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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1421 | 2026-04-30 |
Single-cell profiling reveals that dynamic lung immune responses distinguish protection from susceptibility to tuberculosis
2026-Apr, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013635
PMID:42044120
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序,揭示动态肺部免疫反应区分结核病保护与易感性的机制 | 首次在多个时间点、小鼠品系和结核分枝杆菌菌株下,利用单细胞RNA测序系统比较了初次感染和已控制感染小鼠的肺部免疫动态差异,发现保护性免疫依赖于免疫激活的时间协调而非单一反应强度 | 研究基于小鼠模型,结果向人类的直接推广性有限;未验证这些免疫动态特征在人类疫苗反应中的适用性 | 阐明结核分枝杆菌感染后保护性免疫的免疫相关性,为疫苗策略提供框架 | 初生小鼠和已控制结核分枝杆菌感染的小鼠的肺部免疫细胞 | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点、小鼠品系和结核分枝杆菌菌株的样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 1422 | 2026-04-30 |
Chemotherapy-induced reactive myelopoiesis promotes expansion of immunosuppressive neutrophil-like monocytes in mice and humans
2026-Mar-31, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198360
PMID:41945895
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC测序,揭示了化疗诱导的反应性髓细胞生成促进免疫抑制性中性粒细胞样单核细胞扩增的机制 | 首次在化疗后小鼠和人类中鉴定出CXCR4⁺CX3CR1⁻中性粒细胞样单核细胞亚群,并证明其具有强T细胞抑制活性,揭示了化疗后免疫抑制的新机制 | 对临床样本仅分析了淋巴瘤患者,机制研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证规模有限 | 探究化疗诱导的反应性髓细胞生成及其对免疫抑制性单核细胞扩增的分子机制和临床意义 | 化疗处理的小鼠骨髓单核细胞和接受含环磷酰胺化疗的淋巴瘤患者外周血单核细胞 | 数字病理 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、ATAC测序 | NA | 单细胞基因表达数据、染色质可及性数据 | 化疗处理的小鼠(样本量未明确)以及公共数据集中化疗治疗的癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 1423 | 2026-04-30 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0775
PMID:41874448
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研究论文 | 介绍IN-DEPTH工作流程,实现同一玻片上的空间多组学整合,并揭示肿瘤病毒相关的肿瘤微环境空间重组 | 开发了IN-DEPTH工作流程,结合单细胞空间蛋白质组学成像引导转录组捕获,无需RNA信号损失;并开发了光谱图互相关(SGCC)框架,实现蛋白质-转录组模态的整合分析 | 尚未提及方法的局限性 | 实现同一玻片上的空间多组学整合,揭示弥漫大B细胞淋巴瘤中EB病毒相关的肿瘤微环境空间重组 | 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)肿瘤组织,包括EBV阳性和EBV阴性样本 | 数字病理学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、IN-DEPTH、SGCC | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组成像数据 | 包含EBV阳性和EBV阴性的弥漫大B细胞淋巴瘤样本 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 1424 | 2026-04-30 |
Mucosal Inflammation Shapes Human Neutrophil States in Tissue and Circulation
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.21.713286
PMID:42051301
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、光谱流式细胞术和空间蛋白质组学,研究牙龈、血液和口腔中中性粒细胞在健康与牙周炎状态下的组织特异性状态及其系统性影响 | 首次在健康与疾病状态下系统性表征人类口腔粘膜中性粒细胞的组织特异性状态,揭示牙周炎通过血液样中性粒细胞亚群浸润和转录噪声增加破坏粘膜免疫调节程序,并发现局部炎症可系统性重塑循环中性粒细胞——共享一个Rho-GTPase调控程序,该程序在多种人类炎症性疾病中普遍存在 | 未提及具体限制 | 探究口腔粘膜组织中中性粒细胞在健康与炎症性疾病中的组织特异性状态及其对循环中性粒细胞的系统性影响 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织、血液和口腔腔隙中的中性粒细胞 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、空间蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、空间蛋白质组数据 | 健康个体和牙周炎患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1425 | 2026-04-30 |
Mathematical dissection of tumor phenotypic heterogeneity in a spatial data-informed nonlocal reaction-diffusion model
2026-Mar-22, Journal of mathematical biology
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s00285-026-02380-8
PMID:41866589
|
研究论文 | 提出一种结合空间转录组数据的非局部反应-扩散数学模型,严格分析肿瘤内表型异质性的演化动态 | 首次将空间基因表达数据与非局部反应-扩散模型整合,开展严格的数学分析并揭示表观突变率决定肿瘤细胞表型集中分布的关键作用 | 模型假设依赖血管化肿瘤且参数空间维度较高,实际应用时计算复杂度较大 | 通过数学建模剖析肿瘤内表型异质性及其演化机制 | 血管化肿瘤及其内部异质性表型细胞群体 | 机器学习 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | 非局部反应-扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1426 | 2026-04-30 |
Human Single-cell Atlas Analysis Reveals Heterogeneous Endothelial Signaling
