首次系统地识别了大脑中所有突触群体的转录多样性，并发现突触基因在区分细胞类型方面与所有基因具有相同的能力。 | NA | 量化并识别神经元细胞类型的特定突触特征。 | 小鼠新皮质中的神经元细胞类型。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠新皮质中的所有突触群体 |
| 14575 | 2024-08-07 |
A Comparison of the Various Methods for Selecting Features for Single-Cell RNA Sequencing Data in Alzheimer's Disease
2023, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-31982-2_27
PMID:37486500
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研究论文 | 本文比较了用于阿尔茨海默病中单细胞RNA测序数据特征选择的不同方法 | 本文采用了专门为单细胞RNA测序设计的特征选择算法，并将其应用于阿尔茨海默病的研究 | NA | 研究旨在评估和比较不同标记基因选择方法在阿尔茨海默病中的性能 | 阿尔茨海默病中的单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 (SVM), k-最近邻算法 (k-NN), 线性判别分析 (LDA) | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 14576 | 2024-08-07 |
Construction and evaluation of endometriosis diagnostic prediction model and immune infiltration based on efferocytosis-related genes
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1298457
PMID:38370978
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研究论文 | 本研究构建并评估了基于吞噬作用相关基因的子宫内膜异位症诊断预测模型及免疫浸润 | 本研究首次识别并验证了与子宫内膜异位症相关的13个吞噬作用相关差异表达基因，并构建了诊断模型 | 研究主要基于公共数据库和机器学习技术，临床样本验证有限 | 旨在识别子宫内膜异位症的诊断标志物并构建诊断模型 | 子宫内膜异位症及其相关的吞噬作用相关基因 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO和SVM回归模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公共数据库中的数据集 |
| 14577 | 2024-08-07 |
Development of a single-cell atlas for woodland strawberry (Fragaria vesca) leaves during early Botrytis cinerea infection using single cell RNA-seq
2022-Jan-19, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhab055
PMID:35043166
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，构建了林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的单细胞图谱，并分析了不同细胞类型的基因表达模式 | 首次报道了植物病原入侵过程中单细胞转录组景观，为宿主-病原体相互作用的全面动态提供了新见解 | NA | 研究植物在病原体入侵时的防御反应及信号转导过程 | 林地草莓叶片在灰霉病菌感染早期的细胞类型及基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过50,000个单细胞 |
| 14578 | 2024-08-07 |
Single-cell trajectories of melanoma cell resistance to targeted treatment
2021-Oct-01, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了BRAFV600E突变的黑色素瘤细胞系在不同治疗条件下的反应，以探索黑色素瘤细胞对靶向治疗产生耐药性的机制 | 研究首次详细描述了单药和双药治疗耐药黑色素瘤细胞的分子轨迹，并验证了这些发现 | NA | 深入理解黑色素瘤细胞在治疗诱导下的细胞重编程和可塑性，并识别可能与耐药管理相关的靶点 | BRAFV600E突变的黑色素瘤细胞系在不同治疗条件下的反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入和自组织映射 | RNA | 涉及四种治疗条件的黑色素瘤细胞系 |
| 14579 | 2024-08-07 |
EZH2 identifies the precursors of human natural killer cells with trained immunity
2021-Sep-24, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究旨在识别和探索人类自然杀伤细胞（NK细胞）中训练免疫的前体细胞亚群及其调控靶点 | 首次识别出CD57-NKG2A+EZH2+IFNG+MKI67+IL12R+IL15R+IL18R+ NK细胞亚群作为训练免疫的前体细胞，并揭示EZH2在训练免疫诱导中的关键作用 | NA | 识别训练免疫的人类NK细胞前体亚群并探索可能的药物干预调控靶点 | 人类自然杀伤细胞（NK细胞）及其训练免疫特性 | 免疫学 | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14580 | 2024-08-07 |
Examining heterogeneity of stromal cells in tumor microenvironment based on pan-cancer single-cell RNA sequencing data
2021-Aug-17, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文综述了基于泛癌单细胞RNA测序数据研究肿瘤微环境中基质细胞异质性的研究 | 展示了不同癌症类型中内皮细胞和成纤维细胞/肌成纤维细胞可以被分类为共同亚型，并且亚型组成与癌症特征和治疗反应明显相关 | NA | 评估多种癌症类型中主要细胞类型组成的异质性 | 肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多种癌症类型 |