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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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14521 | 2024-08-07 |
Metabolic modeling of single Th17 cells reveals regulators of autoimmunity
2021-08-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.05.045
PMID:34216539
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Compass的算法,用于基于单细胞RNA测序和通量平衡分析来表征细胞的代谢状态,并应用于Th17细胞的代谢状态与其功能变异性(致病潜力)的关联研究 | Compass算法能够预测Th17致病性与精氨酸及下游多胺代谢的关联,并通过实验验证了这一预测 | NA | 研究单个Th17细胞的代谢模型,揭示自身免疫的调控因子 | Th17细胞的代谢状态及其与功能变异性的关联 | NA | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序 | Compass算法 | RNA测序数据 | NA |
14522 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of the cellular heterogeneity and interactions in the injured mouse spinal cord
2021-08-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20210040
PMID:34132743
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠脊髓损伤部位的细胞异质性和细胞间相互作用 | 发现了新的细胞亚群,并利用受体-配体对的表达值识别了预测在血管生成、胶质化和纤维化中调控特定细胞相互作用的信号通路 | NA | 更好地理解脊髓损伤后的愈合过程,以开发针对适当病理生物学的有效治疗药物 | 小鼠脊髓损伤部位的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
14523 | 2024-08-07 |
MondoA-Thioredoxin-Interacting Protein Axis Maintains Regulatory T-Cell Identity and Function in Colorectal Cancer Microenvironment
2021-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.04.041
PMID:33901495
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研究论文 | 本文研究了MondoA-硫氧还蛋白相互作用蛋白轴在结直肠癌微环境中对肿瘤内调节性T细胞(Tregs)身份和功能的影响 | 揭示了MondoA-TXNIP轴在结直肠癌微环境中对Tregs代谢和功能的调控作用,并提出其作为癌症治疗的新靶点 | NA | 探究MondoA在结直肠癌浸润Tregs中对葡萄糖限制的响应作用 | 结直肠癌中的肿瘤内调节性T细胞(Tregs) | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠和人类结直肠癌组织进行研究 |
14524 | 2024-08-07 |
Glucocorticoids and Androgens Protect From Gastric Metaplasia by Suppressing Group 2 Innate Lymphoid Cell Activation
2021-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.04.075
PMID:33971182
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研究论文 | 本文探讨了糖皮质激素和雄激素通过抑制第二组先天淋巴细胞(ILC2s)的激活来保护胃免受化生性损伤的机制 | 揭示了糖皮质激素和雄激素在调节胃炎症中的重叠作用,并阐明了雄激素信号在ILC2s中防止其病理性激活的作用 | NA | 研究性别对胃炎症调节的影响 | 小鼠的胃炎症和化生性损伤 | NA | 胃疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠样本 |
14525 | 2024-08-07 |
A safe and effective mucosal RSV vaccine in mice consisting of RSV phosphoprotein and flagellin variant
2021-07-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109401
PMID:34289371
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研究论文 | 本文构建了一种重组蛋白P-KFD1,由RSV磷蛋白和E. coli K12株衍生的鞭毛蛋白变体KFD1组成,通过鼻内免疫在小鼠中抑制RSV复制并保护其免受肺部疾病的影响。 | 首次报道了使用P-KFD1重组蛋白作为鼻内疫苗,有效抑制RSV复制并保护小鼠免受肺部疾病的影响,且无疫苗增强疾病(VED)。 | 研究仅在 mice 模型中进行,尚未在人类中验证其安全性和有效性。 | 开发一种安全有效的黏膜RSV疫苗。 | RSV病毒和小鼠模型。 | 疫苗学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 小鼠 |
14526 | 2024-08-07 |
Regional specialization and fate specification of bone stromal cells in skeletal development
2021-07-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109352
PMID:34260921
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研究论文 | 本文通过小鼠遗传学、体外细胞分化实验和转录组分析,研究了骨髓间充质干细胞(BMSCs)在骨骼发育中的区域特异性和命运指定 | 首次揭示了来自骨干(dpMSCs)和骨骺(mpMSCs)的BMSCs之间的根本差异,并阐明了BMSC命运受PDGFRβ信号和转录因子Jun-B调控的机制 | NA | 深入理解BMSC在骨骼发育中的发展、谱系关系和分化 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)及其在骨骼发育中的作用 | NA | NA | 小鼠遗传学、体外细胞分化实验、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 |
14527 | 2024-08-07 |
Single-nucleus RNA-seq2 reveals functional crosstalk between liver zonation and ploidy
2021-07-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24543-5
PMID:34253736
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研究论文 | 本文开发了一种针对冷冻组织核转录组全面分析的单核RNA-seq2方法,用于揭示肝细胞不同倍性水平下的转录组特征及其与代谢潜能和空间分布的关系 | 开发了适用于冷冻组织核转录组分析的单核RNA-seq2方法,揭示了肝细胞倍性与代谢潜能及空间分布之间的相互作用 | NA | 探索细胞异质性,特别是肝细胞中倍性状态与代谢潜能及空间分布的关系 | 肝细胞的转录组特征及其与倍性状态的关系 | 数字病理学 | NA | 单核RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
14528 | 2024-08-07 |
Cellular basis of omentum activation and expansion revealed by single-cell RNA sequencing using a parabiosis model
2021-07-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-93330-5
PMID:34230565
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研究论文 | 本研究通过使用共生模型对小鼠网膜进行单细胞RNA测序,揭示了网膜激活和扩张的细胞基础 | 发现了一种新的细胞群,该细胞群在激活的网膜中同时表达巨噬细胞和成纤维细胞标记,表明其可能源自循环巨噬细胞衍生的成纤维细胞样细胞 | 文章未明确提及研究的具体局限性 | 探究网膜在激活过程中的细胞类型变化及其来源 | 小鼠网膜细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 未明确提及具体样本数量 |
14529 | 2024-08-07 |
Coupled analysis of transcriptome and BCR mutations reveals role of OXPHOS in affinity maturation
2021-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00936-y
PMID:34031613
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和主题建模分析了氧化磷酸化(OXPHOS)模块在生发中心(GC)B细胞中的表达,并结合免疫球蛋白重链(Igh)可变基因区域的体细胞超突变分析,揭示了OXPHOS在亲和力成熟中的作用。 | 首次揭示了氧化磷酸化(OXPHOS)在生发中心B细胞亲和力成熟中的作用,并通过实验验证了OXPHOS活性对B细胞克隆扩增和正选择的促进作用。 | NA | 阐明氧化磷酸化在生发中心B细胞亲和力成熟过程中的作用机制。 | 生发中心B细胞及其在亲和力成熟过程中的基因表达和突变。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,主题建模 | NA | 基因表达数据 | NA |
14530 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of human oocyte ageing
2021-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16594
PMID:34037315
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类卵母细胞老化过程中的关键基因和生物信号通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了人类卵母细胞老化过程中的差异表达基因及其富集的生物过程 | 研究样本量较小,且仅包括老年和年轻患者,可能影响结果的普遍性 | 探究人类卵母细胞老化过程中的关键基因和相关生物信号通路 | 人类卵母细胞 | 基因组学 | 生殖健康 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 9个RNA-seq数据集,包括6名老年患者和3名年轻患者 |
14531 | 2024-08-07 |
Post-myocardial infarction heart failure dysregulates the bone vascular niche
2021-06-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24045-4
PMID:34172720
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研究论文 | 本文探讨了心肌梗死后心力衰竭对骨血管细胞组成的影响 | 首次描述了心肌梗死和心力衰竭后骨血管内皮细胞类型的变化,并利用单细胞RNA测序揭示了人类骨髓内皮细胞的转录异质性 | NA | 研究心肌梗死和心力衰竭对骨血管细胞组成的影响 | 心肌梗死和心力衰竭后的骨血管细胞组成 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
14532 | 2024-08-07 |
Tumor vessel co-option probed by single-cell analysis
2021-06-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109253
PMID:34133923
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗血管生成治疗抵抗的肺肿瘤模型中的肿瘤血管共选择现象 | 首次在单细胞水平上研究了共选择的内皮细胞和周细胞的异质性,并发现了可能参与血管共选择的细胞类型 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类肿瘤中验证 | 探究肿瘤血管共选择现象及其对抗血管生成治疗的抵抗机制 | 肿瘤内共选择的内皮细胞、周细胞、癌细胞和骨髓细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 31,964个细胞 |
14533 | 2024-08-07 |
Interactions between cancer cells and immune cells drive transitions to mesenchymal-like states in glioblastoma
2021-06-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.05.002
PMID:34087162
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析人类肿瘤和模型系统,结合功能实验,探讨了胶质母细胞瘤与微环境之间的相互作用 | 首次证明巨噬细胞通过分泌oncostatin M诱导胶质母细胞瘤细胞向间质样状态转变,并揭示了这一过程的分子机制 | NA | 研究胶质母细胞瘤细胞与免疫细胞之间的相互作用及其对肿瘤细胞状态的影响 | 胶质母细胞瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类肿瘤样本 |
14534 | 2024-08-07 |
Tumor restriction by type I collagen opposes tumor-promoting effects of cancer-associated fibroblasts
2021-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI146987
PMID:33905375
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研究论文 | 研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAF)在肿瘤促进和抑制中的双重作用及其机制 | 发现了由肌成纤维细胞型CAF分泌的I型胶原蛋白通过机械限制抑制肿瘤扩散,抵消了CAF的肿瘤促进作用 | 研究主要集中在肝转移的肿瘤类型,可能不完全适用于其他器官的肿瘤 | 理解CAF亚型、其介质、纤维化反应与肿瘤生长之间的功能关系 | 癌症相关成纤维细胞(CAF)及其在肿瘤生长中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,CellPhoneDB配体-受体分析 | NA | RNA | 包括小鼠和患者的多种肿瘤类型 |
14535 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis defines heterogeneity of the murine pancreatic ductal tree
2021-05-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.67776
PMID:34009124
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠胰腺导管细胞、胰胆管细胞和胰内胆管细胞的异质性 | 研究描述了胰腺导管亚群中的上皮-间质过渡轴,并鉴定了骨桥蛋白作为这一命运决定和人类导管细胞去分化的调节因子。此外,研究还揭示了小连蛋白在慢性胰腺炎背景下DNA损伤积累中的作用 | NA | 研究胰腺导管细胞的异质性及其在疾病发展中的作用 | 小鼠胰腺导管细胞、胰胆管细胞和胰内胆管细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
14536 | 2024-08-07 |
Direct contribution of skeletal muscle mesenchymal progenitors to bone repair
2021-05-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22842-5
PMID:34001878
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研究论文 | 本文研究了骨骼肌中的间充质前体细胞在骨修复过程中的直接作用 | 首次揭示了骨骼肌间充质前体细胞在骨折后的纤维化和软骨形成中的作用,并提出使用抗纤维化药物伊马替尼可以改善骨愈合 | NA | 探讨骨骼肌在骨再生中的核心作用,并寻找改善骨愈合的方法 | 骨骼肌中的间充质前体细胞在骨修复中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
14537 | 2024-08-07 |
The neutrotime transcriptional signature defines a single continuum of neutrophils across biological compartments
2021-05-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22973-9
PMID:34001893
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了正常和炎症状态下小鼠组织中中性粒细胞的转录特征,揭示了中性粒细胞发育的单一连续谱。 | 本文首次提出了中性粒细胞发育的单一连续谱概念,称为中性时间(neutrotime),并验证了其在人和小鼠中的普遍性。 | NA | 探讨中性粒细胞在不同生物隔室中的功能多样性是否需要离散的中性粒细胞亚群。 | 正常和炎症状态下小鼠组织中的中性粒细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
14538 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular heterogeneity of aneurysmal infrarenal abdominal aorta
2021-04-23, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaa214
PMID:32678909
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了腹主动脉瘤(AAA)进展中腹主动脉下段(IAA)的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了腹主动脉瘤进展中血管细胞的异质性和细胞反应 | NA | 揭示腹主动脉瘤进展中血管细胞的转录特征和细胞反应 | 腹主动脉下段的血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过4500个腹主动脉细胞 |
14539 | 2024-08-07 |
TNFAIP8 Regulates Intestinal Epithelial Cell Differentiation and May Alter Terminal Differentiation of Secretory Progenitors
2021-04-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10040871
PMID:33921306
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research paper | 本文研究了TNFAIP8(TIPE0)在肠道上皮细胞分化中的作用,特别是对分泌前体细胞终末分化的影响 | 发现了三种可能的新型终末细胞命运决定因子:Nupr1、Kdm4a和Gatad1,并提出TIPE0可能在调节终末分化中起作用 | NA | 探究TNFAIP8在肠道上皮细胞分化中的作用及其对分泌前体细胞终末分化的影响 | 肠道上皮细胞分化及分泌前体细胞的终末分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小肠的单细胞样本 |
14540 | 2024-08-07 |
Interrupting reactivation of immunologic memory diverts the allergic response and prevents anaphylaxis
2021-04, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.11.042
PMID:33338539
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研究论文 | 本文探讨了在花生过敏中IgE回忆反应的关键需求,并展示了IL-4/IL-13信号通路的阻断如何中止IgE产生并改变细胞因子反应。 | 首次展示了IL-4/IL-13信号通路的阻断可以中止IgE产生,并保护小鼠免受过敏反应的影响。 | NA | 研究IgE回忆反应在花生过敏中的关键需求。 | 人类外周血单核细胞(PBMCs)和小鼠模型。 | 免疫学 | 过敏反应 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |