单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 14441 - 14460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14441 | 2024-08-07 |
A multimodal cell census and atlas of the mammalian primary motor cortex
2021-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03950-0
PMID:34616075
|
研究论文 | 本文报道了通过BRAIN Initiative Cell Census Network (BICCN)生成的哺乳动物初级运动皮层的多模态细胞普查和图谱 | 研究首次整合了单细胞转录组、染色质可及性、DNA甲基化图谱、空间解析的单细胞转录组、形态学和电生理特性以及细胞分辨率的输入-输出映射，并通过跨模态计算分析进行整合 | NA | 推进对大脑细胞类型组织的集体知识和理解 | 哺乳动物初级运动皮层的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、DNA甲基化分析、空间解析的单细胞转录组学 | 跨模态计算分析 | 转录组、染色质可及性、DNA甲基化、形态学和电生理数据 | NA |
| 14442 | 2024-08-07 |
Dysbalance of ACE2 levels - a possible cause for severe COVID-19 outcome in COPD
2021-09, The journal of pathology. Clinical research
DOI:10.1002/cjp2.224
PMID:33978304
|
研究论文 | 研究探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）患者中ACE2及其相关辅助因子的表达水平，以及这些变化如何影响SARS-CoV-2感染的风险 | 首次揭示了COPD患者肺组织中ACE2和TMPRSS2表达增加，同时循环sACE2水平降低，这些变化可能增加COPD患者对SARS-CoV-2感染的易感性 | 研究未涉及这些变化与肺部血流动力学变化之间的关联 | 探究COPD患者中ACE2及其相关辅助因子的表达变化及其对SARS-CoV-2感染的影响 | COPD、特发性肺动脉高压（IPAH）和肺纤维化（PF）患者的肺组织样本及健康对照组样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺病 | 定量PCR、酶联免疫吸附试验、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | COPD患者28例，IPAH患者10例，PF患者10例，健康对照组10例 |
| 14443 | 2024-08-07 |
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2020.12.006
PMID:33429107
|
研究论文 | 研究通过开发一种新的肽激动剂，探讨了蛋白酶活化受体3（PAR3）在痛觉中的作用 | 开发了一种脂质连接的PAR3激动剂C660，该激动剂能特异性地激活PAR3并引起DRG和三叉神经元中的钙反应 | NA | 更好地理解PAR3在外周感觉神经系统中的潜在功能 | PAR3在痛觉中的作用及其与其他PARs的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | G蛋白偶联受体（GPCRs） | RNA序列数据 | 使用了野生型和PAR3敲除的小鼠模型 |
| 14444 | 2024-08-07 |
The alx3 gene shapes the zebrafish neurocranium by regulating frontonasal neural crest cell differentiation timing
2021-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197483
PMID:33741714
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了alx3基因在调控前鼻神经嵴细胞分化时间和细胞形态中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细定义了颅神经嵴细胞的不同群体，并发现Alx转录因子基因家族在前鼻神经嵴细胞中的富集 | NA | 深入理解控制发育时序的基因如何塑造颅面骨骼元素 | alx3基因在前鼻神经嵴细胞分化中的作用 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 14445 | 2024-08-07 |
Comprehensive single-cell sequencing reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of nasopharyngeal carcinoma
2021-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21795-z
PMID:33750785
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态和肿瘤特异性特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞群及其亚群，并揭示了其对患者预后和治疗结果的影响 | 研究仅基于14名患者的样本，可能需要更多样本以增强结果的普遍性 | 深入理解鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞动态，以促进癌症诊断、治疗和预后 | 鼻咽癌肿瘤微环境中的基质细胞及其亚群 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66,627个细胞来自14名患者 |
| 14446 | 2024-08-07 |
ReactomeGSA - Efficient Multi-Omics Comparative Pathway Analysis
2020-12, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1074/mcp.TIR120.002155
PMID:32907876
|
研究论文 | 介绍了一种名为ReactomeGSA的新资源，用于多组学数据集的比较途径分析 | ReactomeGSA通过Reactome的现有网页界面和新的ReactomeGSA R Bioconductor包，支持scRNA-seq数据，并能自动将不同物种的数据映射到共同的途径空间，大大降低了多组学、跨物种比较途径分析的技术门槛 | NA | 探索多组学数据集的比较途径分析方法 | B细胞在抗肿瘤免疫中的作用 | 生物信息学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 多组学数据 | 比较了来自Cancer Genome Atlas (TCGA)的五个转录组学研究和Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC)的两个蛋白质组学研究的B细胞丰富和贫乏的人类癌症样本 |
| 14447 | 2024-08-07 |
Quantitative single-cell interactomes in normal and virus-infected mouse lungs
2020-06-26, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.044404
PMID:32461220
|
研究论文 | 本文介绍了一种定量直观算法和优化实验方案，用于构建和比较正常与感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞间的相互作用网络。 | 提出了一种新的定量直观算法，结合优化的实验协议，使不具有高级编程技能的实验室科学家也能适应。 | 算法和方法的通用性需要在其他器官和人类样本中进一步验证。 | 解析哺乳动物器官中通过配体-受体相互作用进行的细胞间信号传递，特别是在病毒感染情况下的变化。 | 正常和感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 定量直观算法 | RNA序列数据 | 每种细胞类型至少90个细胞 |
| 14448 | 2024-08-07 |
Clonally expanded CD8 T cells patrol the cerebrospinal fluid in Alzheimer's disease
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1895-7
PMID:31915375
|
研究论文 | 本研究通过综合分析多个队列，揭示了阿尔茨海默病中血液和脑脊液的适应性免疫变化，并发现了克隆扩增的CD8 T细胞在脑脊液中的存在 | 首次发现阿尔茨海默病患者脑脊液中存在克隆扩增的CD8 T细胞，并证实这些细胞对Epstein-Barr病毒抗原具有特异性 | NA | 探究阿尔茨海默病中适应性免疫反应的贡献 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞和脑脊液中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 机器学习 | 细胞 | 多个队列的患者样本 |
| 14449 | 2024-08-07 |
Computational analysis of single-cell transcriptomics data elucidates the stabilization of Oct4 expression in the E3.25 mouse preimplantation embryo
2019-06-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-45438-y
PMID:31222057
|
研究论文 | 本研究通过计算分析32至64细胞阶段的E3.25小鼠胚胎的单细胞转录组数据，揭示了Oct4表达在植入前胚胎中的稳定机制 | 发现了非自主机制，基于ICM中至少四个细胞接触，激活植入前胚胎中的Oct4表达，并稳定在高水平 | NA | 阐明E3.25小鼠胚胎中Oct4表达的稳定机制及其与早期多能状态的关系 | E3.25小鼠胚胎的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞微阵列转录组学 | Hierarchical Optimal k-Means (HOkM) 聚类 | 转录组数据 | 超过3,800个基因在E3.25-HNC的ICM细胞中表现出转录组分叉 |
| 14450 | 2024-08-07 |
Single-cell landscape in mammary epithelium reveals bipotent-like cells associated with breast cancer risk and outcome
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0554-8
PMID:31428694
|
研究论文 | 本研究利用无标记算法分析单细胞RNA测序数据，揭示了与乳腺癌风险和预后相关的高潜能细胞状态 | 本研究首次应用无标记算法在单细胞RNA测序数据中识别出一种新的双潜能干细胞样状态，并验证了其在乳腺癌中的临床相关性 | 由于单细胞RNA测序数据的高丢失率，无偏见地识别成人干细胞具有挑战性 | 揭示乳腺上皮中的双潜能干细胞样细胞与乳腺癌风险和预后的关系 | 人类乳腺上皮细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 无标记算法 | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 14451 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of estrogen- and endocrine-disrupting chemical-induced reorganization of mouse mammary gland
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0618-9
PMID:31701034
|
研究论文 | 本研究使用手术绝经（卵巢切除）小鼠模型，分析了17β-雌二醇（E2）和多溴联苯醚（PBDEs）对乳腺组织的影响，并通过单细胞RNA测序（scRNAseq）揭示了E2和PBDEs对乳腺细胞基因表达的调控作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了E2和PBDEs对乳腺细胞基因表达的调控作用，并发现了PBDEs促进E2-AREG-EGFR-M2巨噬细胞途径 | NA | 探究绝经后雌激素和内分泌干扰化学物质对小鼠乳腺组织的重组影响 | 小鼠乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 手术绝经（卵巢切除）小鼠模型 |
| 14452 | 2024-08-07 |
Genome organization and DNA accessibility control antigenic variation in trypanosomes
2018-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0619-8
PMID:30333624
|
研究论文 | 本文研究了布氏锥虫中基因组组织和DNA可及性控制抗原变异的现象 | 首次在布氏锥虫中识别了连接全局基因组结构、局部染色质构象和抗原变异的分子机制，即组蛋白变异体 | 研究受限于抗原基因阵列的高度重复性和杂合性，这阻碍了许多病原体的完整基因组组装 | 探讨基因组结构在抗原变异中的作用 | 布氏锥虫的抗原基因阵列及其基因组结构 | 基因组学 | 寄生虫病 | 长读长测序技术、染色体构象捕获(Hi-C) | NA | 基因组数据 | NA |
| 14453 | 2024-08-04 |
Integrating single-cell RNA-seq datasets with substantial batch effects
2024-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.03.565463
PMID:37961672
|
研究论文 | 本文提出了一种新模型，旨在优化单细胞RNA测序数据集的整合，解决批次效应问题 | 通过引入和比较一系列正则化约束，提出了结合VampPrior和循环一致性损失的新模型，提高了生物变异的保留和批次校正 | 依赖KL正则化强度调节会在不区分生物信息和批次信息的情况下去除两者 | 优化单细胞RNA测序数据集的整合，以改善批次效应的去除和生物变异的保留 | 不同的单细胞RNA测序数据集，包括跨器官、物种和不同协议的数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件变分自编码器（cVAE） | RNA序列数据 | NA |
| 14454 | 2024-08-07 |
Mrc1+ macrophage-derived IGF1 mitigates crystal nephropathy by promoting renal tubule cell proliferation via the AKT/Rb signaling pathway
2024, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.89174
PMID:38389846
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）等方法，探讨了晶体肾病中细胞成分及其相互作用的变化，并发现Mrc1+巨噬细胞衍生的IGF1通过AKT/Rb信号通路促进肾小管细胞增殖，从而减轻晶体肾病。 | 首次揭示了Mrc1+巨噬细胞在晶体肾病中的作用，及其通过IGF1促进肾小管细胞增殖的机制。 | NA | 研究晶体肾病中细胞特征及其相互作用，寻找潜在的治疗靶点。 | 晶体肾病中的细胞成分及其相互作用。 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组 | 超过40000个单细胞，包括不同阶段的肾小管细胞、T细胞、B细胞、骨髓细胞和间充质细胞。 |
| 14455 | 2024-08-04 |
Single-cell transcriptomics analysis of proliferative diabetic retinopathy fibrovascular membranes reveals AEBP1 as fibrogenesis modulator
2023-Nov-02, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172062
PMID:37917183
|
研究论文 | 该研究分析了增殖性糖尿病视网膜病变中的前视网膜纤维血管膜的单细胞转录组特征 | 首次发现AEBP1在人视网膜周细胞向肌成纤维细胞转变中的调节作用 | 未说明样本的具体数量和来源细节 | 识别潜在的治疗靶点以改善糖尿病视网膜病变的管理 | 来自患者的前视网膜纤维血管膜进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 14456 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of human MAIT cell transcriptional, functional and clonal diversity
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01575-1
PMID:37580605
|
研究论文 | 本文研究了人类黏膜相关不变T细胞（MAIT细胞）的转录组、功能和克隆多样性 | 开发了功能性RNA测序方法，能够在单细胞分辨率下整合功能和TCR克隆型 | NA | 探讨人类MAIT细胞的功能和克隆多样性 | 血液和肝脏中的MAIT细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 血液和肝脏中的MAIT细胞 |
| 14457 | 2024-08-04 |
Location of CD39+ T cell subpopulations within tumors predict differential outcomes in non-small cell lung cancer
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006770
PMID:37648263
|
研究论文 | 该研究调查了CD39和CD73在非小细胞肺癌（NSCLC）中的预后意义 | 提供了CD39+ T细胞亚群在肿瘤组织中的分布和功能特性的深入理解 | 未提及特定的局限性 | 理解免疫抑制途径在非小细胞肺癌中的作用，以开发新的诊断和治疗方法 | 162名早期未治疗的非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫荧光、流式细胞仪、靶向RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞、组织 | 162名早期未治疗的非小细胞肺癌患者 |
| 14458 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析剖析了银屑病的严重程度与细胞生态系统的关系 | 首次通过空间转录组学揭示了健康皮肤和炎症皮肤之间免疫微环境的显著差异 | 尚未深入探讨银屑病对其他系统性疾病的影响 | 研究银屑病的细胞组学及其在不同严重程度下的差异 | 25个健康、活跃病变和临床未涉及的皮肤活检样本 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 25个皮肤活检样本 |
| 14459 | 2024-08-07 |
Trajectory reconstruction identifies dysregulation of perinatal maturation programs in pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112330
PMID:37014753
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）重建轨迹，识别了多能干细胞衍生的心肌细胞（PSC-CMs）中胎儿成熟程序的失调 | 首次通过单细胞RNA测序技术，比较了体内外心肌细胞成熟过程的差异，并识别了跨物种间在PSC-CMs中持续失调的转录因子网络 | 多能干细胞衍生的心肌细胞未能达到完全功能成熟 | 探究多能干细胞衍生的心肌细胞成熟过程中的机制差异，并寻找改善其临床应用的方法 | 多能干细胞衍生的心肌细胞及其成熟过程 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 广泛采样了先前难以分离的胎儿期时间段的鼠体内心肌细胞 |
| 14460 | 2024-08-07 |
Identifying fibrogenic cells following salivary gland obstructive injury
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1190386
PMID:37287453
|
研究论文 | 研究探讨了刺猬信号传导效应子Gli1在阻塞性损伤后唾液腺纤维化反应中的作用 | 使用单细胞RNA测序技术分析了纤维化反应中细胞亚群的变化，并发现某些基质细胞亚群在纤维化过程中表达更多的基质基因 | 研究表明Gli1信号和Gli1细胞对机械损伤诱导的唾液腺纤维化变化贡献较小 | 确定参与损伤反应和疾病进展的基质细胞和信号通路，揭示未来的治疗靶点 | 唾液腺中的纤维化反应及其相关细胞和信号通路 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 实验使用了雌性小鼠的下颌下唾液腺进行导管结扎手术 |