单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 14381 - 14400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 14381 | 2024-08-07 |
NLRP3 Inhibition Leads to Impaired Mucosal Fibroblast Function in Patients with Inflammatory Bowel Diseases
2024-Mar-01, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjad164
PMID:37748021
|
研究论文 | 研究NLRP3炎症小体在炎症性肠病（IBD）中黏膜炎症和纤维化形成中的作用及其抑制效果 | 首次详细研究了NLRP3炎症小体在IBD患者中黏膜炎症和纤维化过程中的表达和功能，并探讨了NLRP3抑制剂对肠道纤维细胞增殖和胶原蛋白产生的影响 | 研究主要集中在NLRP3炎症小体的抑制作用上，未涉及其他可能的炎症途径或治疗方法 | 探讨NLRP3炎症小体在炎症性肠病中的作用及其抑制剂的治疗潜力 | 炎症性肠病患者的黏膜免疫细胞和纤维细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序和微阵列分析 | NA | RNA | 来自炎症性肠病患者的肠道黏膜免疫细胞和纤维细胞 |
| 14382 | 2024-08-07 |
Dissecting the immune discrepancies in mouse liver allograft tolerance and heart/kidney allograft rejection
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13555
PMID:37748771
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研究论文 | 本文构建了小鼠肝、心和肾同种异体移植模型，并利用单细胞RNA测序技术分析了66,393个细胞，以描述器官移植早期阶段的细胞组成和免疫细胞相互作用，同时通过批量RNA测序分析了移植后第7天至第60天的转录组动态变化。 | 首次详细描述了小鼠肝移植耐受与心/肾移植排斥反应中细胞组成和免疫细胞相互作用的差异，并揭示了Kupffer细胞和巨噬细胞在耐受诱导中的协同功能。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 深入理解实体器官移植中的耐受和排斥机制。 | 小鼠肝、心和肾同种异体移植模型中的细胞组成和免疫细胞相互作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列 | 66,393个细胞 |
| 14383 | 2024-08-07 |
Integration of human organoids single-cell transcriptomic profiles and human genetics repurposes critical cell type-specific drug targets for severe COVID-19
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13558
PMID:37807299
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研究论文 | 本文构建了一个计算框架，整合了人类类器官单细胞转录组数据、全基因组关联研究统计数据、表达数量性状位点以及基因-药物相互作用数据，以识别与COVID-19严重性相关的关键细胞群体和药物靶点 | 本文创新性地利用人类类器官单细胞转录组数据和遗传学数据，重新定位了针对COVID-19的细胞类型特异性药物靶点 | NA | 识别与COVID-19严重性相关的细胞类型特异性药物靶点，以促进开发有效的治疗方法 | 人类类器官中的39种细胞类型及其与COVID-19严重性的关联 | 基因组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 计算框架 | 转录组数据 | 八种类器官中的39种细胞类型 |
| 14384 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing gene signatures for classifying and scoring exhausted CD8+ T cells in B-cell acute lymphoblastic leukaemia
2024-Mar, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13583
PMID:38030593
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14385 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals peripheral blood leukocyte responses to spinal cord injury in mice with humanised immune systems
2024-Mar-01, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03048-0
PMID:38429643
|
研究论文 | 本研究利用人源化免疫系统的小鼠模型和单细胞RNA测序技术，探讨了人免疫细胞在脊髓损伤后的反应和变化 | 首次在人源化小鼠模型中使用单细胞RNA测序技术研究脊髓损伤后免疫细胞的反应和变化 | 研究仅限于特定的人源化小鼠模型，可能不完全代表人类脊髓损伤后的免疫反应 | 深入研究脊髓损伤后免疫抑制综合征（SCI-IDS）以及人白细胞在损伤部位的迁移和变化 | 人源化NSG-SGM3小鼠脊髓损伤后的免疫细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 11种人免疫细胞（亚）类型或状态 |
| 14386 | 2024-08-07 |
Traditional Chinese Medicine Shi-Bi-Man ameliorates psoriasis via inhibiting IL-23/Th17 axis and CXCL16-mediated endothelial activation
2024-Mar-01, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-024-00907-z
PMID:38429819
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研究论文 | 研究中药石壁曼通过抑制IL-23/Th17轴和CXCL16介导的内皮细胞活化来改善银屑病的作用机制 | 首次探讨了石壁曼通过抑制IL-23/Th17细胞轴和CXCL16表达来减轻银屑病样皮肤炎症的作用 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体临床试验验证 | 寻找银屑病的新治疗策略并探究其作用机制 | 石壁曼对银屑病样皮肤炎症的影响及其分子机制 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 反转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR) | NA | 细胞 | 使用咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 |
| 14387 | 2024-08-04 |
IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6 positive feedback loop in tumor-associated macrophages promotes the EMT and metastasis of lung adenocarcinoma
2024-Feb-29, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-02989-x
PMID:38424624
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）通过IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6正反馈环路促进肺腺癌的上皮间质转化（EMT）和转移的机制 | 揭示了巨噬细胞促进肿瘤进展的新机制，IL6-STAT3-C/EBPβ-IL6信号级联可能成为肺癌治疗的新靶点 | 研究的样本主要来自单一医院，样本容量相对较小 | 研究肿瘤相关巨噬细胞在肺癌转移中的调控机制 | 研究对象包括来自公共数据库和14名肺癌患者的正常及肿瘤组织样本 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞测序，RT-qPCR，Western blotting，免疫荧光，双荧光素酶报告实验，ChIP | NA | 组织样本 | 14名手术患者的肿瘤和正常组织样本 |
| 14388 | 2024-08-07 |
The Role of CD8A in the Immune Microenvironment of Breast Cancer
2024-Feb-21, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/j.fbl2902073
PMID:38420798
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研究论文 | 研究探讨了CD8A在三阴性乳腺癌（TNBC）免疫微环境中的作用及其与预后的关系 | 通过使用单细胞RNA测序数据和临床样本评估，揭示了CD8A在转移性乳腺癌免疫微环境中的表达及其对预后的影响 | NA | 寻找新的治疗靶点和策略，改善三阴性乳腺癌的预后 | 三阴性乳腺癌及其免疫微环境中的CD8A表达 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE102818、GSE118389和GSE202695等多个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 14389 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial multi-omics highlight effects of anti-integrin therapy across cellular compartments in ulcerative colitis
2024-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.21.525036
PMID:36711576
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研究论文 | 本文研究了抗整合素疗法对溃疡性结肠炎中细胞不同群体的影响 | 首次通过单细胞转录组和蛋白组分析揭示了VDZ对炎症细胞的影响及其在溃疡性结肠炎中的作用 | 本研究未详细阐明VDZ对于其他细胞亚群体的广泛影响 | 确定参与溃疡性结肠炎的炎症细胞及其受VDZ影响的程度 | 健康对照组及接受VDZ或其他疗法的溃疡性结肠炎患者的外周血和结肠活检样本 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞转录组学和蛋白组学分析 | NA | 外周血和结肠活检样本 | 健康对照组和接受不同治疗的溃疡性结肠炎患者的样本 |
| 14390 | 2024-08-04 |
Conceptual Framework of Epigenetic Analyses of Plant Responses to Sedentary Endoparasitic Nematodes
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3638-1_12
PMID:38427303
|
章节 | 本章节提供了一种用于研究植物与寄生线虫相互作用的表观遗传调控的概念框架 | 提供了针对miRNA调控和功能的当前及新兴方法的详细分析 | 文章提到了一些方法的局限性并讨论如何克服这些问题 | 阐明植物与寄生线虫相互作用过程中的表观遗传调控 | 关注植物表观基因组中各种成分在寄生线虫感染中的作用 | NA | NA | 单细胞测序技术、基因组编辑 | NA | NA | NA |
| 14391 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing uncovers the dynamic changes of tumour immune microenvironment in advanced lung adenocarcinoma
2023-12-11, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2023-001878
PMID:38081768
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了晚期肺腺癌肿瘤免疫微环境的动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肺腺癌肿瘤微环境中未被充分认识的细胞组成和动态变化 | 研究仅基于34名患者的样本，可能存在样本量不足的问题 | 阐明肺腺癌的细胞组成并揭示其肿瘤微环境的先前未被充分认识的特征 | 肺腺癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 106,829个高质量细胞来自34名患者 |
| 14392 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals endometrial immune microenvironment in minimal/mild endometriosis
2023-06-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad029
PMID:36869723
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了极轻度/轻度子宫内膜异位症患者的子宫内膜免疫微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下系统地分析了子宫内膜异位症患者的子宫内膜白细胞类型、炎症环境和受损的容受性 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在系统地理解子宫内膜异位症患者的子宫内膜白细胞类型、炎症环境和受损的容受性 | 子宫内膜异位症患者和对照组的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 138,057个子宫内膜细胞，来自6名子宫内膜异位症患者和7名对照组 |
| 14393 | 2024-08-07 |
Single Cell Transcriptomics Identifies Distinct Choroid Cell Populations Involved in Visually Guided Eye Growth
2023-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.30.542876
PMID:37398381
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了鸡视网膜色素上皮层（choroid）在视觉引导眼球生长过程中的细胞群体及其基因表达变化 | 首次提供了视网膜色素上皮层主要细胞类型及其在视觉引导眼球生长过程中的基因表达变化的综合图谱 | 基因表达变化主要较小（< 2倍），且最高变化出现在一个罕见的细胞群体中 | 阐明视网膜色素上皮层在视觉引导眼球生长过程中的作用 | 鸡视网膜色素上皮层的细胞群体及其在视觉引导眼球生长过程中的基因表达变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 24个不同的细胞集群，代表了95%的总视网膜色素上皮层细胞 |
| 14394 | 2024-08-07 |
DIAPH1 Variants in Non-East Asian Patients With Sporadic Moyamoya Disease
2021-08-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2021.1681
PMID:34125151
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序分析了非东亚人群中散发的烟雾病（MMD）患者中的DIAPH1基因变异，以评估这些变异与MMD风险的相关性 | 发现了非东亚人群中散发的烟雾病患者中的DIAPH1基因致病变异，表明DIAPH1是MMD的一个新的风险基因 | 研究样本量较小，且主要集中在非东亚人群 | 评估超罕见的新发和罕见、有害的遗传变异是否与MMD风险相关 | 烟雾病患者及其父母 | 遗传学 | 脑血管疾病 | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 发现队列包括24名患者（22个三联体和2名单体），验证队列包括84名患者（29个三联体和55名单体） |
| 14395 | 2024-08-07 |
Tmem100- and Acta2-Lineage Cells Contribute to Implant Osseointegration in a Mouse Model
2021-05, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4264
PMID:33528844
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研究论文 | 本文研究了在小鼠模型中，Tmem100和Acta2谱系细胞如何促进金属植入物的骨整合 | 首次发现Pdgfra和Ly6a/Sca1表达的基质细胞（PαS细胞）在植入物周围骨形成中的作用 | NA | 确定参与金属植入物周围骨形成的特定骨髓基质细胞群 | Tmem100和Acta2谱系细胞在植入物骨整合中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胫骨植入模型 |
| 14396 | 2024-08-07 |
Enabling methanol fixation of pediatric nasal wash during respiratory illness for single cell sequencing in comparison with fresh samples
2024-Feb, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-023-02780-2
PMID:37758866
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研究论文 | 本研究开发了一种协议，允许在甲醇固定的儿童鼻洗样本中进行单细胞RNA测序，并与新鲜样本进行比较 | 首次展示了甲醇固定儿童鼻洗样本进行单细胞RNA测序的可行性，并发现其与新鲜样本在定性和定量参数上无显著差异 | NA | 探索甲醇固定儿童鼻洗样本在单细胞RNA测序中的应用 | 儿童鼻洗样本 | 数字病理学 | 呼吸道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 14397 | 2024-08-04 |
Integrin β1-rich extracellular vesicles of kidney recruit Fn1+ macrophages to aggravate ischemia-reperfusion-induced inflammation
2024-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169885
PMID:38258908
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研究论文 | 本研究分析了缺血-再灌注损伤中肾脏的细胞间通讯及其对炎症的影响 | 首次系统性地分析了在缺血-再灌注微环境中，细胞外囊泡介导的细胞间通讯及其带来的炎症反应 | 该研究未能提供不同时间点的动态分析数据 | 探讨缺血-再灌注导致的急性肾损伤中的细胞外囊泡对单核吞噬细胞的影响 | 研究对象主要是肾脏近端小管细胞和单核吞噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA Seq数据和蛋白质组学数据 | NA |
| 14398 | 2024-08-07 |
Spatially resolved transcriptomics of high-grade serous ovarian carcinoma
2022-Mar-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.103923
PMID:35252817
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研究论文 | 本研究首次全面采用空间转录组学方法分析高级别浆液性卵巢癌，通过分析治疗前肿瘤组织样本，揭示了化疗反应者之间的肿瘤组成差异 | 首次采用空间转录组学方法全面分析高级别浆液性卵巢癌，揭示了细胞集群组织和定位对化疗反应的影响 | 研究样本量较小，仅包括少数经过详细注释的高级别浆液性卵巢癌患者 | 深入分析高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织，探讨细胞集群的空间交互作用对化疗反应的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者，特别是化疗反应不同的患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 小样本量，具体数量未明确 |
| 14399 | 2024-08-04 |
Endothelial downregulation of nuclear m6A reader YTHDC1 promotes pulmonary vascular remodeling in sugen hypoxia model of pulmonary hypertension
2024-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e24963
PMID:38318069
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研究论文 | 本文分析了YTHDC1在苏根缺氧小鼠模型中的表达变化及其在肺动脉内皮细胞功能障碍中的作用 | 首次分析了苏根缺氧小鼠模型中m6A调节因子的表达和生物功能变化，建立了YTHDC1与PAECs功能障碍之间的因果关系 | 目前对m6A调节因子在肺动脉内皮细胞功能障碍中的具体机制尚不完全清楚 | 研究m6A调节因子在肺动脉内皮细胞功能障碍中的作用 | 鼠类模型中的肺动脉内皮细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞测序 | 苏根缺氧模型 | RNA测序数据 | 苏根缺氧小鼠模型的肺动脉内皮细胞 |
| 14400 | 2024-08-07 |
Centrosome amplification-related signature correlated with immune microenvironment and treatment response predicts prognosis and improves diagnosis of hepatocellular carcinoma by integrating machine learning and single-cell analyses
2024-Feb, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-023-10538-5
PMID:37154991
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析，构建了与免疫微环境和治疗反应相关的中心体扩增相关特征，用于预测肝细胞癌的预后和改善诊断 | 首次详细探讨了中心体扩增在肝细胞癌中的作用，并构建了一个具有高敏感性和特异性的预后和诊断特征 | 研究主要基于TCGA和ICGC数据集，可能需要更多临床数据验证 | 探讨中心体扩增在肝细胞癌中的分子机制及其对临床特征、肿瘤微环境和临床药物反应的影响 | 肝细胞癌患者及其中心体扩增相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-惩罚Cox回归算法 | 基因表达数据 | 134个中心体扩增相关预后基因，其中6个关键预后基因 |