单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
14501	2024-08-07	HER3 Is an Actionable Target in Advanced Prostate Cancer 2021-12-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3360 PMID:34753775	研究论文	本文研究了HER3蛋白在晚期前列腺癌中的表达及其作为治疗靶点的潜力	首次展示了HER3在致命性前列腺癌中的高表达，并证实了HER3靶向治疗策略的有效性	NA	探讨HER3在前列腺癌中的作用及其作为治疗靶点的可行性	HER3蛋白在前列腺癌中的表达及其对肿瘤生长和生存的影响	数字病理学	前列腺癌	多重免疫荧光技术，单细胞RNA测序	NA	组织样本	人类前列腺癌活检样本及小鼠转基因前列腺癌模型
14502	2024-08-07	YTHDF2 is essential for spermatogenesis and fertility by mediating a wave of transcriptional transition in spermatogenic cells 2021-Dec-08, Acta biochimica et biophysica Sinica IF:3.3Q1 DOI:10.1093/abbs/gmab148 PMID:34664060	研究论文	研究探讨了YTHDF2在哺乳动物精子发生中的作用，通过生成特定基因突变体，揭示了YTHDF2对小鼠精子发生和生育能力的重要性	首次证明了YTHDF2在哺乳动物精子发生中的关键作用，并揭示了其在转录后水平调控精子发生过程中的具体机制	研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在其他哺乳动物中验证YTHDF2的作用	探讨YTHDF2在哺乳动物精子发生中的作用及其对生育能力的影响	YTHDF2在小鼠精子发生中的功能及其对生育能力的影响	NA	男性不育	RNA-seq, MeRIP-qPCR, 荧光激活细胞分选	NA	转录组数据	特定基因突变体Ythdf2-vKO小鼠
14503	2024-08-07	Neurexin-3 defines synapse- and sex-dependent diversity of GABAergic inhibition in ventral subiculum 2021-12-07, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2021.110098 PMID:34879268	研究论文	研究通过电生理切片、成像和单细胞RNA测序技术，探讨了Neurexin-3在腹下托GABA能抑制性神经元中的作用及其与性别的关系	首次揭示了Neurexin-3在腹下托抑制性突触中的多重作用，并发现了其在性别上的差异性表现	NA	探究腹下托抑制性局部回路的内在连接和突触特性	Neurexin-3在腹下托GABA能抑制性神经元中的功能	神经科学	NA	电生理切片、成像、单细胞RNA测序	NA	电生理数据、图像、RNA序列	雄性和雌性小鼠
14504	2024-08-07	Parity-induced changes to mammary epithelial cells control NKT cell expansion and mammary oncogenesis 2021-12-07, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2021.110099 PMID:34879282	研究论文	本文通过单细胞RNA测序研究了未产和已产雌性小鼠乳腺组织中上皮和非上皮细胞的组成，发现妊娠后乳腺上皮细胞（MECs）中γδ自然杀伤T样免疫细胞（NKTs）的扩张和免疫信号分子的上调，揭示了妊娠如何调节MECs与免疫微环境之间的交流，并建立了妊娠、免疫微环境和乳腺肿瘤发生之间的因果关系。	首次揭示了妊娠后乳腺上皮细胞中CD1d分子的上调导致NKTs细胞扩张，进而影响乳腺肿瘤的发生。	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现。	探讨妊娠对乳腺微环境的影响及其与乳腺肿瘤发生的关系。	乳腺上皮细胞（MECs）和γδ自然杀伤T样免疫细胞（NKTs）。	数字病理学	乳腺肿瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	未产和已产雌性小鼠的乳腺组织
14505	2024-08-07	Vascular Smooth Muscle Cell Subpopulations and Neointimal Formation in Mouse Models of Elastin Insufficiency 2021-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.120.315681 PMID:34587758	研究论文	本研究利用缺乏弹性蛋白（Eln）的小鼠模型，研究了血管平滑肌细胞（SMCs）的来源和表型异质性，以及它们在升主动脉中新内膜形成中的作用	首次通过单细胞测序和细胞系标记技术，识别了新内膜细胞群，并揭示了这些细胞独特的发育来源和转录特征	NA	探讨弹性蛋白不足情况下，血管平滑肌细胞的适应性变化及其在新内膜形成中的作用	血管平滑肌细胞及其在新内膜形成中的作用	NA	NA	单细胞测序	NA	细胞	SMC-Eln敲除小鼠中的两个独特的SMC群体
