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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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14541 | 2024-08-04 |
Multi-omics and single-cell sequencing analyses reveal the potential significance of circadian pathways in cancer therapy
2024 Jan-Feb, Expert review of molecular diagnostics
IF:3.9Q1
DOI:10.1080/14737159.2023.2296668
PMID:38288973
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研究论文 | 该研究探讨了生物钟通路在癌症治疗中的潜在重要性 | 首次全面分析了癌症中的生物钟相关基因及其在肿瘤微环境中的作用 | 该研究仅使用了TCGA数据库的数据,可能无法涵盖所有相关表型和样本 | 探索生物钟相关基因在泛癌症中的影响 | 研究多个不同类型肿瘤中的生物钟相关基因表达及其对免疫微环境的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 免疫组织化学 | NA | 基因组数据 | 使用TCGA数据库的多种癌症相关数据,包括多个肿瘤类型的样本 |
14542 | 2024-08-04 |
Association of peripheral B cells and delirium: combined single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2024, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2024.1343726
PMID:38379709
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研究论文 | 本研究探讨了外周B细胞与谵妄的关联,分析了炎症压力下的免疫细胞亚群变化。 | 首次结合单细胞测序和孟德尔随机化法来探究外周免疫细胞与谵妄的因果关系 | 本研究的结果可能受到样本量和遗传数据的限制 | 研究外周免疫细胞亚群在炎症应激情况下的变化及其与谵妄的因果关联 | 人类外周血单核细胞(PBMC)及其亚群 | 数字病理学 | 谵妄 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因型数据、单细胞转录组数据 | 70个与PBMC相关的免疫性状 |
14543 | 2024-08-04 |
Selective inhibition of DNA ligase IV provides additional efficacy to the treatment of anaplastic thyroid cancer
2024, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2024.1323313
PMID:38380364
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研究论文 | 本研究探讨了选择性抑制DNA连接酶IV对治疗未分化甲状腺癌的额外疗效 | 本研究首次显示了DNA连接酶IV抑制剂与DNA损伤剂联合应用对未分化甲状腺癌的治疗潜力 | 样本量和模型的应用限制了研究结果的广泛适用性 | 探讨选择性抑制DNA连接酶IV对未分化甲状腺癌治疗的影响 | 未分化甲状腺癌细胞系(C643和Hth74)及甲状腺癌不同亚型患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 未分化甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,DNA损伤响应监测 | NA | RNA测序数据,细胞培养实验结果 | 多个不同亚型甲状腺癌患者的单细胞数据,使用小鼠异种移植模型进行实验 |
14544 | 2024-08-07 |
Distinct Transcriptional Profiles in the Different Phenotypes of Neurofibroma from the Same Subject with Neurofibromatosis 1
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.03.1688
PMID:37301319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学分析,探讨了同一患者中皮肤神经纤维瘤(cNF)和丛状神经纤维瘤(pNF)的转录特征和微环境差异 | 首次揭示了同一患者中cNF和pNF具有不同的转录特征,pNF中富含具有恶性特征的施万细胞和癌症相关成纤维细胞样表型的成纤维细胞,而cNF中富含带有组织驻留标记的CD8 T细胞 | 研究样本数量有限,仅包括来自不同患者的六例cNF和五例pNF | 探讨神经纤维瘤病1中不同表型的转录特征和微环境差异 | 皮肤神经纤维瘤(cNF)和丛状神经纤维瘤(pNF)的细胞类型和转录特征 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六例cNF和五例pNF样本 |
14545 | 2024-08-07 |
ΔNp63 Regulates Homeostasis, Stemness, and Suppression of Inflammation in the Adult Epidermis
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.07.005
PMID:37543242
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研究论文 | 本研究探讨了ΔNp63在成年表皮中的作用,发现其缺失会导致角质形成细胞增殖和自我维持受损,并触发类似银屑病的炎症反应 | 首次揭示了ΔNp63在成年表皮中调控稳态、干细胞特性及抑制炎症的关键作用 | 研究主要集中在ΔNp63的急性遗传消融对成年表皮的影响,未涉及长期或慢性消融的效应 | 探究ΔNp63在成年表皮中的功能及其对表皮稳态、干细胞特性和炎症抑制的调控机制 | ΔNp63在成年表皮中的作用及其对角质形成细胞增殖、自我维持和炎症反应的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
14546 | 2024-08-04 |
Single-Cell Sequencing of Lung Macrophages and Monocytes Reveals Novel Therapeutic Targets in COPD
2023-12-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12242771
PMID:38132091
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研究论文 | 本研究确定了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的特征,并识别了新型治疗靶点 | 首次明确了COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞的转录特征,为寻找新的治疗靶点提供了依据 | 样本量相对较小,可能限制了研究结果的广泛适用性 | 探索COPD患者肺部巨噬细胞和单核细胞在炎症过程中的作用 | COPD患者和对照组人类肺组织中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 (COPD) | RNA测序 | NA | 转录组数据 | COPD患者18个样本和对照组28个样本 |
14547 | 2024-08-07 |
Pooled Genome-Scale CRISPR Screens in Single Cells