2026-Mar-20, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag025
PMID:41863304
|
研究论文 | 通过整合15个人体组织中的三百万个单细胞进行单细胞RNA-seq数据分析,揭示了内皮细胞的异质性及其在血管类型和组织微环境中的信号传导机制 | 首次大规模整合多个组织单细胞转录组数据,开发计算流程分析代谢物或蛋白质介导的细胞间通讯,利用主题建模识别内皮细胞与其他组织驻留细胞之间的通讯模式 | 研究主要依赖公开数据集,可能受限于原始数据质量及组织覆盖的全面性 | 系统研究内皮细胞在血管类型和组织微环境背景下的异质性及其调控机制 | 人体15个组织中的内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 主题建模 | 单细胞转录组数据 | 15个人体组织中三百万个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1427 | 2026-04-30 |
Dynamic and cell-type specific transcriptional reprogramming underlies the floral transition in the maize shoot apical meristem
2026-Mar-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04033-x
PMID:41851888
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研究论文 | 通过整合时间序列批量RNA-seq、单细胞转录组学、染色质可及性和转录因子结合谱,构建玉米茎尖分生组织花转变的时空分子框架,揭示动态和细胞类型特异性转录重编程机制 | 首次构建了玉米花转变的完整时空调控框架,发现花转变并非由统一的转录开关驱动,而是源自空间上不同的茎尖分生组织区域的协同作用,并鉴定出ZmMADS69-ZmRap2.7-ZMM4调控模块以及UNBRANCHED2和UNBRANCHED3在促进花转变中的新角色 | 未明确提及局限性 | 研究玉米茎尖分生组织在花转变过程中的转录重编程和细胞身份变化的分子机制 | 玉米茎尖分生组织 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞转录组学, 染色质可及性分析, 转录因子结合谱分析 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 时间序列样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1428 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1429 | 2026-03-19 |
A differential single-cell transcriptome atlas of left-sided and right-sided colorectal cancer
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04789-5
PMID:41844817
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1430 | 2026-03-19 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1431 | 2026-04-28 |
Artificial intelligence-assisted spatial omics-based biomimetic nanoplatform for intelligent and precise intervention in the immunosuppressive core region of ovarian cancer
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01345-w
PMID:41814059
|
综述 | 综述了人工智能辅助的空间组学基于仿生纳米平台用于卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 提出人工智能辅助的闭环治疗框架,整合识别、递送和反馈,实现个性化精准免疫治疗,并系统梳理了空间组学鉴定免疫抑制核心区域的方法 | 空间图谱标准化、递送系统稳定性和跨平台兼容性仍需进一步技术突破 | 实现卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 卵巢癌免疫抑制肿瘤微环境中的核心区域,包括调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞构成的“排斥结构” | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1432 | 2026-04-30 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
|
研究论文 | 揭示KDM6A磷酸化在口腔鳞状细胞癌中调控糖酵解的机制 | 首次发现KDM6A Ser829位点磷酸化可作为E3泛素连接酶FBXW7的底物,并利用条件性敲入小鼠模型结合单细胞RNA测序阐明其对糖酵解的调控作用 | 未提及,但一般可能包括:机制验证仅在小鼠模型中进行,未在人类样本中确认;4NQO诱导的OSCC模型可能不能完全模拟人类疾病 | 探究KDM6A翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌糖酵解调控中的作用 | KDM6A蛋白、FBXW7泛素连接酶、小鼠舌组织及口腔鳞状细胞癌细胞 | 分子生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP(免疫共沉淀)、免疫印迹、条件性基因敲入、单细胞RNA测序、4NQO诱导OSCC模型、免疫荧光成像 | NA | 测序数据(scRNA-Seq)、免疫荧光图像 | Kdm6a S829A条件性敲入小鼠(多个)及野生型对照小鼠;具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1433 | 2026-03-31 |
Single-cell RNA sequencing-guided drug discovery to alleviate radiotherapy-induced esophageal toxicity
2026-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.12.038
PMID:41909731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1434 | 2026-04-30 |
Benchmarking cell-type-specific spatially variable gene detection methods
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag190
PMID:42041225
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研究论文 | 系统评估了六种最新的细胞类型特异性空间可变基因检测方法的性能,包括一致性、预测性能、旋转鲁棒性、可扩展性和生物学可解释性 | 首次全面比较多种ctSVG检测方法,涵盖46个真实数据集和大量模拟数据集,揭示了方法间的互补性和性能差异 | 旋转不变性问题仍需进一步研究,Celina方法易受非目标细胞类型影响产生假信号 | 评估和比较细胞类型特异性空间可变基因检测方法,为工具选择和算法开发提供指导 | 六种ctSVG检测方法(STANCE、Celina、C-SIDE、spVC、ctSVG、CTSV) | 数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 46个真实数据集及多种模拟数据集 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 1435 | 2026-04-30 |
Longitudinal in vivo human wound healing model defines key role for smooth muscle cells in ECM remodeling
2026-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.24.707845
PMID:42051305
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研究论文 | 通过纵向体内人体伤口愈合模型,定义平滑肌细胞在细胞外基质重塑中的关键作用 | 首次利用纵向体内人体数据,结合单细胞和空间转录组学,揭示血管平滑肌细胞在伤口愈合重塑阶段的主导作用,并鉴定TIMP1作为关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 明确血管平滑肌细胞在人体伤口愈合中的调控机制,特别是与细胞外基质重塑相关的信号活动 | 健康志愿者的皮肤伤口组织以及糖尿病足溃疡患者的非愈合伤口组织 | 数字病理学, 机器学习 | 伤口愈合, 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 健康志愿者(具体数量未提及),糖尿病足溃疡患者(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 1436 | 2026-04-30 |
ADT-030, a novel PDE10 inhibitor, demonstrates potent antitumor activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.11.705411
PMID:41726934
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研究论文 | 研究了新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤活性及其机制 | 首次发现PDE10抑制剂ADT-030能有效抑制KRAS突变PDAC细胞增殖并通过诱导G2/M期阻滞和凋亡发挥抗肿瘤作用,且对KRAS抑制剂耐药细胞也有活性 | 未提及具体局限性 | 评估新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的治疗潜力 | KRAS突变胰腺导管腺癌细胞系及动物模型 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含同源移植和患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析肿瘤微环境重编程 |
| 1437 | 2026-04-30 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2026-02, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
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综述 | 探讨星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞协调者在健康和疾病中构成的胶质细胞免疫网络 | 提出大胶质细胞(星形胶质细胞、少突胶质细胞)应被视为中枢神经系统免疫系统的主动组分,形成胶质细胞特异性的免疫样网络,并协调多种中枢神经系统效应 | 基于现有文献综述,缺乏直接实验验证,且主要聚焦于阿尔茨海默病,对其他神经病理学适用性尚未充分探讨 | 综述大胶质细胞来源的免疫信号及其在健康和疾病中的相关性,特别是在阿尔茨海默病病理中的分子对话 | 大胶质细胞(星形胶质细胞和少突胶质细胞)以及小胶质细胞 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于分析健康和疾病状态下细胞谱系的单细胞转录组学技术 |
| 1438 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals disease associated changes in brain endothelial cells in the 5XFAD mouse
2026-Jan-30, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00766-w
PMID:41618410
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1439 | 2026-04-30 |
Differential Hes1 activation defines neural stem cell lineage commitment and niche maintenance in embryonic and adult mouse cortex
2026-Jan-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511800123
PMID:41557790
|
research paper | 利用单细胞转录组学和条件敲除小鼠模型,研究Hes1差异激活在胚胎和成年小鼠皮层神经干细胞谱系特化及生态位维持中的作用 | 首次区分了Notch非依赖性表达Hes1的神经干细胞与Notch依赖性表达的放射状胶质细胞,并证明了NIHes1神经干细胞是产生其他神经前体细胞的祖先前体细胞 | 未明确提及具体限制 | 阐明Hes1差异激活在神经干细胞谱系特化和生态位维持中的功能和机制 | 小鼠胚胎和成年皮层神经干细胞/祖细胞 | machine learning | NA | 单细胞转录组学, 条件敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 胚胎和成年小鼠皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1440 | 2026-04-30 |
EGFR-mutant transformed small cell lung cancer harbors intratumoral heterogeneity targetable with MEK inhibitor combination therapy
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197008
PMID:41574603
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研究论文 | 通过对EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液进行单细胞RNA测序,发现肿瘤内存在可被MEK抑制剂联合疗法靶向的异质性 | 首次揭示EGFR突变小细胞肺癌由不同细胞状态混合组成,并发现非NE细胞对MEK抑制剂具有选择性敏感性,为靶向肿瘤异质性提供了新治疗策略 | 仅基于少量患者的胸水样本,需要更大样本量和更多模型验证;EZH2调控EGFR表达的机制及临床转化潜力需进一步研究 | 探究EGFR突变小细胞肺癌转化中的肿瘤异质性及其治疗靶点 | EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液及患者来源细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多例EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |