单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
14501 2024-08-04
Empagliflozin attenuates inflammation levels in autoimmune myocarditis through the STAT3 pathway and macrophage phenotype transformation
2024-Mar, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究探讨了SGLT-2抑制剂empagliflozin在自身免疫性心肌炎中的抗炎作用及其分子机制 发现empagliflozin通过STAT3通路和巨噬细胞表型转化降低自身免疫性心肌炎的炎症水平 研究主要集中在小鼠模型上,可能无法完全反映人类的临床情况 探索empagliflozin在自身免疫性心肌炎中的抗炎机制 实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型及体外巨噬细胞实验 数字病理学 自身免疫性心肌炎 HE染色、Sirius红染色、Masson染色、西方印迹、ELISA、免疫荧光染色、逆转录PCR NA 基因组空间事件数据集、单细胞测序结果 未具体说明样本数量,但使用了小鼠模型和体外细胞实验
14502 2024-08-04
High-throughput omics technologies in inflammatory bowel disease
2024-Mar-01, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
综述 该文章综述了高通量组学技术在炎症性肠病中的应用和进展 文章强调了高通量技术在炎症性肠病研究中的重要性和最新进展 需要更标准化的方法和大规模数据集处理以实现个体化医学的目标 阐明高通量技术在炎症性肠病病理机制研究中的应用 高通量技术在炎症性肠病的基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学等领域的应用 数字病理学 炎症性肠病 高通量组学技术 NA 大数据 NA
14503 2024-08-04
Single-Cell RNA-Seq Reveals Coronary Heterogeneity and Identifies CD133+TRPV4high Endothelial Subpopulation in Regulating Flow-Induced Vascular Tone in Mice
2024-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了冠状动脉内皮细胞的异质性并确定了CD133+TRPV4high内皮亚群在调节流动诱导的血管张力中的作用 该研究发现了冠状动脉内皮细胞的异质性,并首次识别了CD133+TRPV4high内皮亚群在调节冠状动脉血流中的重要性 本研究仅在小鼠模型中进行,可能无法完全适用于人类冠状动脉内皮细胞的研究 研究冠状动脉内皮细胞的异质性及其对血流的反应 研究对象为小鼠冠状动脉内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 细胞 31,962个细胞
14504 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals transdifferentiation of parathyroid chief cells into oxyphil cells in patients with uremic secondary hyperparathyroidism
2024-Mar, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中甲状旁腺主细胞向嗜酸细胞转分化的现象 首次建立了人类甲状旁腺的转录组图谱,并发现了与尿毒症环境相关的线粒体逐渐富集的主细胞向嗜酸细胞转分化的机制 NA 探究尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者中嗜酸细胞的起源及其转分化机制 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者的甲状旁腺结节 数字病理学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 三名尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进患者的甲状旁腺混合结节
14505 2024-08-07
Advanced insights on tumor-associated macrophages revealed by single-cell RNA sequencing: The intratumor heterogeneity, functional phenotypes, and cellular interactions
2024-Mar-01, Cancer letters IF:9.1Q1
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示肿瘤相关巨噬细胞的肿瘤内异质性、功能表型和细胞相互作用方面的最新进展 利用单细胞RNA测序技术深入分析肿瘤相关巨噬细胞的异质性和功能表型,为优化新型治疗策略提供依据 NA 深入理解肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用 肿瘤相关巨噬细胞的表型和功能变化 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
14506 2024-08-07
scRNA-seq of colorectal cancer shows regional immune atlas with the function of CD20+ B cells
2024-Mar-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过分析来自结直肠癌(CRC)和配对正常组织的39,484个单细胞转录数据,揭示了CRC不同区域的免疫特征,特别是B细胞的功能。 发现了CRC不同区域的免疫细胞浸润显著不同,特别是CD20 B细胞与患者预后的关联,以及它们在肿瘤杀伤活性中的作用。 NA 旨在表征结直肠癌不同区域的免疫景观,并寻找潜在的治疗靶点。 结直肠癌(CRC)及其配对正常组织。 数字病理学 结直肠癌 scRNA-seq NA 转录数据 39,484个单细胞转录数据来自19个CRC样本和配对正常组织
14507 2024-08-07
