单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 14461 - 14480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14461 | 2024-08-07 |
SwarnSeq: An improved statistical approach for differential expression analysis of single-cell RNA-seq data
2021-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.02.014
PMID:33662531
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SwarnSeq的改进统计方法，用于单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | SwarnSeq方法在模型中考虑了单细胞RNA测序数据中的分子捕获过程，这是现有差异表达方法中较少考虑的 | NA | 开发一种改进的差异表达分析方法，以解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 基因表达数据 | 10个不同的真实单细胞RNA测序数据集 |
| 14462 | 2024-08-04 |
Applications of single‑cell omics and spatial transcriptomics technologies in gastric cancer (Review)
2024-Apr, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2024.14285
PMID:38406595
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综述 | 本文综述了单细胞组学和空间转录组学技术在胃癌研究中的应用与进展 | 综述了单细胞组学和ST技术在胃癌分子特征及肿瘤异质性研究中的独特见解 | 缺乏大规模临床数据验证应用效果的讨论 | 探讨单细胞组学和ST技术对胃癌研究的影响 | 单细胞组学和空间转录组学在胃癌中的具体应用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞组学、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 14463 | 2024-08-04 |
Bulk and single-cell sequencing identified a prognostic model based on the macrophage and lipid metabolism related signatures for osteosarcoma patients
2024-Feb-29, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e26091
PMID:38404899
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研究论文 | 本研究利用大规模和单细胞测序技术，探讨了与巨噬细胞和脂质代谢相关的预后模型在骨肉瘤患者中的应用 | 创新地建立了一个基于巨噬细胞和脂质代谢的风险模型，为骨肉瘤患者的化疗效果提供了新的预测工具 | 未提及具体的样本量和外部验证的有效性 | 研究巨噬细胞的分化状态与骨肉瘤化疗效果间的关系 | 骨肉瘤患者及其免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 大规模和单细胞测序 | 风险模型 | 基因相关数据 | NA |
| 14464 | 2024-08-07 |
Cutting-Edge Skin Ageing Research on tissue stem cell
2024-Feb-26, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvae022
PMID:38408191
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综述 | 本文综述了干细胞衰老的机制及其对健康的影响，并探讨了干细胞疗法在皮肤领域的应用潜力 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在干细胞研究中的进展 | NA | 探讨干细胞衰老的机制及其对健康的影响 | 干细胞及其在组织修复和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 14465 | 2024-08-07 |
Development of a CD8+ T cell associated signature for predicting the prognosis and immunological characteristics of gastric cancer by integrating single-cell and bulk RNA-sequencing
2024-02-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54273-9
PMID:38402299
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，开发了一种与CD8+ T细胞相关的预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 本研究首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，开发了一种新的预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 本研究主要基于TCGA和GEO队列的数据，未来需要更多队列验证其普适性 | 开发一种能够预测胃癌预后和免疫特征的标志物 | 胃癌患者的预后和免疫特征 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA测序 | LASSO回归 | RNA测序数据 | 703个CD8+ T细胞特征基因，其中8个用于构建预测标志物 |
| 14466 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics identifies the differentiation trajectory from inflammatory monocytes to pro-resolving macrophages in a mouse skin allergy model
2024-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46148-4
PMID:38396021
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了小鼠皮肤过敏模型中炎症单核细胞向促解析巨噬细胞的分化轨迹 | 本研究阐明了Ly6C经典单核细胞向Ly6C促解析巨噬细胞的逐步分化过程 | 本研究局限于小鼠模型，未验证在人类过敏反应中的适用性 | 研究炎症单核细胞在小鼠皮肤过敏中向巨噬细胞的分化过程 | 研究对象为Ly6C经典单核细胞及其向促解析巨噬细胞的分化过程 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq，流式细胞术分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 14467 | 2024-08-07 |
Kidney double positive T cells have distinct characteristics in normal and diseased kidneys
2024-02-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-54956-3
PMID:38396136
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研究论文 | 研究了在正常和疾病状态下小鼠和人肾脏中双阳性T细胞（DPT细胞）的特征和功能 | 首次详细研究了在正常和疾病状态下小鼠和人肾脏中双阳性T细胞的存在和功能 | 研究主要集中在小鼠模型和人类肾细胞癌样本，可能需要进一步研究以涵盖更广泛的肾脏疾病 | 探讨双阳性T细胞在肾脏中的存在、功能及其在肾脏损伤后的变化 | 小鼠肾脏中的双阳性T细胞，以及人类肾细胞癌患者的肾脏样本 | NA | 肾细胞癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠肾脏样本和人类肾细胞癌患者的肾脏样本 |
| 14468 | 2024-08-04 |
Identifying PLAUR as a Pivotal Gene of Tumor Microenvironment and Regulating Mesenchymal Phenotype of Glioblastoma
2024-Feb-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers16040840
PMID:38398231
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研究论文 | 本研究确定了PLAUR作为胶质母细胞瘤肿瘤微环境的关键基因，并调控其间质表型 | 识别PLAUR作为胶质母细胞瘤间质表型的中心基因，揭示其在肿瘤相关巨噬细胞和胶质瘤细胞之间的配体-受体相互作用 | 尚未详细探讨PLAUR在不同肿瘤微环境条件下的具体作用机制 | 识别能够通过肿瘤内在和外在机制调节胶质母细胞瘤间质表型的基因 | 胶质母细胞瘤及其相关的微环境组成部分 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞测序，功能富集分析，WGCNA | BALB/c裸鼠异种移植模型 | 基因表达数据 | 涉及细胞系、原代胶质瘤细胞及BALB/c裸鼠的实验 |
| 14469 | 2024-08-04 |
Harnessing the Transcriptional Signatures of CAR-T-Cells and Leukemia/Lymphoma Using Single-Cell Sequencing Technologies
2024-Feb-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25042416
PMID:38397092
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综述 | 本文探讨了利用单细胞测序技术分析CAR-T细胞和白血病/淋巴瘤的转录特征 | 采用现代单细胞测序技术，深入剖析白血病细胞与CAR-T细胞的转录复杂性 | 未提及文章的具体限制 | 讨论导致CAR-T免疫治疗临床失败的潜在机制 | 探讨CAR-T细胞的生物特征和影响临床反应的机制 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 14470 | 2024-08-04 |
Peripheral Lymphocytes in Primary Liver Cancers: Elevated NK and CD8+ T Cells and Dysregulated Selenium Metabolism
2024-Feb-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14020222
PMID:38397459
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研究论文 | 该研究探讨了原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响，特别关注NK细胞和CD8+ T细胞的变化以及硒代谢的失调 | 首次揭示了原发性肝癌对外周血淋巴细胞数量和硒蛋白代谢的显著影响 | 该研究的样本可能有限，且主要数据来自特定数据库，可能存在选择偏倚 | 研究原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响 | 研究对象包括肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）患者的外周血淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序技术 | Cox回归模型 | 细胞型数据，转录组数据，蛋白质组数据 | 研究涉及的样本数量不明确，主要来源于GEO数据库和肿瘤切除患者的外周血样本 |
| 14471 | 2024-08-04 |
Microarray Gene Expression Analysis of Lesional Skin in Canine Pemphigus Foliaceus
2024-Feb-14, Veterinary sciences
IF:2.0Q2
DOI:10.3390/vetsci11020089
PMID:38393106
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研究论文 | 本研究旨在表征犬类脓疱性皮肤病患者皮肤损伤中的分子机制和生物通路变化 | 本研究发现犬类脓疱性皮肤病损伤与人类脓疱性皮肤损伤的免疫特征相似，提供了新的分子机制见解 | 研究样本量相对较小，仅包括7例病变皮肤和5例健康皮肤 | 阐明犬类脓疱性皮肤病的发病机制及其生物通路变化 | 犬类脓疱性皮肤病患者的损伤皮肤与健康皮肤样本 | 数字病理学 | 自体免疫性疾病 | RNA微阵列 | NA | 基因表达数据 | 7例犬类脓疱性皮肤病患者和5例健康犬样本 |
| 14472 | 2024-08-07 |
scMGCN: A Multi-View Graph Convolutional Network for Cell Type Identification in scRNA-seq Data
2024-Feb-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25042234
PMID:38396909
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMGCN的多视角图卷积网络模型，用于从scRNA-seq数据中识别细胞类型 | 引入了多视角学习和多图构建方法来捕捉scRNA-seq数据中的全面细胞信息，并结合图卷积网络与注意力机制提取细胞间的高阶共享信息 | NA | 开发一种稳定且可解释的方法来从大规模scRNA-seq数据中识别细胞类型 | scRNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 图卷积网络 | 多视角图卷积网络模型 | scRNA-seq数据 | 多种数据集，包括单数据集、跨物种和跨平台实验 |
| 14473 | 2024-08-07 |
Comparison of Umbilical Cord Mesenchymal Stem Cells and Fibroblasts as Donor Nuclei for Handmade Cloning in Sheep Using a Single-Cell Transcriptome
2024-Feb-10, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani14040589
PMID:38396557
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研究论文 | 本文比较了脐带间充质干细胞和成纤维细胞作为供体核在手工克隆绵羊中的应用，使用单细胞转录组学方法分析了八细胞胚胎的转录组特征。 | 首次探索了脐带间充质干细胞作为供体核在核转移技术中的应用，并提供了细胞重编程机制的新见解。 | 文章未明确提及研究的局限性。 | 研究旨在提高核转移技术的效率，并探索脐带间充质干细胞作为供体核的优势。 | 研究对象包括脐带间充质干细胞、成纤维细胞和八细胞胚胎。 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 研究涉及脐带间充质干细胞和成纤维细胞作为供体核的八细胞胚胎。 |
| 14474 | 2024-08-07 |
Correlation of Myeloid-Derived Suppressor Cell Expansion with Upregulated Transposable Elements in Severe COVID-19 Unveiled in Single-Cell RNA Sequencing Reanalysis
2024-Jan-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12020315
PMID:38397917
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，探讨了可转座元件（TEs）在严重COVID-19患者中的表达与髓源抑制细胞（MDSCs）扩增之间的关联。 | 首次在单细胞水平上研究了可转座元件表达与COVID-19免疫反应中细胞功能的可能关联。 | 研究样本量较小，仅包括六名严重COVID-19患者和三名健康捐赠者的支气管肺泡灌洗样本。 | 评估可转座元件表达与严重COVID-19患者中由SARS-CoV-2引发的免疫反应之间的可能关联。 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本中的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 六名严重COVID-19患者和三名健康捐赠者的样本 |
| 14475 | 2024-08-04 |
Pan-Cancer Analysis Reveals Disulfidoptosis-Associated Genes as Promising Immunotherapeutic Targets: Insights Gained from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-Jan-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12020267
PMID:38397869
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研究论文 | 本研究探讨了与二硫化死亡相关的基因作为免疫治疗靶标的潜力 | 首次揭示二硫化死亡在不同肿瘤中的免疫和预后作用 | 研究主要依赖于公共数据库数据，缺乏临床实验证据 | 揭示二硫化死亡在肿瘤发生中的机制和临床应用潜力 | 研究了与二硫化死亡相关的基因在多种癌症中的表达及其临床意义 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，实时PCR，西方印迹 | NA | 基因表达数据，细胞系数据 | 包括多种癌症样本与细胞系的比较，具体数量未提及 |
| 14476 | 2024-08-04 |
Wnt signal-dependent antero-posterior specification of early-stage CNS primordia modeled in EpiSC-derived neural stem cells
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1260528
PMID:38405136
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研究论文 | 本文研究了早期中枢神经系统（CNS）前后轴的特征化过程，利用来源于EpiSC的神经干细胞模型。 | 该研究展示了Wnt信号在中枢神经系统前后轴特征化中所起的重要作用，特别是在不同Wnt信号强度影响转瞬细胞的区域特征化方面。 | 研究未展示后续中枢神经系统区域的特征，可能限制了对后部更后部区域的理解。 | 研究中胚胎早期CNS前后规格化过程中的分子机制。 | 使用小鼠源的EpiSC导出的神经干细胞进行实验和分析。 | 数字病理学 | NA | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六个神经干细胞系 |
| 14477 | 2024-08-07 |
Deciphering Oligodendrocyte Lineages in the Human Fetal Central Nervous System Using Single-Cell RNA Sequencing
2024-Mar, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03661-9
PMID:37775719
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了人类胎儿中枢神经系统中三个区域（纹状体、脑干和脊髓）的少突胶质细胞发育过程 | 发现了多个少突胶质细胞前体细胞（OPCs）的谱系，并描绘了这三个中枢神经系统区域中少突胶质细胞分化的不同发育轨迹 | NA | 揭示人类胎儿中枢神经系统中少突胶质细胞谱系的分子异质性 | 人类胎儿中枢神经系统中的少突胶质细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从妊娠第8周到第12周的人类胎儿中枢神经系统样本 |
| 14478 | 2024-08-04 |
Multimodal Single-Cell Sequencing of B Cells in Primary Sjögren's Syndrome
2024-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42683
PMID:37610265
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研究论文 | 本研究探讨了原发性干燥综合征中B细胞的组成、基因表达和B细胞受体使用情况 | 该研究首次通过多模态单细胞测序揭示了B细胞的异质性和分子特征，提供了更深入的患者分层方法 | 样本量相对较小，可能影响结果的广泛适用性和统计力量 | 确定SSA/SSB抗体分层的原发性干燥综合征（pSS）患者中B细胞的角色 | 研究对象为6名SSA-、8名SSA+单阳性和10名SSA/SSB+双阳性的pSS患者及4名健康对照者 | 数字病理学 | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞变异、多样性及连接（VDJ）基因测序（scVDJ-seq） | NA | 单细胞数据 | 230,000个B细胞，涉及24名参与者（6名SSA-，8名SSA+，10名SSA/SSB+及4名健康对照） |
| 14479 | 2024-08-04 |
Tissue niches and immunopathology through the lens of spatial tissue profiling techniques
2024-Feb, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350484
PMID:37985207
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评论 | 本研究讨论了空间组织在生物学中的基础作用及其对免疫系统的影响 | 结合多重组织学和空间转录组学技术，提供了蛋白质和基因表达模式的空间背景 | 承认空间组织剖析技术的挑战和局限性 | 探讨如何通过空间组织剖析改善对区域免疫的理解 | 重点关注组织生态位在健康和疾病中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 多重组织学和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 14480 | 2024-08-04 |
Role and Therapeutic Potential for Targeting Fibroblast Growth Factor 10/FGFR1 in Relapsed Rheumatoid Arthritis
2024-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42674
PMID:37584284
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研究论文 | 该文章探讨了针对成纤维细胞生长因子10/FGFR1在复发性类风湿关节炎中的作用和治疗潜力 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示FLS异质性及其在复发与缓解中的作用，提出针对FGF10/FGFR1的靶向治疗的新思路 | 样本数量较少，仅包含六个配对的滑膜组织样本，限制了结果的广泛适用性 | 本研究旨在识别成纤维细胞样滑膜细胞(FLSs)的异质性及其在复发性类风湿关节炎中的致病作用 | 研究对象为三名复发性RA患者和三名缓解期患者的滑膜组织样本 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学 | 胶原诱导关节炎(CIA)模型 | 组织样本 | 六个配对的滑膜组织样本 |