2023-11-27, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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review | 本文综述了单细胞水平上基于CRISPR的基因筛选技术的原理和实际考虑 | 介绍了利用CRISPR-Cas技术在单细胞中进行基因功能调控和表达控制的创新方法 | NA | 探讨基因功能分配和表达控制的基础,以及其在细胞生物学和治疗开发中的应用 | 基因功能和表达控制 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Cas | NA | RNA sequencing, 细胞图像 | NA |
14548 | 2024-08-07 |
IL-11 induces NLRP3 inflammasome activation in monocytes and inflammatory cell migration to the central nervous system
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221007120
PMID:37339207
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研究论文 | 本研究探讨了IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | 首次报道IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中增加,并通过αIL-11 mAb治疗减少炎症和脱髓鞘 | NA | 研究IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中的作用及其治疗潜力 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括复发缓解型多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单个核细胞及脑脊液细胞 |
14549 | 2024-08-04 |
Characterization of the Doublesex/MAB-3 transcription factor DMD-9 in Caenorhabditis elegans
2023-02-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkac305
PMID:36454093
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研究论文 | 本文对秀丽隐杆线虫中的DMD-9转录因子的表达模式和功能进行了表征 | 识别了DMD-9在神经元中的细胞特异性调控及其可能的性别二态性角色 | 在dmd-9突变体中未能观察到DMD-9表达神经元介导的行为缺陷 | 研究DMD-9在秀丽隐杆线虫中的表达模式及其作用 | 主要研究对象为秀丽隐杆线虫的DMD-9转录因子和相关神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | RNA表达数据 | 22种神经细胞命运报告基因 |
14550 | 2024-08-07 |
Gut microbiome dysbiosis in men who have sex with men increases HIV infection risk through immunity homeostasis alteration
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1260068
PMID:38035339
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研究论文 | 本研究旨在比较HIV感染者与男男性行为者(MSM)肠道微生物群变化的差异,并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | 本研究首次揭示了MSM相关肠道微生物群失调通过影响免疫稳态增加HIV感染风险 | 需要进一步研究阐明MSM肠道微生物群失调调节HIV易感性的机制 | 比较HIV感染者与MSM肠道微生物群变化的差异,并揭示MSM相关肠道微生物群失调对免疫系统的影响 | HIV感染者与男男性行为者(MSM)的肠道微生物群 | NA | HIV感染 | 生物信息学技术,单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因和代谢物数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
14551 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals common and unique gene expression profiles in primary CD4+ T cells latently infected with HIV under different conditions
2023, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2023.1286168
PMID:38156317
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的基因表达谱 | 研究揭示了在不同条件下潜伏感染HIV的CD4+ T细胞的共同和独特基因表达模式 | NA | 识别潜伏感染HIV的单个CD4+ T细胞的基因表达谱,并探索这些基因表达谱以优先考虑未来实验验证的基因 | 潜伏感染HIV的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
14552 | 2024-08-07 |
The epigenetic basis of cellular heterogeneity
2021-04, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-020-00300-0
PMID:33244170
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序方法揭示的细胞间基因表达水平的异质性,并分析了表观遗传信息如染色质可及性、核小体定位、组蛋白尾部修饰和增强子-启动子相互作用对基因表达调控的影响。 | 本文介绍了单细胞表观基因组分析方法的最新进展,这些方法能够高分辨率地映射单个细胞中的染色质状态。 | NA | 研究细胞间基因表达异质性的表观遗传基础。 | 研究对象包括单细胞测序数据、染色质状态及其对基因表达的影响。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
14553 | 2024-08-04 |
Mapping the developmental potential of mouse inner ear organoids at single-cell resolution
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109069
PMID:38375227
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研究论文 | 本文使用单细胞测序研究小鼠内耳类器官的细胞异质性 | 本研究揭示了支持细胞亚型和耳蜗样及前庭样毛细胞的发展轨迹 | 尚未明确改进突触连接和区域特异性的未来策略 | 研究内耳类器官的发育潜能及其对基本科学研究的应用 | 小鼠内耳类器官的感官上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | late-stage小鼠内耳类器官的细胞 |
14554 | 2024-08-07 |
SinCMat: A single-cell-based method for predicting functional maturation transcription factors
2024-Feb-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.12.006
PMID:38215756
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research paper | 本文开发了一种基于单细胞RNA测序的计算方法SinCMat,用于预测细胞功能成熟转录因子 | SinCMat是首个专门考虑功能细胞成熟过程的方法,通过识别身份转录因子和信号依赖转录因子的配对,共同靶向驱动功能成熟的基因 | NA | 旨在生成组织特异性成熟和功能细胞的再生医学的主要目标 | 细胞功能成熟转录因子 | natural language processing | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 大规模应用于Mouse Cell Atlas和Tabula Sapiens |
14555 | 2024-08-04 |
A comprehensive pan-cancer analysis of prognostic value and potential clinical implications of FTH1 in cancer immunotherapy
2024-Jan-28, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03625-x
PMID:38281198
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研究论文 | 本文系统探讨了FTH1在癌症免疫疗法中的预后意义和免疫角色 | 本研究揭示了FTH1在肿瘤免疫微环境中的重要作用及其与免疫疗法抵抗之间的关联 | 本文未明确评估不同类型肿瘤对FTH1表达的影响及其潜在机制 | 探讨FTH1在多种癌症免疫治疗中的预后价值和临床潜力 | 探究FTH1作为各种实体癌免疫治疗靶点的潜力 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析和多重免疫荧光染色技术 | NA | NA | NA |
14556 | 2024-08-04 |
Integrating bulk-RNA sequencing and single-cell sequencing analyses to characterize adenosine-enriched tumor microenvironment landscape and develop an adenosine-related prognostic signature predicting immunotherapy in lung adenocarcinoma
2024-Jan-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01281-z
PMID:38265702
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研究论文 | 该文章探讨了腺苷信号在肺腺癌肿瘤微环境中的生物学作用,并开发了与腺苷相关的预后特征。 | 文章创新点在于量化腺苷信号,并建立了腺苷相关的预后特征,预测免疫治疗的有效性。 | 数据分析主要集中在腺苷信号与免疫微环境的关系,可能未涵盖其他重要的生物标志物。 | 探讨腺苷信号在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其在免疫治疗中的预后价值。 | 研究对象为肺腺癌样本中的腺苷信号和肿瘤免疫微环境。 | 数字病理学 | 肺癌 | bulk-RNA测序和单细胞测序 | NA | 样本数据 | LUAD样本的具体样本数量未提及 |
14557 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the transcriptional heterogeneity of Tbx18-positive cardiac cells during heart development
2024-Jan-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01290-6
PMID:38265516
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了Tbx18阳性心脏细胞在心脏发育过程中的转录异质性 | 首次全面揭示了Tbx18阳性心脏细胞在发育过程中的转录景观和细胞异质性 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据,未涉及实验验证 | 探索Tbx18阳性心脏细胞在心脏发育过程中的异质性和转录景观 | Tbx18阳性心脏细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了已发表的小鼠心脏单细胞RNA测序数据 |
14558 | 2024-08-04 |
Transcription Factor IRF7 is Involved in Psoriasis Development and Response to Guselkumab Treatment
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S450048
PMID:38375022
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子IRF7在银屑病发生和guselkumab治疗反应中的作用 | 该研究首次确认了IRF7在银屑病及其对guselkumab治疗反应中的重要性 | 研究可能在样本数量和多样性上存在局限性 | 研究银屑病病因及guselkumab治疗的新治疗策略 | 针对银屑病患者的基因表达及单细胞RNA测序数据进行分析 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 对12周guselkumab治疗前后的银屑病皮肤样本进行分析 |
14559 | 2024-08-04 |
Modelling the distinct roles of epithelial and stromal androgen receptor in the regulation of prostate epithelial dynamics
2023-Nov, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.16900
PMID:37424435
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研究论文 | 本文提出了一个简单的概念框架,阐述了雄激素在前列腺细胞动态中的调控作用 | 提出了基于框架的数学模型,定量拟合了描述前列腺回退和再生的实验数据 | 该模型的复杂性可能不足以全面描述健康和疾病前列腺的所有动态 | 探讨雄激素在前列腺上皮动态调控中的作用及机制 | 前列腺上皮及其微环境中的细胞间相互作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 实验数据 | NA |
14560 | 2024-08-07 |
Immune checkpoint inhibitor-induced colitis is mediated by polyfunctional lymphocytes and is dependent on an IL23/IFNγ axis
2023-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41798-2
PMID:37872166
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研究论文 | 研究免疫检查点抑制剂(CPIs)引起的结肠炎,通过分析小鼠模型中的免疫细胞和分子机制 | 首次揭示了CPIs引起的结肠炎依赖于IL23/IFNγ轴和多功能的淋巴细胞 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类中验证 | 探究免疫检查点抑制剂引起的结肠炎的机制,并寻找可能的治疗策略 | 免疫检查点抑制剂引起的结肠炎及其相关免疫细胞和分子机制 | 免疫学 | 结肠炎 | RNA测序,单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 |