Cinchophen induces RPA1 related DNA damage and apoptosis to impair ENS development of zebrafish
2024-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 研究探讨了非甾体抗炎药辛可芬对斑马鱼肠道神经系统发育的影响及其分子机制 首次证实辛可芬通过诱导RPA1相关的DNA损伤和细胞凋亡,损害斑马鱼的肠道神经系统发育 NA 探究辛可芬对斑马鱼肠道神经系统发育的影响及其分子机制 斑马鱼的肠道神经系统 数字病理学 先天性神经嵴病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
14508 2024-08-07
2-bromoacetamide exposure impairs oocyte maturation in mice and humans primarily via disrupting the cytoskeleton
2024-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 研究探讨了2-溴乙酰胺(BAcAm)对小鼠和人类卵母细胞成熟的影响,发现BAcAm通过破坏细胞骨架主要干扰卵母细胞成熟 首次全面展示了BAcAm对卵母细胞成熟的毒性影响 研究主要基于体外培养系统,可能与体内环境存在差异 探究BAcAm对哺乳动物卵母细胞质量的毒性效应 小鼠和人类的卵母细胞 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 小鼠卵母细胞中识别了605个差异表达基因,其中366个上调,239个下调
14509 2024-08-07
Advancing parathyroid anatomy understanding through single-cell RNA sequencing in uremic secondary hyperparathyroidism
2024-Mar, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中甲状旁腺的细胞动态变化 利用单细胞RNA测序揭示了主细胞和高嗜酸细胞的分化过程,挑战了传统观点 NA 通过单细胞RNA测序技术深入理解甲状旁腺的解剖结构 尿毒症继发性甲状旁腺功能亢进症中的甲状旁腺细胞 数字病理学 尿毒症 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA
14510 2024-08-04
Single-cell RNA-Seq reveals the earliest lineage specification and X chromosome dosage compensation in bovine preimplantation embryos
2024-Feb-29, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 该研究揭示了牛胚胎早期谱系特征和X染色体剂量补偿的情况。 利用单细胞转录组学和基因组编辑方法探讨了牛胚胎中的谱系特征和X染色体剂量补偿的时序和调控。 该研究主要集中在牛胚胎模型,可能无法直接推广到其他物种。 旨在通过使用牛胚胎模型深入理解早期胚胎发育中的调控机制。 研究对象为286个牛个体细胞的转录组。 数字病理学 NA 单细胞转录组学,基因组编辑 NA 转录组数据 286个牛个体细胞
14511 2024-08-04
Cortical somatostatin long-range projection neurons and interneurons exhibit divergent developmental trajectories
2024-Feb-21, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 研究了小鼠体内表达生长抑素的细胞的多样性及其发育过程 首次将单细胞RNA测序和空间转录组学结合,揭示了发育过程中生长抑素表达神经元的差异化轨迹 仅限于小鼠模型,可能无法完全代表其他哺乳动物的发育过程 探讨哺乳动物皮层抑制性神经元的细胞多样性及其发育机制 小鼠体内的生长抑素(SST+)表达细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 NA
14512 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing of submandibular gland reveals collagen type XV-positive fibroblasts as a disease-characterizing cell population of IgG4-related disease
2024-02-20, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了IgG4相关疾病患者下颌下腺中的非免疫细胞,发现表达胶原蛋白XV的成纤维细胞可能是该疾病的特征性细胞群 首次揭示了胶原蛋白XV阳性成纤维细胞在IgG4相关疾病中的作用,并提出其可能作为疾病监测的标志物 NA 探讨IgG4相关疾病中非免疫细胞的特征及其潜在的生物标志物 IgG4相关疾病患者的下颌下腺非免疫细胞 数字病理学 自身免疫病 单细胞RNA测序 NA RNA IgG4相关疾病患者的下颌下腺非免疫细胞样本
14513 2024-08-04
BPTF cooperates with MYCN and MYC to link neuroblastoma cell cycle control to epigenetic cellular states
2024-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 这篇文章探讨了核小体重塑因子BPTF如何与MYCN和MYC合作,将神经母细胞瘤细胞周期控制与表观遗传细胞状态联系起来 文章提出BPTF在神经母细胞瘤中扮演双重角色,既与MYCN/MYC共定位于细胞周期相关基因的启动子,又与CRC共定位于超级增强子以调节细胞身份 NA 探讨BPTF在神经母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的相关性 神经母细胞瘤细胞及其内在转录调控机制 数字病理学 神经母细胞瘤 Bulk RNA-seq, 单细胞测序, 组织微阵列, 免疫沉淀/质谱 NA 基因表达数据 NA
14514 2024-08-07
Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data Reveals Memory-like NK Cell Subset Associated with Mycobacterium tuberculosis Latency
2024-Feb-06, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq)数据,分析了外周血自然杀伤(NK)细胞的表型和分子特征,并探讨了NK细胞在结核分枝杆菌(Mtb)潜伏感染中的作用 本研究首次揭示了与结核分枝杆菌潜伏感染相关的记忆样NK细胞亚群,并通过流式细胞术验证了这些细胞的存在 研究样本量较小,需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 探讨NK细胞在结核分枝杆菌潜伏感染中的作用及其分子特征 外周血NK细胞 免疫学 结核病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) NA RNA 小样本量
14515 2024-08-07
Single-Cell RNA Sequencing Reveals HIF1A as a Severity-Sensitive Immunological Scar in Circulating Monocytes of Convalescent Comorbidity-Free COVID-19 Patients
2024-Feb-06, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,探讨了无并发症的COVID-19康复患者循环单核细胞中HIF1A作为敏感性免疫疤痕的作用 首次在单细胞水平上研究了无并发症COVID-19康复患者在不同时间点的转录组免疫细胞失调,并揭示了HIF1A在康复期的长期免疫作用 NA 研究无并发症COVID-19康复患者的免疫细胞转录组失调,以识别不同疾病严重程度的康复标志 无并发症的COVID-19康复患者的循环单核细胞 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
14516 2024-08-07
HHLA2 is more significantly associated with poor prognosis in TSCC than PD-L1
2024-Feb, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology IF:2.7Q2
研究论文 本研究旨在探讨HHLA2作为免疫检查点在舌鳞状细胞癌中的潜力,并与PD-L1进行比较 本研究发现HHLA2在舌鳞状细胞癌中表达上调,且与不良预后显著相关,可能成为比PD-L1更有效的免疫治疗靶点 NA 研究HHLA2作为免疫检查点在舌鳞状细胞癌中的作用及与PD-L1的比较 舌鳞状细胞癌中的HHLA2和PD-L1表达及预后影响 数字病理学 舌鳞状细胞癌 RNA测序, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 COX回归模型 RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 RNA-seq数据来自TCGA,单细胞RNA测序数据来自GEO数据库
14517 2024-08-07
Analytical Workflows for Single-Cell Multiomic Data Using the BD Rhapsody Platform
2024-Feb, Current protocols
研究论文 本文描述了一个详细的分析流程,包括六个管道,用于单细胞多组学数据的高质量分析 提出了一个包括六个管道的详细分析流程,用于处理和分析单细胞多组学数据 NA 开发一个高效的分析流程,以从单细胞多组学数据中提取生物学相关信息 单细胞多组学数据 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达矩阵 数千个单个细胞
14518 2024-08-07
Recommendations on single-cell RNA sequencing of skin xenografts in the study of genetic skin diseases
2024-Feb, Experimental dermatology IF:3.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
14519 2024-08-07
Characterization of the m6A/m1A/m5C/m7G-related regulators on the prognosis and immune microenvironment of glioma by integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2024-Feb, The journal of gene medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(RNA-seq)数据,分析了m6A、m1A、m5C和m7G相关调控因子在胶质瘤预后和免疫微环境中的作用 首次整合了四种RNA甲基化调控因子(m6A、m1A、m5C和m7G)在胶质瘤中的研究,并分析了它们与胶质瘤预后和肿瘤内异质性的关系 NA 探讨m6A/m1A/m5C/m7G相关调控因子在胶质瘤中的作用,并提供新的可靠的胶质瘤预后和治疗生物标志物 胶质瘤中的m6A/m1A/m5C/m7G相关调控因子及其与预后和免疫微环境的关系 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(RNA-seq) 机器学习方法和多元Cox回归分析 RNA序列数据 三个自有的单细胞RNA测序数据集和公开的批量RNA测序数据集
14520 2024-08-07
PD-1 signaling uncovers a pathogenic subset of T cells in inflammatory arthritis
2024-01-22, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过流式细胞术和CRISPR/Cas9筛选分析了类风湿关节炎患者外周血和滑膜液中的T细胞,发现PD-1+ HLA-DRHIGH KLRG1LOW T细胞是一种新的炎症性T细胞亚群 本研究首次识别出PD-1+ HLA-DRHIGH KLRG1LOW T细胞作为炎症性T细胞的新亚群,并揭示了与PD-1信号传导相关的新基因 本研究仅限于类风湿关节炎患者,且需要进一步研究以全面了解PD-1在滑膜T细胞中的作用 探索PD-1信号传导在炎症性关节炎中的作用,并寻找新的治疗靶点 类风湿关节炎患者的外周血和滑膜液中的T细胞 免疫学 类风湿关节炎 流式细胞术,CRISPR/Cas9筛选 NA RNA测序数据 类风湿关节炎患者的多个样本
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