单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
14461 2024-08-07
Tristetraprolin expression by keratinocytes protects against skin carcinogenesis
2021-03-08, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文研究了角质形成细胞中tristetraprolin(TTP)表达对皮肤癌发生的影响 首次展示了TTP在皮肤化学致癌过程中的关键调控作用,并揭示了其在调控肿瘤相关炎症和关键致癌途径中的作用 NA 探讨TTP在皮肤癌发生中的作用及其机制 TTP在角质形成细胞中的表达及其对皮肤癌发生的影响 NA 皮肤癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA
14462 2024-08-07
Transient ACE (Angiotensin-Converting Enzyme) Inhibition Suppresses Future Fibrogenic Capacity and Heterogeneity of Cardiac Fibroblast Subpopulations
2021-03-03, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术,探讨短暂使用血管紧张素转换酶抑制剂对心脏成纤维细胞亚群的影响 首次揭示了短暂使用ACE抑制剂能够持久改变心脏成纤维细胞亚群的分布和活性,从而减少纤维化表型 研究仅在自发性高血压大鼠模型中进行,结果的普遍性和临床应用需进一步验证 探讨短暂使用ACE抑制剂对心脏成纤维细胞亚群的影响及其保护机制 自发性高血压大鼠的心脏成纤维细胞 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 每组7只自发性高血压大鼠
14463 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing reveals the induction of novel myeloid and myeloid-associated cell populations in visceral fat with long-term obesity
2021-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、免疫荧光和流式细胞术,鉴定了小鼠附睾/内脏脂肪组织中的髓系细胞个体群 发现了与长期肥胖相关的新的髓系和髓系相关细胞群,并验证了一种具有髓系和间充质特性的新型髓系/巨噬细胞群 NA 探究长期肥胖下内脏脂肪中髓系细胞群的变化及其在肥胖相关炎症和纤维化中的作用 小鼠内脏脂肪组织中的髓系细胞 数字病理学 肥胖 单细胞RNA测序 NA RNA NA
14464 2024-08-07
High-dimensional analysis of the adenosine pathway in high-grade serous ovarian cancer
2021-03, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多参数平台分析了高级别浆液性卵巢癌中胞外ATP水解为腺苷(eADO)途径的影响 揭示了eADO信号在高级别浆液性卵巢癌中的临床和免疫学影响,以及CD39的化学保护作用,支持在卵巢癌患者中评估eADO靶向药物 NA 研究高级别浆液性卵巢癌中eADO途径的影响 高级别浆液性卵巢癌患者 癌症研究 卵巢癌 转录组元分析、组织微阵列、流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质表达数据 约1200名高级别浆液性卵巢癌患者和约1000例组织微阵列样本
14465 2024-08-07
Single-cell transcriptomics uncovers potential marker genes of ochratoxin A-sensitive renal cells in an acute toxicity rat model
2021-02, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
14466 2024-08-07
1p/19q co-deletion status is associated with distinct tumor-associated macrophage infiltration in IDH mutated lower-grade gliomas
2021-Feb, Cellular oncology (Dordrecht)
研究论文 本研究探讨了1p/19q共缺失状态对IDH突变型低级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAM)表型及其丰度的影响 首次全面研究了IDH突变型低级别胶质瘤中TAM的表型及其与1p/19q共缺失状态的关系 研究主要基于TCGA数据库和单细胞RNA测序数据,可能存在样本选择偏倚 确定1p/19q共缺失状态是否影响IDH突变型低级别胶质瘤中TAM的表型或其丰度 IDH突变型低级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 数字病理学 脑瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 230个样本
14467 2024-08-07
Small Bowel Resection Increases Paracellular Gut Barrier Permeability via Alterations of Tight Junction Complexes Mediated by Intestinal TLR4
2021-02, The Journal of surgical research IF:1.8Q2
研究论文 本文研究了小肠切除术后通过肠道TLR4信号传导改变紧密连接复合物,从而增加肠道屏障通透性的机制 首次探讨了小肠切除术后通过肠道TLR4信号传导改变紧密连接复合物,从而影响肠道屏障通透性的机制 实验仅在特定的小鼠模型中进行,可能需要进一步的人体研究来验证结果 探讨小肠切除术后肠道屏障通透性增加的机制,并寻找可能的蛋白质靶点以恢复肠道屏障 小肠切除术后肠道屏障通透性的变化及其机制 NA 短肠综合征 单细胞RNA测序,荧光素异硫氰酸盐-葡聚糖摄取,电子显微镜 NA 蛋白质表达 B6和肠道特异性TLR4敲除(iTLR4 KO)小鼠,50%小肠切除或假手术
14468 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing of mouse neural stem cell differentiation reveals adverse effects of cadmium on neurogenesis
2021-Feb, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了暴露于镉的幼鼠神经干细胞分化过程中的影响 首次通过单细胞RNA测序揭示了镉暴露对神经干细胞分化的具体影响,并探讨了其分子机制 研究仅限于24小时镉暴露和7天分化的时间点,可能需要更长时间的研究来全面理解镉的长期影响 探讨镉暴露对神经干细胞分化过程的影响及其分子机制 幼鼠神经干细胞在镉暴露后的分化过程 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 幼鼠神经干细胞
14469 2024-08-07
Opposing Wnt signals regulate cervical squamocolumnar homeostasis and emergence of metaplasia
2021-02, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了鳞状和柱状上皮过渡区的上皮亚群及其基质成分,揭示了两种上皮由不同的宫颈驻留干细胞群通过对抗性的Wnt信号调控产生,并探讨了宫颈化生过程中基质重塑的机制 首次揭示了宫颈鳞状和柱状上皮由不同的干细胞群通过对抗性的Wnt信号调控产生,并展示了化生过程中基质重塑的详细机制 NA 探讨宫颈鳞状和柱状上皮过渡区的上皮组织维持机制及化生过程中的基质重塑 宫颈鳞状和柱状上皮过渡区的上皮亚群及其基质成分 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 NA RNA NA
14470 2024-08-07
Gut CD4+ T cell phenotypes are a continuum molded by microbes, not by TH archetypes
2021-02, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组和染色质分析,探讨了在无菌或有菌小鼠以及感染不同微生物后的小鼠结肠中CD4效应淋巴细胞(T细胞)的实际状态 研究发现T细胞的转录组和染色质结构无法解析出符合经典辅助T细胞(T)亚群的离散簇,而是呈现连续分布,且这种分布与感染的微生物有关,而非传统的细胞因子产生 NA 确定T细胞在活体前线组织中实际采用的状态 CD4效应淋巴细胞(T细胞)在不同微生物环境下的状态 免疫学 NA 单细胞转录组分析,染色质分析 NA 转录组数据 无菌或有菌小鼠以及感染不同微生物后的小鼠的结肠T细胞
14471 2024-08-07
Differential encoding in prefrontal cortex projection neuron classes across cognitive tasks
2021-01-21, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文研究了小鼠前额叶皮层(PFC)投射神经元的特定转录组类型如何与轴突投射和编码特性在多个认知任务中的关系 首次将单细胞转录组学与系统神经科学结合,分析了特定分子-解剖特征的细胞在认知任务中的编码特性 仅限于小鼠模型,且研究集中在特定的神经元类型和任务上 探讨前额叶皮层投射神经元的不同转录组类型在认知任务中的编码特性 小鼠前额叶皮层投射神经元的转录组类型及其在认知任务中的行为 神经科学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 多个小鼠样本
14472 2024-08-07
Co-stimulation with opposing macrophage polarization cues leads to orthogonal secretion programs in individual cells
2021-01-12, Nature communications IF:14.7Q1
research paper 本研究使用单细胞RNA测序探索在同时刺激炎症因子LPS和IFN-γ以及解决性细胞因子IL-4的情况下,单个巨噬细胞的响应机制 研究发现,负交叉调控导致单个共刺激巨噬细胞中T细胞极化细胞因子基因Il6和Il12b与IL-4相关因子Arg1和Chil3的互斥表达 NA 探讨巨噬细胞在同时接受不同刺激信号时的转录响应和功能多样性 巨噬细胞 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 多个单个巨噬细胞
14473 2024-08-07
Cardiomyocytes stimulate angiogenesis after ischemic injury in a ZEB2-dependent manner
2021-01-04, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了转录因子ZEB2在心肌细胞中的作用,特别是在缺血损伤后促进血管生成的能力 首次揭示了ZEB2在心肌细胞中的增加及其通过调节心肌细胞与内皮细胞间的对话来增强缺血后血管生成的机制 NA 探索增强心脏修复和恢复血管网络的因素 心肌细胞中的转录因子ZEB2及其在缺血损伤后的作用 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序 NA 细胞 具体样本数量未在摘要中提及
14474 2024-08-07
Cholesterol-Induced Phenotypic Modulation of Smooth Muscle Cells to Macrophage/Fibroblast-like Cells Is Driven by an Unfolded Protein Response
2021-01, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
research paper 研究胆固醇诱导的血管平滑肌细胞向巨噬细胞/成纤维细胞样细胞表型转变的分子途径 揭示了未折叠蛋白反应(UPR)在胆固醇诱导的血管平滑肌细胞表型转变中的必要性和充分性 NA 探究胆固醇诱导血管平滑肌细胞表型转变的分子机制 血管平滑肌细胞(SMCs)及其在胆固醇暴露下的表型变化 NA 心血管疾病 NA NA RNA sequencing NA
14475 2024-08-07
The T-box transcription factor Eomesodermin governs haemogenic competence of yolk sac mesodermal progenitors
2021-01, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 本文通过胚胎干细胞模型研究了T-box转录因子Eomesodermin(Eomes)在调控卵黄囊中胚层前体细胞造血能力中的作用 本研究发现Eomes在早期血液形成中的转录调控层次中处于顶端,并表明造血能力在胚胎发育早期就已赋予,这一发现比先前认识的更早 NA 探究特定外胚层中胚层子集如何被赋予造血命运 Eomesodermin在胚胎干细胞中的表达及其对造血前体细胞形成的影响 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
14476 2024-08-07
Ndufs1 Deficiency Aggravates the Mitochondrial Membrane Potential Dysfunction in Pressure Overload-Induced Myocardial Hypertrophy
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 本研究通过生物信息学分析scRNA-seq和微阵列数据,探讨了Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 首次揭示了Ndufs1在压力超负荷诱导的心肌肥大中的关键作用,并通过动物实验和细胞模型验证了其对线粒体功能的影响。 研究主要集中在细胞和动物模型上,尚未在人体中进行验证。 探讨Ndufs1缺乏在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用及其机制。 Ndufs1在心肌肥大中的作用及其对线粒体功能的影响。 NA 心血管疾病 scRNA-seq, 微阵列 NA 基因表达数据 使用TAC小鼠模型和Ang II诱导的心肌细胞模型进行研究。
14477 2024-08-07
Loss of Claudin-3 Impairs Hepatic Metabolism, Biliary Barrier Function, and Cell Proliferation in the Murine Liver
2021, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本文研究了紧密连接蛋白claudin-3在小鼠肝脏中的细胞类型特异性表达及其对肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖的影响 首次探讨了claudin-3在肝脏代谢、屏障功能和细胞增殖中的具体作用 NA 探究紧密连接蛋白claudin-3在肝脏中的功能及其对代谢和屏障功能的影响 小鼠肝脏中的紧密连接蛋白claudin-3及其相关代谢和屏障功能 NA NA RNA测序 NA RNA Cldn3-/-和Cldn3+/+小鼠的肝脏样本
14478 2024-08-07
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immunological Profiles of Renal Allograft Rejection in Mice
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞特征 首次揭示了从小鼠急性排斥到慢性排斥过程中免疫细胞类型的变化及其对排斥过程的影响 NA 研究肾移植排斥过程中的免疫细胞特征及其变化 小鼠肾移植排斥模型中的免疫细胞 数字病理学 肾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 10,921个白细胞
14479 2024-08-07
Integrated Systems Analysis of the Murine and Human Pancreatic Cancer Glycomes Reveals a Tumor-Promoting Role for ST6GAL1
2021, Molecular & cellular proteomics : MCP IF:6.1Q1
研究论文 本文通过系统方法整合了KC小鼠和人类胰腺癌患者的糖组分析,识别了在癌症形成中可能起作用的糖类 创建了一种新型小鼠模型,通过胰腺特异性遗传删除ST6 beta-galactoside alpha-2,6-sialyltransferase 1酶,研究其对胰腺癌的影响 某些人类糖组变化在KC小鼠模型中未观察到 识别在胰腺癌形成中起作用的糖类,并开发针对这些糖类的治疗方法 小鼠和人类胰腺癌样本的糖组 数字病理学 胰腺癌 糖组分析 NA 序列数据 包括KC小鼠模型和人类胰腺癌患者样本
14480 2024-08-07
Deep Parallel Characterization of AAV Tropism and AAV-Mediated Transcriptional Changes via Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文开发了一种实验和计算相结合的单细胞RNA测序(scRNA-seq)流程,用于高分辨率地表征编码rAAV池的趋向性和响应 首次采用scRNA-seq技术并行表征AAV的趋向性和转录变化,发现了未被识别的AAV衣壳靶向偏差和细胞类型特异性的短暂反应 NA 旨在开发安全且精确的基因递送载体,并展示在单细胞水平上理解基因疗法响应的重要性 重组腺相关病毒(rAAV)的趋向性和转录变化 基因疗法 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 涉及多种细胞和组织类型
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