14506	2024-08-07	Pre-existing chromatin accessibility and gene expression differences among naive CD4+ T cells influence effector potential 2021-11-30, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2021.110064 PMID:34852223	research paper	研究探讨了未接触抗原的CD4+ T细胞中预先存在的染色质可及性和基因表达差异对其效应潜能的影响	通过单细胞RNA测序揭示了T细胞受体（TCR）信号传导相关基因是变异的关键驱动因素，并发现TCR信号强度在胸腺发育期间对CD4+ T细胞染色质景观的差异建立有影响	NA	探究未接触抗原的CD4+ T细胞中预先存在的转录和染色质景观差异是否影响其效应潜能	未接触抗原的CD4+ T细胞	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未具体说明样本数量
14507	2024-08-07	Endocannabinoid Anandamide Attenuates Acute Respiratory Distress Syndrome through Modulation of Microbiome in the Gut-Lung Axis 2021-11-25, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells10123305 PMID:34943813	研究论文	本研究探讨了内源性大麻素anandamide（AEA）对雌性小鼠由葡萄球菌肠毒素B（SEB）介导的急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的影响	AEA通过调节肠道-肺轴中的微生物群，增加抗菌肽和紧密连接蛋白的表达，以及诱导短链脂肪酸的产生，从而减轻ARDS	NA	研究AEA对SEB介导的ARDS的缓解作用及其机制	雌性小鼠的肺部和肠道微生物群	NA	急性呼吸窘迫综合征	单细胞RNA测序, MiSeq测序, LEfSe分析	NA	RNA序列数据	NA
14508	2024-08-07	The healing myocardium mobilizes a distinct B-cell subset through a CXCL13-CXCR5-dependent mechanism 2021-11-22, Cardiovascular research IF:10.2Q1 DOI:10.1093/cvr/cvab181 PMID:34048536	研究论文	本研究在心肌梗死后的小鼠模型中，通过组织学、流式细胞术和单细胞RNA测序分析，揭示了心脏中特定B细胞亚群的快速积累及其通过CXCL13-CXCR5依赖机制的动员。	本研究首次发现并描述了心肌梗死后心脏中特异性的‘心脏相关B细胞’（hB）亚群，并阐明了其通过CXCL13-CXCR5轴的动员机制。	研究主要在实验小鼠模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。	旨在解析心肌梗死后B细胞动员和活性的机制，以及这些细胞在心脏修复中的作用。	心肌梗死后心脏和纵隔淋巴结中的B细胞反应。	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞	实验使用了小鼠模型，具体样本数量未在摘要中提及。
14509	2024-08-07	Deletion of pancreas-specific miR-216a reduces beta-cell mass and inhibits pancreatic cancer progression in mice 2021-11-16, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100434 PMID:34841287	研究论文	本文研究了胰腺特异性miR-216a在胰腺β细胞和小叶细胞中的作用及其在胰腺癌进展中的影响	首次揭示了miR-216a在胰腺β细胞和小叶细胞中的功能，并探讨了其在胰腺癌诊断中的潜在价值	NA	探讨miR-216a在胰腺β细胞和小叶细胞中的作用及其在胰腺癌进展中的影响	胰腺特异性miR-216a在胰腺β细胞和小叶细胞中的作用	NA	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠和人类样本
14510	2024-08-07	Sutural fibroblasts exhibit the function of vascular endothelial cells upon mechanical strain 2021-11-15, Archives of biochemistry and biophysics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.abb.2021.109046 PMID:34599905	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在机械应力作用下颧骨上颌缝中纤维母细胞向血管内皮细胞样状态的转变	首次揭示了纤维母细胞在机械应力作用下通过与Hippo通路的相互作用，实现向血管内皮细胞样状态的转变，并上调血管生成相关基因	研究仅限于体外实验和数据分析，未涉及临床应用	探究机械应力诱导的颧骨上颌缝中纤维母细胞的功能转变	颧骨上颌缝中的纤维母细胞及其在机械应力下的功能转变	数字病理学	面部发育不良	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	二十九个细胞亚群
14511	2024-08-07	The role of CDHR3 in susceptibility to otitis media 2021-11, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany) DOI:10.1007/s00109-021-02118-7 PMID:34322716	研究论文	本文探讨了CDHR3在儿童中耳炎易感性中的作用，通过外显子测序、Sanger测序等技术，发现CDHR3的新型致病变异与中耳炎风险相关	发现了CDHR3的新型罕见或低频变异，这些变异可能增加中耳炎的风险	NA	进一步阐明CDHR3在中耳炎中的作用	CDHR3基因及其变异与中耳炎的关系	NA	耳部疾病	外显子测序、Sanger测序、16S rRNA测序、单细胞RNA测序	NA	DNA、RNA	257个多民族家庭的OM受影响个体、407个美国三联体或OM受试者、芬兰受试者、小鼠中耳样本
14512	2024-08-07	Association between particulate matter containing EPFRs and neutrophilic asthma through AhR and Th17 2021-Oct-26, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-021-01867-w PMID:34702270	研究论文	本研究探讨了含有EPFRs的颗粒物与中性粒细胞性哮喘之间的关系，以及通过AhR和Th17途径的作用机制	本研究首次揭示了颗粒物通过AhR激活诱导Th17免疫反应，进而导致中性粒细胞性哮喘的机制	研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究颗粒物与中性粒细胞性哮喘之间的关联及其分子机制	含有EPFRs的颗粒物对呼吸系统的影响及其免疫反应机制	NA	哮喘	微阵列和单细胞RNA测序	NA	RNA	老鼠肺部样本
14513	2024-08-07	The Parkinson's-disease-associated mutation LRRK2-G2019S alters dopaminergic differentiation dynamics via NR2F1 2021-10-19, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2021.109864 PMID:34686322	研究论文	研究帕金森病相关突变LRRK2-G2019S如何通过NR2F1改变多巴胺能神经元的分化动力学	首次揭示了LRRK2-G2019S突变通过影响NR2F1表达，改变多巴胺能神经元分化的初始阶段，加速细胞周期退出和细胞死亡	NA	探究帕金森病模型中多巴胺能神经元的发育异常	人源神经上皮干细胞（NESCs）向多巴胺能神经元的分化过程	神经科学	帕金森病	高通量图像分析和单细胞RNA测序	NA	图像和RNA序列	包括LRRK2-G2019S突变的NESCs、神经元和脑中脑类器官，以及NR2F1缺陷的小鼠胚胎
14514	2024-08-07	Efficient stimulation of retinal regeneration from Müller glia in adult mice using combinations of proneural bHLH transcription factors 2021-10-19, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2021.109857 PMID:34686336	研究论文	本文研究了在成年小鼠视网膜中使用bHLH转录因子组合促进Müller胶质细胞再生神经元的效率	发现Ascl1与Atoh1组合能显著提高神经发生效率，即使在无视网膜损伤的情况下也能生成多种视网膜神经元类型	仅有一部分Ascl1表达的Müller胶质细胞能生成新神经元，过程效率不高	探索促进神经系统内源性修复的方法，以替代因退行性疾病而丧失的神经元	成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	成年小鼠视网膜样本
14515	2024-08-07	Microbiota triggers STING-type I IFN-dependent monocyte reprogramming of the tumor microenvironment 2021-10-14, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2021.09.019 PMID:34624222	研究论文	本文研究了微生物群信号如何通过STING-I型干扰素依赖的单核细胞重编程影响肿瘤微环境（TME），并探讨了其对癌症治疗的影响。	首次揭示了微生物群通过STING途径诱导I型干扰素产生，进而影响肿瘤微环境中的单核吞噬细胞和树突状细胞的免疫刺激作用。	NA	探讨微生物群如何调节肿瘤微环境中的免疫成分，以及如何利用这一机制改善癌症治疗。	肿瘤微环境中的单核吞噬细胞、树突状细胞以及自然杀伤细胞。	NA	黑色素瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
14516	2024-08-07	Single cell analysis of M. tuberculosis phenotype and macrophage lineages in the infected lung 2021-09-06, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20210615 PMID:34292313	研究论文	本研究详细介绍了一种结合细菌适应性荧光报告菌株和单细胞RNA测序（scRNA-seq）的新方法，以同时获取每个感染细胞的宿主转录组、表面标记表达和细菌表型	该方法有助于解析活体中感染结核分枝杆菌（M. tuberculosis）的肺泡巨噬细胞（AMs）和间质巨噬细胞（IMs）的功能异质性	NA	旨在研究结核分枝杆菌感染肺部时巨噬细胞的表型和功能异质性	结核分枝杆菌感染的肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞	数字病理学	结核病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及
14517	2024-08-07	Marginating transitional B cells modulate neutrophils in the lung during inflammation and pneumonia 2021-09-06, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20210409 PMID:34313733	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，发现肺循环中存在八种具有独特基因调控网络的IgM+ B细胞亚群，主要由过渡型1 B和过渡型2 B（T2B）细胞主导，并揭示了T2B细胞在肺部炎症期间通过脂氧素A4（LXA4）调节中性粒细胞反应的机制。	首次揭示了过渡型IgM+ B细胞在肺部炎症中的调节作用，特别是T2B细胞通过CD49e、CXCL13和CXCR5在肺毛细血管中边缘化，并通过脂氧素A4（LXA4）减轻过度中性粒细胞炎症。	NA	研究肺部炎症和肺炎期间过渡型B细胞对中性粒细胞的调节作用。	过渡型IgM+ B细胞及其在肺部炎症中的作用机制。	免疫学	肺部疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个IgM+ B细胞亚群
14518	2024-08-07	Functional microRNA targetome undergoes degeneration-induced shift in the retina 2021-08-31, Molecular neurodegeneration IF:14.9Q1 DOI:10.1186/s13024-021-00478-9 PMID:34465369	研究论文	本研究探讨了视网膜退化过程中微小RNA（miRNA）目标组的改变，并分析了其在健康和退化视网膜中的相互作用。	研究揭示了视网膜退化过程中miRNA目标组的活性变化，特别是在炎症途径中的miRNA富集。	研究主要基于啮齿动物模型和公开的单细胞RNA测序数据，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。	识别健康和退化视网膜中miRNA/mRNA相互作用，以深入了解miRNA在疾病发病机制中的调控作用，并探索潜在的治疗靶点。	研究对象包括健康和退化视网膜中的miRNA及其目标mRNA。	数字病理学	老年性黄斑变性	AGO2 HITS-CLIP, 单细胞RNA测序	NA	RNA	研究使用了啮齿动物模型，具体样本数量未详细说明。
14519	2024-08-07	Single-Cell Transcriptomics Reveals Core Regulatory Programs That Determine the Heterogeneity of Circulating and Tissue-Resident Memory CD8+ T Cells 2021-08-20, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells10082143 PMID:34440912	研究论文	本文利用单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，研究了组织驻留记忆CD8+ T细胞与其他循环记忆细胞的转录组和调控因子，揭示了急性感染期间TRM细胞的异质性和新的转录调控因子。	本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了小肠中TRM细胞的异质性及其潜在的转录调控因子。	NA	研究急性感染期间CD8+ T细胞记忆亚群的转录调控机制，以期为疫苗接种和免疫治疗提供新的途径。	组织驻留记忆CD8+ T细胞与其他循环记忆细胞的转录组和调控因子。	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中明确提及
14520	2024-08-07	Gli1+ progenitors mediate bone anabolic function of teriparatide via Hh and Igf signaling 2021-08-17, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2021.109542 PMID:34407400	研究论文	本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序，揭示了Gli1+元骨髓间充质前体细胞（MMPs）对特立帕肽的反应及其在骨形成中的作用	首次发现并证实了特立帕肽通过Hh和Igf信号通路刺激MMPs的增殖和成骨分化，特别是发现了一种新的软骨细胞样成骨前体细胞（COP）	研究主要集中在生长中的小鼠模型，其结果在人类或其他年龄段的动物中的适用性有待进一步研究	探讨特立帕肽在骨形成中的细胞靶点和信号通路	Gli1+元骨髓间充质前体细胞（MMPs）及其对特立帕肽的反应	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个细胞簇