单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 14441 - 14460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14441 | 2024-08-07 |
NeuroTri2-VISDOT: An open-access tool to harness the power of second trimester human single cell data to inform models of Mendelian neurodevelopmental disorders
2024-Feb-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.01.578438
PMID:38352329
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研究论文 | 本文介绍了一个名为NeuroTri2-VISDOT的网络工具，用于探索第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据，以支持孟德尔神经发育障碍的研究 | 开发了一个易于访问的网络工具，降低了使用单细胞数据分析的门槛，促进了孟德尔神经发育障碍的转化研究 | NA | 提供一个易于访问的工具，帮助研究人员利用第二孕期人类大脑的单细胞数据来构建孟德尔神经发育障碍的模型 | 第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 由Bhaduri等人在2021年产生的第二孕期人类大脑的单细胞RNA测序数据集 |
| 14442 | 2024-08-07 |
Clinical-mediated discovery of pyroptosis in CD8+ T cell and NK cell reveals melanoma heterogeneity by single-cell and bulk sequence
2023-08-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06068-5
PMID:37620327
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量测序技术，分析了黑色素瘤中与细胞焦亡相关的基因表达，特别是在CD8 T细胞和NK细胞中的表达情况 | 首次综合分析了黑色素瘤中单细胞转录组景观中的细胞焦亡现象，并通过实验验证了免疫细胞簇和免疫基因模块 | 研究主要集中在CD8 T细胞和NK细胞，未涵盖所有类型的免疫细胞 | 探讨细胞焦亡在黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 黑色素瘤组织中的CD8 T细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 14443 | 2024-08-07 |
Single-cell atlas of the human neonatal small intestine affected by necrotizing enterocolitis
2023-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002124
PMID:37205711
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序、T细胞受体β分析、批量转录组学和成像技术，详细描述了坏死性小肠结肠炎（NEC）中细胞身份、相互作用和区域变化的情况 | 本研究首次建立了NEC相关肠道组织中异常上皮-间质-免疫相互作用的详细图谱，并强调了NEC相关肠道组织的细胞失调 | NA | 旨在填补对坏死性小肠结肠炎（NEC）中细胞变化和异常相互作用全面认识的空白 | 人类新生儿受坏死性小肠结肠炎影响的小肠细胞 | 数字病理学 | 新生儿疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 14444 | 2024-08-04 |
Distinct roles for interleukin-23 receptor signaling in regulatory T cells in sporadic and inflammation-associated carcinogenesis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1276743
PMID:38375204
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研究论文 | 本研究定义了调节性T细胞中IL-23受体信号在散发性和与炎症相关的结直肠癌中的贡献 | 揭示了IL-23R在调节性T细胞中对结直肠癌发展的细胞特异性影响，特别是在炎症相关和散发性癌症中的不同作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 阐明IL-23R信号在调节性T细胞中对结直肠癌的作用 | 小鼠中调节性T细胞的IL-23R信号及其在结肠炎相关癌症和散发性结直肠癌中的功能 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因组数据 | 小鼠模型中有多个样本，不同实验组之间的数量未具体说明 |
| 14445 | 2024-08-07 |
LRcell: detecting the source of differential expression at the sub-cell-type level from bulk RNA-seq data
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac063
PMID:35272348
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LRcell的计算方法，用于从批量RNA-seq数据中识别导致差异表达的具体（亚）细胞类型 | LRcell方法通过预嵌入的标记基因和模拟研究，有效识别了与精神疾病相关的已知细胞类型 | LRcell主要依赖于批量RNA-seq数据，未涉及单细胞RNA测序技术 | 旨在解决批量RNA-seq分析中未解决的问题，即识别差异表达发生的具体（亚）细胞类型 | 批量RNA-seq数据中的（亚）细胞类型 | 生物信息学 | 精神疾病 | RNA-seq | 计算方法 | RNA-seq数据 | 使用了三个不同的真实数据集 |
| 14446 | 2024-08-04 |
Tissue-resident memory T cell signatures from single-cell analysis associated with better melanoma prognosis
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109277
PMID:38455971
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研究论文 | 本研究系统性地探讨了组织驻留记忆T细胞与黑色素瘤肿瘤免疫微环境之间的关系 | 提出了基于T细胞浸润的22基因风险评分，以有效分类黑色素瘤患者的生存风险 | NA | 阐明组织驻留记忆T细胞在黑色素瘤肿瘤免疫微环境中的作用及其与患者生存的关系 | 黑色素瘤患者的组织驻留记忆T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个临床单细胞RNA-seq数据集 |
| 14447 | 2024-08-07 |
Synaptic endocytosis in adult adipose stromal cell-derived neurons
2024-03-15, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2023.148746
PMID:38184164
|
研究论文 | 本研究探讨了从脂肪来源的间充质干细胞（ADSCs）衍生的神经元中的突触内吞作用 | 首次研究了从ADSCs衍生的神经元中的内吞功能 | NA | 旨在检查从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用 | 从ADSCs衍生的神经元中的突触内吞作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 蛋白质和量子点 | NA |
| 14448 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of Drosophila trachea reveals glycosylation-mediated Notch signaling in cell fate specification
2024-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-46455-w
PMID:38448482
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了果蝇气管系统的细胞图谱，揭示了糖基化介导的Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 首次提供了果蝇气管系统的全面单细胞转录组图谱，并发现了糖基化对Notch信号在细胞命运决定中的响应 | NA | 探究果蝇气管系统的管状形态发生程序 | 果蝇气管系统的细胞类型和Notch信号在细胞命运决定中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 9种主要亚型的气管细胞 |
| 14449 | 2024-08-07 |
MSCsDB: a database of single-cell transcriptomic profiles and in-depth comprehensive analyses of human mesenchymal stem cells
2024-Mar-06, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00496-5
PMID:38449024
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研究论文 | 介绍了一个名为MSCsDB的数据库，该数据库整合了人类间充质干细胞的单细胞转录组数据，并提供深度综合分析 | MSCsDB数据库提供了一个一站式交互查询平台，支持调控子活动、基因本体富集、特征基因可视化和转录因子调控子分析，并开发了专门模块评估MSC质量 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术深入研究间充质干细胞的异质性，并提供一个系统分析已发表数据集的平台 | 人类间充质干细胞的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包括来自26个受试者的5个组织中的470,000个细胞 |
| 14450 | 2024-08-07 |
Diacylglycerols and Lysophosphatidic Acid, Enriched on Lipoprotein(a), Contribute to Monocyte Inflammation
2024-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319937
PMID:38269588
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研究论文 | 研究探讨了脂蛋白(a)（Lp[a]）中富含的二酰甘油（DGs）和溶血磷脂酸（LPA）对单核细胞炎症的贡献 | 首次揭示了Lp(a)中DGs和LPA对单核细胞炎症的影响，并发现这种炎症部分依赖于NLRP3炎症小体 | 研究主要集中在体外实验和部分临床样本分析，需要进一步的临床研究来验证这些发现 | 探讨Lp(a)中其他促炎介质对动脉粥样硬化的影响 | 脂蛋白(a)（Lp[a]）及其相关脂质对单核细胞炎症的影响 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 脂质组学、RNA测序、ELISA、Western blot、免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 血液样本、细胞样本 | 健康个体13人，高Lp(a)水平个体12人，心血管疾病患者若干 |
| 14451 | 2024-08-07 |
Human surface ectoderm and amniotic ectoderm are sequentially specified according to cellular density
2024-Mar, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh7748
PMID:38427729
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研究论文 | 本文通过建立人类多能干细胞模型，研究了羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 | 首次提出人类羊膜外胚层和表面外胚层是根据细胞密度沿着共同非神经外胚层轨迹指定的 | NA | 探究人类羊膜外胚层和表面外胚层的分化机制 | 人类羊膜外胚层和表面外胚层 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 14452 | 2024-08-04 |
Recent progress in hair follicle stem cell markers and their regulatory roles
2024-Feb-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v16.i2.126
PMID:38455104
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研究论文 | 本文回顾了毛囊干细胞的分子标记物及其调节作用 | 探讨了单细胞转录组技术提供的详细数据，聚焦于重要的HFSC分子标记物 | 缺乏HFSC的实验验证和比较不同标记物的实用性 | 旨在总结和分析毛囊干细胞标记物及其功能 | 主要研究毛囊干细胞及其在损伤愈合中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | NA | NA |
| 14453 | 2024-08-07 |
Identification and validation of a pyroptosis-related prognostic model for colorectal cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2024-Feb-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v15.i2.329
PMID:38455135
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研究论文 | 本研究基于大量和单细胞RNA测序数据，构建并验证了与结直肠癌（CRC）预后相关的细胞焦亡相关预测模型。 | 首次构建了一个基于细胞焦亡相关基因的结直肠癌预后模型，并验证了其与免疫浸润的相关性。 | NA | 评估细胞焦亡相关基因对结直肠癌预后的影响及其与免疫浸润的关联。 | 结直肠癌（CRC）患者的预后及免疫浸润情况。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | LASSO回归算法 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO的数据集，具体样本数量未在摘要中明确。 |
| 14454 | 2024-08-04 |
Granzyme B+ B cells detected by single-cell sequencing are associated with prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma following liver transplantation
2024-Feb-22, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03609-x
PMID:38386050
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞测序检测到的granzyme B+ B细胞与肝移植后肝内胆管癌患者预后的关系 | 首次揭示了肿瘤样本中granzyme B+ B细胞的显著增加及其与无病生存的正相关性 | 研究仅涉及肝内胆管癌，无法广泛适用于其他癌症类型 | 研究granzyme B+ B细胞在肝内胆管癌中的作用及其对预后的影响 | 肝移植接受者的肝内胆管癌患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序 | NA | 样本数据 | 25个样本来自基因表达综合数据库以及40名肝移植接受者 |
| 14455 | 2024-08-04 |
Identification macrophage signatures in prostate cancer by single-cell sequencing and machine learning
2024-Feb-13, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03633-5
PMID:38349474
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和机器学习识别前列腺癌中的巨噬细胞特征。 | 提出了一种基于巨噬细胞相关基因的风险标签，用于预测前列腺癌患者的进展。 | 样本来源于公共数据库，可能缺乏来自不同临床环境的数据验证。 | 分析肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的作用，并建立相关的预后模型。 | 关注肿瘤微环境中巨噬细胞与前列腺癌进展之间的关系。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、机器学习 | NA | 基因数据、RNA数据 | 从多个公共数据库下载的前列腺癌单细胞测序数据 |
| 14456 | 2024-08-07 |
uPAR (PLAUR) Marks Two Intra-Tumoral Subtypes of Glioblastoma: Insights from Single-Cell RNA Sequencing
2024-Feb-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25041998
PMID:38396677
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了uPAR（PLAUR）在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用及其分子合作者 | 首次全面研究uPAR在GBM内部亚型中的功能及其分子合作者，无需预设生物学途径 | NA | 探讨uPAR在胶质母细胞瘤内部亚型中的作用及其分子机制 | uPAR在胶质母细胞瘤中的作用及其分子合作者 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 37名胶质母细胞瘤患者 |
| 14457 | 2024-08-07 |
Targeting tumor-stromal interactions in triple-negative breast cancer using a human vascularized micro-tumor model
2024-01-05, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01760-y
PMID:38183074
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研究论文 | 本研究利用人血管化微肿瘤模型，探索三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子基础及潜在治疗靶点 | 采用先进的体外微生理系统——血管化微肿瘤模型，结合单细胞RNA测序技术，揭示了正常乳腺组织基质细胞在三阴性乳腺癌微环境中的促癌信号通路 | NA | 研究三阴性乳腺癌中肿瘤-基质相互作用的分子机制，并探索潜在的治疗靶点 | 三阴性乳腺癌中的肿瘤-基质相互作用及其治疗靶点 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 血管化微肿瘤模型 | RNA | NA |
| 14458 | 2024-08-04 |
Tumor-associated macrophages promoting PD-L1 expression in infiltrating B cells through the CXCL12/CXCR4 axis in human hepatocellular carcinoma
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38455420
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研究论文 | 该研究探讨了肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞通过CXCL12/CXCR4轴促进浸润B细胞PD-L1表达的机制 | 发现了一种新型的调节性B细胞PD-L1 Bregs，揭示了它们与CXCL12 TAMs之间的相互作用以及其在肝细胞癌中的作用 | 该研究的局限性可能在于基于单细胞RNA-seq数据的分析，这可能不能完全代表肿瘤微环境的复杂性 | 研究肝细胞癌中细胞间通信的机制 | 调节性B细胞、肿瘤相关巨噬细胞及其在肝细胞癌中的相互作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA-seq、免疫组化 | 小鼠模型 | RNA序列数据 | 使用了小鼠模型进行实验验证，具体样本数量未提供 |
| 14459 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis reveals one cancer-associated fibroblasts subtype linked to metastasis in breast cancer: MXRA5 as a potential novel marker for prognosis
2024, American journal of cancer research
IF:3.6Q2
PMID:38455411
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了乳腺癌中与转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2，并鉴定了MXRA5作为潜在的新型预后标志物。 | 首次识别出与乳腺癌转移相关的特定癌症相关成纤维细胞亚型FN1+CAF2，并发现MXRA5可能作为新的标志物参与乳腺癌转移的调控。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，未来需要更多的实验验证MXRA5在乳腺癌转移中的具体作用机制。 | 揭示乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在转移中的作用，寻找新的预后标志物。 | 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞及其亚型，以及它们与乳腺癌转移的关系。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个乳腺癌患者的组织样本 |
| 14460 | 2024-08-07 |
Complement C1q essential for aeroallergen sensitization via CSF1R+ conventional dendritic cells type 2
2023-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.07.016
PMID:37562753
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研究论文 | 研究探讨了补体C1q在CSF1R+常规树突状细胞类型2中通过识别吸入性过敏原在过敏反应中的作用 | 首次揭示了C1q在CSF1R+cDC2亚群中的选择性富集及其在过敏原识别和哮喘特征中的关键作用 | NA | 阐明CSF1R+cDC2树突状细胞识别吸入性过敏原的转录程序和受体-配体相互作用 | 小鼠肺部树突状细胞和人类肺部转录组数据 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠模型和人类样本 |