单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 14401 - 14420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14401 | 2024-08-07 |
Co-differential genes between DKD and aging: implications for a diagnostic model of DKD
2024, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.17046
PMID:38435999
|
研究论文 | 本研究通过筛选糖尿病肾病（DKD）和衰老相关的共同差异基因，构建了一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 发现了DKD和衰老之间的共同差异基因，并基于这些基因开发了一个遗传诊断模型 | NA | 探索糖尿病肾病（DKD）和衰老之间的共同差异基因，并建立一个基于这些基因的DKD诊断模型 | 糖尿病肾病（DKD）和衰老相关的共同差异基因 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO回归 | 基因表达数据 | DKD小鼠模型（通过链脲佐菌素（STZ）注射构建并由组织切片染色确认） |
| 14402 | 2024-08-07 |
Human γδ T cell identification from single-cell RNA sequencing datasets by modular TCR expression
2023-11-24, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiad069
PMID:37437101
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于TCR模块基因表达评分策略，用于从单细胞RNA测序数据中准确识别人类γδ T细胞 | 提出了一种新的TCR模块评分策略，无需额外的单细胞γδ T细胞受体测序或CITE-seq数据，即可在大型单细胞RNA测序数据集中识别γδ T细胞 | NA | 开发一种新的方法，用于在大型单细胞RNA测序数据集中准确识别γδ T细胞 | 人类γδ T细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 多个不同组织和不同亚型的γδ T细胞的单细胞RNA测序数据集 |
| 14403 | 2024-08-07 |
Single-cell mapping of combinatorial target antigens for CAR switches using logic gates
2023-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01686-y
PMID:36797491
|
研究论文 | 本研究通过构建单细胞表达图谱，整合了来自412个肿瘤和12个正常器官的约140万个肿瘤细胞、肿瘤浸润正常细胞和参考正常细胞，以解析组织复杂性至单个细胞水平，并利用随机森林和卷积神经网络的两步筛选方法，选择对区分单个恶性细胞和正常细胞贡献最大的基因对，评估基于配对基因组合表达模式的AND、OR和NOT逻辑门的肿瘤覆盖率和特异性，并通过单细胞转录组耦合表位分析验证了在卵巢癌和结直肠癌中识别的AND、OR和NOT开关靶点。 | 本研究通过构建大规模的单细胞表达图谱，结合机器学习和深度学习技术，创新性地筛选和验证了用于CAR细胞疗法的组合靶抗原逻辑门开关。 | NA | 旨在解决肿瘤内异质性对CAR细胞疗法中靶抗原选择的关键挑战。 | 研究对象包括肿瘤细胞、肿瘤浸润正常细胞和参考正常细胞。 | 数字病理学 | 卵巢癌、结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | 卷积神经网络 | 单细胞表达数据 | 约140万个细胞，来自412个肿瘤和12个正常器官 |
| 14404 | 2024-08-07 |
scPrisma infers, filters and enhances topological signals in single-cell data using spectral template matching
2023-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01663-5
PMID:36849830
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scPrisma的光谱计算方法，用于在单细胞数据中推断、过滤和增强拓扑信号 | scPrisma方法利用拓扑先验来解耦、增强和过滤单细胞数据中的不同生物过程信号，如周期性和线性信号 | NA | 开发一种新的计算方法，用于分析单细胞RNA测序数据中的生物信号 | 单细胞RNA测序数据中的细胞周期、昼夜节律和空间分区等生物过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 光谱计算方法 | 单细胞数据 | 涉及HeLa细胞、肝小叶、Chlamydomonas和大脑中的视交叉上核等多种样本 |
| 14405 | 2024-08-07 |
The next generation of single-cell sequencing methods can be microfluidics-free
2023-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01710-1
PMID:36879009
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14406 | 2024-08-07 |
Neutrophilic granulocyte-derived B-cell activating factor supports B cells in skin lesions in hidradenitis suppurativa
2023-04, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2022.10.034
PMID:36481267
|
研究论文 | 本研究旨在探讨支持藏毛窦病灶中B细胞/浆细胞持续存在的介质 | 发现中性粒细胞衍生的B细胞激活因子（BAFF）在藏毛窦病灶中支持B细胞/浆细胞的持续存在和功能 | NA | 研究藏毛窦病灶中支持B细胞/浆细胞持续存在的介质 | 藏毛窦病患者的皮肤样本和对照组样本 | 免疫学 | 藏毛窦病 | mRNA测序、定量PCR、流式细胞术、免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据 | 多个藏毛窦病患者和对照组的皮肤样本 |
| 14407 | 2024-08-07 |
Cellular and Transcriptional Dynamics during Brown Adipose Tissue Regeneration under Acute Injury
2023, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0268
PMID:38434240
|
research paper | 本文建立了一种新的棕色脂肪组织（BAT）损伤与再生模型（BAT-IR），并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序研究了BAT在急性损伤后的细胞和转录组动态变化。 | 首次详细描述了BAT在急性损伤后的再生过程，并鉴定了参与再生的特定纤维脂肪生成和髓系祖细胞群。 | NA | 探究棕色脂肪组织在急性损伤后的再生机制。 | 棕色脂肪组织（BAT）及其在急性损伤后的再生过程。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 14408 | 2024-08-07 |
ATR Inhibition Induces CDK1-SPOP Signaling and Enhances Anti-PD-L1 Cytotoxicity in Prostate Cancer
2021-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1010
PMID:34168048
|
研究论文 | 本研究探讨了ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法联合使用在去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中的分子机制 | 发现ATR抑制剂直接抑制ATR-CHK1信号通路，激活CDK1-SPOP轴，导致PD-L1蛋白不稳定，从而增强免疫检查点阻断疗法的疗效 | NA | 揭示ATR抑制剂与免疫检查点阻断疗法在CRPC中的相互作用机制，为临床试验提供依据 | 去势抵抗性前列腺癌细胞和模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了前列腺癌细胞系和同基因的雄激素不敏感前列腺癌模型 |
| 14409 | 2024-08-07 |
Comprehensive analysis of anoikis-related genes in diagnosis osteoarthritis: based on machine learning and single-cell RNA sequencing data
2024-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2024.2318210
PMID:38423139
|
研究论文 | 本研究通过机器学习和单细胞RNA测序数据，全面分析了与细胞凋亡相关的基因在骨关节炎诊断中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据和机器学习模型，识别出与骨关节炎进展相关的细胞凋亡相关基因和通路 | 研究仅使用了两个微阵列数据集和一个单细胞RNA测序数据集，可能存在数据集选择的局限性 | 发现基于转录组的新型细胞凋亡相关生物标志物和通路，用于骨关节炎的进展诊断 | 骨关节炎及其相关的细胞凋亡机制 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | XGB, SVM, RF, GLM | 基因表达数据 | 25,852个细胞，来自6个骨关节炎软骨样本 |
| 14410 | 2024-08-04 |
Space-feature measures on meshes for mapping spatial transcriptomics
2024-Apr, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2023.103068
PMID:38176357
|
研究论文 | 本文描述了一套用于计算微分流形中的测地线的算法，拓展了大变形微分度量映射算法。 | 首次提出空间特征度量 LDDMM 算法，扩展了现有算法以支持组织尺度的空间特征作用 | 尚未实现通过共同坐标的统计平均整合分子和细胞尺度的人群 | 旨在构建一个跨模态的转录组数据对齐算法以实现共同坐标系统的整合 | 研究对象为小鼠脑中的细胞结构和转录组数据 | 计算解剖学 | NA | MERFISH | LDDMM | 几何测量 | 大量未结构化点 |
| 14411 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals that PTPRG activates the m6A methyltransferase VIRMA to block mitophagy-mediated neuronal death in Alzheimer's disease
2024-Mar, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107098
PMID:38325728
|
研究论文 | 本研究揭示了PTPRG通过激活m6A甲基转移酶VIRMA来阻止阿尔茨海默病中的线粒体自噬介导的神经元死亡 | 首次展示PTPRG在阿尔茨海默病进展中的作用，并揭示其通过VIRMA和PRKN相互作用影响神经元存活的机制 | 样本主要集中于特定的大脑区域，可能无法全面代表阿尔茨海默病的复杂病理 | 阐明阿尔茨海默病中神经元死亡的机制，以帮助开发有效的治疗方法 | 85个阿尔茨海默病样本和83个对照样本的单细胞RNA测序数据 | 数字病理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 时空转录组学 | 5×FAD小鼠模型 | 基因表达数据 | 85个阿尔茨海默病样本和83个对照样本，以及6只App AD小鼠和6只对照C57Bl/6 J小鼠的空间转录组数据 |
| 14412 | 2024-08-04 |
Understanding Mechanisms of Response to CAR T-cell Therapy through Single-Cell Sequencing: Insights and Challenges
2024-Mar-01, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-23-0212
PMID:38324393
|
研究论文 | 本文章讨论了单细胞RNA测序在理解CAR T细胞疗法分子特征中的应用及其面临的挑战 | 采用单细胞RNA测序技术，揭示了与临床结果相关的CAR T细胞的分子特征 | 在解释这种复杂数据类型时存在挑战 | 旨在理解CAR T细胞疗法的反应机制 | 研究重点是CAR T细胞的分子特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 14413 | 2024-08-04 |
Mutual Regulation of Transcriptomes between Murine Pneumocytes and Fibroblasts Mediates Alveolar Regeneration in Air-Liquid Interface Cultures
2024-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2023-0078OC
PMID:38051640
|
研究论文 | 该文章分析了肺成纤维细胞与肺上皮细胞在再生过程中的相互作用 | 通过单细胞转录组学揭示了成纤维细胞与肺泡上皮细胞之间的调节循环 | 本研究的局限性未在摘要中详细说明 | 阐明成纤维细胞和肺上皮细胞在再生过程中的相互作用 | 研究了小鼠肺泡 II 型细胞和成纤维细胞的相互作用 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 14414 | 2024-08-07 |
NLRP3 Inhibition Leads to Impaired Mucosal Fibroblast Function in Patients with Inflammatory Bowel Diseases
2024-Mar-01, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjad164
PMID:37748021
|
研究论文 | 研究NLRP3炎症小体在炎症性肠病（IBD）中黏膜炎症和纤维化形成中的作用及其抑制效果 | 首次详细研究了NLRP3炎症小体在IBD患者中黏膜炎症和纤维化过程中的表达和功能，并探讨了NLRP3抑制剂对肠道纤维细胞增殖和胶原蛋白产生的影响 | 研究主要集中在NLRP3炎症小体的抑制作用上，未涉及其他可能的炎症途径或治疗方法 | 探讨NLRP3炎症小体在炎症性肠病中的作用及其抑制剂的治疗潜力 | 炎症性肠病患者的黏膜免疫细胞和纤维细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序和微阵列分析 | NA | RNA | 来自炎症性肠病患者的肠道黏膜免疫细胞和纤维细胞 |
| 14415 | 2024-08-07 |
Dissecting the immune discrepancies in mouse liver allograft tolerance and heart/kidney allograft rejection
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13555
PMID:37748771
|
研究论文 | 本文构建了小鼠肝、心和肾同种异体移植模型，并利用单细胞RNA测序技术分析了66,393个细胞，以描述器官移植早期阶段的细胞组成和免疫细胞相互作用，同时通过批量RNA测序分析了移植后第7天至第60天的转录组动态变化。 | 首次详细描述了小鼠肝移植耐受与心/肾移植排斥反应中细胞组成和免疫细胞相互作用的差异，并揭示了Kupffer细胞和巨噬细胞在耐受诱导中的协同功能。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 深入理解实体器官移植中的耐受和排斥机制。 | 小鼠肝、心和肾同种异体移植模型中的细胞组成和免疫细胞相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列 | 66,393个细胞 |
| 14416 | 2024-08-07 |
Integration of human organoids single-cell transcriptomic profiles and human genetics repurposes critical cell type-specific drug targets for severe COVID-19
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13558
PMID:37807299
|
研究论文 | 本文构建了一个计算框架，整合了人类类器官单细胞转录组数据、全基因组关联研究统计数据、表达数量性状位点以及基因-药物相互作用数据，以识别与COVID-19严重性相关的关键细胞群体和药物靶点 | 本文创新性地利用人类类器官单细胞转录组数据和遗传学数据，重新定位了针对COVID-19的细胞类型特异性药物靶点 | NA | 识别与COVID-19严重性相关的细胞类型特异性药物靶点，以促进开发有效的治疗方法 | 人类类器官中的39种细胞类型及其与COVID-19严重性的关联 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 计算框架 | 转录组数据 | 八种类器官中的39种细胞类型 |
| 14417 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing gene signatures for classifying and scoring exhausted CD8+ T cells in B-cell acute lymphoblastic leukaemia
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13583
PMID:38030593
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14418 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral blood leukocyte responses to spinal cord injury in mice with humanised immune systems
2024-Mar-01, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03048-0
PMID:38429643
|
研究论文 | 本研究利用人源化免疫系统的小鼠模型和单细胞RNA测序技术，探讨了人免疫细胞在脊髓损伤后的反应和变化 | 首次在人源化小鼠模型中使用单细胞RNA测序技术研究脊髓损伤后免疫细胞的反应和变化 | 研究仅限于特定的人源化小鼠模型，可能不完全代表人类脊髓损伤后的免疫反应 | 深入研究脊髓损伤后免疫抑制综合征（SCI-IDS）以及人白细胞在损伤部位的迁移和变化 | 人源化NSG-SGM3小鼠脊髓损伤后的免疫细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 11种人免疫细胞（亚）类型或状态 |
| 14419 | 2024-08-07 |
Traditional Chinese Medicine Shi-Bi-Man ameliorates psoriasis via inhibiting IL-23/Th17 axis and CXCL16-mediated endothelial activation
2024-Mar-01, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-024-00907-z
PMID:38429819
|
研究论文 | 研究中药石壁曼通过抑制IL-23/Th17轴和CXCL16介导的内皮细胞活化来改善银屑病的作用机制 | 首次探讨了石壁曼通过抑制IL-23/Th17细胞轴和CXCL16表达来减轻银屑病样皮肤炎症的作用 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体临床试验验证 | 寻找银屑病的新治疗策略并探究其作用机制 | 石壁曼对银屑病样皮肤炎症的影响及其分子机制 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 反转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR) | NA | 细胞 | 使用咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 |
| 14420 | 2024-08-04 |
IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6 positive feedback loop in tumor-associated macrophages promotes the EMT and metastasis of lung adenocarcinoma
2024-Feb-29, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02989-x
PMID:38424624
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）通过IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6正反馈环路促进肺腺癌的上皮间质转化（EMT）和转移的机制 | 揭示了巨噬细胞促进肿瘤进展的新机制，IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6信号级联可能成为肺癌治疗的新靶点 | 研究的样本主要来自单一医院，样本容量相对较小 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肺癌转移中的调控机制 | 研究对象包括来自公共数据库和14名肺癌患者的正常及肿瘤组织样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序，RT-qPCR，Western blotting，免疫荧光，双荧光素酶报告实验，ChIP | NA | 组织样本 | 14名手术患者的肿瘤和正常组织样本 |